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DOI: 10.3791/56186-v
Rizwan Rehimi1, Michaela Bartusel1, Francesca Solinas2, Janine Altmüller2, Alvaro Rada-Iglesias1,3
1Center for Molecular Medicine Cologne (CMMC),University of Cologne, 2Cologne Center for Genomics (CCG),University of Cologne, 3Cologne Excellence Cluster for Cellular Stress Responses in Aging-Associated Diseases (CECAD), Research Center and Systems Biology of Ageing Cologne,University of Cologne
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
This article presents a chromatin immunoprecipitation (ChIP) and ChIP-seq library preparation protocol designed for generating global epigenomic profiles from low-abundance chicken embryonic samples. The method aims to elucidate the binding profiles of histone modifications to enhance the functional annotation of vertebrate genomes.
Aquí, describimos una inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) y el protocolo de preparación de biblioteca de ChIP-seq para generar perfiles de epigenómica global de muestras embrionarias de pollo baja abundancia.
El objetivo general de este procedimiento es investigar los perfiles de unión de diferentes modificaciones de histonas, utilizando muestras embrionarias de baja abundancia para mejorar la anotación funcional de los genomas de los vertebrados. Este método puede ayudar a responder preguntas clave en el campo de la biología del desarrollo, como cuáles son los potenciadores clave y los genes que definen la identidad de un tejido embrionario en particular. Las principales ventajas de estas técnicas son que requiere una cantidad limitada de material particular y también se puede utilizar tanto para análisis específicos locales como para análisis de todo el genoma.
Aunque este método puede proporcionar información sobre la regulación de la transcripción o la heterogeneidad celular con los tejidos embrionarios, también se puede aplicar a otros sistemas, como las muestras de patentes. Para obtener la etapa HH19, los embriones de gallina para este experimento, incubaron huevos fértiles de gallina Leghorn blanca en orientación horizontal a 37 grados centígrados y 80% de humedad durante tres días. Para empezar a aislar los embriones de HH19, hazlos accesibles extrayendo tres mililitros de albúmina con una jeringa de 10 milímetros para bajar el blastodermo.
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