Un modelo basado en la línea celular murina de la inhibición crónica de CDK9 para estudiar defectos de alargamiento transcripcional no genéticos generalizados (TEdefinitivamente)en cánceres

Dado que los cánceres de TEdeff son un obstáculo significativo contra la inmunoterapia, nuestro modelo farmacológico es una herramienta ventajosa porque imita adecuadamente los defectos transcripcionales y epigenéticos generalizados observados en estos cánceres, y permite estudiar estas anomalías no genéticas para obtener nuevos conocimientos, encontrar nuevos usos para los fármacos existentes, o encontrar nuevas estrategias contra tales cánceres. Este es un modelo fácil de establecer y generalizable para estudiar los defectos de alargamiento transcripcional en cánceres, lo que permite estudiar las interacciones tumoral-inmune tanto in vitro como in vivo. Este método también se puede aplicar a las líneas de carcinoma humano.

Hemos probado esto en T47D y CAL51 a corto plazo, dando lugar a características similares a TEdeff. El protocolo que describimos aquí proporciona un marco básico para minimizar las variables conocidas críticas para la generación de características similares a TEdeff por inhibición crónica de CDK9. Sin embargo, se debe tener cuidado de optimizar la dosis subletal exacta de flavopiridol para otras líneas murinas.