Name: Resonancia magnética nuclear de desplazamiento puro: una nueva herramienta para la metabolómica de las plantas (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-07-31T15:00:00.000+00:00
Duration: 13 min 16 s
Description: Aprende a analizar extractos vegetales mediante resonancia magnética nuclear de desplazamiento puro usando las técnicas PSYCHE y SAPPHIRE-PSYCHE. Este método mejora la resolución espectral para identificar metabolitos en hojas de vainilla, tubérculos de papa y frutos de uchuva.

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<ol><li>Hall, R., Beale, M., Fiehn, O., Hardy, N., Sumner, L., Bino, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plant+metabolomics%3A+the+missing+link+in+functional+genomics+strategies%5BTitle%5D)+AND+%22The+Plant+Cell%22%5BJournal%5D)">Plant metabolomics: the missing link in functional genomics strategies.</a> The Plant Cell. 14 (7), 1437-1440 (2002).</li>
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<li>Foroozandeh, M., Adams, R. W., Kiraly, P., Nilsson, M., Morris, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measuring+couplings+in+crowded+NMR+spectra%3A+pure+shift+NMR+with+multiplet+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Chemical+Communications%22%5BJournal%5D)">Measuring couplings in crowded NMR spectra: pure shift NMR with multiplet analysis.</a> Chemical Communications. 51 (84), 15410-15413 (2015).</li>
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<li>Cloarec, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Statistical+total+correlation+spectroscopy%3A+an+exploratory+approach+for+latent+biomarker+identification+from+metabolic+1H+NMR+data+sets%5BTitle%5D)+AND+%22Analytical+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Statistical total correlation spectroscopy: an exploratory approach for latent biomarker identification from metabolic 1H NMR data sets.</a> Analytical Chemistry. 77 (5), 1282-1289 (2005).</li>
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</ol>

<table><tbody><tr><td>77500 Series Freezone 4.5 Litros de sobremesa</td><td>Labconco</td><td>77500</td><td></td></tr><tr><td>Bruker Avance III 500 MHz equipado con una sonda criogénica TCI de 5 mm</td><td>Centrífuga Refrigerada Bruker Corporation</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Centrivap Concentradores Centrífugos Refrigerados Labconco 7310000 Serie</td><td>Labconco</td><td>7310000</td><td></td></tr><tr><td>Óxido de deuterio</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>151882</td><td></td></tr><tr><td>Máquina trituradora MKM6003</td><td>Bosch</td><td>MKM6003</td><td></td></tr><tr><td>Licuadora Licuadora 8011S modelo Hgb2wts3</td><td>Waring</td><td>Hgb2wts3</td><td></td></tr><tr><td>Metanol-d4</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>151947</td><td></td></tr></tbody></table>

resonancia magnética nuclear de desplazamiento puro: una nueva herramienta para la metabolómica de las plantas

Pure Shift Nuclear Magnetic Resonance: a New Tool for Plant Metabolomics

Análisis del espectro de RMN Los experimentos PSYCHE aumentan la resolución de los espectros al colapsar las resonancias acopladas en singletes21, lo que a su vez reduce la superposición y facilita la asignación y el análisis de datos. Pure Shift NMR se puede aplicar a extractos de plantas. Aquí demostramos su uso en tres matrices diferentes: hojas de vainilla, tubérculos de papa y frutos de Physalis peruviana . La mejora de la resolución lograda en los espectros de es...

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Nuclear Magnetic Resonance (NMR) is one of the most powerful tools used in metabolomics. It stands as a highly accurate and reproducible method that not ...

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Research

Investigación

JoVE Journal

Biochemistry

Bioquímica

Un método para la extracción de metabolitos microbianos de las comunidades planctónicas se presenta. Muestreo de toda la comunidad se logra por filtración en filtros especialmente preparados. Después de la liofilización, acuoso-solubles metabolitos se extraen. Este enfoque permite la aplicación de la metabolómica ambientales trans-ómicas las investigaciones de las comunidades microbianas naturales o experimentales.

La concentración de los metabolitos de las comunidades planctónicas de baja densidad para la metabolómica ambiental utilizando espectroscopia de Resonancia Magnética Nuclear

El procedimiento se describe la colonización progresiva de seguir evaluando su impacto sobre el metabolismo hepático de acogida. La colonización se controla de manera no invasiva mediante la evaluación de la excreción urinaria de los metabolitos microbianos co-mediante RMN basados ​​en los perfiles metabólicos, mientras que el metabolismo hepático es evaluado por alto ángulo Resolución Magic Spinning (MAS HR) de perfiles de RMN de la biopsia intactas.

La evaluación de alteraciones hepáticas metabólicas durante la colonización progresiva de la libre de gérmenes de ratón por 1 H espectroscopía de RMN

Preparación de la muestra de<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em&gt; Extractos de Estudios de Resonancia Magnética Nuclear metabolómica

Este video describe la técnica de espectroscopia de resonancia magnética nuclear para estudiar las interacciones proteína-proteína entre 15proteínas envoplakina mutantes y de tipo salvaje marcadas con N y la proteína vimentina no marcada. La interacción exitosa entre la envoplaquina de tipo salvaje y la vimentina conduce a un amplio ensanchamiento de la línea y a la desaparición de picos en los espectros de RMN, mientras que la ausencia de una interacción entre la envoplaquina mutada y la...

Resonancia magnética nuclear para estudiar las interacciones proteína-proteína a nivel atómico

Metabolito de perfiles ha sido un valioso activo en el estudio del metabolismo en la salud y la enfermedad. La utilización de la cromatografía en fase normal líquida acoplada a espectrometría de masas de alta resolución con el cambio de polaridad y un ciclo de trabajo rápido, se describe un protocolo para analizar la composición metabólica polar de material biológico con una alta sensibilidad, precisión y resolución.

Una estrategia para sensibles, grande escala cuantitativa Metabolómica

La neuroquímica del cerebro de los mamíferos cambia en muchas enfermedades neurológicas y sistémicas. Los perfiles característicos de los metabolitos cerebrales se pueden obtener de manera eficiente a partir de extractos crudos de tejido cerebral. Para ello, se emplea la espectroscopia de RMN de alta resolución, que permite un análisis cuantitativo detallado de las concentraciones de metabolitos (metabolómica).

Análisis de Metabolómica de cerebro de rata por Alta Resolución Nuclear Espectroscopía de Resonancia Magnética de Extractos de Tejidos

Espectrometría de masas en aerosol foliar es una técnica de análisis químico directo que reduce al mínimo la preparación de la muestra y elimina la cromatografía, permitiendo la detección rápida de pequeñas moléculas de los tejidos vegetales.

Espectrometría de masa de hoja aerosol: Una técnica rápida ionización ambiental evaluar directamente los metabolitos de los tejidos vegetales

Se presenta un protocolo para preparar 13C,15marcado con N muestras de hongos y plantas para espectroscopia de RMN de estado sólida multidimensional y las investigaciones de la polarización nuclear dinámica (DNP).

Preparación de hongos y materiales vegetales para la elucidación estructural mediante RMN de estado sólido de polarización Nuclear dinámica

Describimos aquí un método para identificar múltiples fosforilaciones de una proteína intrínsecamente desordenada mediante espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN), utilizando la proteína Tau como caso de estudio. La Tau recombinante se enriquece isotópicamente y se modifica in vitro mediante una quinasa antes de la adquisición y el análisis de datos.

Nuclear espectroscopía de resonancia magnética para la identificación de múltiples fosforilaciones de proteínas intrínsecamente desordenadas

Estructuras de conjuntos supramoleculares proteína a resolución atómica son de alta relevancia debido a su papel crucial en una variedad de fenómenos biológicos. Adjunto, presentamos un protocolo para llevar a cabo estudios estructurales de alta resolución en asambleas de proteína macromolecular insoluble y no-cristalino magic-angle spinning estado sólido de resonancia magnética nuclear espectroscopia (MAS SSNMR).

Estudios estructurales de escala atómica de asambleas macromoleculares por espectroscopia de estado sólido de resonancia magnética Nuclear

Aprende a analizar extractos vegetales mediante resonancia magnética nuclear de desplazamiento puro usando las técnicas PSYCHE y SAPPHIRE-PSYCHE. Este método mejora la resolución espectral para identificar metabolitos en hojas de vainilla, tubérculos de papa y frutos de uchuva.

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