Un robusto flujo de trabajo de procesamiento de criomicroscopía electrónica de una sola partícula (cryo-EM) con cryoSPARC, RELION y Scipion

La criomicroscopía electrónica de una sola partícula es el método para determinaciones estructuradas de macromoléculas a una resolución casi atómica. Múltiples paquetes de software están disponibles para el procesamiento de imágenes y cálculos de estructuras, sin embargo, el resultado en los mapas 3D a menudo varía en calidad y resolución debido a las diferencias en los algoritmos aplicados durante los cálculos. Por lo tanto, el uso de una combinación de diferentes programas a menudo es beneficioso para lograr los resultados óptimos.

Este protocolo guía a los usuarios a navegar por el flujo de trabajo a través de tres plataformas de procesamiento crio-EM diferentes: CryoSPARC, RELION y Scipion. Demostraremos cómo utilizar esta tubería para obtener una estructura de alta resolución del virus adenoasociado, que es un vector ampliamente utilizado para la terapia génica. Después de abrir CryoSPARC v3 en un navegador web y crear el espacio de trabajo para el proyecto, navegue hasta el nuevo espacio de trabajo y abra el generador de trabajos en el panel derecho.