Predicción computacional de las preferencias de aminoácidos de dominios de unión a péptidos potencialmente multiespecíficos implicados en las interacciones proteína-proteína

Proponemos un protocolo para la predicción computacional de preferencias de aminoácidos en interacciones proteína-proteína más específicas. Este protocolo puede ser considerado como un primer paso en el diseño de mediadores de estas interacciones. Estamos interesados en utilizar estos mediadores como potenciales inhibidores de interacciones específicas, en inmunología tecnóloga.

Nuestro implementador utilizado para caracterizar las preferencias de aminoácidos entre los sitios de unión específicos es costoso y engorroso. Nuestro protocolo es una tecnología bio-respaldada basada en la eficiencia y las operaciones en serie. Esta estrategia tiene el potencial de procesar un gran número de secuencias de líneas, proporcionando una diferencia completa y consistente de preferencias de aminoácidos.