Name: Aplicación de códigos de barras de ADN para identificar plantas medicinales (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2024-11-01T13:20:00.000+00:00
Duration: 8 min 55 s
Description: Aprende a aplicar códigos de barras de ADN para identificar plantas medicinales con precisión, utilizando Angelica sinensis como caso de estudio. Este método mejora la autenticación y el control de calidad en botánica medicinal.

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<meta charset="utf8"></head><body>Código de barras de ADN para plantas medicinales: identificación y análisis filogenético

<ol><li>Chen, S. L., et al. Conservation and sustainable use of medicinal plants: Problems, progress, and prospects. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aChen%2C+SL+%22Chin+Med%22">Chin Med</a>. 11, 37(2016).</li>
<li>Han, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+authenticity+survey+of+herbal+medicines+from+markets+in+China+using+DNA+barcoding%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">An authenticity survey of herbal medicines from markets in China using DNA barcoding.</a> Sci Rep. 6, 18723(2016).</li>
<li>Zhang, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integration+of+high-throughput+omics+technologies+in+medicinal+plant+research%3A+The+new+era+of+natural+drug+discovery%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">Integration of high-throughput omics technologies in medicinal plant research: The new era of natural drug discovery.</a> Front Plant Sci. 14, 1073848(2023).</li>
<li>Ji, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Determination+of+the+authenticity+and+origin+of+panax+notoginseng%3A+A+review%5BTitle%5D)+AND+%22J+AOAC+Int%22%5BJournal%5D)">Determination of the authenticity and origin of panax notoginseng: A review.</a> J AOAC Int. 105 (6), 1708-1718 (2022).</li>
<li>Parveen, I., Techen, N., Khan, I. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+species+in+the+aromatic+spice+family+apiaceae+using+DNA+mini-barcodes%5BTitle%5D)+AND+%22Planta+Med%22%5BJournal%5D)">Identification of species in the aromatic spice family apiaceae using DNA mini-barcodes.</a> Planta Med. 85 (2), 139-144 (2019).</li>
<li>Techen, N., Parveen, I., Pan, Z., Khan, I. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+barcoding+of+medicinal+plant+material+for+identification%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">DNA barcoding of medicinal plant material for identification.</a> Curr Opin Biotechnol. 25, 103-110 (2014).</li>
<li>Xiong, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Market+access+for+Chinese+herbal+medicinal+products+in+Europe-a+ten-year+review+of+relevant+products%2C+policies%2C+and+challenges%5BTitle%5D)+AND+%22Phytomedicine%22%5BJournal%5D)">Market access for Chinese herbal medicinal products in Europe-a ten-year review of relevant products, policies, and challenges.</a> Phytomedicine. 103, 154237(2022).</li>
<li>Virk, J. K., Gupta, V., Kumar, S., Singh, R., Bansal, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ashtawarga+plants+-+suffering+a+triple+standardization+syndrome%5BTitle%5D)+AND+%22J+Tradit+Complement+Med%22%5BJournal%5D)">Ashtawarga plants - suffering a triple standardization syndrome.</a> J Tradit Complement Med. 7 (4), 392-399 (2017).</li>
<li>An, Y. L., Wei, W. L., Guo, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+analytical+technologies+in+the+discrimination+and+authentication+of+herbs+from+fritillaria%3A+A+review%5BTitle%5D)+AND+%22Crit+Rev+Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Application of analytical technologies in the discrimination and authentication of herbs from fritillaria: A review.</a> Crit Rev Anal Chem. 54 (6), 1775-1796 (2024).</li>
<li>Li, M., Cao, H., But, P. P. H., Shaw, P. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+herbal+medicinal+materials+using+DNA+barcodes%5BTitle%5D)+AND+%22J+Systemat+Evolut%22%5BJournal%5D)">Identification of herbal medicinal materials using DNA barcodes.</a> J Systemat Evolut. 49 (3), 271-283 (2011).</li>
<li>Khan, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Herbal+spices+as+food+and+medicine%3A+Microscopic+authentication+of+commercial+herbal+spices%5BTitle%5D)+AND+%22Plants+%28Basel%29%22%5BJournal%5D)">Herbal spices as food and medicine: Microscopic authentication of commercial herbal spices.</a> Plants (Basel). 13 (8), 1067(2024).</li>
<li>Techen, N., Crockett, S. L., Khan, I. A., Scheffler, B. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Authentication+of+medicinal+plants+using+molecular+biology+techniques+to+compliment+conventional+methods%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Med+Chem%22%5BJournal%5D)">Authentication of medicinal plants using molecular biology techniques to compliment conventional methods.</a> Curr Med Chem. 11 (11), 1391-1401 (2004).</li>
<li>Sasidharan, S., Chen, Y., Saravanan, D., Sundram, K. M., Yoga Latha, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Extraction%2C+isolation+and+characterization+of+bioactive+compounds+from+plants%27+extracts%5BTitle%5D)+AND+%22Afr+J+Tradit+Complement+Altern+Med%22%5BJournal%5D)">Extraction, isolation and characterization of bioactive compounds from plants' extracts.</a> Afr J Tradit Complement Altern Med. 8 (1), 1-10 (2011).</li>
<li>Wei, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+techniques+and+detection+methods+of+edible+fungi+species%5BTitle%5D)+AND+%22Food+Chem%22%5BJournal%5D)">Identification techniques and detection methods of edible fungi species.</a> Food Chem. 374, 131803(2022).</li>
<li>Mehle, N., Trdan, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Traditional+and+modern+methods+for+the+identification+of+thrips+%28thysanoptera%29+species%5BTitle%5D)+AND+%22J+Pest+Sci%22%5BJournal%5D)">Traditional and modern methods for the identification of thrips (thysanoptera) species.</a> J Pest Sci. 85 (2), 179-190 (2012).</li>
<li>Hebert, P. D., Cywinska, A., Ball, S. L., Dewaard, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biological+identifications+through+DNA+barcodes%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Biol+Sci%22%5BJournal%5D)">Biological identifications through DNA barcodes.</a> Proc Biol Sci. 270 (1512), 313-321 (2003).</li>
<li>Chen, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Validation+of+the+its2+region+as+a+novel+DNA+barcode+for+identifying+medicinal+plant+species%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Validation of the its2 region as a novel DNA barcode for identifying medicinal plant species.</a> PLoS One. 5 (1), e8613(2010).</li>
<li>Li, D. Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+analysis+of+a+large+dataset+indicates+that+internal+transcribed+spacer+%28its%29+should+be+incorporated+into+the+core+barcode+for+seed+plants%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Comparative analysis of a large dataset indicates that internal transcribed spacer (its) should be incorporated into the core barcode for seed plants.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (49), 19641-19646 (2011).</li>
<li>Raskoti, B. B., Ale, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+barcoding+of+medicinal+orchids+in+asia%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">DNA barcoding of medicinal orchids in asia.</a> Sci Rep. 11 (1), 23651(2021).</li>
<li>Chen, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+barcoding+in+herbal+medicine%3A+Retrospective+and+prospective%5BTitle%5D)+AND+%22J+Pharm+Anal%22%5BJournal%5D)">DNA barcoding in herbal medicine: Retrospective and prospective.</a> J Pharm Anal. 13 (5), 431-441 (2023).</li>
<li>Pei, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Whole-genome+sequencing+in+medicinal+plants%3A+Current+progress+and+prospect%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+China+Life+Sci%22%5BJournal%5D)">Whole-genome sequencing in medicinal plants: Current progress and prospect.</a> Sci China Life Sci. 67 (2), 258-273 (2024).</li>
<li>Zhu, S., Liu, Q., Qiu, S., Dai, J., Gao, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+barcoding%3A+An+efficient+technology+to+authenticate+plant+species+of+traditional+chinese+medicine+and+recent+advances%5BTitle%5D)+AND+%22Chin+Med%22%5BJournal%5D)">DNA barcoding: An efficient technology to authenticate plant species of traditional chinese medicine and recent advances.</a> Chin Med. 17 (1), 112(2022).</li>
<li>Pang, X., Shi, L., Song, J., Chen, X., Chen, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+the+potential+DNA+barcode+its2+to+identify+herbal+materials%5BTitle%5D)+AND+%22J+Nat+Med%22%5BJournal%5D)">Use of the potential DNA barcode its2 to identify herbal materials.</a> J Nat Med. 67 (3), 571-575 (2013).</li>
<li>Ajmal Ali, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+changing+epitome+of+species+identification+-+DNA+barcoding%5BTitle%5D)+AND+%22Saudi+J+Biol+Sci%22%5BJournal%5D)">The changing epitome of species identification - DNA barcoding.</a> Saudi J Biol Sci. 21 (3), 204-231 (2014).</li>
<li>Peng, H., Chen, G., Ou, L. L., Luo, M., Zhang, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+a+new+efficient+scar+marker+for+authentication+of+Angelica+sinensis%2C+an+important+traditional+Chinese+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Scienceasia%22%5BJournal%5D)">Development of a new efficient scar marker for authentication of Angelica sinensis, an important traditional Chinese medicine.</a> Scienceasia. 47 (6), 751-757 (2021).</li>
<li>He, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Authentication+of+Angelica+anomala+av%C3%A9-lall+cultivars+through+DNA+barcodes%5BTitle%5D)+AND+%22Mitochondrial+DNA%22%5BJournal%5D)">Authentication of Angelica anomala avé-lall cultivars through DNA barcodes.</a> Mitochondrial DNA. 23 (2), 100-105 (2012).</li>
<li>Yuan, Q. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+species+and+materia+medica+within+Angelica+l.+%28umbelliferae%29+based+on+phylogeny+inferred+from+DNA+barcodes%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Ecol+Resour%22%5BJournal%5D)">Identification of species and materia medica within Angelica l. (umbelliferae) based on phylogeny inferred from DNA barcodes.</a> Mol Ecol Resour. 15 (2), 358-371 (2015).</li>
<li>Xie, P. J., Ke, Y. T., Kuo, L. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Modified+ctab+protocols+for+high-molecular-weight+DNA+extractions+from+ferns%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">Modified ctab protocols for high-molecular-weight DNA extractions from ferns.</a> Appl Plant Sci. 11 (3), e11526(2023).</li>
<li>Stefanova, P., Taseva, M., Georgieva, T., Gotcheva, V., Angelov, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+modified+ctab+method+for+DNA+extraction+from+soybean+and+meat+products%5BTitle%5D)+AND+%22Biotech+Biotechnol+Equipment%22%5BJournal%5D)">A modified ctab method for DNA extraction from soybean and meat products.</a> Biotech Biotechnol Equipment. 27 (3), 3803-3810 (2013).</li>
<li>Li, Z., Parris, S., Saski, C. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+plant+high-molecular-weight+DNA+extraction+method+suitable+for+single-molecule+technologies%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Meth%22%5BJournal%5D)">A simple plant high-molecular-weight DNA extraction method suitable for single-molecule technologies.</a> Plant Meth. 16, 38(2020).</li>
<li>Keller, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((5.8s-28s+rrna+interaction+and+hmm-based+its2+annotation%5BTitle%5D)+AND+%22Gene%22%5BJournal%5D)">5.8s-28s rrna interaction and hmm-based its2 annotation.</a> Gene. 430 (1-2), 50-57 (2009).</li>
<li>Morgulis, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Database+indexing+for+production+megablast+searches%5BTitle%5D)+AND+%22Bioinformatics%22%5BJournal%5D)">Database indexing for production megablast searches.</a> Bioinformatics. 24 (16), 1757-1764 (2008).</li>
<li>Liao, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Global+pharmacopoeia+genome+database+is+an+integrated+and+mineable+genomic+database+for+traditional+medicines+derived+from+eight+international+pharmacopoeias%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+China+Life+Sci%22%5BJournal%5D)">Global pharmacopoeia genome database is an integrated and mineable genomic database for traditional medicines derived from eight international pharmacopoeias.</a> Sci China Life Sci. 65 (4), 809-817 (2022).</li>
<li>Ghahramanlu, A., Rezaei, M., Heidari, P., Balandari, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Species+survey+of+iranian+barberry+genotypes+using+ITS2+sequences+and+basic+local+alignment+search+tools%5BTitle%5D)+AND+%22Erwerbs-Obstbau%22%5BJournal%5D)">Species survey of iranian barberry genotypes using ITS2 sequences and basic local alignment search tools.</a> Erwerbs-Obstbau. 65, 2491-2499 (2023).</li>
<li>Han, K., Wang, M., Zhang, L., Wang, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+molecular+methods+in+the+identification+of+ingredients+in+Chinese+herbal+medicines%5BTitle%5D)+AND+%22Molecules%22%5BJournal%5D)">Application of molecular methods in the identification of ingredients in Chinese herbal medicines.</a> Molecules. 23 (10), 2728(2018).</li>
<li>Wang, X., Liu, Y., Wang, L., Han, J., Chen, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+nucleotide+signature+for+the+identification+of+Angelicae+sinensis+radix+%28danggui%29+and+its+products%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">A nucleotide signature for the identification of Angelicae sinensis radix (danggui) and its products.</a> Sci Rep. 6, 34940(2016).</li>
<li>Chen, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+based+identification+of+medicinal+materials+in+Chinese+patent+medicines%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">DNA based identification of medicinal materials in Chinese patent medicines.</a> Sci Rep. 2, 958(2012).</li>
<li>Hou, D. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+identification+of+corni+fructus+and+its+adulterants+by+ITS%2FITS2+sequences%5BTitle%5D)+AND+%22Chin+J+Nat+Med%22%5BJournal%5D)">Molecular identification of corni fructus and its adulterants by ITS/ITS2 sequences.</a> Chin J Nat Med. 11 (2), 121-127 (2013).</li>
<li>Han, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+short+ITS2+sequence+serves+as+an+efficient+taxonomic+sequence+tag+in+comparison+with+the+full-length+its%5BTitle%5D)+AND+%22Biomed+Res+Int%22%5BJournal%5D)">The short ITS2 sequence serves as an efficient taxonomic sequence tag in comparison with the full-length its.</a> Biomed Res Int. 2013, 741476(2013).</li>
<li>Trujillo-Argueta, S., Del Castillo, R. F., Velasco-Murguía, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Testing+the+effectiveness+of+rbcla+DNA-barcoding+for+species+discrimination+in+tropical+montane+cloud+forest+vascular+plants+%28oaxaca%2C+mexico%29+using+blast%2C+genetic+distance%2C+and+tree-based+methods%5BTitle%5D)+AND+%22PeerJ%22%5BJournal%5D)">Testing the effectiveness of rbcla DNA-barcoding for species discrimination in tropical montane cloud forest vascular plants (oaxaca, mexico) using blast, genetic distance, and tree-based methods.</a> PeerJ. 10, e13771(2022).</li>
<li>Marizzi, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+barcoding+brooklyn+%28new+york%29%3A+A+first+assessment+of+biodiversity+in+marine+park+by+citizen+scientists%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">DNA barcoding brooklyn (new york): A first assessment of biodiversity in marine park by citizen scientists.</a> PLoS One. 13 (7), e0199015(2018).</li>
<li>Antil, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+barcoding%2C+an+effective+tool+for+species+identification%3A+A+review%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biol+Rep%22%5BJournal%5D)">DNA barcoding, an effective tool for species identification: A review.</a> Mol Biol Rep. 50 (1), 761-775 (2023).</li>
<li>Pang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Utility+of+the+trnh-psba+intergenic+spacer+region+and+its+combinations+as+plant+DNA+barcodes%3A+A+meta-analysis%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Utility of the trnh-psba intergenic spacer region and its combinations as plant DNA barcodes: A meta-analysis.</a> PLoS One. 7 (11), e48833(2012).</li>
<li>Tripathi, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+internal+transcribed+spacer+%28its%29+region+and+trnh-psba+%5Bcorrected%5D+are+suitable+candidate+loci+for+DNA+barcoding+of+tropical+tree+species+of+India%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">The internal transcribed spacer (its) region and trnh-psba [corrected] are suitable candidate loci for DNA barcoding of tropical tree species of India.</a> PLoS One. 8 (2), e57934(2013).</li>
<li>Zheng, X. S., An, W. L., Yao, H., Xu, J., Chen, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+authentication+of+the+poisonous+plant+Gelsemium+elegans+by+combining+filter-paper-based+DNA+extraction+and+rpa-lfd+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Engineering%22%5BJournal%5D)">Rapid authentication of the poisonous plant Gelsemium elegans by combining filter-paper-based DNA extraction and rpa-lfd detection.</a> Engineering. 7 (1), 14-16 (2021).</li>
<li>Jiang, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Barcoding+melting+curve+analysis+for+rapid%2C+sensitive%2C+and+discriminating+authentication+of+saffron+%28Crocus+sativus+l.%29+from+its+adulterants%5BTitle%5D)+AND+%22Biomed+Res+Int%22%5BJournal%5D)">Barcoding melting curve analysis for rapid, sensitive, and discriminating authentication of saffron (Crocus sativus l.) from its adulterants.</a> Biomed Res Int. 2014, 809037(2014).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>CTAB Kit de extracción rápida de ADN genómico de plantas Shanghai</td><td>Huiling Biotechnology Co.</td><td>NG411M</td><td>Adecuado para la extracción rápida de ADN genómico de alta calidad de diferentes tejidos de una amplia gama de plantas</td></tr><tr><td>DL5000</td> DNA <td>Marker Nanjing vazyme Bio-technology Co.</td><td>MD102-02</td><td>Producto listo para usar, tome una cantidad adecuada de este producto directamente para la electroforesis cuando ejecute el gel.</td></tr><tr><td>Electroforesis</td><td>Beijing Liuyi Biotechnology Co.</td><td>DYY-6C</td><td>Adopte el diseño de pantalla táctil, puede mostrar el voltaje establecido, la corriente establecida al mismo tiempo, salida paralela</td></tr><tr><td>Ácido etilendiaminotetraacético</td><td>BeijingpsaitongBiotechnologyCo., Ltd</td><td>E70015-100G</td><td>Reactivos de formulación de tampón de aislamiento nuclear.</td></tr><tr><td>Tinción de gel de ácido nucleico Goldview (10,000 veces)</td><td>Yisheng Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd</td><td>10201ES03</td><td>Cuando se usa electroforesis en gel de agarosa para detectar ADN, se une al ADN y produce una fuerte señal fluorescente.</td></tr><tr><td>Centrífuga de mesa de alta velocidad</td><td>Changsha Zona de desarrollo industrial de alta tecnología Xiangyi Centrífuga Instrument Co.</td><td>H1650</td><td>Para una separación rápida y eficiente de muestras, esta centrífuga compacta y liviana ofrece una seguridad confiable</td></tr><tr><td>Trituradora de tejidos de alto rendimiento</td><td>Shanghai Jingxin Industrial Development Co.</td><td>Tiss-48</td><td>Un instrumento de vibración de alta frecuencia para moler muestras</td></tr><tr><td>http://www.gpgenome.com/</td> <td>Instituto de Materia Médica China, Academia China de Ciencias Médicas</td> <td>Chinas-La</td> <td>base de datos de HerbGenomics incluye secuencias de genoma, conjuntos de genes, genomas de orgánulos, datos de genoma de baja cobertura y secuencias de códigos de barras de ADN.</td></tr><tr><td>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/</td> <td>Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.</td><td>:</td> <td>el Centro Nacional de Información Biotecnológica promueve la ciencia y la salud al proporcionar acceso a información biomédica y genómica.</td></tr><tr><td>Kylin-Bell</td><td>Haimen Qilinbel Fabricación de Instrumentos Co.</td><td>VORTEX-5</td><td>Mezcla rápida en forma de vórtice de alta velocidad, velocidad de mezcla, uniformidad, minuciosidad</td></tr><tr><td>LifeTouch</td><td>Hangzhou BORI Technology Co.</td><td>TC-96 / G / H (b) B</td><td>Adopción de tecnología de refrigeración termoeléctrica avanzada y tecnología TAS recién creada para mejorar su rendimiento general</td></tr><tr><td>Sistema de análisis de imágenes de gel multifuncional</td><td>Centro de operaciones del suroeste de Shanghai Tianneng Life Science Co.</td><td>Tanon-Mini Space 2000</td><td>Realiza experimentos rápidos de amplificación de genes con una función de gradiente para mapear las condiciones de amplificación y un rango de temperatura de gradiente de hasta 30 grados; C</td></tr><tr><td>NaCl</td><td>Beijing Solarbio Ciencia& Tecnología Co., Ltd.</td><td>S8210-100</td><td>Reactivos de formulación tampón de aislamiento nuclear.</td></tr><tr><td>Nanodrop One</td><td>Genes Ltd.</td><td>ND ONE</td><td>Cuantifique muestras de ADN, ARN y proteínas en segundos con solo 1-2 y micro; L de la muestra</td></tr><tr><td>Pirrolidona de polivinilo</td><td>Shanghai yuanye Bio-Technology Co., Ltd</td><td>S30268-500g</td><td>Reactivos de formulación tampón de aislamiento nuclear.</td></tr><tr><td>Máquina de hielo copo de nieve</td><td>Shanghai Zhixin Experimental Instrument Technology Co.</td><td>ZX-60X</td><td>Adoptando el método de fabricación de hielo por extrusión rotativa, velocidad rápida de fabricación de hielo y alta eficiencia de producción de hielo</td></tr><tr><td>Perlas de acero inoxidable para homogeneizador de tejidos</td><td>Beyotime Biotechnology.</td><td>F6623</td><td>Equipo para la molienda y mezcla de tejidos y otras muestras por vibración</td></tr><tr><td>Tampón de acetato de tris-EDTA</td><td>Beyotime Biotech Inc</td><td>ST716</td><td>TAE es un tampón de uso común para la electroforesis de ADN, empleado con frecuencia en la electroforesis en gel de agarosa.</td></tr><tr><td>Tris-HCl</td><td>Beijing Solarbio Science& Tecnología Co., Ltd.</td><td>T8230</td><td>Reactivos de formulación tampón de aislamiento nuclear.</td></tr><tr><td>Hervidor de agua</td><td>Shanghai Senxin Experimental Instrument Co.</td><td>DK-8D</td><td>Termostato preciso y regulación de temperatura, control de temperatura preciso y confiable</td></tr><tr><td>&beta;-mercaptoetanol</td><td>Shanghai Eon Chemical Technology Co.</td><td>R054186-100ml&nbsp; &nbsp;</td><td>Reactivos de formulación tampón de aislamiento nuclear.</td></tr></tbody></table>

aplicación de códigos de barras de adn para identificar plantas medicinales

Application of DNA Barcoding to Identify Medicinal Plants

Calidad del ADN de la muestra
El rango de relaciones de absorbancia OD260/OD280 fue de 1,80-1,84. La cantidad de ADN medida por espectrofotómetro para cada muestra fue superior a 100 ng/μL (Tabla 3), lo que indica una buena calidad de extracción de ADN de la muestra. Esto indica que las muestras no estaban contaminadas por proteínas, ARN o reactivos durante el proceso de extracción y que eran de buena calidad y adecuadas para la amplificación posterior por PCR.
Análisis de PCR
Se realizó electroforesis en gel sobre el producto de PCR de las tres muestras experimentales paralelas. La configuración fue: Marcador, muestras 1-3 (AS-1, AS-2, AS-3) y control negativo (0), como se muestra en la Figura 3. Los tamaños de AS-1, AS-2 y AS-3 están todos entre 500 pb con bandas simples, brillantes y claras, y no hay bandas en el 0, lo que indica que el ADN extraído se amplificó a 500 pb utilizando cebadores ITS2.
Comparación de los resultados de la secuenciación en la base de datos
Los resultados de la secuenciación identificaron A. sinensis con una similitud de secuencia del 100% al combinar los resultados de identificación de BLAST de la base de datos del NCBI, que es la misma que los resultados de identificación de especies de la base de datos GPGD (Tabla 4). El resultado de BLAST se determinó utilizando la puntuación de identidad porcentual más alta y el valor e más bajo. La identificación de especies se consideró exitosa cuando el porcentaje máximo de identidad más alto incluyó una sola especie y obtuvo una puntuación de &gt;99%. Si una puntuación es ≤ 99%, compruebe la calidad del archivo de secuenciación o si el producto de PCR está contaminado.
Análisis filogenético de la identificación de especies
Los resultados mostraron que en el árbol filogenético construido de Nueva Jersey, las cuatro especies se agruparon en clados separados, y el P. praeruptorum como grupo externo se separó de los clados de Angélica . Las secuencias de empalme se agruparon con el clado A. sinensis OR879715.1, y el valor de soporte del clado (bootstrap) fue 100, y luego las otras dos especies, A. dahurica y A. cartilaginomarginata , se agruparon en un clado separado, demostrando así que las secuencias de empalme eran de A. sinensis (Figura 4).
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/66925/66925fig01.jpg"> Figura 1: Diagrama de flujo de identificación de especies de plantas medicinales. (A) Planta de proceso, extracción de ADN y secuenciación de plantas medicinales, (B) comparación de la secuencia de especies utilizando bases de datos, y (C) empleo de árboles filogenéticos para la validación taxonómica para confirmar las relaciones filogenéticas entre las especies. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66925/66925fig01large.jpg" target="_blank">Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/66925/66925fig02.jpg"> Figura 2: Flujo de trabajo de extracción de ADN de plantas medicinales. (A) Un total de 6 pasos están involucrados en la extracción de ADN de plantas medicinales. (B) Amplificación de instrumentos de PCR y proceso de ciclado de PCR. c) Electroforesis. D) Secuenciación Sanger y cromatograma de secuenciación. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66925/66925fig02large.jpg" target="_blank">Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/66925/66925fig03.jpg"> Figura 3: Electroforesis en gel de Angelica sinensis (Oliv.) Diels. Utilizando el marcador de ADN DL5000 como marcador molecular, AS-1, AS-2 y AS-3 se utilizan como muestras y 0 como grupo de control. Se realizó electroforesis en gel y los resultados mostraron que las muestras de AS-1, AS-2 y AS-3 tenían bandas a 500 pb, mientras que el control no mostró bandas. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66925/66925fig03large.jpg" target="_blank">Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/66925/66925fig04.jpg"> Figura 4: Árbol filogenético de unión de vecinos creado a partir de 13 secuencias. Se descargaron un total de 10 secuencias de cuatro especies de plantas de la base de datos del NCBI, y se compararon las secuencias de empalme para analizar y comparar la variación de secuencias intraespecíficas e interespecíficas y para construir árboles filogenéticos de unión de vecinos. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66925/66925fig04large.jpg" target="_blank">Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.</a>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody><tr><td>Nombre del Material/Equipo</td>
			<td>dosis</td>
		</tr><tr><td>Polivinil pirrolidona</td>
			<td>10 g</td>
		</tr><tr><td>Tris-HCl</td>
			<td>1 M 50 mL</td>
		</tr><tr><td>Ácido etilendiaminotetraacético</td>
			<td>0.5 M 20 mL</td>
		</tr><tr><td>NaCl</td>
			<td>20,45 g</td>
		</tr><tr><td>β-mercaptoetanol</td>
			<td>10 mL</td>
		</tr><tr><td>Agua desionizada esterilizada</td>
			<td>500 mL</td>
		</tr></tbody></table>Tabla 1: Reactivos de formulación tampón de aislamiento nuclear.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody><tr><td>Código de barras</td>
			<td>Cebador</td>
			<td colspan="2">Secuencia de cebadores (5'-3')</td>
			<td colspan="3">Secuenciación de amplificación por PCR</td>
		</tr><tr><td rowspan="5">ITS 2</td>
			<td rowspan="3">R:3R</td>
			<td colspan="2" rowspan="3">GACGCTTCTCCAGACTACAAT</td>
			<td>94°C</td>
			<td colspan="2">5 minutos</td>
		</tr><tr><td>94°C</td>
			<td>Años 30</td>
			<td rowspan="3">40ciclos</td>
		</tr><tr><td>56°C</td>
			<td>Años 30</td>
		</tr><tr><td rowspan="2">F:2F</td>
			<td colspan="2" rowspan="2">ATGCGATACTTGGTGTGAAT</td>
			<td>72°C</td>
			<td>45 años</td>
		</tr><tr><td>72°C</td>
			<td colspan="2">10 minutos</td>
		</tr></tbody></table>Tabla 2: Cebadores de códigos de barras de ADN y condiciones de reacción de PCR.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody><tr><td>Muestras</td>
			<td>Extracción de ADN (ng/μL)</td>
			<td>OD260/OD280</td>
		</tr><tr><td>AS-1</td>
			<td>124</td>
			<td>1.84</td>
		</tr><tr><td>AS-2</td>
			<td>184</td>
			<td>1.81</td>
		</tr><tr><td>AS-3</td>
			<td>164</td>
			<td>1.82</td>
		</tr></tbody></table>Tabla 3: Angélica sinensis (Oliv.) Diels extrajo ADN de calidad.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody><tr><td>Muestras</td>
			<td>Longitud de la secuencia alineada (bp)</td>
			<td>Secuencia de empalme Longitud (bp)</td>
			<td>GC(%)</td>
			<td>NCBI:Porcentaje BLAST(%)</td>
			<td>GPGD:Porcentaje de identificación de especies(%)</td>
		</tr><tr><td>AS-1</td>
			<td>500 puntos básicos</td>
			<td>229 pb</td>
			<td>55.50%</td>
			<td>100%</td>
			<td>100%</td>
		</tr><tr><td>AS-2</td>
			<td>504 puntos básicos</td>
			<td>229 pb</td>
			<td>55.50%</td>
			<td>100%</td>
			<td>100%</td>
		</tr><tr><td>AS-3</td>
			<td>499 pb</td>
			<td>229 pb</td>
			<td>55.50%</td>
			<td>100%</td>
			<td>100%</td>
		</tr></tbody></table>Tabla 4: Comparación de los resultados de la secuenciación de la base de datos.

Aplicación de códigos de barras de ADN para identificar plantas medicinales

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