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DOI: 10.3791/68674-v
Fabio C. L. Almeida1,2, Francisco Felipe Bezerra1,3, Ariana A. Vasconcelos1,2
1Institute of Medical Biochemistry Leopoldo de Meis (IBqM),Federal University of Rio de Janeiro (UFRJ), 2National Center for Structural Biology and Bioimaging (CENABIO),Federal University of Rio de Janeiro (UFRJ), 3Laboratory of Connective Tissue,Clementino Fraga Filho University Hospital
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Este protocolo basado en RMN investiga las interacciones débiles proteína-glicano utilizando cianovirina-N y D-manosa. Combinando métodos detectados por ligandos y proteínas, mapea sitios de unión, detecta efectos alostéricos e identifica complejos de encuentro. El enfoque describe la preparación de muestras y el análisis de datos, ofreciendo información estructural y dinámica valiosa para el diagnóstico específico de glicanos y los mecanismos de reconocimiento.
Estudiamos las interacciones proteína-proteína y proteína-glicano, centrándonos en el complejo integrina-desintegrina. Nuestro modelo explora la dinámica estructural y destaca el papel de la fuerza superficial en la mediación de la formación compleja y la estabilidad de la interacción. Nuestro grupo se dedica al estudio del papel de las fuerzas superficiales en el reconocimiento molecular y la evolución de los sitios de unión mediante el estudio de grupos hidrófobos superficiales presentes en proteínas.
La solución de RMN permite la detección de interacciones proteicas. Aunque las interacciones débiles son esenciales para la vida, existe un sesgo hacia los complejos de alta afinidad, a pesar de que están presentes en muchas funciones biológicas importantes. Nuestro grupo se centra en el uso de enfoques de biología estructural integrativa para estudiar grandes complejos de proteínas.
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