Una canalización computacional para la cuantificación de ARN potenciador intergénico / intragénico en células madre embrionarias de ratón

Nuestro grupo investiga la epigenética y epitranscriptómica de potenciadores, centrándose en desarrollar métodos precisos para cuantificar ARN potenciadores como indicadores de activación de potenciadores. Debido a que los potenciadores intragénicos estaban con los transcritos del huésped, distinguir las señales de DER potenciadoras y cuantificarlas con precisión es complicado. Para comenzar, abrir el terminal y escribir el comando para preparar los archivos y referencias necesarios para la identificación del mejorador.

Escribe el comando en el terminal para introducir el directorio de trabajo. Luego ejecuta el comando que copia los scripts de identificación del mejorador al directorio actual. Luego ejecuta el comando correspondiente para generar archivos BED para regiones promotoras, cuerpos génicos y genes codificadores de proteínas usando la anotación de código gen.