Name: Microdisección por captura láser de tejido hepático de ratón fijado con paraformaldehído para análisis de ARN (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-04-17T12:33:00.000+00:00
Duration: 9 min 21 s
Description: Aprende microdisección por captura láser de hígado de ratón fijado con paraformaldehído para análisis transcriptómico de ARN. Este protocolo permite aislar poblaciones celulares específicas con alta pureza e integridad de ARN para qPCR y secuenciación.

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<ol><li>Shapiro, E., Biezuner, T., Linnarsson, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+sequencing-based+technologies+will+revolutionize+whole-organism+science%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Genet%22%5BJournal%5D)">Single-cell sequencing-based technologies will revolutionize whole-organism science.</a> Nat Rev Genet. 14 (9), 618-630 (2013).</li>
<li>Halpern, K. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+spatial+reconstruction+reveals+global+division+of+labour+in+the+mammalian+liver%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Single-cell spatial reconstruction reveals global division of labour in the mammalian liver.</a> Nature. 543 (7647), 352-356 (2017).</li>
<li>Aizarani, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+human+liver+cell+atlas+reveals+heterogeneity+and+epithelial+progenitors%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors.</a> Nature. 572 (7768), 199-204 (2019).</li>
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<li>Baron, C. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+Type+Purification+by+Single-Cell+Transcriptome-Trained+Sorting%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Cell Type Purification by Single-Cell Transcriptome-Trained Sorting.</a> Cell. 179 (2), 527-542.e19 (2019).</li>
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<li>Chen, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatiotemporal+transcriptomic+atlas+of+mouse+organogenesis+using+DNA+nanoball-patterned+arrays%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball-patterned arrays.</a> Cell. 185 (10), 1777-1792.e21 (2022).</li>
<li>Ståhl, P. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualization+and+analysis+of+gene+expression+in+tissue+sections+by+spatial+transcriptomics%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Visualization and analysis of gene expression in tissue sections by spatial transcriptomics.</a> Science. 353 (6294), 78-82 (2016).</li>
<li>Espina, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser-capture+microdissection%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Laser-capture microdissection.</a> Nat Protoc. 1 (2), 586-603 (2006).</li>
<li>Baba, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gene+expression+profiling+in+biliary+epithelial+cells+of+primary+biliary+cirrhosis+using+laser+capture+microdissection+and+cDNA+microarray%5BTitle%5D)+AND+%22Transl+Res%22%5BJournal%5D)">Gene expression profiling in biliary epithelial cells of primary biliary cirrhosis using laser capture microdissection and cDNA microarray.</a> Transl Res. 148 (3), 103-113 (2006).</li>
<li>Mena, J. E. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser+capture+microdissection+after+%CE%B3-glutamyl+transferase+histochemistry%3A+An+optimization+for+gene+expression+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Biochem%22%5BJournal%5D)">Laser capture microdissection after γ-glutamyl transferase histochemistry: An optimization for gene expression analysis.</a> Anal Biochem. 447, 126-132 (2014).</li>
<li>Liu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Next-generation+RNA+Sequencing+of+Archival+Formalin-fixed+Paraffin-embedded+Urothelial+Bladder+Cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+Urol%22%5BJournal%5D)">Next-generation RNA Sequencing of Archival Formalin-fixed Paraffin-embedded Urothelial Bladder Cancer.</a> Eur Urol. 66 (6), 982-986 (2014).</li>
<li>Ludyga, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nucleic+acids+from+long-term+preserved+FFPE+tissues+are+suitable+for+downstream+analyses%5BTitle%5D)+AND+%22Virchows+Arch%22%5BJournal%5D)">Nucleic acids from long-term preserved FFPE tissues are suitable for downstream analyses.</a> Virchows Arch. 460 (2), 131-140 (2012).</li>
<li>Mägel, L., Bartels, S., Lehmann, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Next-Generation+Sequencing+Analysis+of+Laser-Microdissected+Formalin-Fixed+and+Paraffin-Embedded+%28FFPE%29+Tissue+Specimens%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Next-Generation Sequencing Analysis of Laser-Microdissected Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded (FFPE) Tissue Specimens.</a> Methods Mol Biol. 1723, 111-118 (2018).</li>
<li>Von Ahlfen, S., Missel, A., Bendrat, K., Schlumpberger, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Determinants+of+RNA+Quality+from+FFPE+Samples%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Determinants of RNA Quality from FFPE Samples.</a> PLoS One. 2 (12), e1261(2007).</li>
<li>Böhm, M., Wieland, I., Schütze, K., Rübben, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microbeam+MOMeNT%3A+non-contact+laser+microdissection+of+membrane-mounted+native+tissue%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Pathol%22%5BJournal%5D)">Microbeam MOMeNT: non-contact laser microdissection of membrane-mounted native tissue.</a> Am J Pathol. 151 (1), 63-67 (1997).</li>
<li>Schütze, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cut+out+or+poke+in--the+key+to+the+world+of+single+genes%3A+laser+micromanipulation+as+a+valuable+tool+on+the+look-out+for+the+origin+of+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Genet+Anal%22%5BJournal%5D)">Cut out or poke in--the key to the world of single genes: laser micromanipulation as a valuable tool on the look-out for the origin of disease.</a> Genet Anal. 14 (1), 1-8 (1997).</li>
<li>Datta, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser+capture+microdissection%3A+Big+data+from+small+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Histol+Histopathol%22%5BJournal%5D)">Laser capture microdissection: Big data from small samples.</a> Histol Histopathol. 30 (11), 1255-1269 (2015).</li>
<li>Desjardins, P., Conklin, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((NanoDrop+microvolume+quantitation+of+nucleic+acids%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">NanoDrop microvolume quantitation of nucleic acids.</a> J Vis Exp. (45), e2565(2010).</li>
<li>Ge, S. J., Gan, W. Q., Karlinsey, K., Zhou, B. Y., Pachter, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Immuno-laser+capture+microdissection+of+perfusion-fixed+mouse+brain+tissue+coupled+to+RNA-seq%5BTitle%5D)+AND+%22J+Neurosci+Methods%22%5BJournal%5D)">Immuno-laser capture microdissection of perfusion-fixed mouse brain tissue coupled to RNA-seq.</a> J Neurosci Methods. 423, 110548(2025).</li>
<li>Takahashi, K., Beltran, W. A., Sudharsan, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+optimized+workflow+for+transcriptomic+analysis+from+archival+paraformaldehyde-fixed+retinal+tissues+collected+by+laser+capture+microdissection%5BTitle%5D)+AND+%22Exp+Eye+Res%22%5BJournal%5D)">An optimized workflow for transcriptomic analysis from archival paraformaldehyde-fixed retinal tissues collected by laser capture microdissection.</a> Exp Eye Res. 246, 109989(2024).</li>
<li>Mahalingam, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser+Capture+Microdissection%3A+Insights+into+Methods+and+Applications%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Laser Capture Microdissection: Insights into Methods and Applications.</a> Methods Mol Biol. 1723, 1-17 (2018).</li>
<li>Kim, S. O., Kim, J., Okajima, T., Cho, N. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanical+properties+of+paraformaldehyde-treated+individual+cells+investigated+by+atomic+force+microscopy+and+scanning+ion+conductance+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Converg%22%5BJournal%5D)">Mechanical properties of paraformaldehyde-treated individual cells investigated by atomic force microscopy and scanning ion conductance microscopy.</a> Nano Converg. 4 (1), (2017).</li>
<li>Erickson, H. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+RT-PCR+gene+expression+analysis+of+laser+microdissected+tissue+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Quantitative RT-PCR gene expression analysis of laser microdissected tissue samples.</a> Nat Protoc. 4 (6), 902-922 (2009).</li>
<li>Pan, D. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser+Capture+Microdissection-Based+RNA+Microsequencing+Reveals+Optic+Nerve+Crush-Related+Early+mRNA+Alterations+in+Retinal+Ganglion+Cell+Layer%5BTitle%5D)+AND+%22Transl+Vis+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Laser Capture Microdissection-Based RNA Microsequencing Reveals Optic Nerve Crush-Related Early mRNA Alterations in Retinal Ganglion Cell Layer.</a> Transl Vis Sci Technol. 9 (11), 30(2020).</li>
<li>Civita, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser+Capture+Microdissection+and+RNA-Seq+Analysis%3A+High+Sensitivity+Approaches+to+Explain+Histopathological+Heterogeneity+in+Human+Glioblastoma+FFPE+Archived+Tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Oncol%22%5BJournal%5D)">Laser Capture Microdissection and RNA-Seq Analysis: High Sensitivity Approaches to Explain Histopathological Heterogeneity in Human Glioblastoma FFPE Archived Tissues.</a> Front Oncol. 9, 482(2019).</li>
<li>Phan, H. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+RNA+sequencing+of+paraformaldehyde-fixed+single+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">High-throughput RNA sequencing of paraformaldehyde-fixed single cells.</a> Nat Commun. 12 (1), 5636(2021).</li>
<li>Thomsen, E. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fixed+single-cell+transcriptomic+characterization+of+human+radial+glial+diversity%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Fixed single-cell transcriptomic characterization of human radial glial diversity.</a> Nat Methods. 13 (1), 87-93 (2016).</li>
<li>Lin, X. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comparative+analysis+of+RNA+sequencing+methods+with+ribosome+RNA+depletion+for+degraded+and+low-input+total+RNA+from+formalin-fixed+and+paraffin-embedded+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Bmc+Genomics%22%5BJournal%5D)">A comparative analysis of RNA sequencing methods with ribosome RNA depletion for degraded and low-input total RNA from formalin-fixed and paraffin-embedded samples.</a> Bmc Genomics. 20 (1), 831(2019).</li>
<li>Luzzi, V., Mahadevappa, M., Raja, R., Warrington, J. A., Watson, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Accurate+and+reproducible+gene+expression+profiles+from+laser+capture+microdissection%2C+transcript+amplification%2C+and+high+density+oligonucleotide+microarray+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Accurate and reproducible gene expression profiles from laser capture microdissection, transcript amplification, and high density oligonucleotide microarray analysis.</a> J Mol Diagn. 5 (1), 9-14 (2003).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td><fuerte>Material</fuerte></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Tubos de pared fina de 0,2 ml</td><td>Axygen</td><td>PCR-02-C</td><td>Tubos para la colección de LCM</td></tr><tr><td>Tubo centrífugo de 1,5 mL</td><td>Axygen</td><td>339653</td><td></td></tr><tr><td>4% de paraformaldehído</td><td>Leagene</td><td>DF0135</td><td></td></tr><tr><td>Tubo centrífugo de 50 mL</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>339653</td><td></td></tr><tr><td>DEPC (pirocarbonato dietílico)</td><td>Sigma</td><td>D-5758</td><td></td></tr><tr><td>Conjunto digestivo DNasa I</td><td>Qiagen</td><td>73504</td><td>Componente del kit FFPE RNeasy incluye la solución de DNase I stock y el buffer DNase Booster</td></tr><tr><td>Etanol (100%)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>BP2818</td><td>Purificado para biología molecular</td></tr><tr><td>Amortiguador de lavado a base de etanol</td><td>Qiagen</td><td>73504</td><td>RPE de búfer (componente del kit FFPE RNeasy)</td></tr><tr><td>Amortiguador de lavado con alto contenido de sal</td><td>Qiagen</td><td>73504</td><td>RBC de búfer (componente del kit FFPE RNeasy)</td></tr><tr><td>Cuchillas de microtomo de perfil bajo</td><td>Leica Biosystems</td><td>819</td><td></td></tr><tr><td>Mayer' s hematoxilina</td><td>Leagene</td><td>DH0001</td><td></td></tr><tr><td>Compuesto OCT</td><td>Sakura</td><td>4583</td><td></td></tr><tr><td>Portaobjetos recubiertos de membrana PEN</td><td>Leica</td><td>11505188</td><td></td></tr><tr><td>Solución salina tamponada con fosfato</td><td>Leagene</td><td>CC0010</td><td>Libre de DNasa/RNasa</td></tr><tr><td>Poli-L-lisina</td><td>Macklin</td><td>P875131S</td><td></td></tr><tr><td>Buffer de digestión K de la proteinasa</td><td>Qiagen</td><td>73504</td><td>PKD de búfer (componente del kit RNeasy FFPE)</td></tr><tr><td>Columna de purificación</td><td>Qiagen</td><td>73504</td><td>Columna de spin RNeasy MinElute (componente del kit RNeasy FFPE)</td></tr><tr><td>Mezcla maestra cuantitativa por PCR</td><td>Biografía de Takara</td><td>RR820A</td><td>TB Green Premix Ex Taq II (Tli RNaseH Plus)</td></tr><tr><td>Kit de transcripción inversa</td><td>Qiagen</td><td>205411</td><td>Kit de transcripción inversa QuantiNova</td></tr><tr><td>Kit de extracción de ARN</td><td>Qiagen</td><td>73504</td><td>RNeasy FFPE Kit</td></tr><tr><td>Kit de secuenciación de ARN (Baja entrada, bloqueado)</td><td>Biografía de Takara</td><td>634412</td><td>Kit SMARTer de RNA-seq total en cadena - mamífero con entrada pico v2</td></tr><tr><td>Agente de descontaminación de RNasa</td><td>Solarbio</td><td>SR0040</td><td>Limpieza</td></tr><tr><td>Sacarosa</td><td>Macklin</td><td>S818049</td><td></td></tr><tr><td><fuerte>Animales y Dieta</fuerte></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Ratón: C57BL/6J</td><td>Centro de Animales de Laboratorio de la provincia de Guangdong</td><td>03</td><td></td></tr><tr><td><Dieta > Especial y Fuerte Beber agua</fuerte></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Dieta alta en grasas y deficiente en colina (Dieta base)</td><td>TROPHIC Animal Feed High-Tech Co., Ltd.</td><td>TP36310M</td><td>Macronutrientes: proteína, 14 kcal%; carbohidratos, 26 kcal%; grasa, 60 kcal%</td></tr><tr><td>Agua potable con azúcar</td><td>Macklin</td><td>N/A (preparado internamente)</td><td>Se añadió una mezcla de D-glucosa (Macklin, Cat# F87500) y D-fructosa (Macklin, Cat# S818049) al agua potable autoclavada a una concentración final de 42 g/L, con una proporción glucosa-fructosa de 55:45 (p/w)</td></tr><tr><td><Primers fuertes>Ratón</fuertes></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>&beta;-actin (Adelante: AGAGGGAATCGTGCGTGAC)</td><td>Secuenciación BGI</td><td>Personalizado</td><td>HPLC purificado</td></tr><tr><td>&beta;-actin (reverso: CAATAGTGATGACCTGGCCGT)</td><td>Secuenciación BGI</td><td>Personalizado</td><td>HPLC purificado</td></tr><tr><td><fuerte>Equipo</fuerte></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Microtomo criostato</td><td>Leica Biosystems</td><td>CM3050 S</td><td></td></tr><tr><td>Sistema de bioanalizadores</td><td>Agilent</td><td>G2939BA</td><td></td></tr><tr><td>Plataforma de secuenciación de alto rendimiento</td><td>Illumina; Inc.</td><td>Sistema NovaSeq 6000</td><td></td></tr><tr><td>Sistema de microdisección por captura láser</td><td>Leica Microsystems</td><td>Leica LMD6500</td><td></td></tr><tr><td>Sistema de PCR cuantitativa</td><td>Biosistemas Aplicados</td><td>Sistema de PCR en tiempo real QuantStudio 5</td><td></td></tr><tr><td>Espectrofotómetro</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>NP80</td><td>NanoDrop</td></tr><tr><td>Thermal Cycler</td><td>BioRad</td><td>T100</td><td></td></tr><tr><td><fuerte>Software</fuerte></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Adobe Illustrator CC 2019 (versión 23.0.2)</td><td>Adobe</td><td>https://www.adobe.com/products/illustrator.html</td><td></td></tr><tr><td>GraphPad Prism (versión 8.3.0)</td><td>GraphPad Software</td><td>https://www.graphpad.com</td><td></td></tr></tbody></table>

microdisección por captura láser de tejido hepático de ratón fijado con paraformaldehído para análisis de arn

Laser Capture Microdissection of Paraformaldehyde-Fixed Mouse Liver Tissue for RNA Analysis

Microdisección por captura láser de tejido hepático de ratón fijado con paraformaldehído para análisis de ARN

Laser capture microdissection (LCM) provides spatial access to specific cell populations within complex tissues through in situ visualization and ...

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Investigación

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Biology

Biología

El perfilado de la expresión de ARN en regiones cerebrales discretas del ratón requiere una estrategia precisa y reproducible de recolección de tejido. Aquí se describe un protocolo que utiliza tanto la sección coronal del cerebro como la microdisección asistida por punzón tisular. El rendimiento y la calidad del ARN total obtenido a partir de las muestras resultantes confirman la utilidad del método descrito.

Sin láser y de captura de enfoque de Microscopía de la microdisección de regiones discretas del cerebro del ratón para el aislamiento de ARN total y Downstream secuenciación de próxima generación y de perfiles de expresión génica

La expresión de genes de un subconjunto de células en un tejido específico representa un reto importante. En este artículo se describe cómo aislar el ARN total de alta calidad a partir de una población de células específicas mediante la combinación de un método immunolabeling rápida con láser captura microdissection.

Aislamiento de ARN a partir de células subpoblaciones específicas utilizando láser captura Microdissection Combinado con Rapid Immunolabeling

Aquí describimos un protocolo simplificado para análisis de expresión de microARN (miARN) en tejidos clínicos archivados de cáncer de próstata (PCa) fijados en formol, incluidos en parafina (FFPE) o congelados frescos que emplean PCR cuantitativa en tiempo real (RT-PCR) e hibridación in situ (ISH).

Los análisis de expresión de miRNA en tejidos clínicos sobre el cáncer de próstata

El objetivo de este protocolo es utilizar la microdisección de captura láser como un método eficaz para aislar poblaciones puras de tipos celulares de tejidos prostáticos heterogéneos para el análisis de ARN posterior.

Laser-captura microdisección de Human Prostática epitelio de Análisis de ARN

Aquí, describimos un protocolo para un microdissection de la captura del laser reproducible (LCM) para aislar la red trabecular (TM) para posteriores análisis de ARN. La capacidad de analizar los cambios en la expresión génica en el TM ayudarán en la comprensión de los mecanismos moleculares subyacentes de enfermedades oculares relacionadas con la TM.

Microdissection de la captura del laser de la malla Trabecular muy pura de ojos de ratón para análisis de expresión génica

Presentamos un método robusto, rentable y flexible para medir los cambios en el número de hepatocitos y la ploidía nuclear dentro de muestras de tejido fijo/crioconservado que no requieren citometría de flujo. Nuestro enfoque proporciona una poderosa firma de citología hepática en toda la muestra ideal para rastrear la progresión de las lesiones y enfermedades hepáticas.

Un método in situ de alto rendimiento para la estimación de la ploideide nuclear de hepatocitos en ratones

Se desarrolló un protocolo de microdisección de captura láser (LCM) para obtener una cantidad suficiente de ARN de alta calidad para el análisis de la expresión génica en células óseas. El estudio actual se centra en las secciones del fémur del ratón. Sin embargo, el protocolo LCM reportado aquí se puede utilizar para estudiar la expresión génica en células de cualquier tejido duro.

Un protocolo de microdisección de captura láser que produce ARN de alta calidad a partir de huesos de ratón congelados

La traducción de la purificación de afinidad ribosoma (TRAP) permite un aislamiento rápido y eficiente del ARNm de traducción específico del tipo de célula. Aquí, demostramos un método que combina la inyección hidrodinámica de cola-vena en un modelo de ratón de repoblación hepática y TRAP para examinar el perfil de expresión de los hepatocitos repoblados.

Perfilado de expresión génica específico del tipo de celda en el hígado del ratón

Este protocolo describe la microdisección de captura láser para el aislamiento del cartílago y el hueso de las secciones congeladas frescas del embrión del ratón. El cartílago y el hueso se pueden visualizar rápidamente mediante la tinción violeta de cresíl y se recogen con precisión para producir ARN de alta calidad para el análisis transcriptómico.

Microdisección de captura láser de cartílago embrionario de ratón y hueso para análisis de expresión génica

La microdisección láser (LMD) es una técnica sensible y altamente reproducible que se puede utilizar para descubrir vías que median la heterogeneidad e invasión del glioma. Aquí, describimos un protocolo optimizado para aislar áreas discretas del tejido glioma usando LMD láser seguido de análisis transcriptomático.

Microdisección de captura láser de las subregiones de Glioma para la caracterización espacial y molecular de la heterogeneidad intratumoral, los oncostreams y la invasión

Aquí se presenta un protocolo para la microdisección de captura láser (LCM) de tejidos vegetales. LCM es una técnica microscópica para aislar áreas de tejido de una manera libre de contaminación. El procedimiento incluye fijación de tejido, incrustación de parafina, seccionamiento, LCM y extracción de ARN. El ARN se utiliza en el análisis de transcriptomas de transcriptomas específicos del tejido aguas abajo y resueltos temporalmente.

Secuenciación de ARN-Secuenciación de ARN-Captura láser para Análisis de Expresión Genética Espacial y Temporal Específica de Tejidos en Plantas

Aprende microdisección por captura láser de hígado de ratón fijado con paraformaldehído para análisis transcriptómico de ARN. Este protocolo permite aislar poblaciones celulares específicas con alta pureza e integridad de ARN para qPCR y secuenciación.

Microdisección por captura láser de tejido hepático de ratón fijado con paraformaldehído para análisis de ARN

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