Name: Software de Mapeo de Parámetros Microgliales (MMPS): Una herramienta de código abierto y fácil de usar para el análisis cuantitativo de la morfología de la microglía (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-07-24T12:55:00.000+00:00
Duration: 8 min 35 s
Description: Aprende a utilizar MMPS, un software de código abierto basado en Python, para analizar cuantitativamente la morfología microglial a nivel de célula única. Esta herramienta permite detectar cambios morfológicos asociados a la neuroinflamación en modelos animales.

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<table><tbody><tr><td>12-well plate</td><td>Fisher Scientific</td><td>07-200-82</td><td>Plato utilizado para la incubación y lavado de secciones de tejido.</td></tr><tr><td>Aluminio</td><td>Fisher Scientific</td><td>01-213-101</td><td>Usado para proteger muestras fluorescentes de la exposición a la luz.</td></tr><tr><td>Antigen Retrieval Buffer (10&times;)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>00-4955-58</td><td>Usado para mejorar la accesibilidad del antígeno durante la tinción de inmunofluorescencia.</td></tr><tr><td>Anti-Iba1 anticuerpo primario</td><td>FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation</td><td>019-19741</td><td>Anticuerpo primario utilizado para el etiquetado inmunofluorescente de microglía.</td></tr><tr><td>Criostato</td><td>Fisher Scientific</td><td>95-710-0L</td><td>Instrumento utilizado para seccionar tejido cerebral congelado en espesores definidos.</td></tr><tr><td>Donkey anti-Rabbit IgG, Alexa Fluor 555</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>A-21428</td><td>Anticuerpo secundario fluorescente utilizado para la visualización de anticuerpos primarios de conejo.</td></tr><tr><td>Donkey Serum</td><td>Fisher Scientific</td><td>50-413-115</td><td>Reactivo de bloqueo utilizado para reducir la unión no específica de anticuerpos.</td></tr><tr><td>EVOS FL Auto 2 Imaging System</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMAFD2000</td><td>Microscopio de fluorescencia utilizado para la adquisición de imágenes.</td></tr><tr><td>Fiji (ImageJ) 2.16.0</td><td>NIH</td><td>fiji.sc</td><td>Plataforma de procesamiento de imágenes utilizada para análisis morfológicos posteriores y plugins.</td></tr><tr><td>Fluoromount-G</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>00-4959-52</td><td>Medio de montaje utilizado para preservar la fluorescencia y asegurar las cubreobjetos.</td></tr><tr><td>Isoflurano</td><td>EntirelyPets Pharmacy</td><td>MWI502017</td><td>Anestésico inhalado utilizado durante procedimientos en animales.</td></tr><tr><td>Lipopolisacárido</td><td>Millipore Sigma</td><td>L2630</td><td>Usado para inducir neuroinflamación sistémica y activación de microglía en roedores.</td></tr><tr><td>Matplotlib</td><td>https://pypi.org/project/matplotlib/</td><td></td><td>Biblioteca de trazado de Python utilizada para la visualización de datos y generación de figuras.</td></tr><tr><td>MMPS (Mapping Microglial Parameters Software) v1.00</td><td>Este trabajo</td><td>https://github.com/NeurodegenerativePharmaceuticalLab/Mapping-Microglia-Parameters-Software/releases/tag/v1.00</td><td>Plataforma de software de código abierto desarrollada para el análisis de morfología de microglía.</td></tr><tr><td>Net wells</td><td>Millipore Sigma</td><td>CLS3477</td><td>Insertos utilizados para mantener secciones de tejido flotando libremente durante los procedimientos de tinción.</td></tr><tr><td>Numpy</td><td>https://pypi.org/project/numpy/</td><td></td><td>Biblioteca de Python utilizada para cálculos numéricos dentro de MMPS.</td></tr><tr><td>Objective lens (4&times;)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMEP4922</td><td>Objetivo de baja magnificación utilizado para orientación anatómica e identificación de regiones.</td></tr><tr><td>Objective lens (40&times;)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMEP4625</td><td>Objetivo de alta magnificación utilizado para la imagen de la morfología de microglía.</td></tr><tr><td>opencv-python</td><td>https://pypi.org/project/opencv-python/</td><td></td><td>Biblioteca de visión computacional utilizada para funciones de procesamiento de imágenes dentro de MMPS.</td></tr><tr><td>Paraformaldehído</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>169650025</td><td>Fijador utilizado para la perfusión de tejidos y preservación antes de la sección.</td></tr><tr><td>Permount</td><td>Fisher Scientific</td><td>SP15-100</td><td>Medio de montaje permanente utilizado para la preservación de portaobjetos.</td></tr><tr><td>Phosphate-buffered saline</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP3991</td><td>Solución tampón utilizada para el lavado de tejidos y preparación de reactivos.</td></tr><tr><td>Pillow</td><td>https://pypi.org/project/Pillow/</td><td></td><td>Biblioteca de imágenes de Python utilizada para operaciones de procesamiento de imágenes.</td></tr><tr><td>PyQt5</td><td>https://pypi.org/project/PyQt5/</td><td></td><td>Marco de GUI de Python utilizado para generar la interfaz de usuario gráfica de MMPS.</td></tr><tr><td>Python 3.11</td><td>Python Software Foundation</td><td>python.org</td><td>Entorno de lenguaje de programación utilizado para desarrollar y ejecutar MMPS.</td></tr><tr><td>R 4.3.2</td><td>R Foundation for Statistical Computing</td><td>r-project.org</td><td>Software estadístico utilizado para el análisis de datos y la generación de gráficos.</td></tr><tr><td>Scikit-image</td><td>https://pypi.org/project/scikit-image/</td><td></td><td>Biblioteca de análisis de imágenes de Python utilizada para el procesamiento y segmentación de imágenes.</td></tr><tr><td>Scipy</td><td>https://pypi.org/project/scipy/</td><td></td><td>Paquete de computación científica de Python utilizado para operaciones de filtrado y procesamiento de imágenes.</td></tr><tr><td>Sprague-Dawley Rats</td><td>Evingo</td><td>002</td><td>Animales experimentales utilizados para la validación del modelo de neuroinflamación.</td></tr><tr><td>Sacarosa</td><td>Fisher Scientific</td><td>S5-3</td><td>Crioprotector utilizado antes de congelar el tejido cerebral.</td></tr><tr><td>Tifffile</td><td>https://pypi.org/project/tifffile/</td><td></td><td>Paquete de Python utilizado para leer y escribir archivos de imagen TIFF.</td></tr><tr><td>Tissue-Tek O.C.T. Compound</td><td>Sakura Finetek</td><td>4583</td><td>Medio de inclusión utilizado para la criosección de muestras de tejido congelado.</td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP151-100</td><td>Detergente utilizado para la permeabilización de membranas durante la inmunofluorescencia.</td></tr></tbody></table>

software de mapeo de parámetros microgliales (mmps): una herramienta de código abierto y fácil de usar para el análisis cuantitativo de la morfología de la microglía

Mapping Microglial Parameters Software (MMPS): An Open-Source, User-Friendly Tool for Quantitative Microglia Morphology Analysis

Software de Mapeo de Parámetros Microgliales (MMPS): Una herramienta de código abierto y fácil de usar para el análisis cuantitativo de la morfología de la microglía

Microglia are myeloid-derived immune cells of the central nervous system that mediate tissue degradation and remodeling following neurological injury and ...

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Research

Investigación

JoVE Journal

Neuroscience

Neurociencia

Fuente: Etienne, F. et al. Imágenes de dos fotones de la atracción de los procesos microgliales hacia el ATP o la serotonina en cortes agudos de cerebro. J. Vis. Exp. (2019)Este video demuestra el uso de la microscopía de dos fotones para estudiar la atracción de los procesos microgliales hacia un compuesto inyectado en cortes de cerebro. Proporciona una descripción general de la preparación de cortes de cerebro de ratón, la inyección de un compuesto de prueba quimioatrayente y la obtención de...

Microscopía de dos fotones para estudiar la atracción del proceso microglial hacia un compuesto en un corte de cerebro de ratón

Una clave para el éxito de la investigación de la biología microglial es la preservación de immunofunction microglial ex vivo durante el aislamiento del tejido del SNC. Aislar microglia mediante agitación rotatoria resultados en cultivos de células de alta pureza y inmunofuncional según la evaluación de imágenes fluorescentes, inmunocitoquímica y ELISA después de la activación microglia con el lipopolisacárido estímulos proinflamatorias (LPS) y Pam 3 CSK 4 (Pam).

Aislamiento de cortical Microglia con Inmunofenotipo Conservas y funcionalidad de murinos Neonatos

La microglía son las células inmunes residentes del sistema nervioso central (SNC) con una alta capacidad de fagocitar o material de envolver en su entorno extracelular. Aquí, se describe un ensayo ampliamente aplicable, fiable, y altamente cuantitativo para visualizar y medir la microglia mediada por inmersión de componentes sinápticas.

Un ensayo de Inmersión en: Un Protocolo para Evaluar Interacciones entre CNS fagocitos y neuronas

La activación de la microglia y microgliosis son respuestas clave a la neurodegeneración crónica. A continuación, presentamos los métodos para in vivo, visualización a largo plazo de la retina células microgliales CX3CR1-GFP + por oftalmoscopía confocal y de umbral y los análisis morfométricos para identificar y cuantificar su activación. Hacemos un seguimiento de los cambios microgliales durante las primeras etapas del glaucoma relacionada con la edad.

En Vivo Dinámica de Retina Microglial Activación Durante Neurodegeneración: Confocal oftalmoscópico Imaging y Morfometría celular en el ratón Glaucoma

Este protocolo proporciona un análisis de las subpoblaciones de macrófagos en el sistema nervioso central del ratón adulto mediante citometría de flujo y es útil para el estudio de múltiples marcadores expresados ​​por estas células.

Análisis de microglia y macrófagos derivados de monocitos del sistema nervioso central por citometría de flujo

Microglía son células inmunes del cerebro que encuesta y reaccionan a la fisiología alterada del cerebro a través de cambios morfológicos que pueden evaluarse cuantitativamente. Este protocolo describe un ImageJ basado en protocolos de análisis para representar la morfología de la microglia como datos continuos según métricas tales como ramificación de la célula, la complejidad y la forma.

Cuantificar la morfología de la microglía de microfotografías de la inmunohistoquímica preparado tejido con ImageJ

Este protocolo describe un flujo de trabajo paso a paso para la costaría inmunofluorescente de IBA1 y TMEM119, además del análisis de la densidad microglial, la distribución y la morfología, así como la infiltración de células mieloides periféricas en el tejido cerebral del ratón.

Tinción de inmunofluorescencia utilizando IBA1 y TMEM119 para la densidad microglial, morfología y análisis de infiltración de células mieloides periféricas en el cerebro del ratón

Aquí, describimos un protocolo que combina la inyección de virus adenoasociados con la implantación de ventana craneal para obtener imágenes simultáneas de la dinámica microglial y la actividad neuronal en ratones despiertos.

Imágenes simultáneas de la dinámica microglial y la actividad neuronal en ratones despiertos

Aquí presentamos dos protocolos para cuantificar el envolvimiento microglial de sinapsis positivas para vGLUT1 y sinaptosomas crudos marcados con pHRodo Red mediante citometría de flujo.

Cuantificación de la envolvimiento microglial de material sináptico mediante citometría de flujo

Este artículo demuestra un método para visualizar y cuantificar la motilidad y el contacto de la microglía con puntos postsinápticos en la retina mediante microscopía confocal de disco giratorio.

Imágenes en vivo y caracterización de la dinámica de la microglía e interacciones con sinapsis en retina murina enferma

Este protocolo combina la citometría de flujo y la secuenciación de ARN unicelular para aislar y caracterizar los estados de las células microgliales en el cerebelo de los cerebros de ratones postnatales tempranos. Utiliza la disociación enzimática, la centrifugación de Percoll y la inmunotinción para revelar la heterogeneidad de la microglía y mejorar la comprensión de sus funciones en el desarrollo y la enfermedad del cerebelo.

Citometría de flujo y análisis unicelular para caracterizar la activación de la microglía en el desarrollo temprano del cerebro de ratón posnatal

Aprende a utilizar MMPS, un software de código abierto basado en Python, para analizar cuantitativamente la morfología microglial a nivel de célula única. Esta herramienta permite detectar cambios morfológicos asociados a la neuroinflamación en modelos animales.

Software de Mapeo de Parámetros Microgliales (MMPS): Una herramienta de código abierto y fácil de usar para el análisis cuantitativo de la morfología de la microglía (Video) | JoVE Journal

Software de Mapeo de Parámetros Microgliales (MMPS): Una herramienta de código abierto y fácil de usar para el análisis cuantitativo de la morfología de la microglía

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