Une introduction au métabolisme cellulaire

Métabolisme cellulaire se réfère aux réactions métaboliques vitales qui se produisent dans une cellule. Quand la plupart des gens pensent « métabolisme », ils associent le « brûler » ou de la rupture vers le bas des éléments nutritifs. Toutefois, en biologie cellulaire, métabolisme comprend « catabolisme », soit la rupture des molécules et « anabolisme », qui est la synthèse de nouveaux composés biologiques. Ces processus fournissent des cellules avec énergie et aident à construire leurs composantes, respectivement.

Cette vidéo va se plonger dans les grandes découvertes qui ont contribué à notre compréhension du métabolisme cellulaire. Nous allons suivre cela vers le haut avec un examen des questions clés dans le champ, et certaines des techniques actuellement utilisées pour l’étude des voies métaboliques.

Nous allons plonger dans la riche histoire du métabolisme cellulaire.

Entre 1770 et 1805, quatre chimistes effectué des expériences clés, qui a permis d’expliquer comment les plantes produisent « masse » à se développer. Leur travaux ont conduit à la réaction de la base de la photosynthèse, qui a établi qu’en plein soleil, plantes prennent dans l’eau et de dioxyde de carbone et produisent de l’oxygène et matières organiques. Plus tard dans les années 1860, Julius von Sachs a déterminé que cette matière organique était amidon, qui est composé du glucose sucre.

Ainsi, les plantes produisent du sucre. Mais, nous en consommons. Que se passe-t-il au sucre dans notre corps ? Une réponse potentielle est venu dans les années 1930, quand Gustav Embden, Otto Meyerhof et Jacob Parnas décrivent la glycolyse, la voie qui décompose le glucose en pyruvate. Nous savons maintenant que la glycolyse produit également de l’adénosine triphosphate ou ATP.

Structure de l’ATP a été déterminée en 1935 dans le laboratoire de Meyerhof par Karl Lohmann. Meyerhof et Lohmann proposent que ATP pourrait « stocker » l’énergie, qui a été confirmé par Fritz Lipmann en 1941, qui a identifié les liaisons riches en énergie ATP et fourni une théorie par laquelle ces obligations pourraient être exploitées au cours de la biosynthèse.

En parallèle, Hans Krebs a trouvé que l’oxydation du glucose ou du pyruvate peut être stimulée par un certain nombre d’acides, qui sont une partie des réactions cycliques, formant le cycle des acides tricarboxyliques, abrégé comme le cycle de Krebs. Sa contribution majeure était notant que le pyruvate et l’oxaloacétate pourraient être converties en citrate, qui a donné à cette série d’oxydation sa forme cyclique.

En 1946, Lipmann et Nathan Kaplan encore élucidé la réaction de conversion pyruvate au citrate avec leur découverte de la coenzyme a. Nous savons maintenant que pyruvate interagit avec cette enzyme pour former l’acétyl-coenzyme A, qui lance le cycle de Krebs.

Plus tard, entre les années 1950 et 1970, les chercheurs ont déterminé qu’électrons libérés pendant le cycle de Krebs « transportables » pour des complexes de protéine situées dans les mitochondries dans une voie appelée la chaîne de transport d’électrons. Ce qui est important, en 1961, Peter Mitchell a proposé que le transfert d’électrons entre ces complexes produit un proton « gradient » qui pourrait conduire à la production de la majorité de l’ATP de la cellule.

Pris ensemble, les découvertes de la photosynthèse, la glycolyse, le cycle de Krebs et la chaîne de transport d’électrons ont constitué la base sur des études qui aujourd'hui reste maintenant le métabolisme cellulaire.

Bien que ces découvertes historiques ont donné un immense aperçu des voies métaboliques, ils ont aussi stimulé plusieurs questions. Passons en revue certains de ceux qui restent sans réponse.

Aujourd'hui, les chercheurs se penchent à comment métaboliques sont affectés par des facteurs de stress environnementaux comme les toxines ou la radiothérapie. En particulier, il y a intérêt à comment ces facteurs se traduisent par la production anormale des espèces réactives de l’oxygène comme les radicaux libres, qui possèdent des électrons non appariés sur les atomes d’oxygène, ce qui les rend très réactives. Ces molécules peuvent endommager d’autres composants cellulaires et conduire à un stress oxydatif.

Le stress oxydatif a été impliqué dans la mort et de la sénescence cellulaire, ainsi que dans l’initiation et la progression du cancer. Par conséquent, les biologistes cellulaires sont intéressées pour déterminer comment ces espèces réactives affectent les processus physiologiques normaux de la cellule, comme la division cellulaire. Avec cette information, ils peuvent encore déduire le rôle de ces espèces dans des manifestations pathologiques.

Enfin, plusieurs chercheurs s’intéressent à des troubles métaboliques, des conditions dans lesquelles les réactions métaboliques spécifiques sont perturbées. Il s’agit de maladies comme le diabète, où le corps est incapable de métaboliser le sucre. Les chercheurs tentent actuellement d’identifier les facteurs, tels que les gènes ou les signaux environnementaux, qui contribuent à ces maladies. Cela les aidera dans le développement de thérapies plus efficaces pour les patients.

Maintenant que vous avez entendu parler de quelques problèmes pressants dans le domaine du métabolisme cellulaire, passons en revue les techniques expérimentales scientifiques utilisent pour y remédier.

Le but ultime de nombreux processus cataboliques dans des cellules vivantes est de générer de l’ATP, qui est la molécule de stockage d’énergie primaire utilisée par les cellules. Techniques telles que le test ATP bioluminescence, qui quantifie ATP dans un échantillon à l’aide d’une réaction de luminescence, peuvent donc, donnent un aperçu de l’activité métabolique des cellules.

Autres méthodes de se concentrent sur certaines voies métaboliques. Par exemple, les chercheurs peuvent évaluer le métabolisme du glycogène en son glucose monomère. Une façon de faire ceci est de traiter le glucose provenant de glycogène dans les produits qui réagissent avec les sondes de détection et induire un changement de couleur ou de la fluorescence. De cette façon, les chercheurs peuvent calculer combien glycogène était initialement présent dans leurs échantillons.

En revanche, le métabolisme anormal peut être détecté en mesurant des espèces réactives de l’oxygène. Généralement, les chercheurs utilisent une sonde qui émet une fluorescence après avoir été « attaqués » par un membre de ces espèces. Ces analyses directement quantifier la quantité de métabolites réactifs de l’oxygène et donc aident à la détection du stress oxydatif.

Enfin, les chercheurs analysent métabolisme au niveau organismique de « Profilage métabolique ». Avec l’aide de méthodes avancées telles que la chromatographie liquide haute performance ou HPLC et spectrométrie de masse ou MS, les scientifiques peuvent quantifier les métabolites présents dans les échantillons biologiques et déterminer si certaines voies métaboliques sont au point mort ou hyperactivité.

Avec tous ces outils à leur disposition, nous allons voir comment les scientifiques eux mettent à usage expérimental.

Certains scientifiques appliquent ces méthodes pour développer de nouvelles façons de diagnostiquer des troubles métaboliques. Ici, un protocole a été développé afin d’isoler les cellules mononucléaires du sang périphérique ou PBMC, provenant d’échantillons de sang de patients afin d’évaluer leur teneur en glycogène. En utilisant un test de coloration spécifique du métabolisme du glycogène, chercheurs acquis dans la quantité de glycogène présent dans ces échantillons. À l’avenir des applications, cette technique pourrait aider diagnostiquer les patients souffrant de maladies métaboliques de glycogène.

D’autres chercheurs utilisent ces outils pour étudier l’effet du stress environnemental sur le métabolisme. Dans cette expérience, les scientifiques mesuré les espèces réactives de l’oxygène dans des embryons de poisson-zèbre traités avec une roténone chimique appelée, ou suite à une avarie à la queue. Cela a été fait à l’aide d’une sonde qui émet une fluorescence rouge quand pris pour cible par des espèces réactives de l’oxygène. Évaluation ultérieure des embryons entiers a révélé une production accrue de ces molécules en réponse à l’exposition de blessures et de produit chimique, suggérant un rôle protecteur de ces métabolites.

Enfin, les biologistes cellulaires étudient également les caractéristiques métaboliques des cellules cancéreuses. Ici, les chercheurs ont recueilli le contenu des cellules humaines de cancer du côlon et cet extrait l’objet métabolique de profilage à l’aide de HPLC et MS. Cela a permis aux chercheurs d’identifier des métabolites présents dans ce tissu malade.

Vous avez juste regardé des vidéo d’introduction de JoVE au métabolisme cellulaire. Nombreuses voies complexes décrivent l’activité métabolique des cellules, et maintenant vous savez comment ces voies ont été découverts, et comment recherches sont encore à essayer de déchiffrer les composants inconnus. Rappelez-vous, le métabolisme est bon, mais l’excès de quoi que ce soit peut être nocif. Comme toujours, Merci pour regarder !