La particule centrale du nucléosome

La particule de cœur du nucléosome se compose d'un octamère contenant quatre types d'histones, encerclés par une bobine d'ADN à gauche. Les particules de cœur du nucléosome jouent un rôle important dans la fonction de l'ADN en contrôlant le compactage de l'ADN et la structure de la chromatine. Ce rôle est si essentiel que les histones sont parmi les protéines les plus fortement conservées chez les eucaryotes, des pois aux vaches, et d'autres organismes.

Par exemple, il n'y a que deux acides aminés différents sur 102 entre les histones H4 d'une plante de pois et d'une vache. Les quatre types d'histones qui composent la particule de cœur du nucléosome, H2A, H2B, H3 et H4 partagent certaines caractéristiques. Tout d'abord, ils sont tous petits, contenant seulement jusqu'à 135 acides aminés.

Deuxièmement, ils partagent un motif structurel commun, le motif histone fold. L'histone fold se compose de trois hélices alpha reliées par deux boucles. Lorsque les particules de cœur du nucléosome sont assemblées, les histones fold se lient d'abord les uns aux autres dans une interaction décrite comme une poignée de main, formant deux dimères H2A, H2B et deux dimères H3, H4.Après cela, les dimères H3, H4 s'arrangent en tétramère, qui forme ensuite l'octamère de la particule de cœur du nucléosome avec les dimères H2A et H2B.

La structure de cet octamère d'histone engendre des interactions étendues entre les histones et l'ADN s'enroule autour d'eux. Il y a plus de 100 liaisons hydrogène entre les histones et l'ADN du cœur du nucléosome. Et beaucoup d'entre eux se trouvent entre les squelettes d'acides aminés des histones et le squelette de phosphate de sucre de l'ADN.

Enfin, de nombreux acides aminés dans chaque histone de cœur sont la lysine ou l'arginine, qui ont des charges positives qui neutralisent efficacement le squelette de l'ADN chargé négativement.