Réparation par excision de base longue

Chez les mammifères, un deuxième type de BER est observé, qui est souvent utilisé de préférence pendant une pénurie d'ATP, le long-patch BER. Au lieu de simplement retirer la base endommagée, le long-patch BER répare un patch de plusieurs nucléotides de long. Pour ce faire, une ADN polymérase différente, la delta-epsilon, ajoute plusieurs nucléotides qui déplacent les nucléotides d'origine.

Cela entraîne un débordement d'oligonucléotides appelé lambeau, qui contient la base endommagée. En présence d'un facteur de réplication appelé antigène nucléaire cellulaire proliférant, ou ANCP, une endonucléase spéciale, appelée flap endonucléase, FEN, enlève ce rabat avant qu'une ligase d'ADN ne ferme l'entaille. Le mécanisme long-patch BER est particulièrement utile pour réparer les dommages résultant du rayonnement ionisant.