Réparation par excision de base longue

Depuis la découverte des deux voies BER, il y a eu un débat sur la manière dont une cellule choisit une voie plutôt que sur l’autre et sur les facteurs déterminant cette sélection. De nombreuses expériences in vitro ont mis en évidence de multiples déterminants pour la sélection des sous-voies. Ceux-ci sont:

1. Type de lésion : Selon le type de dommage aux bases, une ADN glycosylase spécifique - mono ou bifonctionnelle, est recrutée sur le site endommagé. Alors que l’action séquentielle d’une glycosylase monofonctionnelle favorise les événements de réparation de patchs longs, la glycosylase bifonctionnelle entraîne un BER de patchs courts.
2. État du cycle cellulaire : les principaux participants protéiques qui distinguent le BER à patch long de la voie alternative du BER à patch court sont l'antigène nucléaire cellulaire en prolifération (PCNA), le facteur de réplication protéique C (RF-C) et la structure du lambeau. endonucléase spécifique 1 (FEN1). Le PCNA est particulièrement reconnu comme la cheville ouvrière de cette voie. Il agit à la fois comme échafaudage pour ancrer la polymérase sur le site endommagé et se lie au FEN-1 pour faciliter son activité nucléase. De plus, RF-C est nécessaire pour charger le PCNA sur l’ADN. Toutes ces protéines sont également nécessaires lors de la réplication de l'ADN, ce qui suggère que le BER à patch long répare les dommages causés à l'ADN en réplication, tandis que le patch court est utilisé pour réparer l'ADN au repos.
3. Pénurie d'ATP : il a également été observé que, même si le BER à nucléotide unique ou à patch court prédomine dans des conditions physiologiques normales, dans des conditions de pénurie d'ATP, la préférence se déplace vers le BER à patch long. En effet, le poly (ADP-ribose) peut servir de source unique d'ATP lors de l'étape de ligature du BER.