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1: test d'évitement osmotique.
- A propos de 16-24 heures avant le dosage, ramasser les animaux stade larvaire L4 de chaque génotype à une plaque de NGM frais contenant OP50 E. coli qu'il andincubate à 20 ° C. Le lendemain, commencer l'expérience avec de jeunes adultes.
- Il est recommandé d'effectuer le dosage "aveuglément". Les plaques avec chaque souche à doser doivent être réétiquetés par un second expérimentateur, réaliser le dosage en utilisant les plaques réétiquetés qui serait démasqué lorsque l'expérience est terminée.
- Le jour du dosage, préparer une solution stock de 4M de fructose avec 1% rouge Congo solution et dissoudre complètement à température ambiante. Nous vous recommandons de vérifier la solution avant chaque essai, depuis le colorant pourrait précipiter avec le temps.
- Anneau (1 cm de diamètre) sur la plaque NGM est décrit sur le centre du milieu solide, avec 15 ul de la solution de fructose 4M rouge. Laissez tremper la solution de fructose dans la gélose, ce qui prend généralement entre 2 et 5 minutes.
- Place individuelle des animaux adultes jeunes de chaque souche dans le ring et suivre au cours des 10 prochaines minutes pour déterminer la réponse à la barrière osmotique. Animaux en évitant l'anneau plus de six fois dans une rangée sont classés comme normaux, ceux de quitter le ring en moins de six tentatives sont considérés comme défectueux dans la sensibilité osmotique.
Note: La souche de contrôle doit être utilisé dans chaque essai. Animaux N2 jeunes adultes sont utilisés comme contrôles positifs car ils décisive éviter la barrière anneau. Les animaux qui ont été préalablement affamés, traversé Dauer larves ou viennent de plaques qui sont trop secs ne doivent pas être utilisés. Au début, les animaux de contrôle devraient être évalués en double exemplaire, pour confirmer que les plaques de dosage et la solution sont corrects.
2: Génération des vers knockdown en alimentant l'ARNi.
- ARNi plaques: les plaques d'alimentation NGM RNAi contient par litre: 17 g d'agar, 2,5 g de peptone, 3,0 g de NaCl, 1 ml de 5 mg de cholestérol ml -1; remplir le flacon à 1 litre avec H 2 O et autoclave. Après agar refroidit à environ 65 ° C, ajouter 25 ml de 1 M KPO 4, pH 6,0, 1 ml de 1 M CaCl 2, 1 ml de 1M MgSO 4, 0,5 ml de carbénicilline (50 mg ml -1) et 1 ml 1M IPTG. Si vous commencez avec le NGM solide préparé, faire fondre le milieu solide en micro-ondes et par la suite lieu NGM liquide sur le banc pour refroidir et ajouter ensuite KPO 4, pH 6,0, CaCl 2, MgSO 4, carbénicilline et IPTG comme indiqué précédemment.
Ajouter 10 ml de NGM dans chaque boîte de Pétri de 60 mm. Laisser refroidir et inverser les plaques en les maintenant au jour au lendemain avant d'utiliser RT. Les plaques peuvent être stockées dans un sac en plastique à 4 ° C pendant environ 4-5 jours. - Préparation bactérienne et de l'induction: Isoler les colonies de E. coli HT115 (DE3) souche, transformé avec L4440 vecteur contenant un fragment correspondant au gène cible, sur Luria-Bertani (LB) gélose (17 g d'agar, 10 g de tryptone, 5 g extrait de levure et 10 g de NaCl par litre) contenant de l'ampicilline (50 ug / ml) et la tétracycline (15 pg / ml).
Choisissez une colonie de bactéries et inoculer dans LB avec 50 pg / ml d'ampicilline et cultivé pour 6 8 h avec agitation à 37 ° C; semences une goutte de cette culture sur les plaques préparées NGM et sécher les plaques à fond avant d'être en incubation pendant la nuit ( 12 24 h) à température ambiante pour permettre aux bactéries de croître et de commencer à induction. L'incubation a été dans l'obscurité, car la tétracycline est sensible à la lumière et il peut affecter la variabilité des dosages ARNi dans les assiettes.
Il est nécessaire d'utiliser un positif et un contrôle négatif pour des expériences d'alimentation ARNi. Le contrôle positif est E.coli HT115 cellule transformée avec le vecteur contenant la séquence L4440-22 du gène unc. Le knockdown de l'UNC-22 gène produit un «phénotype tics». Le contrôle négatif est E.coli HT115 cellule transformée avec le vecteur L4440 vide. - La manipulation et la notation Worm: Le premier jour, place L4 vers l'étape d'une plaque de NGM ensemencé avec OP50 sur des plaques NGM sans bactéries et incuber à 20 ° C pendant 12 heures (à jeun).
Le lendemain, le transfert des jeunes adultes hermaphrodites jeûné sur une plaque seedded avec les bactéries exprimant l'ARNi spécifiques des gènes cibles. Laisser 40-48 heures à 20 ° C pour générer descendance F1.
Ensuite, placez quelques vers pour adultes F1 sur une autre plaque ensemencée avec la même bactérie. Après 24-48 heures, sélectionner et isoler de la descendance F2, les jeunes adultes (entièrement formée vulve saillante avec quelques œufs) et le score pour les phénotypes.
Remarque: l'induction d'ARNi dans les neurones ont quelques limitations en raison des propriétés réfractaires de la C elegans système nerveux de l'ARNi.. Pour surmonter les problèmes de cette inefficacité dans le neurone, il est recommandé d'utiliser la souche far-3, un fond d'hypersensibilité aux effets de l'ARNi dans les neurones 10. Dans nos expériences ne differences ont été trouvés entre Bristol N2 et far-3 souches pour les gènes et le phénotype analysé.
3: Les souches utilisées.
Le C. elegans souches utilisées dans ce travail sont présentés au tableau 1. Des souches mutantes ont été hors traversé l'encontre N2 sauvages - type au moins quatre fois pour enlever les mutations aléatoires qui auraient pu être générés au cours du protocole de mutagenèse.
. OP50 E coli souche a été suppliied par Caenorhabditis génétique Center, University of Minnesota, USA E.coli HT115 (DE3) avec le plasmide portant pL4440 NRX-1 (JA: C29A12.5). Et NLG-1 (JA: C40C9.5 fragments de gènes) ont été fournies par le Dr Peter Askjaer, Centro Andaluz de Biología del Desarrollo (CABD), CSIC Universidad Pablo Olavide, Séville, Espagne.
4: Les résultats représentatifs.
Résultats indicatifs sont représentés dans les figures 1 et 2. Dix animaux de chaque souche et un minimum de trois expériences répliques ont été réalisées.

Figure 1. Des expériences de comportement d'évitement osmotique.
Souches de contrôle et NRX-1 (ok1649 et tm1961) mutantworms V déficiente face en renversant en arrière quand ils rencontrent une barrière osmotique (4M fructose). NLG-1 (ok259 et tm474) X mutants ne parviennent pas à détecter cette barrière. Doubles mutants déficients en NLG-1 et NRX-1, les souches CRR21 (ok1649; ok259) VX et CRR23 (tm1961; ok259) VX récupéré le phénotype de type sauvage. Le * indique des différences significatives (P ≤ 0,001) par le t-test de d'étudiants, dans la réponse de chaque souche de la N2 Bristol type sauvage par le t-test de d'étudiants

Figure 2. Les expériences avec les vers knockdown en alimentant l'ARNi.
E.coli HT115 (DE3) transformées avec le vecteur vide ou contenant pL4440 un fragment correspondant aux gènes cibles NRX-1 ou NLG-1 ont été utilisés pour nourrir le ver souches différentes. Le * indique des différences significatives (P ≤ 0,001) par le t-test de d'étudiants, dans la réponse de la souche N2 nourris avec des bactéries portant le vecteur pL4440 avec un fragment de ciblage des NLG-1 du gène en comparaison avec la souche N2 nourris avec des vides pL4440 vectoriel .