1. Préparation des échantillons de microscopie
Note: Les cellules à observer par microscopie sont placées sur une gaine de microscope puis recouvertes d’un coussin d’agarose contenant des nutriments. La gaine de couverture est collée sur un cadre en plastique ou en métal pour assurer un support mécanique. En préparation de la microscopie, un grand tampon d’agarose/TPM/0,2 % CTT doit être préparé à l’avance, comme décrit aux étapes 2.1 à 2.3. Veuillez également consulter le tableau des matériaux pour les produits spécifiques utilisés ici.
1. Préparer 500 mL de tampon TPM (10 mM Tris-HCl pH 7,6, 1 mMKH, 2PO4 pH 7,6, 8 mMMgSO 4) et stériliser par autoclave ou filtre à l’aide d’un filtre à bout de bouteille.
NOTE: Le tampon stérile peut être conservé pendant plusieurs mois à température ambiante.
2. Préparer une solution microscopique d’agarose à 1 % contenant 0,2 % de CTT (mélanger 1 g d’agarose avec 80 mL de tampon TPM et 20 mL de milieu CTT à 1 %). Chauffez dans un four micro-ondes jusqu’à ce que l’agarose soit fondue.
NOTE: Le taux de 0,2 % de CTT suffit à permettre aux cellules de croître et à prévenir la famine. Des concentrations plus élevées de CTT dans le milieu microscopique entraînent une fluorescence de fond élevée.
3. Remplir une boîte de Petri avec l’agarose fondue jusqu’à une épaisseur de 0,5 cm (pour une boîte de Petri de 11,5 cm x 11,5 cm carrés, environ 60 mL d’agarose fondu sont nécessaires) et laisser refroidir à température ambiante.
NOTE: Le tampon d’agarose peut être conservé à 4 °C dans un environnement humide pendant jusqu’à 2 jours.
1. Préchauffer le tampon à 1 % d’agarose/TPM/0,2 % CTT à 32 °C pendant au moins 15 minutes avant utilisation.
NOTE: Pour préparer les cellules à la microscopie, suivez les étapes 2.4 à 2.8.
4. Placer une housse en verre stérile (60 mm x 22 mm, épaisseur : 0,7 mm) sur un cadre en plastique ou en métal comportant un trou au centre (Figure 1A) ; Ce cadre sert de support mécanique pour la fine couverture et aide à réduire la dérive lors de la microscopie. Fixez la gaine de couverture au cadre avec du ruban adhésif.
1. Pour préparer le cadre, découper un cadre de 75 mm × 25 mm à partir d’une plaque métallique de 1 mm d’épaisseur, puis découper un trou de taille appropriée (20 mm × 30 mm dans cette expérience) au centre.
5. Ajouter 10 à 20 μL de cellules de M. xanthus à croissance exponentielle sur la gaine.
6. Ajouter des microsphères fluorescentes de 0,5 μm comme marqueurs fiduciaux aux cellules pour simplifier le suivi des cellules ou des protéines lors des enregistrements en accéléré.
1. Diluer les microsphères 1:100 dans un tampon TPM et les conserver à 4 °C pendant plusieurs mois. Secouez soigneusement avant l’utilisation et ajoutez 5 à 10 μL des microspheres diluées aux cellules.
NOTE: Ici, des microspheres fluorescentes dans tous les canaux fluorescents courants bleu, vert, jaune et rouge étaient utilisées.
7. Découper un petit coussinet d’environ la taille de la housse du grand tampon préchauffé à 1 % d’agarose/TPM/0,2 % CTT et placez-le sur les cellules (Figure 1B). Placez une couche de couverture sur le coussinet d’agarose à 1 %, TPM et 0,2 % CTT pour éviter l’évaporation et maintenir les cellules dans un environnement humide.
NOTE: La seule couverture empêchera une évaporation significative pendant au moins 2 heures. Pour les enregistrements en accéléré prolongé, le tampon à 1 % d’agarose/TPM/0,2 % CTT et le sandwich de couverture doivent être scellés avec un film de paraffine pour éviter l’évaporation.
8. Incuber l’échantillon de microscopie à 32 °C pendant 15 à 20 minutes pour permettre aux cellules de s’attacher au fond du tampon d’agarose. Ensuite, commencez les enregistrements de la microscopie en accéléré.