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Article de méthode

Surveillance de la colonisation bactérienne des racines d’Arabidopsis thaliana dans un système sans sol

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31 mars 2026

Dans cet article

Résumé

Source : Harris, S. L., et al. Surveillance de la colonisation bactérienne et de l’entretien des racines d’Arabidopsis thaliana dans un système hydroponique flottant. J. Vis. Exp. (2019)

Cette vidéo démontre un protocole pour surveiller la colonisation de bactéries associées aux racines sur des semis d’Arabidopsis thaliana cultivés dans un système sans sol. Après la colonisation, les bactéries sont déplacées par sonication, puis diluées, placées et incubées pour former des colonies reflétant l’attachement et la viabilité bactériennes.

Protocole

Collecte de bactéries pour le comptage cellulaire viable

REMARQUE : Le nombre de bactéries par racine de semis peut être déterminé à n’importe quel moment d’incubation. La colonisation peut être suivie entre 0 h et 18 h, tandis que l’entretien peut être suivi à partir de 18 h.

  1. Retirez les semis du maillage (Figure 1, étape 5). Placez doucement des pinces stérilisées à la flamme sous les feuilles (mais du côté feuille de la treillette), et pincez légèrement la tige. Remontez les semis et éloignez-les du grillage pour déloger la racine sans la casser. Si la racine casse, grattez doucement le dessous du maillage pour en récu....

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Résultats

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Figure 1 : Analyse de colonisation bactérienne et d’entretien sur les racines d’A. thaliana . Les semis d’A. thaliana cultivés sur un maillage plastique stérilisé ont été transférés dans un milieu de croissance optimisé pour les b.......

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Plaques à 24 puitsBD Falcon1801343 
Flamme   
Pinces   
Incubateur  À température optimale pour la croissance de bactéries spécifiées
Eau stérile   
Ultrasonicateur   
Accessoire ultrasonicateur à 24 broches  Pour sonner plusieurs échantillons en même temps. Peut se faire individuellement
Perles de verre   
Multipetter/Repetter   
Plaques stériles à 96 puits  Pour les dilutions en série. Peut être remplacé par des tubes d’Eppendorf
Graines d’Arabidopsis thaliana  Nous recommandons le Arabidopsis Biological Resource Center pour les stocks de semences
Pseudomonas simiae WCS417r   

Mots-clés

Biofilm racinairerupture par sonicationdilution en s rietalement sur g losetalement aux billes de verreformation de coloniessonicateur multiprongue