1. Préparation des cellules HepG2 pour la production de virus de l'hépatite E dérivé de cultures cellulaires (HEVcc)
REMARQUE : Pour éviter toute contamination, la préparation des cellules, l'électroporation, l'infection, la récolte et la fixation des cellules ont été réalisées dans des conditions stériles dans un laboratoire de niveau de sécurité biologique 2. Les étapes d'incubation à 37 °C impliquant les cellules ont été effectuées dans un incubateur à 5 % de CO2.
- Pour préparer les cellules HepG2 en vue de la production de HEVcc (Figure 1), ensemencer les cellules dans un milieu de culture complet de Dulbecco (DMEM) (voir Tableau 1) sur une plaque de culture de 15 cm revêtue de collagène (voir Tableau 1, filtrer à l’aide d’un tamis de 0,2 µm une solution tampon phosphate (PBS) stérile acidifiée à l’acide acétique avant d’ajouter le collagène). Incuber à 37 °C jusqu’à ce que les cellules atteignent une confluence de 90 %.
REMARQUE : chaque plaque de 15 cm contenant des cellules à 90 % confluentes permettra d’obtenir suffisamment de cellules pour jusqu’à 4 électroporations. - Retirer délicatement le milieu de la plaque et laver les cellules une fois avec 10 mL de PBS 1x. Détacher les cellules par trypsination en ajoutant 3 mL de trypsine-EDTA à 0,05 % sur les cellules, puis incuber à 37 °C jusqu’à détachement complet. Resuspendre les cellules dans 10 mL de milieu DMEM complet et transférer la suspension cellulaire dans un tube de 50 mL. Déterminer le nombre total de cellules.
- Étant donné que chaque électroporation nécessite 5 x 106 cellules, transférer le volume approprié dans un nouveau tube de 50 mL et compléter à au moins 35 mL avec du PBS 1x. Centrifuger les cellules à 200 x g pendant 5 min, puis jeter soigneusement le surnageant sans perturber le culot cellulaire.
- Laver à nouveau les cellules une fois avec 35 mL de PBS 1x à 200 x g pendant 5 min. Placer les cellules sur de la glace et ne pas encore retirer le PBS 1x afin de maintenir les cellules en suspension.
2. Électroporation des cellules HepG2
- Pour l'électroporation des cellules HepG2 (Figure 2), préparer 400 µL de Cytomix complet par électroporation en complétant 384 µL de Cytomix (voir Tableau 1) avec 2 mM d'ATP et 5 mM de glutathion. Préparer frais juste avant utilisation et placer immédiatement sur de la glace.
REMARQUE : Une exécution correcte et rapide des étapes suivantes est cruciale. Veiller donc à ce que tout soit correctement préparé. - Retirer soigneusement 1x PBS sans perturber le culot cellulaire de l'étape 4.4. Resuspendre 5 x 106 cellules dans 400 µL de Cytomix complet et ajouter 5 µg d'ARN. Transférer la solution dans une cuvette de 4 mm et appliquer une impulsion unique de 975 µF, 270 V pendant 20 ms à l’aide d’un système d’électroporation.
- Après électroporation, transférer les cellules le plus rapidement possible à l’aide d’une pipette Pasteur dans 11 mL de DMEM complet par électroporation.
REMARQUE : Afin de s’assurer que l’ARN est correctement transféré dans les cellules HepG2, un contrôle de transfection (CT) sera effectué. Les taux de transfection attendus varient entre 40 et 60 % de cellules positives pour ORF2.
- Transférer 10 mL de cellules électroporées dans une boîte de culture de 10 cm revêtue de collagène. Ajouter 1,3 x 105 cellules électroporées (300 µL) dans une cavité d’une plaque de microtitration 24 puits revêtue de collagène contenant un lamelle (utilisée ultérieurement comme contrôle de transfection). Répartir les cellules uniformément et incuber à 37 °C.
- Après 24 h, changer le milieu dans la boîte de 10 cm et le remplacer par 10 mL de DMEM complet frais. Ne pas changer le milieu du contrôle de transfection. Incuber pendant 6 jours supplémentaires à 37 °C.
3. Récupération des particules de VHE dérivées de cultures cellulaires intracellulaires et extracellulaires (VHEcc)
- Pour récolter les HEVcc extracellulaires (Figure 3), filtrer le surnageant obtenu à partir de la boîte de 10 cm après 6 jours à travers une membrane de 0,45 µm afin d'éliminer tous les débris cellulaires. Conserver les HEVcc extracellulaires récoltés à 4 °C pour une infection le jour même ; sinon, les stocker à -80 °C.
- Pour récolter les HEVcc intracellulaires (Figure 3), laver les cellules avec du PBS 1x et les trypsiner en ajoutant 1,5 mL de trypsine-éthylènediaminetétraacétique (trypsine-EDTA) à 0,05 %. Incuber à 37 °C jusqu'à ce que les cellules soient complètement détachées. Ajouter 10 mL de DMEM complet, rincer la plaque pour détacher les cellules et transférer la suspension cellulaire dans un tube de 50 mL. Laver les cellules deux fois avec du PBS. Centrifuger à 200 x g pendant 5 min.
- Jeter le surnageant et resuspendre le culot cellulaire dans 1,6 mL de DMEM complet par électroporation. Transférer la suspension cellulaire dans un tube réaction de 2 mL.
REMARQUE : Ne pas utiliser de volumes supérieurs, car cela diminuerait fortement la charge virale. - Congeler (dans de l'azote liquide) et décongeler les cellules. Répéter cette séquence 3 fois.
REMARQUE : Ne pas regrouper plus d'une électroporation (1,6 mL) pour les 3 cycles de congélation-décongélation, car l'efficacité de lyse serait compromise. Ne pas vortexer la suspension cellulaire entre les cycles. Veiller à décongeler lentement la suspension cellulaire (par exemple, à température ambiante ou sur glace) afin de maximiser la charge virale. - Centrifuger à grande vitesse les cellules lysées pendant 10 min à 10 000 x g pour séparer les débris cellulaires. Transférer le surnageant dans un nouveau tube. Utiliser le surnageant pour l'infection ; sinon, le stocker à -80 °C.
- Éventuellement, concentrer les HEVcc extracellulaires et intracellulaires à l'aide d'un concentrateur afin d'augmenter la charge virale.
Tableau 1 : Tableau des compositions des tampons.
| Solution de travail | Concentration | Volume |
| Collagène | 40 mL | PBS |
| 40 µl | Acide acétique |
| 1 mL | Solution de collagène R stérile à 0,4 % |
| Cytomix | 120 mM | KCl |
| 0,15 mM | CaCl2 |
| 10 mM | K2HPO4 (pH 7,4) |
| 25 mM | HEPES |
| 2 mM | EGTA |
| DMEM complet | 500 mL | DMEM |
| 5 mL | Pen/Strep |
| 5 mL | MEM NEAA (100X) |
| 5 mL | L-Glutamine |
| 50 mL | Sérum de veau fœtal |
| MEM complet | 500 mL | MEM |
| 5 mL | Pyruvate de sodium |
| 5 mL | Gentamicine |
| 5 mL | MEM NEAA (100X) |
| 5 mL | L-Glutamine |
| 50 mL | ultra-low IgG |