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Technologie d’interférométrie de biocouche pour détecter les interactions entre le ligand et l’analyte

8 juillet 2025

Dans cet article

Résumé

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Source : Desai, M., et al. Application de l’interférométrie de biocouche (BLI) pour l’étude des interactions protéine-protéine dans la transcription. J. Vis. Exp. (2019)

Dans cette vidéo, nous faisons la démonstration de la technologie d’interférométrie de biocouche (BLI) pour détecter les interactions intermoléculaires entre les ligands et les analytes cibles en temps réel. BLI mesure les changements dans le modèle d’interférence de la lumière blanche réfléchie par une couche de ligands immobilisés à la surface d’un biocapteur lorsqu’ils interagissent avec des analytes en solution.

Protocole

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1. Configuration de l’hydratation et du dosage des biocapteurs

  1. Allumez la machine BLItz.
  2. Assurez-vous que la machine est connectée à l’ordinateur via un port de sortie de données USB à l’arrière de la machine.
  3. Sur l’ordinateur, ouvrez le logiciel associé (par exemple, BLItz Pro) et cliquez sur Cinétique avancée sur le côté gauche de l’écran.
  4. Sur le logiciel, tapez toutes les informations appropriées sur l’expérience (y compris le nom de l’expérience, la description, l’ID de l’échantillon et la concentration en protéines) sous chaque en-tête respectif.
  5. Cliquez sur Type de biocapteur et choisissez Ni-NTA dans le menu déroulant.
    1. Sous l’en-tête Paramètres d’exécution, vérifiez que le Shaker est défini sur Activer.
    2. Sous l’en-tête Liste des types d’étapes, vérifiez que 5 éléments sont répertoriés : Base de référence initiale, Chargement, Base de référence, Association et Dissociation.
      note: La durée de chaque étape peut être modifiée par défaut si nécessaire. Pour des résultats optimaux, utilisez un minimum de 30 s pour la ligne de base initiale et la ligne de base ; et 120 s pour l’association et la dissociation. La durée de l’étape de chargement (allant de 120 à 240 s) dépendra de la concentration du ligand et de l’affinité de l’étiquette d’épitope His, sur le ligand et le biocapteur Ni-NTA.
  6. Retirez le biocapteur Ni-NTA hydraté du tube PCR et fixez-le sur le support du biocapteur sur la machine en faisant glisser la partie large du biocapteur sur le support.
    note: Ne laissez pas le biocapteur se dessécher pendant l’expérience.
  7. Placez un tube de microcentrifugation noir de 0,5 ml dans le support de tube de la machine et pipetez 400 μL du tampon BLI dans celui-ci.
  8. Vérifiez que le curseur de la machine est positionné de telle sorte que le support de tube soit situé devant la flèche noire de la machine.
  9. Fermez le couvercle de la machine de manière à ce que l’extrémité du biocapteur soit immergée dans le tampon du tube de microcentrifugation.
  10. Cliquez sur Suivant sur le logiciel pour commencer à enregistrer la référence initiale.

2. Chargement du ligand sur le biocapteur

  1. Une fois l’enregistrement terminé à l’étape de référence initiale, ouvrez le capot de l’appareil.
  2. Déplacez le curseur vers la droite de sorte que le support de goutte (au lieu du support de tube) soit situé devant la flèche noire.
  3. Pipeter 4 μL d’un ligand dialysé marqué His-tag sur le support de goutte et fermer le couvercle de la machine.
    REMARQUE : La concentration optimale du ligand à utiliser peut varier pour chaque protéine. Une concentration comprise entre 1,0 et 2,0 mg/mL est généralement suffisante pour saturer le NTA à l’extrémité du biocapteur en 240 s.
  4. Sur le logiciel, cliquez sur Suivant pour commencer le chargement.

3. Lavage du ligand supplémentaire

  1. Une fois l’enregistrement terminé à l’étape de chargement, ouvrez le capot de la machine.
  2. Déplacez le curseur vers la gauche de sorte que le support de tube soit à nouveau situé devant la flèche noire.
  3. Fermez le couvercle de la machine et assurez-vous que l’embout du biocapteur est immergé dans le tampon BLI du tube dans le support de tube.
  4. Cliquez à nouveau sur Suivant dans le logiciel pour commencer à enregistrer la ligne de base.

4. Association de l’analyte au ligand

  1. Une fois l’enregistrement de l’étape Ligne de base terminé, ouvrez le capot de l’appareil.
  2. Retirez le support de goutte et nettoyez-le en pipetant toute protéine et en le rinçant avec de l’eau doublement désionisée (ddH2O) pour un total de 5 fois.
    1. Utilisez une lingette pour mouchoir pour nettoyer la surface du porte-goutte après le lavage.
  3. Replacez le support de chute sur la machine.
  4. Déplacez le curseur de la machine vers la droite de sorte que le support de goutte soit à nouveau situé devant la flèche noire.
  5. Pipeter 4 μL d’un analyte dialysé sur le support de goutte et fermer le couvercle de la machine.
  6. Sur le logiciel, cliquez sur Suivant pour commencer l’association.

5. Dissociation de l’analyte du ligand

  1. Une fois l’enregistrement terminé, ouvrez le capot de la machine.
  2. Déplacez le curseur de la machine vers la droite de sorte que le support de tube soit à nouveau situé devant la flèche noire.
  3. Sur le logiciel, cliquez sur Suivant pour commencer la dissociation.
  4. Une fois l’enregistrement de l’étape de dissociation terminé, ouvrez le capot de la machine.
  5. Retirez le support de chute et le support de tube.
  6. Rincez soigneusement les deux avec de la ddH2O pour éliminer toute protéine.
  7. Retirez le biocapteur et jetez-le en toute sécurité.

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Déclarations de divulgation

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$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
Aucun conflit d’intérêts n’a été déclaré.

Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Machine BLItzForteBio45 à 5000appareil
Trempage et lecture du plateau du biocapteur Ni-NTAForteBioRéférence 18-5101Biocapteurs Ni-NTA prêts à l’emploi pour protéines poly-His-marquées
Support de chuteForteBio45-5004appareil
Tubes PCR (0,2 mL)Thomas ScientificCLS6571Articles en plastique
Tubes de microcentrifugation (noirs)Thermo Fisher ScientificTél. : 03-391-166Articles en plastique
Lingettes KimwipesThermo Fisher Scientific06-666AArticles en plastique
La TNTThermo Fisher ScientificRéf. R0861chimique
EdtaMilliporeSigmaE6758chimique
MgCl2MilliporeSigmaRéférence M8266chimique
NaClMilliporeSigmaRéf. S9888chimique
Tris-HClOrBiographieT095100tampon

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Mots-clés

Interaction ligand analytebiocapteur Ni NTAligand marqu l histidinemesure du d calage de longueur d ondecin tique d association et de dissociationsyst me de tampon BLIbiocapteur fibre optiqueinstrument BLItzlogiciel Advanced Kinetics

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