| Souches de drosophiles | | | |
| E-cadhérine omniprésente marquée GFP ; Ubi-p63F-shg.GFP ; (chrII) | Centre d’approvisionnement de Kyoto, DGRC | #109007 | Les séquences promotrices d’Ubi-p63E pilotent l’expression de la drosophile E-cadhérine (fusil de chasse) marquée à l’extrémité C-terminale avec GFP. |
| E-cadhérine omniprésente marquée GFP ;; Ubi-p63F-shg.GFP (III) | Centre de stock de drosophile de Bloomington (Université de l’Indiana) | Réf. 58742 | Les séquences promotrices d’Ubi-p63E pilotent l’expression de la drosophile E-cadhérine (fusil de chasse) marquée à l’extrémité C-terminale avec GFP. |
| Moesin P{sGMCA}3.1 | Centre de stock de drosophile de Bloomington (Université de l’Indiana) | Réf. 59023 | Le promoteur/amplificateur de sqh, exprimé de manière ubiquitaire, entraîne l’expression d’un fragment de Moesin (qui comprend les séquences de liaison à l’actine) marqué avec GFPS65T. |
| Pilote serpent-Gal4 spécifique aux hémocytes ; srp-Gal4 ; | Généré par Katja Bruckner | Généré par Katja Bruckner | L’expression de Scer\GAL4 fusionné à une queue polyA est contrôlée par 2 séquences génomiques en amont du serpent Drosophila. Réf. : Brückner, K., Kockel, L., Duchek, P., Luque, C.M., Rørth, P., Perrimon, N. Le récepteur PDGF/VEGF contrôle la survie des cellules sanguines chez la drosophile. Cellule de développement. 7 (1), 73–84, doi : 10.1016/j.devcel.2004.06.007 (2004). |
| UAS-nucléaireRFP w1118 ;; P{UAS-RedStinger}6 | Centre de stock de drosophile de Bloomington (Université de l’Indiana) | #8545 ou #8547 | Les séquences réglementaires UAS pilotent l’expression de la forme DsRed.T4 de RFP qui est marquée à l’extrémité C-terminale avec un signal de localisation nucléaire |
| UAS-cytoplasmiqueGFP ;; P{UAS-GFP. S65T} | Centre de stock de drosophile de Bloomington (Université de l’Indiana) | Plusieurs stocks disponibles (par exemple #1522) | Expression de la version S65T de la GFP par les séquences régulatrices de l’UAS ; la variante S65T présente une luminosité accrue. |
| UAS-photoconvertibleKaede w1118 ;; P{UAS-Kaede.A}3 | Centre de stock de drosophile de Bloomington (Université de l’Indiana) | Réf. 26161 | La protéine Kaede émet une fluorescence vert vif après la synthèse, mais se transforme efficacement en une fluorescence rouge vif et stable lors de l’irradiation par UV. |
| Courge spaghetti marquée GFP w1118 ;; P{sqh-GFP.RLC} | Centre de stock de drosophile de Bloomington (Université de l’Indiana) | Réf. 57145 | La région codante sqh, qui est balisée à l’extrémité C-terminale avec une balise T :Avic\GFPS65T, est exprimée sous le contrôle du promoteur naturel sqh. |
| Ingrédients pour les supports alimentaires contre les mouches | | | Les milieux alimentaires contre les mouches sont fabriqués selon des procédures standard (voir Greenspan, R. 1997. Poussée de mouches : la théorie et la pratique de la génétique de la drosophile. Cold Spring Harbor Press. 1-191 pages.) |
| maïs | Wild Oats, Bristol, Royaume-Uni (ou fournisseur équivalent) | Contacter directement le fournisseur | organique |
| Farine de soja | Wild Oats, Bristol, Royaume-Uni (ou fournisseur équivalent) | Contacter directement le fournisseur | organique |
| Extrait de malt | Wild Oats, Bristol, Royaume-Uni (ou fournisseur équivalent) | Contacter directement le fournisseur | organique |
| mélasse | Wild Oats, Bristol, Royaume-Uni (ou fournisseur équivalent) | Contacter directement le fournisseur | organique |
| Gélose Difco | BD Biosciences, Fisher Scientific | Référence : DF0142-15-2 | Pour la préparation de nourriture pour mouches |
| Acide propionique | sigma | 402907 | Pour la préparation de nourriture pour mouches |
| Nipagen | sigma | Référence 79721 | Pour la préparation de nourriture pour mouches |
| Levure de boulanger séchée | Redstar, Dutscher Scientific, Royaume-Uni Ltd | Redstar, Dutscher Scientific, Royaume-Uni Ltd | Pour la préparation de nourriture pour mouches |
| Préparation et montage des échantillons | | | |
| Parafilm | sigma | P7793-1EA | Pour la préparation de la colle heptane |
| Pinceau zibeline | Daler-Rowney (ou équivalent) | #0 ou 1 | |
| forceps | Fisher Scientific (ou Fine Science Tools) | NC9404145 | Dumont #5 |
| Boîtes à fond en verre pour l’imagerie | MatTek | P35G-0-10-C | Nous vous suggérons d’utiliser des boîtes de Pétri de 35 mm, avec un Microwell d’au moins 10 mm, un verre de couverture de 0,085 à 0,13 mm, non revêtu. Des boîtes avec des micropuits plus grands permettront de monter et d’imager un nombre croissant de pupes en une seule expérience. |
| heptane | sigma | 51730-5ML | Pour la préparation de la colle heptane |
| Ruban adhésif double face (par exemple Scotch) | Agar Scientific | AGG263 | Pour la préparation de la colle heptane |
| Tube de 50ml (pour colle heptane) | Tubes Falcon de Fisher Scientific | Tél. : 14-432-22 | Pour la préparation de la colle heptane |
| Lames de microscope en verre | Agar Scientific | AGL4244 | Pour la dissection des pupes de drosophile |
| Stéréomicroscope de dissection à fond clair | Leica (ou équivalent) | M50 | Pour la dissection des pupes de drosophile |
| Microciseaux | John Weiss International | 103123 | Ciseaux de recherche miniatures (droits) |
| Ablation laser et imagerie | | | |
| Laser d’ablation Nitogen | Spectra-Physique (ou équivalent Andor) | Modèle VSL-337ND-S | Pour les blessures, il doit être attaché à un système d’imagerie à grand champ |
| Microscope confocal à balayage laser multilaser (CLSM) | Leica (ou équivalent) | TCS AOBS SP8 ou SP5-II fixé à un microscope à épifluorescence inversée Leica DMi8 (ou équivalent) | Idéalement, il comprend une platine motorisée pour le balayage multi-sites et « mosaïque », ainsi que des détecteurs GaAsP « hybrides » (qui offrent une sensibilité beaucoup plus grande et une amplification du signal faible) |
| Chambre environnementale | Services d’imagerie de vie (ou équivalent) | « Système de contrôle de la température du microscope » | Fixé au microscope confocal pour le contrôle de la température pendant l’imagerie |
| Logiciel d’analyse d’images | | | |
| Module logiciel FRAP | Leica (ou équivalent) | Module logiciel CLSM FRAP | Pour la photoconversion de fluorophores photoconvertibles tels que Kaede |
| ImageJ (logiciel d’analyse d’images) | Instituts nationaux de la santé (NIH) | https://imagej.nih.gov/ij/ | Schneider, C.A., Rasband, W.S., Eliceiri, K.W. « NIH Image to ImageJ : 25 ans d’analyse d’images ». Nature Methods 9, 671-675, 2012. |
| Plugin ImageJ « Suivi manuel » | Instituts nationaux de la santé (NIH) | https://imagej.net/Manual_Tracking | |
| Plugin ImageJ « TrackMate » | ImageJ, NIH | https://imagej.net/TrackMate | Tinevez, JY. ; Perry, N. et Schindelin, J. et al. (2016), « TrackMate : Une plateforme ouverte et extensible pour le suivi d’une seule particule », Méthodes 115 : 80-90, PMID 27713081 |
| Volocity (logiciel d’imagerie 3D haute performance) | Perkin Elmer | Volocité 6,3 | Pour l’analyse d’images |
| IMARIS (logiciel d’analyse d’images) | Plan binaire | IMARIS pour les biologistes cellulaires | Pour l’analyse d’images |