Toutes les procédures impliquant le prélèvement d'échantillons ont été effectuées conformément aux directives de l'IRB de l'institut.
1. Dosage de la phagocytose
- Incuber 2 x 106 leucocytes et 4 x 10conidies marquées au FITC (multiplicité de l’infection = 2) dans 1,5 mL de RPMI + 10 % de FCS dans une plaque de culture cellulaire à 12 puits. En tant que témoins, incluez uniquement les cellules (pas de conidies) et les cellules + conidies non étiquetées.
- Placer dans un incubateur de CO2 humidifié à 37 °C et incuber pendant la période souhaitée (par exemple, 0,5 h, 2 h ou 4 h).
- Après l’incubation, prélever les cellules à l’aide d’un grattoir cellulaire et les mettre dans un tube de 15 ml.
- Essorer pendant 5 min à 300 x g à température ambiante.
- Prélever le surnageant pour l’analyse des cytokines ou le jeter si vous ne le souhaitez pas. Remettre chaque échantillon en suspension dans 100 μL de PBS + 2 mM d’EDTA.
2. Coloration des anticorps
- Pour chaque échantillon, préparer 100 μL de mélange d’anticorps, y compris l’anticorps anti-FITC APC, conformément au tableau 1.
- Placez un échantillon de 100 μL dans un puits d’une plaque à fond en V de 96 puits. Ajouter 150 μL de PBS + 2 mM d’EDTA pour le lavage.
- Pour la compensation des couleurs, placez 1 x 106 cellules pour chaque couleur dans d’autres puits de la plaque inférieure en V à 96 puits. Incluez un puits de cellules qui n’est pas coloré. Ajouter 150 μL de PBS + 2 mM d’EDTA pour le lavage.
- Couvrez la plaque d’une feuille adhésive.
- Essorer pendant 5 min à 300 x g à température ambiante. Retirez le papier d’aluminium.
- Jetez le surnageant en ne retournant rapidement et vigoureusement la plaque qu’une seule fois au-dessus de l’évier ou avec un essuie-tout jetable.
REMARQUE : Ne répétez pas ou ne renversez pas la plaque sur un papier jusqu’à ce qu’elle soit sèche, car cela entraînerait une perte massive de cellules de la plaque.
- Remettre les cellules en suspension dans le mélange d’anticorps de 100 μL et bien mélanger par pipetage.
- Pour compenser la couleur, remettre les cellules respectives en suspension dans 100 μL de PBS + 2 mM d’EDTA et ajouter un seul anticorps à chaque puits à la même quantité que celle utilisée dans le mélange d’anticorps.
- Couvrir d’une feuille adhésive et incuber pendant 20 min à température ambiante dans l’obscurité.
- Retirez le papier d’aluminium. Ajouter 150 μL de PBS + 2 mM d’EDTA dans chaque puits pour le lavage. Couvrir d’une feuille adhésive.
- Essorer pendant 5 min à 300 x g à température ambiante. Retirez le papier d’aluminium. Jetez le surnageant en renversant rapidement et vigoureusement l’assiette au-dessus de l’évier ou d’une serviette en papier jetable.
- Remettre en suspension dans 200 μL de PBS + 2 mM d’EDTA et transférer les cellules de chaque puits dans un tube à fond rond séparé. Assurez-vous qu’il n’y a pas de groupes de cellules dans la suspension. Supprimer les clusters sinon.
REMARQUE : Chaque grappe suffisamment grande pour que l’œil puisse la voir est assez grande pour potentiellement obstruer le cytomètre.
3. Cytométrie en flux
- Démarrez le cytomètre en flux et laissez-le se réchauffer. Démarrez le logiciel d’acquisition.
- Créez une nouvelle expérience, puis configurez et étiquetez les échantillons.
- Configurez les paramètres (FSC 250, SSC 250) et les détecteurs pour les fluorophores FITC, APC, BUV395, V500 et PerCP-Cy5.5.
- Configuration de la rémunération
- Ouvrez la configuration de la compensation.
- Indiquez les couleurs individuelles.
- À l’aide des cellules de contrôle laissées non colorées ou avec des colorations individuelles, réglez les tensions du détecteur PMT pour inclure tous les événements de l’échelle.
- Enregistrez au moins 10 000 événements de chaque contrôle.
- Utilisez la configuration de compensation pour calculer le débordement des fluorophores et appliquez-le aux paramètres du cytomètre de l'expérience.
- Enregistrement des données d’échantillon
- Affichez le FSC et le SSC dans le logiciel d’acquisition et placez une porte autour des leucocytes.
- Sur la base de la porte leucocytaire, affichez le diagramme à points SSC/CD45 et la porte pour les cellules CD45+ à séparer des conidies.
- Affichez les cellules CD45+ dans un graphique à points CD14/CD66b et les monocytes de grille (CD14+) et les neutrophiles (CD66b+) séparément.
- Affichage des neutrophiles dans un graphique à points anti-FITC/FITC.
- En utilisant l’échantillon avec des conidies non marquées, définissez des quadrants pour les signaux anti-FITC et FITC, en autorisant un maximum de 1 % de cellules dans les quadrants respectifs.
- Répétez les étapes 3.5.4 et 3.5.5 pour la porte monocytaire.
- Enregistrez tous les échantillons comportant au moins 20 000 événements dans la porte leucocytaire.
Tableau 1 : Mélange d’anticorps pour la cytométrie en flux. Les quantités de chaque réactif sont données sous forme de microlitres par échantillon (1 x 106 cellules) à analyser.
| Réactif | μl par échantillon |
| CD45 BUV395 | 1 |
| CD14 V500 | 0,5 |
| CD66b PerCP-Cy5.5 | 1.5 |
| APC anti-FITC | 0,5 |
| PBS + 2 mM EDTA | 97 |
| total | 100 |