1. Immunomarquage des lymphocytes T CD8 résidents et des cellules tumorales
- Diluer les anticorps (concentration finale 10 μg/mL) et le colorant nucléaire (concentration finale 1 μg/mL) dans un milieu RPMI-1640 sans rouge de phénol.
note: Utilisez des anticorps anti-CD8 (IgG murins, clone SK1) et anti-EpCAM (molécule d’adhésion des cellules épithéliales) (IgG murins HEA-125) couplés par fluorescence pour marquer les lymphocytes T CD8 et les cellules épithéliales tumorales, respectivement. Utilisez un anticorps anti-CD90/Thy1 couplé par fluorescence (IgG murin, clone 5E10) pour marquer les fibroblastes et les cellules endothéliales activées. Utiliser le 4',6-diamidino-2-phénylindole (DAPI) pour marquer le noyau des cellules dont la membrane plasmique est compromise afin d'évaluer la viabilité des tissus.
- Retirez les plaques de culture de l’incubateur et utilisez une pipette pour aspirer tout liquide à l’intérieur des rondelles en acier inoxydable. Ne retirez pas le milieu RPMI-1640 de 1,1 ml placé sous les inserts de culture cellulaire.
- Sans toucher la tranche et à l’aide d’une pointe de pipette, ajoutez 40 μL de la solution contenant les anticorps sur chaque tranche de tumeur.
- Incuber la plaque à 37 °C pendant 15 min pour permettre la coloration des anticorps.
- À l’aide d’une pince fine, retirez les rondelles, retirez les tranches et trempez-les 10 s dans un média RPMI-1640 sans rouge de phénol. Replacez les tranches sur les inserts de culture cellulaire et ajoutez une goutte de milieu RPMI-1640 sans rouge de phénol sur chaque tranche individuelle. Maintenir la plaque à 37 °C pendant 10 min. Passez à l’imagerie.
2. Imagerie et analyse de la migration des lymphocytes T CD8 résidents dans des coupes de tumeurs pulmonaires humaines
REMARQUE : Le microscope confocal utilisé dans ce protocole est un disque rotatif vertical équipé d’un objectif à immersion dans l’eau 25x (25x/0,95 N.A.).
- Préparation de la configuration du microscope
- Réglez la température de la chambre chauffante du microscope à 37 °C quelques heures avant de commencer la séance d’imagerie.
- Mettre en place un système permettant de perfuser constamment les tranches tumorales avec un milieu RPMI oxygéné (5 % CO2, 95 % O2) sans rouge de phénol (Figure 1). À l’aide d’une pompe péristaltique, faire couler le milieu de perfusion dans la chambre d’imagerie et aspirer la solution dans une fiole de collecte des déchets.
- Faites fonctionner la pompe péristaltique pour permettre à la solution oxygénée de passer à travers les tubes de perfusion.
- À l’aide d’une pince fine, retirez la tranche de la plaque à 6 puits et transférez-la dans le plat en plastique de 35 mm rempli de milieu RPMI sans rouge de phénol. Immobilisez la tranche à l’aide d’un ancrage de tranche de 19,7 mm de diamètre avec des filetages espacés de 2 mm. Placez la boîte de Pétri sur la platine d’imagerie du microscope. Connectez les embouts d’entrée et de sortie du système de perfusion. Allumez le système de perfusion et réglez le débit du média à 0,8 mL/min.
- Abaissez l’objectif d’immersion dans l’eau sur la tranche. Concentrez-vous sur le haut de la tranche avec une lumière à champ vif. À l’aide d’une lumière fluorescente appropriée, sélectionnez une région d’intérêt qui contient des lymphocytes T CD8, des îlots tumoraux (positifs pour EpCAM) et une zone stromale (positive pour CD90). Vérifiez la viabilité des cellules à l’intérieur de la tranche en évaluant la coloration DAPI à la surface coupée et plus profondément dans le tissu.
REMARQUE : Une tranche saine ne contient qu’une minorité de cellules DAPI-positives à plusieurs microns de la surface coupée.
- Définissez une session d’imagerie avec les actions suivantes.
- En fonction de l’intensité du signal fluorescent des 3 fluorophores, réglez le temps d’exposition entre 50 et 800 ms et l’intensité laser entre 20 et 40
%.
- Sélectionnez l’épaisseur de la pile z à imager dans la tranche de tumeur.
note: Ici, 10 à 12 plans optiques couvrant une profondeur totale de 60 à 70 μm dans la dimension z ont été capturés.
- Sélectionnez la position de départ à environ 10 μm en dessous des premiers lymphocytes T CD8 marqués.
- Définissez l’intervalle de temps entre chaque image z-stack entre 10 et 30 s et la durée totale d’enregistrement entre 10 et 30 min.