1. Immunocoloration de tranches d’organoïdes
- Placez les lames de microscope contenant des coupes organoïdes dans un bocal contenant 50 ml de PBS 1x préchauffé, en contenant jusqu’à 10 lames dos à dos.
note: Toutes les sections d’organoïdes doivent être immergées dans un liquide.
- Incuber pendant 45 min à 37 °C pour dégélatiniser les lames.
- Laver 1 fois avec 50 ml de PBS 1× pendant 5 min à RT : Transférer les lames dans un bocal contenant du PBS frais 1×.
- Transférez les lames dans un bocal contenant 50 ml de glycine fraîchement préparée (tableau 1) et incubez pendant 10 min à RT.
- Transvaser les lames dans un bocal contenant 50 mL de triton à 0,1 % (tableau 1) et perméabiliser pendant 10 minutes à RT.
- Laver avec 1× PBS pendant 5 min 2x.
- Préparez la boîte d’immunocoloration avec du papier de 3 mm imbibé de 1× de PBS. Séchez les lames avec un mouchoir tout autour des tranches et placez-les sur du papier de 3 mm. À l’aide d’une pipette Pasteur, recouvrez toute la surface des lames d’une solution bloquante (tableau 1), à raison de 0,5 mL par lame. Incuber pendant 30 min à RT.
- Retirez l’excès de solution bloquante et séchez les lames avec un mouchoir tout autour des tranches. Placer 50 μL de l’anticorps primaire (tableau 2) dilué dans une solution bloquante sur les sections et couvrir avec les lamelles. Placez les tranches dans une boîte d’immunomarquage préalablement préparée. Incuber toute la nuit à 4 °C.
- Transférez les lames dans un bocal avec 50 ml de TBST (tableau 1), laissez tomber les lamelles et lavez-les avec du TBST pendant 5 min 3x.
- Placer 50 μL de l’anticorps secondaire dilué dans une solution bloquante sur les sections et couvrir avec les lamelles. Placez les tranches dans la boîte d’immunomarquage préalablement préparée. Incuber pendant 30 min à RT, à l’abri de la lumière.
- Transférez à nouveau les lames dans un bocal et lavez-les avec 50 ml de TBST pendant 5 minutes 3x.
- Séchez les lames avec un mouchoir tout autour des tranches et placez les tranches dans une boîte d’immunocoloration préalablement préparée. À l’aide d’une pipette Pasteur, ajoutez 0,5 mL de solution DAPI sur toute la surface des lames. Incuber pendant 5 min à RT.
- Répétez l’étape 1.9.
- Séchez soigneusement les lames avec un mouchoir en papier. Ajoutez 50 μL de support de montage goutte à goutte le long de la lame, puis abaissez soigneusement une lamelle sur chaque lame, en la pliant légèrement pour éviter les bulles.
Tableau 1 : Solutions pour la préparation d’organoïdes pour la cryosection et l’immunomarquage. Vous trouverez la liste de tous les composants et volumes utilisés pour préparer les solutions utilisées dans la préparation des organoïdes pour la cryosection et l’immunomarquage.
Gélatine/Saccharose
Concentration finale : 7,5 %/15 % p/p | 1. Pesez 15 g de saccharose et 7,5 g de gélatine dans une bouteille en verre Schott stérile et mélangez bien
2. Préchauffez le PBS 1x à 65 °C
3. Ajoutez du PBS 1x préchauffé pour un poids final de 100 g et mélangez bien
4. Placez la bouteille en verre Schott dans une plaque chauffante à 65 °C et secouez-la jusqu’à ce que la gélatine fonde
5. Incuber à 37 °C jusqu’à ce que la solution se stabilise |
Glycine
Concentration finale : 0,1 M | Ajouter 0,37 g de glycine à 50 ml de PBS 1x fraîchement préparé. |
Triton solution
Concentration finale : 0,1 % p/v | 1. Préparez un bouillon Triton X-100 à 10 % : 5 g de Triton X-100 dans 50 mL de PBS 1x
2. Ajoutez 0,5 mL de stock Triton X-100 à 50 mL de PBS 1x. |
TBST
20 mM Tris-HCl pH 8,0, 150 mM NaCl, 0,05 % p/v Tween-20 | 20 mL Tris 1 M
30 mL de NaCl 5 M
5 mL de Tween-20 (10 % de matière première : 5 g de Tween-20 dans 50 mL d’eau)
Remplissez à 1 L d’eau. |
| Solution de blocage | Ajouter 5 mL de sérum fœtal bovin (FBS, concentration finale : 10 % v/v) à 50 mL de TBST. |
| La solution DAPI | Ajouter 15 μL de solution mère de DAPI (1 mg/mL) à 10 mL d’eau distillée |
| Mowiol | 1. Ajouter 2,4 g de Mowiol à 6 g de glycérol et agiter pendant 1 h dans une assiette préchauffée à 50 °C
2. Ajouter 6 mL d’eau distillée et agiter pendant 2 h
3. Ajouter 12 mL de Tris 200 mM (pH 8,5) et agiter pendant 10 min
4. Centrifuger à 5 000 × g pendant 15 min5. Aliquote et conserver à -20 °C. |
Tableau 2 : Anticorps primaires. Les anticorps primaires, le clone et les dilutions optimisées utilisés pour l’immunomarquage sont répertoriés.
| anticorps | Espèces hôtes | dilution |
| BARHL1 | lapin | 1/500 |
| CALBINDIN | lapin | 1/500 |
| CARTE 2 | souris | 1/1000 |
| N-CADHERINE | souris | 1/1000 |
| NESTIN | souris | 1/400 |
| OLIG2 | lapin | 1/500 |
| PAX6 | lapin | 1/400 |
| SOX2 | souris | 1/200 |
| TBR1 | lapin | 1/200 |
| TBR2 | lapin | 1/200 |
| TUJ1 | souris | 1/1000 |