Article de méthode

Hybridation in situ à l’aide de sondes oligonucléotidiques pour étudier l’expression de l’ARN dans des sections de cerveau de rat

851 vues

8 juillet 2025

Dans cet article

Résumé

Source : Shokry, I. M., et al. Hybridation rapide in situ à l’aide de sondes oligonucléotidiques sur le cerveau préfixé au paraformaldéhyde de rats atteints du syndrome sérotoninergique. J. Vis. Exp. (2015).

Cette vidéo démontre la détection de la synthèse de l’ARN du récepteur de la sérotonine à l’aide de sondes oligonucléotidiques dans le tissu cérébral du rat affecté par le syndrome sérotoninergique. Le protocole comprend le prétraitement tissulaire, l’hybridation de sondes et la détection enzymatique pour visualiser et quantifier l’expression de l’ARN du récepteur de la sérotonine au microscope.

Protocole

Toutes les procédures impliquant des échantillons d’animaux ont été examinées et approuvées par le comité d’éthique animale approprié.

1. Préparation

  1. Préparation et sectionnement des tissus
    1. Répartissez les rats au hasard en trois groupes : frais/salin (SAL ; 0,9 % de NaCl), préfixé/SAL et préfixé/3,4-méthylènedioxyméthamphétamine (MDMA ; voir détails dans tableau 1).
    2. Administrer trois doses de 1 ml/kg de SAL et de 10 mg/kg de MDMA par voie intrapéritonéale, respectivement, aux groupes SAL et MDMA à 2 heures d’intervalle. Laissez les animaux survivre au traitement pendant 6 jours.
    3. Le jour 7, administrer 100 mg/kg de kétamine en association avec 5 mg/kg de xylazine par voie intrapéritonéale aux rats pour une anesthésie profonde (c’est-à-dire , perte de clignement cornéen et réflexes de pincement de la queue).
    4. Pour le groupe frais/SAL, décapitez rapidement les rats et retirez le cerveau pour le test du cerveau frais.
    5. Pour les groupes préfixés/SAL et préfixés/MDMA, faites une incision le long du sternum d’environ 10 à 12 cm, puis exposez l’extrémité du sternum.
    6. Tenez l’extrémité du sternum avec un hémostatique et coupez le diaphragme latéralement des deux côtés avec des ciseaux tranchants, puis coupez vers le haut à travers les côtes et parallèlement aux poumons.
    7. D’une main, tenez l’extrémité ventrale du cœur à l’aide de petites pinces. De l’autre main, percez le ventricule gauche avec une aiguille de seringue de 18 G (notez que le côté adaptateur de l’aiguille est relié par un tuyau en silicone en forme de Y à des récipients de SAL et de paraformaldéhyde glacés et à des pompes péristaltiques).
    8. Allumez la pompe SAL au niveau moyen du débit (~5 ml/min) et percez l’oreillette droite avec la pince pour permettre l’échappement de la circulation de retour. Maintenir la perfusion de SAL pendant 30 min.
    9. Allumez la pompe de paraformaldéhyde à un niveau moyen et laissez le paraformaldéhyde glacé à 4 % pénétrer l’animal pendant 30 min.
    10. Retirez l’instrument de perfusion et décapitez l’animal. Faites une coupe postéro-antérieure à travers la ligne médiane du crâne, puis battez le crâne pour exposer la cavité du crâne.
    11. Retirez le cerveau de la cavité crânienne à l’aide d’une spatule et placez-le dans un tube à centrifuger de 50 ml contenant 25 ml de paraformaldéhyde à 4 %. Conservez le cerveau à l’intérieur du tube contenant du paraformaldéhyde à 4 ºC au réfrigérateur pendant 24 heures.
    12. Placez le cerveau dans un tube à centrifuger de 50 ml contenant 25 ml de solution de saccharose à 30 % à 4 ºC pendant 3 jours. Enfin, conservez le cerveau dans des sacs en plastique à -80 °C jusqu’à utilisation.
    13. Montez le cerveau sur un mandrin avec un support d’enrobage et congelez le support d’enrobage contenant le cerveau dans un cryostat à une température de -26 ºC. Coupez le cerveau fraîchement congelé en sections de 20 μm et le cerveau préfixé au paraformaldéhyde en sections de 10 μm. Transférez la coupe sur une lame de microscope à température ambiante (RT) en touchant la lame à la section.
    14. Séchage à l’air libre à RT pendant 4 heures. Conservez les lames de section dans un sac hermétique à -80 °C jusqu’à utilisation.
  2. Déshydratation
    1. Prenez des lames du congélateur à -80 °C et répartissez-les dans l’un des trois tests suivants : gène du récepteur de la sérotonine 5-HT2A (ht2a), ppiB (gène de la peptidylprolyl isomérase B, contrôle positif) ou dapB (gène de la dihydrodipicolinate réductase bactérienne, contrôle négatif) ; Marquez et étiquetez des sections avec un stylo à bille (n’utilisez pas de crayon). Diapositives immergées dans 100 % d’alcool à RT pendant 5 min. Faites sécher les lames pendant 5 min dans une hotte.
  3. Prétraitement
    1. Pipette de 20 μl du réactif de prétraitement-1 (inactivation de la phosphatase alcaline) sur les sections des lames. Placez les lames sur un rail de rack dans un bac à humidité (notez que le plateau est recouvert d’un couvercle pour maintenir une humidité élevée afin d’éviter l’évaporation de la solution réactionnelle).
    2. Secouez doucement le plateau d’humidité sur un shaker horizontal à basse vitesse pendant 10 min. Lavez les lames deux fois avec de l’eau doublement distillée (ddH2O) pendant 2 min. Immerger la lame dans un bécher de 200 ml contenant 150 ml du réactif de prétraitement-2 (rupture des réticulations induite par la fixation du paraformaldéhyde). Faire bouillir les lames pendant un total de 5 min à 100 ºC (restauration de la structure de l’ARN induite par la chaleur).
    3. Lavez les lames deux fois avec du jjH2O pendant 2 min. Placez les lames dans de l’alcool à 100 % pendant 5 min. Faites sécher les lames pendant 5 min dans la hotte. Utilisez un stylo hydrophobe pour dessiner un cercle autour de la zone sélectionnée dans la section tissulaire (, par exemple , structures non corticales, y compris le thalamus et l’hypothalamus comme indiqué dans Figure 1).
    4. Pipetez 10 μl du réactif de prétraitement-3 (augmentation de la pénétration de la sonde) dans chaque zone sélectionnée et couvrez le bac à humidité avec le couvercle. Placez la plaque dans le four d’hybridation équipé du shaker horizontal et réglez la température du four à 40 ºC ; Agitez doucement le plateau pendant 30 min. Lavez les lames deux fois avec ddH2O pendant 2 min.

2. Hybridation et amplification

  1. Pipette 10 μl de réactifs de sonde htr2a, ppiB et dapB, respectivement, sur les zones sélectionnées. Couvrez le bac à humidité avec le couvercle pour éviter l’évaporation du réactif. Secouez doucement sur le shaker horizontal réglé à basse vitesse. Incuber les lames à 40 ºC au four pendant 2 h.
  2. Lavez les lames deux fois avec un tampon de lavage pendant 2 min. Pipetez 10 μl du réactif d’amplification-1 sur chaque zone sélectionnée, agitez et incubez les lames à 40 ºC pendant 30 min.
  3. Lavez les lames deux fois avec un tampon de lavage pendant 2 min. Pipeter 10 μl du réactif Amplification-2 sur chaque zone sélectionnée, agiter et incuber les lames à 40 ºC pendant 15 min.
  4. Lavez les lames deux fois avec un tampon de lavage pendant 2 min. Pipetez 10 μl du réactif Amplification-3 sur chaque zone sélectionnée, agitez et incubez les lames à 40 ºC pendant 30 min.
  5. Lavez les lames deux fois avec un tampon de lavage pendant 2 min. Pipetez 10 μl du réactif Amplification-4 sur chaque zone sélectionnée, agitez et incubez les lames à 40 ºC pendant 15 min.
  6. Lavez les lames deux fois avec un tampon de lavage pendant 2 min. Pipetez 10 μl du réactif Amplification-5 sur chaque zone sélectionnée, agitez et incubez les lames à RT pendant 30 min.
  7. Lavez les lames deux fois avec un tampon de lavage pendant 2 min. Pipeter 10 μl du réactif Amplification-6 sur chaque zone sélectionnée, agiter et incuber les lames à RT pendant 15 min. Lavez les lames deux fois avec un tampon de lavage pendant 2 min.

3. Détection de signaux

  1. Pipetez 10 μl de réactif Red dans chaque zone sélectionnée (notez que le réactif est un mélange de Red-B et de Red-A dans un rapport de 1:60 et doit être utilisé immédiatement). Placez la lame dans le bac à humidité sur le shaker horizontal à RT et secouez doucement à basse vitesse pendant 10 min.
  2. Lavez les lames deux fois avec (ddH2O) pendant 10 min. Faites sécher les lames à 60 ºC au four pendant 15 min. Placez les lames dans du xylène sous la hotte pendant 5 min. Pipeter 20 μl de support de montage à base de xylène sur chaque zone sélectionnée et couvrir avec une lamelle.

Accès restreint. Veuillez vous connecter ou commencer un essai pour afficher ce contenu.

Résultats

Tableau 1. Plan d’expérience

FraisPréfixé au paraformaldéhydea
SALbSALbMDMAc
Sonde cible (htr2a)
Sonde positive (ppiB)

Accès restreint. Veuillez vous connecter ou commencer un essai pour afficher ce contenu.

Déclarations de divulgation

Aucun conflit d’intérêts n’a été déclaré.

Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Sonde de contrôle négatif RNAscope-DapBDiagnostic cellulaire avancé, INC310098
Prétraitement de l’ARNscope 4Diagnostic cellulaire avancé, INC320046
Kit de réactifs RNAscope 2.0 HD - RougeDiagnostic cellulaire avancé, INC310036
Sonde RNAscope - Rn-PpibDiagnostic cellulaire avancé, INC313921
Rat Htr2aDiagnostic cellulaire avancé, INC300031
CryostatLeicaCM 1850
Agitateur horizontalVWR88032-088
Four d’hybridationThermo Fisher Scientific222000
Lame de microscope Superfrost PlusFisher Scientific12-550-15
Stylo hydrophobeVecteurH-4000
MicroscopeOlympeProvis AX70

Réimpressions et autorisations

Demander l’autorisation de réutiliser le texte ou les figures de cet article JoVE

Demander une autorisation

Mots-clés

Pr traitement des tissushybridation de la sonded tection enzymatiquer cepteur de la s rotoninesubstrats chromog nesquantification microscopique

Articles connexes