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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Cette vidéo présente une technique permettant d’évaluer les lésions d’hypoxie cérébrale par tomographie par émission de positrons (TEP) et imagerie par résonance magnétique (IRM) simultanées. Une souris anesthésiée subit une ligature de l’artère carotide commune (ACC), réduisant le flux sanguin vers un hémisphère cérébral et le prédisposant aux lésions induites par l’hypoxie. L’imagerie TEP et IRM évalue le métabolisme du glucose et les changements structurels pendant l’hypoxie. L’IRM détecte une diffusion restreinte de l’eau, tandis que la TEP révèle une réduction de l’absorption de glucose, indiquant un stress cellulaire induit par l’hypoxie et une altération métabolique.
Toutes les procédures impliquant des modèles animaux ont été examinées par le comité institutionnel local de protection des animaux et le comité d’examen vétérinaire JoVE.
1. Ligature unilatérale de l’artère carotide commune (ACC)
2. Préparation à l’imagerie : vérifications du système et du matériel
3. Flux de travail d’imagerie
Une fois toutes les vérifications nécessaires de l’équipement terminées, procédez à l’imagerie comme suit :
Tableau 1. Paramètres de séquence d’impulsions IRM pour les balayages décrits dans le protocole, et paramètres d’acquisition, d’histogramme et de reconstruction TEP.
| Paramètres d’acquisition d’imagerie et acquisition | matérielle |
| IRM DE DIFFUSION (EPI-DWI) | |
| Temps d’acquisition | 15 min |
| Taille de la matrice | 256 x 64 |
| Tranches | 10 |
| FOV | 30 x 14 x 8 mm |
| Taille du voxel | 0,117 x 0,219 x 0,8 mm |
| Bande passante spectrale effective | 150 kHz |
| TE | 41 ms |
| TR | 3 000 ms |
| Moyennes 6 | |
| segments d’espace k | 16 |
| valeurs b | 0, 400, 800 sec/mm2 |
| IRM anatomique (MSME) | |
| Temps d’acquisition | 5 min |
| Taille de la matrice | 256 x 256 |
| Tranches | 16 |
| Champ de vision | 30 x 22 x 12,8 mm |
| Taille du voxel | 0,117 x 0,086 x 0,8 mm |
| TE | 14 ms |
| TR | 1 000 ms |
| Moyennes | 1 |
| Répétitions | 1 |
Balayage spectroscopique à résolution ponctuelle (PRESS) | |
| Temps d’acquisition | 15 s |
| Taille du voxel | 3,9 x 6 x 9 mm |
| TE | 20 ms |
| TR | 2 500 ms |
| Moyennes | 6 |
| FieldMap | |
| Temps d’acquisition | 1 min 21 s |
| 1er TE | 1,49 ms |
| 2e TE | 5,49 ms |
| TR | 20 ms |
| Moyennes | 1 |
Acquisition TEP, histogramme, et paramètres de reconstruction | |
| Tracer | [18F]FDG |
| Taux d’infusion | 4,44 μL/min |
| Temps d’acquisition | 60 min |
| Taille de l’image par tranche | 128 x 128 |
| Tranches | 99 |
| Taille du voxel | 0,4 x 0,4 x 0,6 mm |
| Cadrage dynamique | 12 x 300 s |
| Type de reconstruction | OS-MLEM (6 sous-ensembles, 6 itérations) |
| Ciseaux chirurgicaux | Roboz | RS-5852 | |
| Forceps | Roboz | RS-5237 | |
| Hartman Pince à moustiques | Miltex | 7-26 | |
| 2x pince à suture McPherson, 8,5 cm | Instruments chirurgicaux et scientifiques précis | 4473 | Il est utile de réduire la largeur d’ouverture avec une bande sur la pince utilisée pour maintenir l’artère carotide |
| 6-0 Suture en soie tressée enduite de silicone avec aiguille 3/8 C-1 | Covidien Sofsilk | S-1172 | |
| Système de couverture homéothermique | Harvard Apparatus | 507220F | |
| Super Débitmètre | d’hypoxie à colle (générique) | ||
| pour O₂ | Alicat Scientific | MC-500SCCM-D | |
| Flomètre pour N₂ | Alicat Scientific | MC-5SLPM-D | |
| O₂mètre | MSA | Altair Pro | |
| Imagerie | |||
| Système d’IRM 7,05 Tesla | Bruker | BioSpec | Diamètre intérieur de l’alésage de 20 cm avec jeu de gradient. Logiciel Paravision 5.1. |
| Bobine de volume Tx/Rx 1H, 35 mm ID | Bruker | T8100 | |
| Système PET | (interne) | 4x24 détecteurs LSO-PSAPD, | |
| 10x10 réseau LSO par détecteur, | |||
| pas de cristal de 1,2 mm et profondeur de 14 mm. 14 x 14 mm PSAPD. Champ de vision : 60 x 35 mm. Fenêtre d’énergie 350-650 keV. Fenêtre de chronométrage de 16 ns. | |||
| Moulage de vaisseau Pince Dumont | Roboz | RS-4991 | |
| Tube en polyéthylène PE-10 | BD Intramedic | 427401 | |
| Pompe à perfusion | Braintree Scientific | BS-300 | |
| Équipement de surveillance et de contrôle des animaux | Small Animal Instruments Inc. | Modèle 1025 | Uniquement surveillance respiratoire utilisé |
| Lit d’animal avec régulation de la température | (interne) | ||