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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Poisson zèbre sont d'un nouveau système pour la modélisation de maladies humaines du muscle squelettique. Nous décrivons une méthode rapide et efficace pour isoler les fibres musculaires des muscles squelettiques de poisson zèbre embryonnaire et larvaire. Cette méthode produit une préparation de haute densité myofiber approprié pour l'étude de la morphologie unique de fibres de muscle squelettique, la localisation subcellulaire des protéines, et la physiologie des muscles.
Le poisson zèbre s'est révélé être un système de modèle utile pour explorer la fonction des muscles squelettiques et pour l'étude de maladies musculaires humaines. Malgré les nombreux avantages offerts par l'analyse in vivo du muscle squelettique chez le poisson zèbre, visualiser le milieu complexe de protéines et finement structuré responsable de la fonction musculaire, en particulier dans les embryons entiers, peut être problématique. Cet obstacle tient à la petite taille du muscle squelettique poisson zèbre (60 um) et la taille encore plus petite du sarcomère. Ici, nous décrivons et démontrons une méthode simple et rapide pour isoler les fibres musculaires squelettiques à partir d'embryons de poisson zèbre et de larves. Nous incluons également des protocoles qui illustrent les techniques de préparation soumettre utiles pour analyser la structure et la fonction musculaire. Plus précisément, nous détaillons la localisation immunocytochimique ultérieure des protéines du muscle squelettique et l'analyse qualitative de la libération de calcium stimulée par l'imagerie en direct de calcium de la cellule. Dans l'ensemble, cette vidéoarticle fournit une méthode straight-forward et efficace pour l'isolement et la caractérisation des fibres musculaires squelettiques de poisson zèbre, une technique qui permet une conduite pour des études ultérieures myriade de structure et la fonction musculaire.
Le muscle squelettique est un tissu hautement spécialisé chargé de générer les forces nécessaires à la motilité contractile. Contraction est initiée par un processus connu sous le nom excitation-contraction (CE) de couplage qui convertit les signaux électriques à la libération de calcium des réserves intracellulaires 1,2. La libération de calcium intracellulaire active le sarcomère à raccourcir et à générer de la force. Les nombreux éléments spécifiques de la machinerie moléculaire responsable de la médiation transmission de la jonction neuromusculaire 3, le couplage CE 4,5, et l'actine-myosine contractions dépendantes 6 continuent à être l'objet permanent de recherche intense. En outre, les protéines qui stabilisent la membrane du muscle lors de la contraction de 7,8 et que la signalisation entre le myofiber et la matrice extracellulaire 7,9 médiate ont été identifiés et étudiés dans les moindres détails.
Des mutations dans un certain nombre de gènes importants pour la structure d'un musclefonction e ont été identifiés comme causes de maladies musculaires squelettiques humaines ( http://www.musclegenetable.org/ ). Ces maladies, classés largement que myopathies squelettiques et les dystrophies musculaires basés sur les caractéristiques cliniques et histopathologiques, sont associées à une faiblesse musculaire, une incapacité permanente, et au début de 10,11 de mortalité. Le poisson zèbre s'est avéré être un excellent système pour la modélisation et l'étude des maladies des muscles squelettiques humains 8,12,13. Il a été utilisé pour valider de nouvelles mutations génétiques 8, définir de nouveaux aspects de la maladie physiopathologie 14,15, et d'identifier de nouvelles approches thérapeutiques 15,16. La puissance de poisson zèbre pour étudier la maladie du muscle humain concerne le grand nombre d'enfants, le développement rapide de la structure musculaire et de la fonction, la clarté optique de l'embryon de poisson zèbre, et la facilité de la manipulation génétique et pharmacologique du zèbre en développementpoissons 17.
Nous et les autres 12,18,19 avons récemment développé une technique simple pour l'isolement rapide et efficace des fibres musculaires du poisson zèbre en développement. Cette méthodologie a permis l'examen des fibres musculaires plus en détail que peut être fournie par l'analyse de l'embryon entier. La technique a été exploitée pour la caractérisation de la protéine 20 localisation sous-cellulaire ainsi que pour l'identification des caractéristiques histopathologiques importants dans le cadre d'études de validation dans des modèles de maladie nouvellement mis au point 21. En outre, les fibres musculaires isolées peuvent en outre être utilisés pour l'imagerie en direct et pour les études électrophysiologiques 22, les techniques qui permettent d'interroger les principaux aspects de la fonction musculaire. Le protocole spécifique pour l'isolation des fibres musculaires, ainsi que deux exemples d'expériences analytiques ultérieurs, est détaillé dans les parties restantes de ce manuscrit.
Une. lamelles de préparation de poly-L-lysine couché (Durée: 1 h)
lamelles de revêtement permet le tassement des fibres musculaires rapides et l'adhérence. Cela peut être effectué au cours de l'étape de dissociation de l'isolement de fibres musculaires (étape 2 ci-dessous).
Note 1: Ces petites lamelles rondes aident à concentrer le nombre des fibres musculaires et réduire l'utilisation de l'excès d'anticorps.
Note 2: D'autres lamelles de taille vont travailler, mais les volumes de réactifs et d'embryons utilisés devront être ajustés en conséquence.
Note 3: Afin de garantir la stérilité, le revêtement peut être fait dans une hotte et sur des lamelles en autoclave.
Note 4: Gardez la boîte de Pétri de 60 mm avec du Parafilm sur le fond. Cette configuration sera utilisée pendant myofiber placage et immunomarquage (plus tard étapes).
Variante 1: Au lieu de lamelles de revêtement immédiatement avant de les utiliser, une lamelle de papier couché peut être utilisé. Un plat de 60 mm de Pétri contenant un minimum de 2 ml de poly-L-lysine peut être conservé à 4 ° C contenant de nombreuses lamelles. Avec cette alternative commencer à l'étape 1.5 pour traiter les lamelles de fibres musculaires.
Alternative 2: Nous avons également des lamelles de manteau en poly-L-ornithine. Tson est plus de travail, mais est utile pour plus de culture terme parce lamelles revêtues de poly-L-ornithine peut être traité anti-UV. Avec un traitement UV et technique stérile attention myofibers vivants peuvent généralement être maintenues en culture provenant 4-7 jours.
2. La dissociation des embryons de poisson zèbre et de placage de fibres musculaires (Durée: 1 à 3 heures)
Remarque: le protocole standard s'applique le mieux à 3 dpf (jours après la fécondation) des embryons.
Note 2: Surveiller attentivement embryon dissociation; plus ou moins de dissociation (surtout plus) sont les raisons les plus fréquentes de l'échec du protocole. Temps pour la digestion varie en fonction de l'intensité de trituration, nombre d'embryons par tube, et l'âge de l'embryon. Il est également souvent moins (par rapport au type sauvage) à partir d'embryons mutants du muscle squelettique.
Remarque3: temps de digestion moyen par âge de l'embryon: 1 dpf = 1 h, 2 dpf = 1,5 h, 3 dpf = 2 h et 4 dpf = 2-2,5 h.
Note 4: Embryon suspension peut être filtrée une seconde fois à travers un filtre de 40 um pour éliminer davantage les débris indésirables. D'une double filtration, la récupération est approximdiatement 800 ul d'un volume initial de 1 ml.
Note 5: Effectuer l'étape 2.9 dans les boîtes de Pétri avec du Parafilm sur le fond, préalablement préparé. Le Parafilm maintient la suspension de fibres musculaires de courir au large des lamelles recouvertes. Gardez boîtes de Pétri couverts pour éviter l'évaporation.
Note 6: les fibres musculaires commencent à s'installer dans 5-10 min. Cependant, pour une bonne fixation de fibres musculaires, un minimum de 1 heure (1-2 heures) est recommandé. Permettre fibres musculaires à se contenter de plus ne nuira pas à la préparation. Pour les incubations plus longues (y compris la nuit), les antibiotiques peuvent être ajoutés aux médias. Avec des antibiotiques et technique stérile cultures vivantes peuvent généralement être conservés pendant 1-2 jours.
Note 7: Le muscle squelettique de 1 dpf embryons ne pas plaquer les fibres allongées et clairement que striés. Au lieu de cela, les grandes myoballs sont visibles. En outre, au cours de l'après dissociation de phase de granulation (étape 2.6), 1 dpf myoballs doivent être centrifugé pendant un minimum de 8 min à 5000 xg pour obtenir une pastille. Pour l'analyse des embryons à ce stade, il est recommandé d'utiliser la lignée transgénique exprimant EGFP spécifiquement dans le muscle squelettique 23. Ceci permettra l'identification des cellules d'origine musculaire par rapport à d'autres sources.
3. Fluorescence Immunocoloration dissociées de poisson-zèbre fibres musculaires (Durée: environ 1 jour)
3.1. Immunomarquage
3.2. Des lamelles de montage
Remarque 1: Attention à l'orientation de la clamelle oated est critique.
4. Imagerie de cellules vivantes de calcium Utilisation GCaMP3
Expériences sur des cellules vivantes peuvent être effectuées sur les fibres musculaires avant la fixation (ci-après l'étape 2.10). Le protocole suivant décrit l'imagerie en direct dans les fibres musculaires exprimant GCaMP3 24, un indicateur de calcium codé génétiquement, exprimée par le α-actine poisson zèbre promoteur spécifique du muscle squelettique (PSKm) 23. Autrement,cette technique peut facilement être adapté pour utiliser des colorants indicateurs de calcium tels que Fura-2.
Immunomarquage fluorescent de fibres musculaires (figure 2)
Images montrant motif de marquage fluorescent attendu de fibres musculaires immunocolorées après isolement succès et le placage. Les fibres musculaires ont été marquées avec soit anti-récepteur de la ryanodine (1:100) (figure 2A) ou l'anti-α-actinine (1:100) (Figure 2B), les anticorps, et révéler l'immunomarquage de la triade et le Z-bande, respectivement. Anticorps secondaires utilisés étaient Alexa Fluor 555 (1:500). Les images capturées en utilisant la microscopie confocale.
La libération de calcium induite par une myofibrille (Figure 3)
série de panneau montrant la libération de calcium représentant d'une des fibres musculaires isolées traités à la caféine. En bref, les embryons de poisson zèbre ont été injectés au stade d'une cellule à l'PSKm: GCaMP3 construction. A 3 dpf, les embryons ont été dissociées et étalées comme décrit dans le protocole. Pour l'analyse, les fibres musculaires exprimant GCaMP3 ont été sélectionnés, comme indiqué par la présence d'une fluorescence verte à l'inclusion. En utilisant une micropipette pour l'administration du médicament, la fibre sélectionnée a été baigné dans une solution 30 mM de caféine pour induire la libération de calcium. L'enregistrement vidéo a été lancé avant l'application de la caféine et a continué jusqu'à ce pic de fluorescence a été atteint. Cette figure démontre la caféine induit la libération de calcium normal, et la technique peut être utilisée pour interroger le dispositif de couplage excitation-contraction par imagerie en temps réel.

Figure 1. Chronologie schématique de l'embryon de dissociation. Des panneaux successifs (de haut en bas) illustrent différentes étapes, le calendrier et l'équipement requis pour l'embryon dissociation. A) sélection d'embryons pour la dissociation. La barre d'échelle de 500 um. B) Jemage de configuration de dissociation. Les embryons sont dans les médias et la collagénase tout en tournant jusqu'à ce que suffisamment dégagée (Protocole étape 2) C) l'image de ces deux techniques de placage de fibres musculaires;. Lamelles rondes ou plaques à 24 puits (Protocole étapes 1 et 4, respectivement) D) Un champ lumineux. image de direct dissocié les fibres musculaires de poisson zèbre plaquées sur les poly-L lysine lamelles recouvertes. Les flèches indiquent les fibres musculaires allongées de 48 HPF poisson zèbre. Barre d'échelle 30 um.

Figure 2. Immunomarquage de fibres musculaires individuelles isolées à partir de 48 embryons HPF de poisson zèbre. A) myofiber marqué avec anti-récepteur de la ryanodine (RyR1), révélant un motif en bandes le long de la fibre conforme à la localisation de la triade / appareil de couplage CE. B) myofiber marqué avec anti-α -actinine, visualizin g stries (rouge) le long de la fibre musculaire à localiser le sarcomère et mettant en évidence les bandes Z. Dans les deux images, noyaux sont marqués au DAPI, considérés comme des ovales bleus. Inserts montrent des images de grossissement de la fibre musculaire dans la grande image. A) et B) de la barre de l'échelle 30 um.

Figure 3. Représentant induite calcium réponse de libération d'un seul myofiber poisson zèbre isolé. Tous les panneaux montrent une myofiber poisson zèbre pseudocolored exprimer GCaMP3. L'évolution dans le temps présente l'augmentation de la fluorescence GCaMP3 (de couleur rouge) en réponse à l'application de caféine de 30 mM. Début de l'enregistrement avant l'application de la caféine (0 ms) et a continué de réponse de fluorescence maximale (992 ms). Barre d'échelle 30 um.nk "> Cliquez ici pour agrandir la figure.
Les auteurs déclarent aucun conflits d'intérêts.
Poisson zèbre sont d'un nouveau système pour la modélisation de maladies humaines du muscle squelettique. Nous décrivons une méthode rapide et efficace pour isoler les fibres musculaires des muscles squelettiques de poisson zèbre embryonnaire et larvaire. Cette méthode produit une préparation de haute densité myofiber approprié pour l'étude de la morphologie unique de fibres de muscle squelettique, la localisation subcellulaire des protéines, et la physiologie des muscles.
Les auteurs tiennent à remercier les membres du laboratoire Dowling (Aaron Reifler, Trent Waugh, Angela Busta, et William Telfer) qui ont contribué au développement de la technique et de la production du manuscrit. Ce travail a été financé par l'Institut Taubman, le département de pédiatrie de l'Université du Michigan, et en partie par des dons de la Muscular Dystrophy Association (JJD MDA186999) et les National Institutes of Health (JJD 1K08AR054835).
| Plaque de culture 24 puits | Corning | 3524 | |
| 10x PBS | Invitrogen Gibco | 70011 | |
| CO2 Milieu indépendant | Invitrogen Gibco | 18045 | |
| Collagénase Type II | Worthington | Biochemical LS004186 | Lot 41H12764 |
| Collagénase Type IV | Worthington | Biochemical L5004188 | |
| 8 % Paraformaldéhyde | Microscopie électronique Sciences | 157-8 | |
| Méthanol | Sigma | 322415 | |
| Triton X-100 | Sigma | X100 | |
| BSA | Sigma | A2153 | |
| Sérum de mouton | Sigma | S3772 | |
| Sérum de chèvre | Sigma | G9023 | |
| Lamelles de protection en verre | Fischerbrand | 12-545-82 12CIR-1D | |
| Poly-L-Lysine | Sigma | P4707 | |
| Pronase | Sigma | P5147 | |
| 40 &mu ; m Filtre | BD Biosciences | 352340 | |
| 70 &mu ; m Filtre | BD Biosciences | 352350 | |
| Prolong Gold réactif anti-décoloration | Invitrogen | P36931 | |
| Anticorps anti-&alpha ;-actinine | Sigma | A5044 | |
| Anticorps anti-RYR | Abcam | 34C | |
| Alexa Fluor | anticorps Invitrogen | A-21425 | |
| TWEEN 20 | Sigma | P1379 | |
| Boîte de Pétri 60 mm | Fischerbrand | 0875713A | |
| Poly-L-Ornithine | Sigma | P4957 | |
| Lame de microscope | Fischerbrand | 12-550-15 | |
| Caffeine | Sigma | C0750 |