Ce protocole décrit la détection colorimétrique rapide d’Escherichia coli, de Salmonella spp. et de Listeria monocytogenes dans de grands volumes (10 L) d’eaux agricoles. Ici, l’eau est filtrée à l’aide d’écouvillons Moore modifiés stériles (MMS), qui consistent en un simple filtre de gaze enfermé dans une cartouche en plastique, pour concentrer les bactéries. Après filtration, des enrichissements non sélectifs ou sélectifs des bactéries cibles sont effectués dans le MMS. Pour la détection colorimétrique des bactéries cibles, les enrichissements sont ensuite dosés à l’aide de dispositifs analytiques sur papier (μPAD) intégrés dans des substrats indicateurs de bactéries. Chaque substrat réagit avec des enzymes bactériennes indicatives cibles, générant des produits colorés qui peuvent être détectés visuellement (détection qualitative) sur le μPAD. Alternativement, des images numériques des μPADs réactifs peuvent être générées à l’aide d’appareils de balayage ou photographiques courants et analysées à l’aide du logiciel ImageJ, ce qui permet une interprétation plus objective et standardisée des résultats. Bien que les procédures de dépistage biochimique soient conçues pour identifier les agents pathogènes bactériens susmentionnés, dans certains cas, les enzymes produites par le microbiote de fond ou la dégradation des substrats colorimétriques peuvent produire un faux positif. Par conséquent, une confirmation à l’aide d’un diagnostic plus discriminatoire est nécessaire. Néanmoins, cette plateforme de concentration et de détection bactérienne est peu coûteuse, sensible (limite de détection de 0,1 UFC/ml), facile à réaliser et rapide (la concentration, l’enrichissement et la détection sont réalisés dans un délai d’environ 24 heures), justifiant son utilisation comme première méthode de dépistage de la qualité microbiologique de l’eau agricole.