Notre expérience avec ce protocole au cours des 10 dernières années a conduit à l'identification des questions méthodologiques critiques. Tout d'abord, la dissection rapide du cerveau dans une boîte de Pétri sur de la glace pilée est important de maintenir la qualité de la préparation. Deuxièmement, il faut être conscient que la sonication de tissu est plus court pour l'amygdale cérébrale par rapport à d'autres types de tissus, comme le cœur (10 sec) ou les reins (20 sec). Troisièmement, un grand soin doit être pris pour mélanger soigneusement le substrat avant de l'ajouter aux échantillons. Nous avons rencontré des signaux variables lorsque la séquence de mélange était inadéquate. Quatrièmement, pas de bulles doivent être présents dans la cellule en quartz lors de la lecture des échantillons. Dans le cas contraire, le signal pourrait être modifiée.
Nous avons fait un changement au cours des dernières années pour accroître la reproductibilité des résultats: l'augmentation du volume de substrat pour éviter volume inférieur à 1 pl. Cependant, de petites variations peuvent se produire entre les essais successifs, et au moins 3 échantillons de contrôle doivent être utilisées pourle contrôle des variations. Mesures de fluorescence de ces contrôles sont en moyenne et la moyenne est fixée à 100%. Des mesures de fluorescence dans les échantillons expérimentaux sont transformées en pour cent des échantillons de contrôle.
Une autre limite de cette technique est que seule une partie de tissu est utilisé et, par conséquent, l'activité caspase-3 pourrait être sous-estimée. En effet, la fenêtre de temps de l'apoptose est courte dans une cellule donnée et peut être manquée, même si elle se produit dans des zones voisines au moment de l'échantillonnage 1,4,15. L'inverse est également possible: l'apoptose pourrait être particulièrement intense dans les parties de tissus, ce qui entraîne une surestimation de l'activité caspase-3. Nous recommandons l'utilisation de tissus restants (amygdale) pour des techniques complémentaires, tels que des essais TUNEL ou rapport Bax / Bcl-2 (voir Introduction).
Spectrofluorométrie a au moins deux avantages sur Western blot. Tout d'abord, il génère directement des données quantitatives. Deuxièmement, il mesure une enzymatiquectivité elle-même plutôt que la protéine ou l'ARN expression, qui peut être sans rapport, et il est connu que l'expression de protéine peut être accrue sans modification de l'activité enzymatique. En outre, spectrofluorimétrie peut être effectuée sur d'autres tissus ou d'espèces différentes et peut être ajusté à d'autres sous-types de caspases, avec différents substrats, de sorte que la comparaison peut être effectuée sans danger.
En conclusion, ce document démontre l'utilisation de spectrofluorométrie pour mesurer activité caspase-3 dans l'amygdale, fournissant la preuve que l'apoptose se produit dans cette région du système limbique 3 jours après un IM.