Mesure Phagosome pH par Ratiométrique microscopie à fluorescence

Résumé

Le pH phagosomal influence la maturation des phagosomes, la production d’oxydants, la destruction des phagosomes ainsi que la présentation de l’antigène. Nous décrivons ici une méthode ratiométrique pour mesurer les changements de pH dans le temps et les paramètres finaux dans les phagosomes individuels des phagocytes vivants à l’aide de la microscopie à fluorescence.

Résumé

La phagocytose est un processus fondamental par lequel les cellules immunitaires innées engloutissent les bactéries, les cellules apoptotiques ou d'autres particules étrangères dans le but de tuer ou neutraliser la matière ingérée, ou de le présenter comme antigènes et d'initier des réponses immunitaires adaptatives. Le pH de phagosomes est un paramètre critique régulation de fission ou fusion avec endomembranes et l'activation des enzymes protéolytiques, des événements qui permettent à la vacuole phagocytaire à mûrir dans une organelle dégradable. En outre, la translocation ^des ions H + est requis pour la production de niveaux élevés d'espèces oxygénées réactives (ROS), qui sont essentiels pour la destruction efficace et signalisation à d'autres tissus de l'hôte. De nombreux agents pathogènes intracellulaires subvertissent assassinat phagocytaire en limitant l'acidification du phagosome, soulignant l'importance du pH dans phagosome biologie. Nous décrivons ici une méthode pour mesurer phagosomale quotientométrique pH dans les neutrophiles en utilisant l'isothiocyanate de fluorescéine (FITC) marqué au zymosan que phagocytaire targETS, et imagerie des cellules vivantes. Le dosage est basé sur les propriétés de fluorescence du FITC, qui est refroidi par un pH acide lorsqu'il est excité à 490 nm mais non lorsqu'il est excité à 440 nm, ce qui permet la quantification d'un rapport dépendant du pH, au lieu de fluorescence absolue, d'un seul colorant. Un protocole détaillé pour réaliser in situ colorant étalonnage et la conversion de rapport aux valeurs réelles de pH est également fourni. Simple-dye méthodes ratiométriques sont généralement considérés comme supérieurs à longueur d'onde unique ou protocoles de pseudo-ratiométrique double teinture, car ils sont moins sensibles aux perturbations telles que le blanchiment, les changements de focus, les variations de laser, et l'étiquetage inégale, qui faussent le signal mesuré. Ce procédé peut être facilement modifié pour mesurer le pH dans d'autres types de cellules phagocytaires, et zymosan peut être remplacée par toute autre particule contenant une amine, à partir de billes inertes à des micro-organismes vivants. Enfin, ce procédé peut être adapté pour utiliser d'autres sondes fluorescentes sensibles à des gammes de pH ou d'autres phagosomactivités al, ce qui en fait un protocole généralisé pour l'imagerie fonctionnelle de phagosomes.

Introduction

Phagocytose, le processus par lequel les cellules immunitaires innées engloutissent de grosses particules, a évolué à partir du mécanisme alimentaire des organismes unicellulaires, et implique de se lier à une cible, de l’envelopper d’une membrane et de pincer la membrane pour former une vacuole dans le cytosol appelée phagosome. Alors que la membrane phagosomale est dérivée de la membrane plasmique, le tri actif des protéines et des lipides, ainsi que la fusion avec les endomembranes lors de la formation du phagosome, transforment le phagosome en un organite distinct au sein de la cellule avec des propriétés dégradantes qui permettent la destruction, la neutralisation et la décomposition du matériel ingéré^1-3. Ce processus, appelé maturation phagosomale, repose sur l’administration d’une foule d’enzymes protéolytiques et microbicides, y compris la nicotinamide adénine dinucléotide phosphate (NADPH) oxydase qui transfère des électrons dans les phagosomes produisant l’oxydant fort O₂^- et son dérivé l’espèce réactive de l’oxygène (ROS) ^2,4.

Le pH luminal des phagosomes a une influence profonde sur plusieurs événements nécessaires à la fonction des phagosomes. Tout d’abord, le pH influence le trafic des endomembranes en général, car les changements conformationnels dépendants du pH des régulateurs du trafic transmembranaire modifient le recrutement des déterminants du trafic tels que Arfs, Rabs et les protéines de l’enveloppe vésiculaire, qui à leur tour définissent quelles vésicules peuvent fusionner avec les phagosomes ^{5 à 8}. Deuxièmement, la composition ionique de la lumière phagosomale est également transformée à mesure que les phagosomes mûrissent, et certains transporteurs d’ions, tels que l’échangeur Na⁺/H⁺ ou les antiporteurs Cl-/H⁺ de la famille ^ClC, qui favorisent la fonction phagocytaire, reposent sur la translocation H^{+ 9,10}. De même, la production de ROS est intimement liée au pH phagosomal. Les ROS et leurs sous-produits oxydants toxiques sont depuis longtemps reconnus comme cruciaux pour la destruction des phagosomes dans les neutrophiles ^{4, 11, 12}, et il a été démontré qu’ils jouent un rôle essentiel dans d’autres phagocytes, notamment les macrophages, les cellules dendritiques (DC) et les amibes ^13-16. La NADPH oxydase est une enzyme électrogène qui libère H⁺ dans le cytosol lorsque le NADPH est consommé, et qui nécessite le transfert simultané de H⁺ à travers les canaux HVCN1 compagnons le long des électrons transportés dans la lumière phagosomale, afin d’atténuer la dépolarisation massive qui conduirait autrement à l’auto-inhibition de l’enzyme ^17-21. Enfin, plusieurs enzymes protéolytiques ont une activité optimale à différents pH, de sorte que les changements de pH phagosomal en fonction du temps peuvent influencer quelles enzymes sont actives et quand. L’importance du pH phagosomal est mise en évidence par des organismes tels que Mycobacterium tuberculosis, Franciscella tularensis et Salmonella typherium qui subvertissent la destruction phagosomale au moins en partie en modifiant le pH phagosomal ^{de 22 à 24}.

Chez les mammifères, les principaux phagocytes sont les neutrophiles, les macrophages et les cellules dendritiques, et selon le type de cellule, les changements de pH phagosomal en fonction du temps peuvent varier considérablement et semblent jouer des rôles différents. Dans les macrophages, une acidification forte et rapide médiée par la pompe à protons vacuolaire ATPase (V-ATPase) dépendante de l’ATP est l’un des facteurs clés médiant la destruction ^25-27, ressemblant aux mécanismes présents dans les amibes qui utilisent la phagocytose comme mécanisme alimentaire ²⁸. Dans ces cellules, on pense que l’activation des protéases acides joue un rôle clé. En revanche, la destruction des neutrophiles repose davantage sur les ROS ainsi que sur le HOCl produit par la myéloperoxydase (MPO)¹¹, et le pH reste neutre ou alcalin pendant les 30 premières minutes, ne s’acidifiant que plus tard ^29,30. Un pH neutre a été suggéré pour favoriser l’activité des protéases oxydatives telles que certaines cathepsines. Dans les DC, le pH phagosomal est controversé, certains signalant une acidification et d’autres un pH neutre ou alcalin ^{de 31,32}, mais les ROS et le pH peuvent profondément influencer la capacité de ces cellules à présenter des antigènes aux lymphocytes T, l’une de leurs principales fonctions ³³.

Il est important de noter que les hormones, les chimiokines et les cytokines peuvent produire des événements de signalisation qui induisent la maturation et des changements dans le comportement des phagocytes, et influencent à leur tour le pH phagosomal ^34,35. De même, des médicaments, par exemple l’antipaludique chloroquine, qui est également envisagé pour les thérapies anticancéreuses ³⁶, peuvent affecter le pH phagosomal et donc les résultats immunitaires. Ainsi, une variété de biologistes cellulaires, d’immunologistes, de microbiologistes et de développeurs de médicaments peuvent s’intéresser à la mesure du pH phagosomal lorsqu’ils cherchent à comprendre les mécanismes sous-jacents aux effets d’une perturbation génétique, d’un composé bioactif ou d’un micro-organisme particulier sur les réponses immunitaires innées et adaptatives.

Nous décrivons ici une méthode de mesure du pH phagosomal dans les neutrophiles qui nous a permis de montrer l’importance du canal HVCN1 dans la régulation du pH phagosomal ¹⁹ des neutrophiles. La méthode est basée sur la propriété ratiométrique de l’isothiocyanate de fluorescéine (FITC) dont l’émission de fluorescence à 535 nm est sensible au pH lorsqu’elle est excitée à 490 nm mais pas à 440 nm ³⁷. Lorsque ce colorant est couplé chimiquement à une cible, dans ce cas le zymosan, il peut être suivi à l’aide de la microscopie à fluorescence à champ large, où les cellules sont imagées pendant qu’elles phagocytent, et les changements de pH phagosomal sont mesurés en temps réel à mesure que le phagosome mûrit. Le pH réel est ensuite glané en effectuant une expérience d’étalonnage où les cellules qui ont phagocyté sont exposées à des solutions de pH différents contenant les ionophores nigéricine et monensin, qui permettent l’équilibre rapide du pH dans les phagosomes avec la solution externe. Les valeurs de rapport sont ensuite comparées au pH connu des solutions, une courbe d’étalonnage est construite par régression non linéaire et l’équation résultante est utilisée pour calculer le pH à partir de la valeur du rapport.

Protocole

Déclaration éthique: Toutes les manipulations d'animaux ont été effectuées en stricte conformité avec les directives du Comité de recherche animale de l'Université de Genève.

1. Préparation des cibles phagocytaires

1. Ajouter 20 mg de zymosan séché à 10 ml de solution saline stérile de phosphate tamponnée (PBS). Vortex et à la chaleur dans un bain d'eau bouillante pendant 10 min. Refroidir et centrifuger à 2000 g pendant 5 min.
2. Retirer le surnageant, remettre en suspension dans 1 ml de PBS et de traitement par ultrasons pendant 10 minutes dans un sonicateur à bain-marie. Transférer 500 ul de deux tubes de 1,5 ml. Centrifuger à 11 000 g pendant 5 min.
3. Répétez le lavage avec 500 pi de PBS. Le zymosan bouillie peut être aliquoté, congelé et stocké à -20 ° C.
4. Laver deux fois le zymosan dans 500 ul fraîchement préparées 0,1 M _de Na 2 CO _3, pH 9,3 comme ci-dessus (étape 1.2).
5. Remettre en suspension dans 490 pi après le lavage final. Ajouter 10 ul de 10 mg / ml dissous dans FITC diméthyl sulfoxide (DMSO), vortex, couvrir de papier, et incuber sous agitation pendant 4 heures à température ambiante.
6. Pour supprimer le colorant non lié, laver comme ci-dessus (étape 1.2), d'abord avec 0,5 ml de DMSO + 150 pi de PBS, puis 0,5 ml de DMSO + 300 pi de PBS, puis 0,5 ml de DMSO + 450 pi de PBS, puis PBS seul.
7. Comptez zymosane utilisant un hémocytomètre. Ajouter 1 pi de zymosan à 500 ul de PBS, vortex, puis ajouter 10 ul du bord de la chambre d'hémocytomètre, où elle rencontre la lamelle couvre-objet placé sur la grille centrale. Montez le hémocytomètre sur un microscope à champ lumineux équipé d'un objectif 20X.
8. Concentrez-vous sur le coin supérieur gauche contenant 16 carrés et compter toutes les particules de zymosan dans ce domaine en utilisant un compteur à main. Répéter l'opération avec le coin inférieur droit. Calculer la concentration zymosane utilisant l'équation suivante: concentration Zymosan = comte / 2 x 500 x 10 ⁴ zymosane / ml. Zymosane marqué peut être aliquoté, congelé et stocké à -20 ° C.
9. Opsoniser le wi zymosane marquéth un anticorps anti-lapin zymosan à 1: 100 dilution. Vortex et incuber pendant 1 heure dans un bain d'eau à 37 C °. Laver avec 500 pi de PBS comme ci-dessus (étape 1.2).
   Remarque: Le traitement par ultrasons est fortement recommandé, surtout après opsonisation, comme zymosane tend à former des amas qui peuvent rendre plus difficile l'analyse plus tard. Opsonisation avec 65% v / v de sérum humain ou de rat peut être utilisé comme une alternative.
10. Comptez zymosane utilisant un hémocytomètre comme décrit dans les étapes 1,7-1,8, et diluer à 100 x 10 ⁶ particules / ml. Opsonisation avec d'autres stimulateurs phagocytaires, comme complément ou pas opsonisation, peut également être réalisé.

2. Live Video Microscopy

1. Isoler neutrophiles primaires de souris comme décrit en détail par ailleurs ^38.
   1. Vous pouvez également utiliser n'importe quel type de cellule phagocytaire. Gardez neutrophiles sur la glace à Roswell Institut Memorial Park (RPMI) 1640 milieu supplémenté avec 5% de sérum de veau foetal (v / v), 200 U de pénicilline / streptomycin, à une concentration de 10 x 10 ⁶ cellules / ml jusqu'à utilisation. D'autres types de cellules peuvent être ensemencées 1-4 jours avant.
2. Ajouter 2 x 10 ⁵ (20 ul) de neutrophiles au centre d'une boîte à fond de verre 35 mm, étaler la goutte par addition de 50 ul de milieu et on incube à 37 ° C pendant 5 minutes pour permettre aux cellules d'adhérer.
3. Ajouter 1 ml de solution saline équilibrée de Hank (HBSS) chauffé à 37 ° C contenant le MPO spécifique hydrazide inhibiteur de 4-aminobenzoïque (4-ABH, 10 M). MPO inhibiteurs non spécifiques, tels que l'azoture de sodium (5 mM), peuvent également être utilisés mais ont récemment été suggéré d'exercer des effets non spécifiques supplémentaires à pH ^39.
4. Monter le plat sur un microscope à fluorescence à grand champ équipé d'un système de chauffage C de 37 ° et un objectif de l'huile 40X. Incuber les cellules sans imagerie pendant 10 minutes pour permettre aux cellules et du matériel à équilibrer.
5. Réglez les paramètres de microscope pour acquérir une image de transmission à champ lumineux [phaSE ou contraste d'interférence différentiel (DIC) si disponible] avec 440 nm ou 490 nm excitation et 535 nm émissions toutes les 30 secondes.
6. Ajuster le temps d'exposition et la fréquence d'acquisition en fonction du système de microscope pour éviter trop de photoblanchiment et de phototoxicité et en fonction de la question posée expérimentales. Commencez acquisition d'image.
7. Après 2 minutes, ajouter 10 x 10 ⁶ (50 pi) zymosan opsonisé FITC vers le centre du plat. Ajuster cible: ratios de cellules en fonction du type de phagocyte et cible utilisée.
8. Continuer imagerie pendant 30 min. Après 30 min d'interrompre l'acquisition time-lapse et commencer une minuterie. Déplacez la scène et capturer 10 ou plusieurs instantanés dans différents champs de vision à l'image d'autres phagosomes, tous à moins de 5 min.

3. étalonnage et de contrôle expériences

1. Préparer les solutions d'étalonnage de pH (recettes sont décrites dans le Tableau 1) avant le jour de l'expérience et de geler en portions de 10 ml.Décongeler les solutions d'étalonnage et chaude à 37 ° C dans un bain d'eau. Vérifier le pH avec un pH-mètre et d'enregistrer le pH réel de solutions.
2. Monter une pompe péristaltique sur le plat de fond de verre avant l'acquisition de l'image et effectuer la microscopie de la vidéo en direct, comme décrit ci-dessus (article 2).
3. A la fin de la période d'acquisition de 30 min tourner sur la pompe pour éliminer la solution à l'intérieur de la cuvette, ajouter 1 ml de la première solution d'étalonnage et d'arrêter la pompe.
4. Attendre que le signal se stabilise, habituellement de 5 min. Répéter l'opération avec chaque solution d'étalonnage.
   1. Effectuer au moins une calibration par jour expérimental, et étalonner en commençant par le plus haut et le pH de travail de manière séquentielle à la plus basse, ainsi que le pH de départ et de travail séquentiellement le plus bas vers le plus haut.
5. A titre de témoin, ajouter 100 ul de 100 uM de l'inhibiteur de la NADPH oxydase diphényl propionium iodure (DPI) dilué dans du HBSS à 900 ul de cellules dans du HBSS dans le fond plat en verre, etincuber pendant 10 min.
6. Commencez acquisition et ajouter zymosane comme ci-dessus (étape 2.7). Après 15 min de la phagocytose, ajouter 10 ul de 10 uM de l'inhibiteur V-ATPase concanamycin A (ConcA) dilué dans du HBSS et continuer imagerie pour 15 minutes supplémentaires.

4. Analyse

1. Analyse des films time-lapse et instantanés phagosome.
   Remarque: Les instructions suivantes sont spécifiques pour ImageJ. Étape par étape les instructions peuvent varier considérablement en fonction du logiciel utilisé, mais les fonctions décrites dans cette section sont disponibles dans la plupart des logiciels professionnels d'analyse d'image.
   1. Ouvrez les images avec un logiciel professionnel d'analyse d'image. Soustraire le fond dans le canal 490 en dessinant un petit ROI carré avec l'outil de sélection de polygone carré dans une zone où il n'y a pas de cellules, et en cliquant sur Plugins> BG Soustraction de ROI. Ensuite, téléchargez le même retour sur investissement sur le canal 440 en cliquant sur Modifier> Sélection> Restaurer la sélection et répétez.
   2. Faire un rapport d'image 32 bits du canal 490 divisé par le canal 440 en cliquant sur Processus> Calculatrice de l'image ..., en sélectionnant les images appropriées dans les menus déroulants ci-Image1 et Image2, puis en sélectionnant 'Divide' dans le menu déroulant Opération et la vérification de la case à cocher de résultat de 32 bits (float).
   3. Modifiez la table de consultation codage couleur à un codage couleur ratio compatible en cliquant sur Image> Tables de recherche> arc RVB. Seuil de l'image de rapport pour éliminer 0 et l'infini pixels en cliquant sur Image> Réglages> Seuil .... Ajustez les barres de défilement pour que zymosane apparaît en rouge et cliquez sur Appliquer, faire que le jeu des pixels de fond à case Nan est sélectionné.
   4. Combinez ce ratio pile avec le canal champ lumineux en un composite multi-canal en cliquant sur Image> Couleur> Fusionner les couches, et en sélectionnant l'image lumineuse-champ dans le menu gris canal de la liste déroulante et le rapport d'image dans le menu déroulant de la voie verte, et la sélection de laGardez images source case à cocher. Numérisation des films time-lapse ou des instantanés pour déterminer les phagosomes doivent être analysés. Le canal champ lumineux est utile pour cela.
   5. Dessiner des régions d'intérêt (ROI) en utilisant l'outil de sélection de polygones ovale autour phagosomes, et les ajouter au gestionnaire de ROI en cliquant sur Analyse> Outils> Gestionnaire de ROI> Ajouter. Mesurer leur ratio d'intensité zymosane en cliquant sur Plus> Multi-mesures et de-la sélection de la ligne par un chèque-boîte de tranche.
   6. Pour les films time-lapse, piste phagosomes un à la fois en dessinant un retour sur investissement, en tapant Ctrl + M pour mesurer chaque point de temps, et en déplaçant le ROI lorsque cela est nécessaire pour suivre les valeurs d'intensité au fil du temps. Copiez les mesures de la fenêtre de résultats dans un tableur.
      Remarque: L'analyse de 15 (5 cours à temps par expérience x 3) expériences indépendantes est idéal, mais plus ou moins peuvent être nécessaires en fonction de la variabilité observée. Sauvegarde des Rois est toujours recommandé. Certains logiciels permettent REGI d'imagestration et mise à jour dynamique de Rois, faciliter cette partie de l'analyse.
2. Conversion de fluorescence à des valeurs de pH
   1. Mesurer le rapport 490/440 pour phagosomes dans les films time-lapse étalonnage comme décrit dans la section 4.1.
   2. Dans une feuille de calcul, tracer les valeurs de ratio au fil du temps, et de calculer les valeurs moyennes du ratio de tous les phagosomes dans le champ de vue (généralement, entre 5-20) à partir de 5 points dans le temps dans le milieu de la période de temps correspondant à chaque étalonnage de pH solution. (Voir aussi les boîtes rouges dans la figure 5A.)
   3. Tracer ces 490/440 valeurs de ratio moyen contre le pH mesurée réelle. Combinez au moins 3 étalonnages indépendants en un seul graphique. Utilisez un logiciel de statistique ou numérique pour effectuer une régression non linéaire (le meilleur de la courbe de forme), généralement à une équation sigmoïde.
      Note: Par exemple, dans la figure 5B l'équation utilisée était une sigmoïde de Boltzmann [Y = Bottom + ((Haut-Bas)/ (1 + EXP ((V50-X) / Slope))], où les valeurs y sont les ratios 490/440, X sont les valeurs de pH et haut, en bas, les paramètres V50 et la pente sont calculées par le logiciel.
   4. Utilisez l'équation obtenue pour transformer les valeurs du rapport au pH.
      Remarque: Par exemple, sur la figure 5B l'équation obtenue pour la courbe d'étalonnage en présence d'azoture de sodium est 490/440 Ratio = 1,103 + [(2,89 à 1,103) / (1 ​​+ EXP ((6,993 pH) /0.9291)] . La résolution de pH donne l'équation suivante: pH = 6,993 à 0,9291 * [LN ((1.178 / (Ratio-1.103)) - 1))].

Résultats

Voici les résultats représentatifs pour une expérience où le phagosome pH de neutrophiles de souris primaires isolées de la moelle osseuse de type sauvage ou Hvcn1 ^{- / -} les souris ont été comparés. Pour une expérience réussie, il est important d'obtenir suffisamment phagosomes dans le champ de vision pendant toute la durée du film time-lapse, tout en évitant de trop nombreux phagosomes, qui sera ensuite plus difficile de segmenter lors de l'analyse d'image. La figure 1 montre

Discussion

Bien que plus de temps que d'autres méthodes, telles que la spectroscopie et FACS, qui emploient une stratégie similaire en utilisant un colorant sensible au pH couplé à des objectifs, mais mesurer le pH moyen d'une population de phagosomes, microscopie offre plusieurs avantages. La première est que interne et externe lié, mais pas intériorisé, les particules peuvent être aisément distingué sans avoir à ajouter d'autres produits chimiques, comme le bleu trypan ou des anticorps, pour étancher ou étiqueter par...

Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article

Nom	Entreprise	Numéro de catalogue	Commentaires
Poudre Zymosan A	Sigma-Aldrich	Z4250	Il existe différents fournisseurs
Isothiocyanate de fluorescéine	Sigma-Aldrich	F7250	Différents fournisseurs existent
Anticorps anti-zymosan (réactif d’opsonisation des bioparticules Zymosan A)	Life Technologies	Z2850	Sigma-Aldrich O6637 est un produit équivalent. Alternativement, le sérum à 25 % peut être utilisé comme réactif d’opsonisation.
Hydrazide 4-aminobenzoïque (4-ABH)	Santa Cruz	sc-204107	Toxique, utilisez des gants, il existe divers fournisseurs Chlorure
diphénylèneiodonium (DPI)	Sigma-Aldrich	D2926	Toxique, utilisez des gants, il existe plusieurs fournisseurs
Concanamycine A (ConcA)	Sigma-Aldrich	27689	Toxique, utilisez des gants, divers fournisseurs existent
Nigericin	Sigma-Aldrich	N7143	Toxique, utilisez des gants, il existe plusieurs fournisseurs
Monensin	Enzo	ALX-380-026-G001	Toxique, utilisez des gants, divers fournisseurs existent
Solution saline tamponnée au phosphate (PBS)	Life Technologies	14200-075	Toxique, utilisez des gants, différents fournisseurs existent
Solution saline équilibrée de Hank	Technologies	14025092	La solution saline équilibrée de Ringer ou d’autres tampons physiologiques clairs peuvent être substitué.
Carbonate de sodium (Na2CO3)	Sigma-Aldrich	S7795	Il existe différents fournisseurs
d’acide 2-(N-morpholino)éthanesulfonique (MES)	Sigma-Aldrich	M3671  ;	Il existe différents fournisseurs
Acide 4-(2-hydroxyéthyl)pipérazine-1-éthanesulfonique (HEPES)	Sigma-Aldrich	H3375	Il existe différents fournisseurs
de N-méthyl-D-glucamine (NMDG)	Sigma-Aldrich	M2004  ;	Il existe différents fournisseurs
Éthylène glycol-bis(2-aminoéthylétre)-N,N,N&prime ;,N&prime ;,-acide tétraacétique (EGTA)	Sigma-Aldrich	3777	Il existe différents fournisseurs
Tris(hydroxyméthyl)aminométhane (Tris)	Sigma-Aldrich	T1503  ;	Il existe différents fournisseurs
Chlorure de potassium (KCl)	Sigma-Aldrich	P9333	Il existe différents fournisseurs
Chlorure de sodium (NaCl)	Sigma-Aldrich	S7653	Il existe différents fournisseurs
Chlorure de magnésium (MgCl2)	Sigma-Aldrich	M8266	Il existe différents fournisseurs
Éthanol absolu (EtOH)	Sigma-Aldrich	2860	existe
différents fournisseursBoîtes de Pétri à fond en verre de 35 mm (Fluorodish)	World Precision Instruments	FD35-100	Ibidi µ ;-clear Boîtes ou lamelles avec chambres d’imagerie appropriées peuvent être remplacées
Bain-marie soniquant	O. Kleiner AG		Un sonicateur peut être utilisé à la place, il existe différents fournisseurs d’instruments
Héamocytomètre	Marienfeld GmbH		Il existe
différents fournisseurs d’instrumentsMicroscope d’imagerie en direct à grand champ	Carl Zeiss AG		Il existe différents fournisseurs d’instruments, mais le microscope doit être capable d’imager respectivement 440/535 et 490/535 d’excitation/émission. Les configurations confocales à disque rotatif avec des capacités de fond clair peuvent être remplacées, mais le zymosan a tendance à se défocaliser plus souvent.   ;
Pompe péristaltique (Dynamax RP-1)	Il existe différents fournisseurs	d’instruments
pH mètre	Schott Geräte GmbH		Différents fournisseurs d’instruments existent
Manual Counter	Milian SA		existe différents fournisseurs d’instruments