ERK active (dpERK) suit un schéma de localisation spatiale et dynamique stéréotypée dans le C. germinale elegans. Ce modèle stéréotypé dpERK spatiale (Figure 5), et de l' amplitude dans un adulte C. elegans gonades, peut être efficacement en corrélation avec les nombreux processus biologiques qui ERK réglemente. Par exemple, une incapacité à activer ERK dans la zone 2 résultats à une arrestation dans les ovocytes en prophase de la méiose, un phénotype observé dans des lignées germinales femelles qui ne spécifient pas le sperme, et donc ne pas activer ERK dans les ovocytes matures (figure 5). Accouplement avec les résultats de mâles dans l' accumulation effective de dpERK dans la zone 2 dans les lignées germinales femelles 11,13, associée à l' apparition de la maturation ovocytaire et l' ovulation. Ainsi l'analyse des configurations spatiales et activation temporelle de dpERK sur certaines perturbations génétiques (tels que l'interférence ARN médiée par inactivation génique) ou des traitements chimiques permet d'identifier des facteurs qui REGUsignalisation ERK fin et les processus biologiques ainsi ERK-dépendants. Ces analyses permettent également la découverte des interactions génétiques entre les nouvelles voies de signalisation.
Un goulot d'étranglement critique pour toute analyse fondée sur l'imagerie est la disponibilité des réactifs fonctionnels tels que des anticorps qui sont spécifiques à l'application. Si un tel réactif existe alors des procédés tels que celui décrit ci-dessus peut être facilement adapté pour l'analyse du motif de localisation pour toute protéine d'intérêt. L'application est donc limitée par la disponibilité d'un anticorps fonctionnel. En outre, parce que la méthode décrit la dissection et la coloration à un temps de développement donné, il ne permet la saisie des informations dans un laps de temps, et ne jette pas la lumière sur la dynamique ou la régulation des protéines en temps réel ou le taux de renouvellement des protéines.
Le procédé décrit ci - dessus est adapté de Francis et al. , 23, qui est distincte de la Seydoux et Dunn mÉTHODE 24 pour gonades extrusion et la coloration des anticorps. La méthode basée sur Francis et al. Sera appelée la «méthode de suspension" et la méthode Seydoux et Dunn appelé le «gel fissuration méthode" pour la comparaison. La méthode de suspension a été très efficace dans nos mains pour obtenir des modèles de localisation reproductibles de molécules de signalisation telles que dpERK, qui sont par nature plus sensibles aux conditions de manipulation difficiles. Dans le cas de dpERK localisation, dans notre expérience, le signal dans la zone 1 est pratiquement indétectable avec la méthode de gel de craquage. En outre, l'échantillon de séchage, ce qui peut souvent se produire avec le procédé de congélation de craquage, se traduit par des signaux parasites d'anticorps. Le procédé de suspension minimise le séchage de l'échantillon, puisque les gonades sont mises en suspension dans un liquide tout au long du processus. Nous constatons également que la méthode de suspension est utile pour l'imagerie multiples génotypes différents sur une seule lame. Par exemple, si deux génotypes, tels que hermaphrodites vsles femmes doivent être directement comparés pour dpERK localisation, les deux génotypes peuvent être mélangés et traités. Ceci est possible car les phénotypes sont distincts et peuvent être distingués par les morphologies DAPI. Coloration dans le même tube suivi par imagerie sur la même lame permet une comparaison directe entre les gonades de différents génotypes. En variante, si les morphologies DAPI ne se distinguent pas, alors une coloration d'anticorps à deux étapes peut être adoptée. Tout d'abord chaque génotype individuel est traitée avec deux anticorps différents, un anticorps pour un anticorps et WT B pour le mutant (les deux anticorps ont besoin d'être soulevée dans un hôte différent de l'anticorps dpERK). Une fois que les deux génotypes ont été colorées avec l'anticorps primaire et on l'a lavé, ils peuvent être mélangés ensemble dans un tube et maintenant colorées avec l'anticorps dpERK, suivie d'un traitement avec l'anticorps secondaire de visualiser tous les anticorps présents dans le tube. Une capacité à comparer les différents génotypes sur une seule lame, en particulier lorsque deductions des modèles d'activation sont faits assure des interprétations exactes ne sont pas affectées par les conditions de coloration distinctes.
Bien avantageux, il y a plusieurs étapes à travers la méthode de suspension qui nécessitent une manipulation minutieuse. Il est essentiel que les dissections se produisent dans un temps de manière efficace; surtout, les dissections ne devraient pas prendre plus de 5 min. De plus longs temps de dissection se traduisent par signal dpERK variable, ce qui peut souvent être interprété comme des changements réglementés dans l'activation de ERK, plutôt que comme des échecs techniques. Il est crucial de commencer avec plus de 100 - 150 animaux pour chaque dissection, car tout au long des différentes étapes de lavage des gonades peuvent facilement être perdues à partir des tubes en raison d'erreurs de pipetage. Perte de gonades peut être réduite soit en disséquant dans plusieurs petits lots (tels que trois lots de 50 animaux chacun) qui peuvent être combinés, ou en disséquant un grand lot de 150. Un autre défi consiste à convaincre les gonades de se coucher dans un bien espacés formationsur la lame de telle sorte que la totalité de la gonade distale peut être imagée. Pour ce faire, utiliser un cil sur une allumette ou une pipette tiré à l'espace sur les gonades. Cependant, il faut prendre soin afin de ne pas endommager les gonades pendant ce processus. Souvent avec ces techniques, il prend de multiples tentatives pour maîtriser les dissections ainsi que des arrangements des gonades sur les lames.
Une fois que cette technique a été maîtrisé, il sert une méthode puissante pour les analyses biologiques variées, et peut être utilisé pour étudier plus que les niveaux dpERK. Par exemple, cette méthode peut être utilisée pour visualiser les niveaux actifs de p38, ou le niveau de CDK actifs, ou toute protéine pour lequel un réactif anticorps existe. En outre, le procédé peut être couplé à un écran d'inhibition chimique dans des animaux entiers de dosage pour de nouveaux inhibiteurs ou activateurs de la voie, par l' intermédiaire de dosage pour les niveaux dpERK. Ceci permettra une lecture in vivo à la fois la sensibilité à la réaction et d' un inhibiteur qui peut interact avec la voie de signalisation RTK-RAS-ERK. De plus, cette méthode peut être utilisée dans les combinaisons d'anticorps avec de multiples sorties de signalisation qui peuvent tous être utilisés et visualisées en une seule fois. En utilisant des anticorps multiples permet corrélation entre de multiples voies, leur état d'activation, et les résultats tout dans le même tissu, ce qui permet une meilleure compréhension de ces interactions. Ce ne sont que quelques exemples de nouvelles applications de cette méthode, mais ce système peut être modifié pour étudier les intérêts de recherche multiples.