Une fois que les réactifs appropriés, réglages du microscope et des expériences d'étalonnage sont mis en place, cette méthode est relativement simple à réaliser. Les étapes essentielles suivantes: l' étiquetage de la Candida avec S-1 afin d' assurer qu'il n'y a pas de surcharge du colorant, d' étalonnage et l' analyse de l'image.
S-1 est un réactif adapté à des environnements de plus de pH alcalin, ce qui est particulièrement important pour les neutrophiles 21 mais limite son utilisation dans certains types de cellules. Pour les environnements plus acides, tels que les phagosomes des macrophages, SNARF-4, ou S-4, est plus appropriée en raison de son pKa inférieur 22. En outre, pour des lectures plus précises cytoplasmiques, il est préférable d'utiliser S-4, la courbe d' étalonnage pour le S-1 montre que les rapports de fluorescence commencent à plateau en dessous de pH 6 (Figure 3). D'autres colorants, tels que les 2' , 7'-bis- (2-carboxyéthyl) -5- (et-6) -carboxyfluorescéine (BCECF) ou pHrodo Red peuvent aussi être plus approprié dans un contposte qui devrait être acide. Cependant , la coloration du cytoplasme est encore nécessaire pour l' identification correcte des phagosomes contenant Candida.
Une caractéristique importante d'un indicateur de pH du phagosome est qu'il ne soit pas modifiée de manière irréversible par l'environnement du phagosome réactif. S-1 semble être résistant au milieu neutrophile. Ceci est illustré par Levine et al. 5 (voir complémentaire vidéo de référence 4 5) qui démontrent la phagocytose et la libération ultérieure d'un S-1 marqué par une particule Candida Hvcn1 - / - neutrophiles. Lorsque phagocyté, la particule passe du jaune / orange au rouge (pH neutre à alcalin), mais quand la particule est libérée par le neutrophile, il retourne à sa couleur d'origine.
Il est important de mentionner quelques-unes des limitations associées à l'utilisation de S-1. Le fait que ce colorant présente deux spectres d'émission permettant meas ratiométriqueurement est un avantage, mais un équipement spécialisé est nécessaire pour acquérir des images; le microscope utilisé pour les expériences doivent être en mesure d'enregistrer deux images simultanément ou avec un retard insignifiant. Les auteurs supposent que le chercheur de tenter ce protocole a de l'expérience en utilisant la microscopie confocale, ou a accès à un professionnel qualifié. Nous ne pouvons pas lister tous les paramètres de microscope spécifiques car ils diffèrent pour chaque microscope et doivent être optimisés par le chercheur. L'ester d'acétoxyméthyle conjugué à S-1 qui permet au colorant de diffuser dans le cytoplasme cellulaire est dégradé par des esterases non spécifiques dans le cytoplasme de la cellule pour former la molécule fluorescente. Estérases, tels que la phosphatase alcaline, sont présents dans le sérum humain et du sérum de veau fœtal, qui sont utilisés pour compléter les milieux de culture cellulaire. En conséquence, le milieu dans lequel les cellules sont chargées avec S-1-AM (section 4.5) ne doit pas contenir du sérum. Cela peut se révéler difficile si l'utilisation de cellules qui nécessitent une plus-ric nutrimentsh moyen pour les soutenir que la solution saline équilibrée utilisé tout au long de ce protocole. De même, d'autres composants du milieu fluorescent, comme le rouge de phénol, peuvent interférer avec les mesures S-1.
Les barres d'erreur sur la figure 3 indiquent qu'il y a une certaine variation dans les mesures de rapport à chaque pH. Un nombre approprié de répétitions de chaque expérience (au moins n = 3) et le plus grand nombre de mesures individuelles dans chaque expérience unique sont nécessaires pour surmonter la variation inter-vacuolaire. Il est donc conseillé de mesurer le pH d'au moins 100 phagosomes pour chaque condition et autant de zones de phagosome qui semblent contenir qu'une seule Candida. Les phagosomes à mesurer pour la quantification doivent être ceux qui ont complètement englouti une particule Candida ( par exemple, ceux complètement entouré par le cytoplasme). Pour atténuer les préjugés involontaires dans la sélection des cellules / phagosomes pour la quantification, toutes les analyses doivent être effectuées enaveugle aux conditions expérimentales.
Ici, nous décrivons l'isolement des neutrophiles par sédimentation au dextrane de sang entier par centrifugation, suivie de la couche de plasma à travers un gradient de densité. Nous utilisons cette technique rapidement et produit efficacement un pur (> 95%) population de neutrophiles, bien qu'il existe d'autres méthodes disponibles, telles que la centrifugation de sang total par d'autres formules de gradient de densité ou la sélection négative des neutrophiles en utilisant des kits spécialisés avec des anticorps ou magnétiques perles. Toutefois, ce dernier peut être prohibitif pour la plupart des groupes qui isolent neutrophiles régulièrement. En outre, on utilise l'héparine anticoagulante dans le tube de collecte de sang, alors que d'autres chercheurs peuvent être plus habitués à utiliser l'acide éthylènediaminetétraacétique (EDTA) ou le citrate de sodium de l'acide (ACD). Comme il existe de nombreuses méthodes différentes à choisir, il est à la préférence personnelle du chercheur.
En outre,lors de l'isolation et la manipulation de neutrophiles, ils doivent être manipulés avec soin afin d'éviter une activation excessive. des mesures de précaution suivantes: en utilisant uniquement les articles en plastique, pas de verre; filtrage stériliser tous les tampons pour éliminer tout contaminant endotoxine; neutrophiles filature assurez-vous que la centrifugeuse est bien équilibrée pour éviter des vibrations excessives; limiter autant que possible les neutrophiles temps restent dans un culot après centrifugation; ne pas maintenir les neutrophiles en solution de plus de 5 x 10 6 / ml; et réaliser l'expérience le plus tôt possible après l'isolement.
Ce procédé peut être adapté pour mesurer les variations du pH et de la zone phagosome au fil du temps en utilisant un ensemble de stade chauffé à 37 ° C sur le microscope et prendre des instantanés une fois tous les 30 à 60 s à partir de la même position, comme décrit pour les étapes d'étalonnage. Il pourrait également théoriquement être adapté pour des expériences à haut débit, par exemple dans des plaques à 96 puits, et pour les expériences de cytométrie en flux, où S-1 peutêtre utilisé comme un indicateur de pH 23. Cependant, dans ces milieux, l'accent sur l'activité cellulaire individuelle est remplacée par un effet plus global sur la population cellulaire.
Cette méthode vise à fournir un dispositif expérimental relativement simple sur laquelle les chercheurs individuels peuvent adapter en fonction de leur domaine d'intérêt. Les chercheurs peuvent vouloir explorer neutrophile pH phagosome et de la zone tout en mesurant également le mouvement des autres ions, par exemple, la concentration de calcium intracellulaire. Il y a plusieurs Ca 2+ fluorescents indicateurs facilement disponibles pour la microscopie confocale, comme indo-1, qui a également des spectres à double émission à 400 et 475 nm 24. Ces longueurs d'onde d'émission ne se chevauchent pas avec les spectres d'émission S-1, mais la longueur d'onde d'excitation est à l'extrémité ultraviolet (UV) du spectre, ce qui peut être dommageable pour les cellules, et un laser UV est pas courante sur tous les microscopes. Un examen complet des différents indicateurs pourmesurer le flux de calcium intracellulaire est couvert par Takahashi et al. 25 et Hillson et al. 26.
En conclusion, il existe d' autres méthodes pour mesurer le pH du phagosome en utilisant différents colorants fluorescents comme Nunes et al. ont montré 13 aussi bien que d' autres groupes 27, 28. D' autres chercheurs ont également utilisé S-1 pour mesurer cytosolique pH 29 ou pH 14 phagosome. Cependant, ce protocole est unique pour mesurer simultanément le pH des deux cytosol et phagosome, ce qui offre la possibilité d'observer les changements de surface de section transversale phagosome et de faire la distinction entre de type sauvage et Hvcn1 - / - neutrophiles de souris, et les neutrophiles humains avec et sans travail NADPH oxydase.