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Les rayonnements ionisants (IR) induisent de nombreuses aberrations chromosomiques stables et instables. Les aberrations instables, où la morphologie des chromosomes est considérablement compromise, peuvent être facilement identifiées par les techniques conventionnelles de coloration des chromosomes. Cependant, la détection d’aberrations stables, qui impliquent l’échange ou la translocation de matériel génétique sans modification considérable de la morphologie des chromosomes, nécessite des techniques sophistiquées de peinture chromosomique qui reposent sur l’hybridation in situ de sondes d’ADN marquées par fluorescence, une technique de peinture chromosomique populairement connue sous le nom de fluorescence in situ hybridation (FISH). Les sondes FISH peuvent être spécifiques pour un ou plusieurs chromosomes entiers ou une sous-région précise sur le(s) chromosome(s). La méthode permet non seulement de visualiser des aberrations stables, mais aussi de détecter le(s) chromosome(s) ou une ou plusieurs séquences d’ADN spécifiques impliquées dans la formation d’une aberration particulière. Une variété de techniques de peinture chromosomique sont disponibles en cytogénétique ; ici, deux méthodes très sensibles, l’hybridation in situ à fluorescence multiple (mFISH) et le caryotype spectral (SKY), sont discutées pour identifier les aberrations stables interchromosomiques qui se forment dans les cellules de la moelle osseuse des souris après une exposition à l’irradiation corporelle totale. Bien que les deux techniques reposent sur des sondes d’ADN marquées fluorescentes, la méthode de détection et le processus d’acquisition d’images des signaux fluorescents sont différents. Ces deux techniques ont été utilisées dans divers domaines de recherche, tels que la radiobiologie, la cytogénétique du cancer, la biodosimétrie rétrospective des rayonnements, la cytogénétique clinique, la cytogénétique évolutive et la cytogénétique comparative.