Profilage de l’acide gras 13C Isotopologue donne un aperçu de transfert trophique de carbone et le métabolisme des lipides des consommateurs d’invertébrés

Ralph Menzel; Rainer Nehring; Dilara Simsek; Liliane Ruess

doi:10.3791/57110

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Article de méthode

Profilage de l’acide gras ¹³C Isotopologue donne un aperçu de transfert trophique de carbone et le métabolisme des lipides des consommateurs d’invertébrés

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DOI :

10.3791/57110

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17 avril 2018

Ralph Menzel¹ , Rainer Nehring¹ , Dilara Simsek¹ , Liliane Ruess¹

¹Ecology, Institute of Biology, Humboldt-Universität zu Berlin

Dans cet article

Résumé

L’approche de marqueur trophique acide gras, c'est-à-dire l’assimilation des acides gras comme molécule entière et le transfert dans les tissus de consommateurs mineures ou sans aucune modification, est entravée par les lacunes dans les connaissances dans le métabolisme des acides gras des invertébrés du sol petite. Profilage de Isotopologue est fourni comme un outil précieux pour démêler les interactions trophiques.

Résumé

Acides gras (FAs) sont des biomarqueurs utiles en écologie trophique car ils sont généralement assimilés comme une molécule complète et transférés dans les tissus de consommateurs avec le mineur ou sans modification, ce qui permet le routage alimentaires entre différents niveaux trophiques. Toutefois, l’approche de marqueur trophique FA est encore entravée par la connaissance limitée dans le métabolisme des lipides de la faune du sol. Cette étude a utilisé entièrement marqué l’acide palmitique (C16 : 0¹³, 99 % d’atomes) comme traceur dans les voies de métabolisme d’acide gras de deux sols généralisée collemboles, Protaphorura fimata et Heteromurus nitidus. Afin d’enquêter sur le sort et les modifications métaboliques de ce précurseur, on présente une méthode de profilage d’isotopologue, interprété par spectrométrie de masse avec détection d’ions simples. En outre, l’alimentation expérience en laboratoire en amont est décrite, ainsi que l’extraction et la méthylation des fractions lipidiques dominante (lipides neutres, phospholipides) et la formule connexe et les calculs. Profilage de Isotopologue n’est pas seulement le rendement l’enrichissement global de ¹³C dans les acides gras provenant de ¹³C marqué précurseur mais produit également le patron des isotopomères supérieure à la masse de l’ion parent (par exemple, l’ion moléculaire de FA M⁺) de chacun marqué FA par une ou plusieurs unités de masse (M^{+ 1}M^{+ 2}M^{+ 3}, etc.). Cette connaissance permet des conclusions sur le rapport de routage diététique d’une FA entièrement consommée par rapport à la biosynthèse de novo . Le profilage d’isotopologue est proposé comme un outil utile pour l’évaluation du métabolisme des acides gras chez les animaux de la terre à démêler les interactions trophiques.

Introduction

Dans un habitat cryptique comme sol, relations trophiques sont difficiles à aborder et sont plus limitées par la petite taille de la faune. La dernière décennie a vu des avances en écologie biochimique, en particulier dans l’utilisation des acides gras comme biomarqueurs pour définir les stratégies d’alimentation de la faune du sol sous des conditions de champ¹^,²^,³. C’est basé sur le fait que les acides gras provenant de ressources peut être incorporés dans les tissus des consommateurs comme des molécules entières, un processus appelé routage alimentaires⁴