Stimulation cérébrale profonde (SCP) est un traitement reconnu pour les troubles du mouvement comme le tremblement essentiel1 et2de la maladie de Parkinson. Cette thérapie est aussi étudiée comme traitement potentiel pour un nombre croissant de troubles y compris de lésion cérébrale traumatique3, syndrome de Tourette4et5de la dépression. DBS systèmes nécessitent l’implantation chirurgicale d’un câble d’électrode au niveau de stimulation dans une région du cerveau localisée pour moduler l’activité neuronale en cours6. L’emplacement des électrodes et les paramètres de stimulation à la fois avoir un effet sur la modulation des circuits neuronaux qui fournissent l’avantage thérapeutique. Au lieu de petites variations peuvent affecter la fenêtre thérapeutique, éventuellement augmente la probabilité d’effets secondaires indésirables avant bénéfice thérapeutique est atteint7,8,9. Dans la pratique, il est souvent difficile de prédire que la stimulation effets auront sur l’activité neuronale ; par conséquent, cette fenêtre de bénéfice thérapeutique est identifiée sur une base de patient par patient comme le dispositif de stimulation est programmé par le clinicien8,9. Ce processus devient plus complex, car les nouvelles générations d’appareils DBS deviennent disponibles. Par exemple, plomb de nouveaux dessins sont mis en place avec plusieurs contacts10,11,12, et dans certains cas, plusieurs pistes sont étant implantés à proximité d’un autre13. Par conséquent, il y a un besoin d’être en mesure d’explorer et de prédire les effets de DBS dans un espace de paramètre important et croissant.
Analyse et modélisation informatique permet de prédire les effets physiologiques et cliniques de DBS sur une base spécifique au patient. Ces modèles utilisent des éléments finis (MEF) de modélisation de construire trois représentations de dimension du tissu cérébral ainsi que les caractéristiques biophysiques de l’électrode implantée. MEF champ bioélectrique modèles ont été utilisés avec succès pour prédire les effets de la DBS14, mais jusqu'à présent, ceux-ci ont été lente et coûteuse par le calcul à générer. Il y a un besoin pour les techniques de modélisation roman au même rythme que la complexité croissante des dispositifs DBS. Ces modèles spécifiques au patient doivent fournir près de rétroaction visuelle en temps réel sur les effets de la DBS comme emplacement de plomb ou paramètres de stimulation sont modifiés. L’utilisateur pourrait obtenir une rétroaction sur un emplacement de plomb et réglage de stimulation en quelques secondes, ce qui permet a continué de raffinement du placement de la tête au cours de plusieurs minutes. Patient-spécificité est obtenue en incorporant de l’anatomie du patient, la forme de leur cerveau et taille, lors de la création du FEM et en appliquant les propriétés biophysiques de leur cerveau, telles que la conductivité des tissus anisotrope. Conductivité anisotrope décrit comment le courant se propage par le biais de différentes régions du cerveau et peut être mesurée de façon non invasive pour l’ensemble du cerveau similaire à une image typique de résonance magnétique (IRM).
DBS approches qui n’utilisent pas d’informations spécifiques à un patient de modélisation peuvent fournir des prédictions rapides, mais moins précises des effets de la stimulation, en raison des géométries généralisées et valeurs de la conductivité des tissus cérébraux. Dans cette approche, une FEM unique est utilisé pour tous les patients et l’activité neuronale prévue peut être calculée à l’avance. Les modèles spécifiques à un patient ne peut pas être généralisées et pré calculées depuis un nouveau MEF est construit pour chaque individu. Ces modèles nécessitent davantage d’efforts à construire, mais peut être plus précis. Plusieurs facteurs limitent la vitesse à laquelle ces modèles peuvent être construits et utilisés : 1) modifiant les paramètres au début de l’oléoduc de bâtiment modèle, tels que de la position de l’électrode, exige un effort manuel pour mettre à jour toutes les étapes subséquentes ; et 2) les étapes du pipeline de modélisation ne sont pas facilement intégrés entre eux, nécessitant le passage de données entre plusieurs logiciels. Souvent, nous voulons évaluer les nombreuses situations comme électrodes, les paramètres de stimulation ou conceptions de l’électrode. Pour fournir des commentaires utiles sur l’effet de ces changements sur l’effet thérapeutique, que le patient recevra, ces résultats doivent être précises et généré rapidement.
Notre objectif est de présenter de nouvelles techniques de construction des modèles spécifiques à un patient qui tirent parti de la vitesse obtenues dans les modèles généralisés et automatisant de nombreuses des étapes pipeline pour créer un environnement de modélisation interactive qui fournit près de visual en temps réel vos commentaires sur les effets de la DBS. Une simulation interactive vous permet de tester des prédictions et obtenir des résultats rapidement sans se concentrer sur les détails du modèle de construction. Cela est bénéfique lorsqu’il y a un espace de paramètre grand à explorer et comment ces paramètres influencent la simulation sont incertaines. Nous décrirons les étapes décrites dans le pipeline de traitement pour produire des modèles de MEF interactives, spécifiques à un patient des acquisitions de l’imagerie par résonance magnétique (IRM). Utilisant les outils et les techniques décrites dans cet article réduira le coût du temps pour créer des modèles de champ bioélectrique MEF et offrent un moyen de rendre ces modèles accessibles aux chercheurs et cliniciens qui ne sont pas modeler experts.
Ce protocole décrit comment construire un modèle spécifique au patient par éléments finis des volumes acquis de MRI et puis de simuler le champ électrique induit par une électrode DBS. Les principales étapes dans la création de ces modèles sont de : 1) construire un modèle éléments finis (MEF), qui représente le cerveau du patient et l’électrode implantée et 3) résoudre pour 2) ajoutez les propriétés biophysiques des paramètres du cerveau et de la stimulation de l’appareil DBS à la FEM la tension générée par l’électrode dans le modèle. Deux modalités d’imagerie sont nécessaires pour construire un patient modèle spécifique pour la simulation de DBS. Une IRM T1 est utilisée pour construire les segmentations de la surface du cerveau, ventricules et noyaux spécifiques. Imagerie de diffusion pondérée (DWI), une mesure de la diffusivité de l’eau, est utilisée pour estimer les tenseurs de diffusion dans le tissu de cerveau15. Les tenseurs de diffusion sont transformés en des tenseurs de conductivité qui quantifier les propriétés biophysiques inhomogènes anisotropes du tissu sur un voxel par voxel base16. La distribution de tension dans tout le cerveau induite par l’électrode est calculée en résolvant l’équation de Poisson, qui, grâce à l’application du FEM se simplifie en un système linéaire d’équations Ax = b où A est une matrice de raideur qui représente la conductivité et la géométrie de la maille, x est la solution de tension à chaque nœud de la maille, et b est modifiée en fonction des conditions aux limites et sources de courant.