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Le patient fourni le consentement éclairé et le projet a été approuvé par le Comité d’éthique de recherche de la faculté de médecine de l’Université Juntendo. Les expériences de souris ont également été approuvées par le Comité d’éthique de recherche animale de la faculté de Juntendo de médecine.
1. création de PDXs CRC dans des souris immunodéficientes
Les procédures expérimentales pour établir la CRC PDXs (étape 1) sont décrites dans la Figure 1 a.
- Préparer le tissu CRC primaire immédiatement après résection chirurgicale de la tumeur du patient.
- Laver le tissu primaire de CRC par agitation modérée plusieurs fois dans 30 mL de phosphate stérile glacé solution saline tamponnée (PBS) dans un tube conique de 50 mL et le maintenir sur la glace.
- Placer le tissu sur une boîte de Pétri 10 cm à l’aide de pinces stériles, supprimer les zones nécrotiques aussi largement que possible à l’aide de ciseaux stériles et couper les tissus de tumeurs solides en petits morceaux (5 x 5 x 5 mm3 en taille) à l’aide de lames de rasoir stériles.
Remarque : Les zones nécrotiques sont souvent plus blanc, plus doux et plus friables que dans les zones environnantes.
- Placer les petits morceaux de la tumeur à l’aide de pinces stériles dans 2 mL de solution de PBS stérile glacée sur une plaque de 6 puits.
- Se reproduisent 6 semaines Shi-NOD/scid IL2Rγ null (NOG) hautement souris immunodéficientes conditions gratuit germe–libre et spécifique pathogène–.
- Anesthésier les souris avec l’isoflurane inhalation à l’aide de l’appareil d’anesthésie inhalation animaux petits et désinfecter la peau avec l’éthanol à 70 %. Assurer le taux normal et la profondeur de la respiration et l’absence d’un réflexe de pincée d’orteil pour anesthetization bon. EFP onguent pour les yeux est une option, pour prévenir la sécheresse oculaire sous anesthésie.
- Stériliser tous les instruments chirurgicaux, à l’aide de stérilisation par la chaleur sèche et ensuite utiliser ces outils pour toutes les procédures pour prévenir les infections de plaies chez les bénéficiaires.
- Placez votre souris anesthésiée dans une position couchée sur le banc de laboratoire. Faire une petite incision sur la partie inférieure des flancs droit et gauche de la souris de destinataire pour générer les poches sous-cutanées pour l’implantation de tissus à l’aide de ciseaux stériles. Prendre soin de ne pas pour perforer la membrane péritonéale. Il devrait y avoir peu de saignements lors de cette procédure.
- Tremper doucement ce qui précède préparé des fragments de tumeur dans 50 µL de matrice extracellulaire artificielle et implanter ensuite vers les parties basses des poches sous-cutanées droite et gauche.
- Suture de l’incision avec des clips de blessure chez les souris qui subissent des procédures chirurgicales. S’assurer que les tissus de la tumeur implantés sont situés à une certaine distance de l’incision sous la peau.
Remarque : Conformément à réduire au minimum les interventions chirurgicales, aucun traitement pour la douleur post-chirurgicale et infection ont été administrés dans cette étude.
- Placez votre souris sur une garniture chaude et maintenir la position de couché sternale jusqu'à ce que la conscience suffisante est rétablie. Une fois complètement récupéré et capable de s’asseoir sur ses quatre jambes, les souris peuvent être retournées à leurs cages maison. Pour éviter la prédation, ne permettent pas d’élevage avec des animaux non exploitées dans la même cage.
- Recherchez les fuites de suture et confirmer que les souris sont dans un état stable, le lendemain, dans le groupe traité par chirurgie. Vérifiez les souris pour les signes de la maladie et mesurer la taille de la tumeur dans chacune des souris, une fois par semaine, en employant des étriers.
2. dissection du CRC PDXs de souris
Les procédures expérimentales pour la dissection des CRC PDXs (étape 2) sont décrits dans la Figure 1 b.
- Permettre à la tumeur de croître par voie sous-cutanée à ~ 1 cm3 en taille, ce qui prend habituellement environ 1 à 3 mois.
- Anesthésier la souris avec l’isoflurane inhalation à l’aide de l’appareil d’anesthésie inhalation animaux petits et désinfecter la peau avec l’éthanol à 70 %.
- Placez votre souris dans une position couchée sur le banc de laboratoire. Inciser la peau, exposition de la tumeur et détacher délicatement la peau de la tumeur à l’aide de ciseaux stériles. Après avoir enlevé la tumeur, placez-le sur une boîte de Pétri de 10 cm et supprimer toute zones nécrotiques grossièrement de la tumeur, puis rincer deux fois avec 5 mL de PBS.
Remarque : Les zones nécrotiques sont souvent plus blanc, plus doux et plus friables que dans les zones environnantes.
-
Placez la tumeur sur la glace et divisez-le tout aussi en au moins 4 pièces pour différentes applications dont 1) la CRC organoïde culture, 2) transplantation secondaire chez la souris, l’examen 3) histologique et 4) congélation et stockage des fragments tumeur.
- Pour la génération de la CRC organoïdes, placez le tissu de tumeur solide sur un plat de Pétri de 6 cm contenant 1 mL de PBS stérile. Gardez le tissu sur la glace jusqu’au traitement (étape 3).
- Pour établir le modèle PDX CRC humaine, passage la douce PDXs CRC dans un secondaire de la souris. Couper le tissu tumoral en petits morceaux (5 x 5 x 5 mm3 en taille) à l’aide de lames de rasoir stériles et tremper doucement ces fragments tissulaires dans 50 µL de matrice extracellulaire artificielle. Ensuite, l’implant ces fragments vers les parties basses des poches sous-cutanée gauche et droit de la souris NOG, tel que décrit à l’étape 1.8, 1.11.
- Pour faire une analyse histologique, fixer les échantillons dans 5 mL de formol tamponné neutre de 10 % dans un tube conique de 15 mL à température ambiante pendant 2 jours.
- Pour la cryoconservation, couper le tissu tumoral en petits morceaux (5 x 5 x 5 mm3 en taille) et plonger délicatement les échantillons dans 500 µL de cellules tubes cryovial 1 – 1,5 mL de la solution de congélation. Ensuite, transférer le tube dans un congélateur à-80 ° C.
3. extraction du PDXs dans la Suspension cellulaire pour la Culture d’organoïde CRC
Les procédures expérimentales pour la dissociation du CRC PDXs (étape 3) sont décrits dans la Figure 1 b.
- Place la tumeur de prêts (étape 2.4.1) ci-dessus des fragments sur une boîte de Pétri de 10 cm.
- Émincer les fragments à l’aide de lames de rasoir stériles et de les transférer dans un tube conique de 15 mL, 8 ml de sérum de veau foetal de 10 % (FCS)-Medium (DMEM de l’aigle de la modification de Dulbecco) avec 80 µL de stock d’enzyme collagénase (voir Table des matières).
- Bien fermer le tube et envelopper le bouchon avec du parafilm pour éviter les fuites. Pour dissocier les fragments de tumeur hachées dans la suspension cellulaire, agitez il doucement pendant 2 h à 37 ° C. Notez qu’il y aura encore de nombreux fragments de tissus non digérés restant dans le tube.
- Centrifuger le tube à 300 x g pendant 5 min à 4 ° C et éliminer le surnageant. Résoudre le culot cellulaire à l’aide de 10 mL de 10 % FCS-DMEM pour faire de la suspension cellulaire.
- Pour éliminer les débris tissulaires non digérés, filtrer la suspension cellulaire deux fois à l’aide de la crépine de cellule de 40 µm sur un tube conique de 50 mL. Puis, centrifuger le cheminement à 300 x g pendant 5 min à 4 ° C. Retirez le surnageant et garder le diabolo sur la glace.
4. génération de la CRC organoïdes cultivés sur la matrice extracellulaire artificielle
Les procédures expérimentales pour la culture d’organoïde CRC des PDXs du côlon (étape 4) sont décrits dans la Figure 1 b.
- Établir un milieu de culture approprié pour l’organoïdes CRC PDX-dérivé (voir Table des matières, « le milieu de culture organoïde CRC ») qui emploient décrites antérieurement pour humain du colon organoïdes11.
- Appliquer 150 µL de matrice extracellulaire artificielle (voir Table des matières) par ainsi sur une plaque de 12 puits sur la glace et ensuite il incuber pendant 30 à 60 min dans un 37 ° C, 5 % CO2 incubateur pour solidifier les gels.
- Suspendre le culot cellulaire de l’étape 3.5 avec le milieu de culture organoïde CRC (de l’étape 4.1) avec 5 % de FCS pour réaliser le réglage à 3 x 105 cellules/mL. Ensuite, les semences 1 mL du milieu sur la plaque extracellulaire artificiel de matrice-enduit préparé à l’étape 4.2. et incuber une nuit à 37 ° C moins de 5 % de CO2. Utilisez un hémocytomètre pour compter le nombre de cellules tumorales, y compris les cellules individuelles et groupes pluricellulaires (un groupe de cellules adhérentes) dans la suspension cellulaire.
Remarque : 5 % FCS est utilisé pour étancher l’activité enzymatique résiduelle de collagénase dans cette étude.
- Recueillir soigneusement le milieu de culture, y compris flottant des cellules qui ont enlevé l’artificielle plaque enduit de matrice extracellulaire, dans un 1,5 mL Centrifuger le tube sur le jour suivant il centrifuger à 1 400 g pendant 5 min. Ensuite, retirez le surnageant et Resuspendre le culot dans 70 µL de matrice extracellulaire artificielle sur la glace.
- Pour augmenter la viabilité cellulaire CRC, superposer la tumeur contenant des cellules artificielles matrice extracellulaire sur la tumeur organoïde cellules fixé à la plaque de revêtement matrice extracellulaire artificielle et incuber pendant 30 minutes dans un 37 ° C, 5 % CO2 incubateur pour solidifier le revêtement artificiel de la matrice extracellulaire. Puis, incuber il avec 1 mL de milieu de culture cellulaire CRC organoïde avec 1 % FCS à 37 ° C sous 5 % CO2.
- Changer le milieu de culture tous les deux jours. Comme les CRC organoïdes remplissent le milieu, il peut devenir nécessaire de changer le support de tous les jours.
5. production et enrichissement des Particules Lentivirales GFP
Les procédures expérimentales pour la génération et l’enrichissement des Particules Lentivirales GFP (étape 5) sont décrits dans la Figure 1.
- La culture de cellules HEK293T avec Roswell Park Memorial Institute (RPMI) 1640 moyen contenant 10 % FCS et préparer six plats de 10 cm (2 x 106 cellules / plat) pour la procédure suivante de transfection.
- Pour la transfection par plat, préparer 500 µL du mélange dont 20 µL de réactif transfection dans DMEM avec un PRRL-GFP vector (5 µg)12 et deux plasmides d’emballage des gènes, tels que CMVp-VSV-G (1 µg) et CMVp-dR8.2 dvpr (5 µg), dans un stérile de 1,5 mL microtube. Garder le mélange à température ambiante pendant 20 min puis superposer sur chacun des plats 10 cm et les incuber pendant 18 heures.
- Retirez le support, ajouter 5 mL de milieu de FCS-RPMI 1640 10 % frais de chaque plat et laisser reposer pendant 24 h.
- Recueillir le milieu conditionné de chaque plat dans un tube à centrifuger 50 mL et stocker un total de 30 mL de milieu à 4 ° C durant la nuit. Ajouter 5 mL de la douce RPMI 1640 sur chaque plat et laisser reposer pendant 24 h.
- Recueillir le milieu conditionné de chaque plat dans un tube à centrifuger de 50 mL et le donjon, au total, 30 mL de milieu sur la glace. Ensuite, jeter les cellules.
- Filtrer sur un filtre de 0,45 µm pour éliminer les cellules et diviser cette quantité en douze tubes de centrifugeuse en polypropylène de 5 mL d’ultracentrifugation 60 mL du milieu (de l’étape de 5,4 à 5,5).
- Afin de concentrer les virus, centrifuger à l’aide d’un rotor oscillant de seau (voir Table des matières) à 85 327 x g pendant 1,5 h à 4 ° C.
- Retirer immédiatement du milieu. Pour résoudre le culot de virus concentré, placez 250 µL du mélange de nutriments Ham F-12 (F12) / milieu DMEM sans FCS dans chacune des douze tubes et maintenir à 4 ° C durant la nuit. Notez que le culot de virus est souvent invisible.
- Pipetez doucement le milieu pour collecter les 3 mL du concentré 5 x GFP lentivirus stock, au total, dont probablement des Particules Lentivirales GFP avec 108 transduction unités / mL (TU/mL). Ensuite, rangez les douze microtubes de 1,5 mL (y compris les 250 µL par tube) dans des conditions stériles à-80 ° C pendant un an. Préparez plusieurs petites parties aliquotes de la solution d’origine afin d’éviter de multiples cycles de dégel freeze–.
6. étiquetage des cellules organoïde CRC avec GFP Particules Lentivirales cultivées sur matrice extracellulaire artificielle
Les procédures expérimentales pour l’étiquetage des cellules organoïde CRC avec lentivirus GFP (étape 6) sont décrits dans la Figure 1.
- Permettre la CRC organoïdes préparé à l’étape de 4,6 à grandir sans interférence pendant 7 à 10 jours, récolter mécaniquement à l’aide d’un grattoir de cellules stériles et puis de les transférer dans un microtube 1,5 mL.
Remarque : La croissance du CRC organoïdes dans la culture dépend de la nature des tumeurs originales provenant de patients. Éviter surcroissance de la CRC organoïdes, en les maintenant à la confluence de 60 à 70 % avant le transfert à un rapport 1:2 de split sur une nouvelle artificielle extracellulaire enduit de matrice 12 puits plaque.
- Centrifuger le microtube pendant 3 min à x 1 400 g, enlevez le milieu de culture et résoudre le culot cellulaire dans 500 µL de PBS en tapotant doucement.
- Centrifuger le microtube pendant 3 min à 1 400 g et éliminer les PBS.
- Pour dissocier l’organoïdes CRC adhérentes, ajouter 500 µL d’une solution de détachement des cellules de protéolytique et collagénolytique enzymes de la cellule dans le tube de granule et mélangent en tapotant doucement. Ensuite, laisser les tubes se contenter de 10 min à température ambiante.
- Pipetter très doucement la suspension de cellules avec un 500 µL supplémentaire de 1 % FCS-DMEM plusieurs fois dans un microtube 1,5 mL environ de dissocier les cellules. Génération de cellules individuelles de l’organoïdes CRC par pipetage dures réduit sensiblement la viabilité cellulaire. Ainsi, il est indispensable de laisser la masse des cellules visuellement détectable dans la suspension cellulaire en pipettant également très doucement dans un microtube 1,5 mL.
- Centrifuger la suspension cellulaire pendant 3 min à 1 400 g et éliminer le surnageant.
- Résoudre le culot cellulaire avec un mélange de la 100 µL de stock de lentivirus x GFP 5 (> 108 TU/mL) et 400 µL de milieu de culture organoïde CRC dans un microtube 1,5 mL en tapotant doucement pour s’adapter à une concentration de 5 x 105 dissociée des cellules tumorales par 500 µL . Utilisez un hémocytomètre pour compter le nombre de cellules tumorales, y compris les cellules individuelles et groupes de cellules dans la suspension cellulaire, tel que décrit ci-dessus (étape 4.3).
- Préparer une artificielle extracellulaire enduit de matrice 12 puits plaque, comme indiqué au point 4.2. Ensuite, placer 500 µL de la suspension cellulaire établie à l’étape 6,7 sur la plaque et laissez-le pendant 18 heures à 37 ° C moins de 5 % de CO2.
- Recueillir le milieu avec les cellules flottantes détachés de la plaque de revêtement matrice extracellulaire artificielle dans un tube de centrifugation de 1,5 mL. Il centrifuger à 1 400 x g puis retirez le surnageant et Resuspendre le culot dans 70 µL de matrice extracellulaire artificielle sur la glace.
- Pour augmenter la viabilité cellulaire CRC, superposer la tumeur contenant des cellules artificielles matrice extracellulaire sur la tumeur d’organoïdes attaché à l’artificielle extracellulaire enduit de matrice 12 puits plaque, comme indiqué au point 4.5. Ensuite, incuber la plaque pendant 30 min dans un 37 ° C, 5 % CO2 incubateur pour solidifier le revêtement artificiel de la matrice extracellulaire et puis culture il avec 1 mL de milieu de culture organoïde CRC avec 1 % FCS à 37 ° C moins de 5 % de CO2.
- Observer les cellules à 3 jours après l’infection sous un microscope à fluorescence pour confirmer la positivité GFP de presque 100 % en raison de l’utilisation d’un titre élevé de Particules Lentivirales (voir la Figure 2 a).
- Culture l’organoïdes CRC pour des périodes de 7 à 10 jours pour développer la croissance cellulaire avant l’injection à des souris destinataires.
7. génération des métastases par GFP-étiqueté CRC organoïdes chez les souris destinataires
Les procédures expérimentales pour la génération des métastases à l’aide de la GFP-étiqueté CRC organoïdes (étape 7) sont décrits dans la Figure 1.
- Pour dissocier l’organoïdes CRC GFP-étiqueté dans la suspension cellulaire, récolter mécaniquement à l’aide d’un grattoir de cellules stériles et transférez-les dans un microtube 1,5 mL, tel que décrit ci-dessus (étape 6.1).
- Centrifuger le microtube pendant 3 min à x 1 400 g, enlevez le milieu de culture et régler le culot cellulaire dans 500 µL de PBS en tapotant doucement.
- Centrifuger le microtube pendant 3 min à 1 400 g et éliminer les PBS.
- Superposition de 500 µL de la solution de détachement cellulaire sur le culot du tube et mélanger en tapotant doucement. Ensuite, laisser les commandes de mélange pendant 10 min à température ambiante enzymatiquement dissocier l’organoïdes CRC adhérentes, tel que décrit ci-dessus (étape 6.4).
- Pipetter très doucement la suspension de cellules avec un 500 µL supplémentaire de 1 % FCS-DMEM plusieurs fois dans un microtube 1,5 mL environ de dissocier les cellules, tel que décrit ci-dessus (étape 6.5). Génération de cellules individuelles de l’organoïdes CRC par pipetage dures réduit sensiblement la viabilité cellulaire. Ainsi, on laisse la masse des cellules visuellement détectable dans la suspension cellulaire en pipettant également très doucement dans un microtube 1,5 mL.
- Centrifuger la suspension cellulaire pendant 3 min à 1 400 g et éliminer le surnageant.
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D’établir un modèle de souris de métastase spontanée du CRC PDXs :
- Préparer une suspension de cellules, y compris les 5 x 105 cellules dans 50 µL de PBS avec la matrice extracellulaire artificiel de 50 % par la souris. Maintenir la suspension sur la glace avant utilisation. Utilisez un hémocytomètre pour compter les cellules cancéreuses, comme indiqué dans l’étape 4.3.
- Anesthésier une souris avec inhalation isoflurane, à l’aide de l’appareil d’anesthésie inhalation animaux petits et désinfecter la peau avec l’éthanol à 70 %, comme indiqué dans l’étape 1.6.
- Placez votre souris NOG en position couchée sur le banc de laboratoire. Saisir la muqueuse rectale avec des pinces stériles et tirez-le doucement hors de l’anus. Puis, immédiatement injecter la suspension cellulaire établie à l’étape 7.7.1 dans la sous-muqueuse rectale de la souris à l’aide d’une seringue (aiguilles : 22 G). Régulièrement, 4-6 souris par groupe sont utilisés pour évaluer les résultats.
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D’établir un modèle expérimental de métastases du CRC PDXs :
- Préparer une suspension de cellules organoïde CRC y compris 4 x 104 cellules dans 50 µL de PBS par souris. Maintenir la suspension sur la glace avant utilisation. Utilisez un hémocytomètre pour compter les cellules cancéreuses (étape 4.3).
- Anesthésier une souris avec inhalation isoflurane, à l’aide de l’appareil d’anesthésie inhalation animaux petits et désinfecter la peau avec l’éthanol à 70 %, comme indiqué dans l’étape 1.6.
- Placez votre souris NOG anesthésiée dans une position couchée sur le banc de laboratoire. Faites une petite incision sur la partie inférieure du flanc gauche et puis coupez le péritoine pour exposer avec soin la rate à l’aide de pinces et ciseaux stériles. Saisir le tissu graisseux, attaché à la rate avec des pinces stériles, puis d’injecter lentement 50 µL de la suspension cellulaire (préparée comme indiqué ci-dessus, l’étape 8.1) dans la rate. Veillez à ce que la suspension cellulaire est injectée de manière appropriée sans fuite vers l’extérieur, de la rate. Régulièrement, 4 souris par groupe sont utilisés pour évaluer les résultats.
- Placez toutes les souris sur un coussin chaud après la chirurgie et maintenir en position allongée sternale jusqu'à ce que la conscience suffisante est restaurée, comme indiqué au point 1.11. Une fois que les souris ont pleinement récupéré, renvoyez-les à leurs cages maison. Pour éviter la prédation, ne permettent pas d’élevage avec des animaux non exploitées dans la même cage.
- Recherchez les fuites de suture et confirmer que les souris sont en vie, dans le groupe traité par chirurgie, le lendemain. Vérifier les souris des signes de maladie et mesure taille tumorale, employant des étriers, dans toutes les souris une fois par semaine.
- Observer les souris pour détecter les métastases expérimentale (1 mois) et des métastases spontanée (pour des périodes pouvant aller jusqu'à 2,5 mois) après l’injection.
- Sacrifier les souris par l’anesthésie et la dislocation cervicale les jours indiqués. Disséquer les tumeurs primaires et divers tissus, y compris le foie et les poumons. Placer les tumeurs disséqués et les organes dans 5 mL de PBS glacée sur une boîte de Pétri de 10 cm et stockez-les sur la glace.
- Pour détecter les cellules organoïde GFP séropositifs au CRC, observer les tissus disséqués au microscope stéréo-fluorescence. Acquisition d’images avec une caméra CCD et préparer à l’aide de logiciels de traitement d’image standard.