Article de méthode

Rhéométrie force-pince pour caractériser les Hydrogels à base de protéines

DOI :

10.3791/58280

21 août 2018

Dans cet article

Résumé

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Une nouvelle technique de rhéométrie pince-force est utilisée pour étudier les propriétés mécaniques des échantillons d’hydrogel basées sur les protéines de faible volume attachés entre un moteur de la bobine et un capteur de force. Un analogique proportionnel-intégral-dérivé (PID) système permet le « serrage » de la force subie au protocole désiré.

Résumé

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$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Nous décrivons ici une méthode de rhéométrie force-pince pour caractériser les propriétés biomécaniques des hydrogels à base de protéines. Cette méthode utilise un système analogique de (PID) proportionnel-intégral-dérivé pour appliquer des protocoles contrôlés-force sur des échantillons cylindriques hydrogel basées sur les protéines, qui sont attachés au maximum entre un moteur bobine linéaire et un capteur de force. Au cours de l’opération, le système PID ajuste l’extension de l’échantillon d’hydrogel à suivre un protocole prédéfini force en réduisant au minimum la différence entre les forces mesurées et consigne. Cette approche unique à base de protéines hydrogels permet l’attachement des échantillons de très faible volume hydrogel (< 5 µL) avec des concentrations de protéines différentes. En vertu de protocoles de force-rampe, où la contrainte appliquée augmente et diminue de façon linéaire avec le temps, le système permet l’étude des comportements élasticité et hystérésis associé le (dé) pliage des protéines et la mesure de l’élastique standard et paramètres de visco-élastique. En vertu de la force constante, où la pulsation a une étape-comme la forme, la réponse élastique, dû au changement de force, est découplé de la réponse viscoélastique, qui vient du domaine protéique déplier et replier. En raison de son faible volume échantillon et la polyvalence dans l’application de diverses perturbations mécaniques, pince-force rhéométrie est optimisé afin d’étudier la réponse mécanique des protéines sous la force à l’aide d’une approche en vrac.

Introduction

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En dehors d’avoir des propriétés physiques uniques, basées sur les protéines hydrogels promettent de révolutionner la spectroscopie de force en permettant la mesure de plusieurs milliards de molécules dans un « pull », permettant ainsi à l’étude des protéines dans des environnements surpeuplés, similaires à celles rencontrées dans la peau et autres tissus. Domaines protéiques restent pliés à l’intérieur des hydrogels, permettant l’étude de leur réaction biomécanique pour forcer, contraignant les partenaires et les conditions chimiques. En outre, la réaction biomécanique des domaines protéiques à l’intérieur des hydrogels ressemble à la réponse vue avec force de molécules simples techniques de spectroscopie. Par exemple, la liste des dénaturants chimiques et agents oxydants diminuent la stabilité de l’état plié, la seule protéine domaine niveau1,2,3 tant le macroscopique niveau4,5 , 6 , 7. de même, osmolytes augmenter la stabilité des protéines simples8,9, conduisant à une diminution de la réponse viscoélastique d’hydrogels, pour la même force conditions7,10.

Plusieurs approches ont été appliquées pour synthétiser des hydrogels à base de protéines, soit à l’aide d’interactions physiques11,12 ou covalente réticulation4,13. Covalentes réactions permettent des emplacements fixes de réticulation et ces hydrogels peut récupérer l’état initial après une suppression des perturbations mécaniques ou chimiques. Une approche réussie de réticulation covalente s’appuie sur la formation de liaisons covalentes carbone-carbone entre des acides aminés tyrosine exposés en utilisant le persulfate d’ammonium (APS) comme un oxydant et un sel de ruthénium (II) comme un initiateur (Figure 1)14. Lors de l’exposition à la lumière blanche, une solution de protéines concentrées peut être transformée en un hydrogel. En contrôlant lorsque la réaction commence, le mélange de protéine-APS peut être injectée dans toute forme de coulée, comme le polytétrafluoroéthylène (PTFE) tubes (Figure 1 b et 1C), permettant l’utilisation d’une solution extrêmement petit volume15. En outre, l’utilisation de la lumière blanche pour déclencher la réaction de réticulation entraîne un blanchiment limitée de protéines fluorescentes et permet la formulation d’hydrogels composites avec des marqueurs fluorescents (Figure 1). Autres méthodes de formation axée sur les protéines hydrogel utilisent réticulation basé sur le SpyTag-SpyCatcher interaction covalente16, amine réticulation par glutaraldéhyde13ou streptavidine-biotine interactions17.

Analyse mécanique dynamique (DMA) est actuellement une technique largement utilisée pour étudier à base de polymères hydrogels13,18. Tandis que DMA peut appliquer des protocoles de force constante aux biomatériaux, requiere modules de Young sur 10 kPa et volumes grand échantillon de plus de 200 µL19. En raison de ces limitations, hydrogels de protéine sont généralement trop faible pour être étudiés par cette technique. Car les polyprotéines machinés sont difficiles à synthétiser que polymères, car ils nécessitent un système vivant pour produire, ces grands volumes sont inefficaces, à meilleur4,15. En outre, la plupart des tissus biologiques sont plus douces que 10 kPa. Plusieurs approches ont été développées pour des échantillons biologiques, en particulier dans l’étude du muscle élasticité20,21. Ces techniques peuvent fonctionner également sous vos commentaires d’employer la force constante mais sont optimisés pour des échantillons de petit diamètre (de l’ordre du micron) exposés à la force pour des temps très courts (généralement inférieure à 1 s).

Hydrogels à base de protéines ont été étudiées avec succès avec des techniques modifiées rhéométrie. Par exemple, exprimer l’hydrogel dans une forme d’anneau permet l’utilisation de distension rhéométrie pour mesurer le changement dans l’équipe expérimenté en fonction de l’extension4,22. Autres approches pour étudier les propriétés rhéologiques des hydrogels à base de protéines utilisent rhéométrie contrôlé-la contrainte de cisaillement. Ces techniques peuvent également atteindre le volume de l’échantillon faible et tolérer les matériaux tendres. Cependant, ces méthodes manque la capacité à imiter le tirant force cette cause protéiques qui se déroule en vivoet module de Young est calculée en fonction des théories complexes qui nécessitent des hypothèses et corrections diverses23.

Nous avons récemment rapporté une nouvelle approche qui utilise une petite quantité de protéines, polymérisé à l’intérieur des tubes d’un diamètre < 1 mm. Notre première mise en œuvre de cette technique fonctionnait en mode collier en longueur, où le gel a été prolongé après le protocole désiré15. Dans cette méthode, les protéines éprouver un changement continu en extension et en force tandis que les domaines se déroulent, rendant l’interprétation des données encombrantes. Récemment, nous avons rapporté une nouvelle technique de rhéométrie pince-force, où une boucle de rétroaction peut exposer des hydrogels de protéine de faible volume à une force prédéfinies protocole no7 (Figure 2). Un système PID analogique compare la force mesurée par le capteur de force avec le point de consigne envoyé depuis l’ordinateur et permet d’ajuster l’extension du gel en déplaçant la bobine pour réduire au minimum la différence entre les deux entrées. Ce « bridage » de la force permet maintenant de nouveaux types d’expériences pour mesurer la biomécanique des hydrogels de protéine.

En mode force-rampe, un hydrogel de protéine captif connaît une augmentation constante et la diminution de la force avec le temps. Le PID compense toute déformation viscoélastique en changeant l’extension d’une manière non linéaire, selon le type de formulation de protéine et hydrogel. Le principal avantage de la rampe de la force, c’est qu’il permet la quantification des paramètres standards, tels que le module de Young et de dissipation de l’énergie, en raison d’un déploiement et le repliement de domaines protéiques.

En mode force constante, la force appliquée change dans une étape-comme la mode. Dans ce mode, le gel se prolonge et contrats élastiquement quand la force est augmentée ou diminuée, respectivement, suivie d’une déformation en fonction du temps. Cette déformation viscoélastique, qui aura lieu alors que le gel subit une force constante, est directement liée au domaine de dépliement/repliement. De façon simplifiée, cette extension peut être vu comme l’équivalent de plusieurs traces de molécules simples milliards en moyenne ensemble et mesurée à la fois. Force constante protocoles peuvent être utilisés pour étudier le fluage et relaxation des hydrogels de protéines en fonction de la force et l’heure. En fonction de la force, pour la protéine axée sur les BSA hydrogels, nous avons montré récemment qu’il y a une dépendance linéaire entre l’extension élastique et viscoélastique et recul avec la souche appliquée7.

Ici, nous détaillons le fonctionnement d’un rhéomètre de force-pince en utilisant des gels composites fabriqués à partir d’un mélange de protéines L (8 domaines24, dépeinte comme L8) et une construction de protéine L-eGFP (L-eGFP), ce qui rend l’hydrogel globale fluorescent et facile à démontrer.

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Protocole

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1. préparation de la Solution réactifs

  1. Préparer une solution de protéine départ en dissolvant/diluant de la protéine d’intérêt de la concentration désirée, à l’aide d’un tampon Tris [tris (hydroxyméthyl) aminométhane de 20 mM et 150 mM NaCl, pH 7.4].
    NOTE : La plus petite concentration de protéines de réticulation menant à hydrogels dépend de la protéine utilisée et est généralement > 1 mM.
  2. Préparer des stocks de persulfate d’ammonium (APS) (1 M) et le chlorure de tris(bipyridine)ruthenium(II) ([Ru(bpy)3]2 +) des solutions en dissolvant APS (6,67 mM) et [Ru(bpy)3]2 + poudres dans le tampon Tris.

2. base de protéines de synthèse Hydrogel

  1. Fixer une aiguille 23 G sur une seringue de 1 mL avec un piston de pressée.
  2. Couper un tube de polytétrafluoroéthylène (PTFE) de 10 cm (avec un diamètre intérieur de 0,022 à et un diamètre extérieur de 0,044 dans) à l’aide d’une lame de rasoir. Fixer l’aiguille et la seringue à une extrémité du tube PTFE.
  3. Insérez la deuxième extrémité du tube dans une solution de silane et remplir le tube en rétractant le piston de la seringue. Maintenir le tube pendant environ 30 min.
  4. Enlever la solution de silane et sécher le tube d’air comprimé.
    Remarque : Assurez-vous que toute la solution de silane est séché et qu’aucun résidu ne reste dans le tube.
  5. Mélanger la solution de protéines avec APS et [Ru (bpy) 3]2 + dans un tube de 1,5 mL à l’aide d’un ratio volume constant [par exemple, 15:1:1 ou 15:0.5:0.5 (v : v : v)].
  6. Vortex la solution photoactif jusqu'à ce qu’il se mélange complètement.
  7. Centrifuger le mélange à vitesse maximale (par exemple, 14 000 x g) pour supprimer toutes les bulles de la solution.
  8. Insérez l’extrémité ouverte du tube PTFE traité dans le mélange photoactif et dessiner la solution dans le tube en rétractant le piston de la seringue.
  9. Placer le tube chargé ~ 10 cm distance une lampe à mercure 100 W pour prévenir chauffant et y maintenir jusqu'à 30 min à température ambiante (Figure 1 b).
    Remarque : Dans certains cas, la durée d’exposition à la lumière peut être aussi faible que 30 s. temps de gélification plus courts sont utilisés ici pour les gels fluorescents, pour limiter le photoblanchiment.
  10. Retirer le tube de l’aiguille et couper les bords du tube près des extrémités de l’hydrogel avec une lame de rasoir.
  11. Utiliser une aiguille de 24 G atténuée pour extruder l’hydrogel dans la solution de Tris (Figure 1).
    NOTE : Blunted aiguilles servent à éviter des encoches ou endommagement de l’échantillon d’hydrogel.
  12. Inspecter visuellement les gels tous les défauts susceptibles de former pendant l’extrusion ou en raison de bulles et de jeter les gels présentant des défauts.

3. base de protéines Hydrogel attachement et Force-pince rhéomètre Set-up

  1. Démarrez le programme de contrôle d’instrument. Allumez le moteur de la bobine. Régler la position de la bobine sur une valeur vers la fin de la plage (par exemple, 7,5 mm).
    Remarque : La position de la bobine est recommandée d’être vers la fin de la gamme de mouvement maximale, afin de maximiser l’extension éventuelle de l’hydrogel.
  2. Déplacer les crochets dans la z-direction et alignez-les au détour de la x-direction (qui est la coordonnée de traction ; voir Figure 2 b). Enregistrez les valeurs des vis micrométrique pour le x-direction.
  3. Couper 2 sutures stériles en brins de longueur égale (2-3 cm ; voir les figures 3 a et B).
  4. Attachez un demi-nœud double lâche dans chacun des volets et placez les 2 boucles sur le crochet connecté le capteur de force (Figure 3 et 3D).
  5. Remplir la chambre expérimentale avec un tampon Tris et transférer l’échantillon de l’hydrogel dans la chambre remplie à l’aide de brucelles médicale.
  6. Placer la bobine de voix et forcer les crochets capteur près de la surface de la solution et alignez les crochets dans toutes les directions en utilisant le x/y/z-positionnement des manipulateurs.
  7. Utilisez des pinces médicales, accrocher les deux côtés de l’échantillon d’hydrogel de protéines sur les crochets reliés à la voix de bobine et force sensor (Figure 3).
  8. Serrer 1 boucle de suture autour de l’échantillon d’hydrogel sur le crochet de bobine de voix en tenant les deux extrémités de la boucle de suture avec des pincettes médicaux et en les tirant simultanément (Figure 3D).
  9. Répétez l’étape 3,8 pour la boucle reliée à la capteur de force (Figure 3D).
    NOTE : Éviter un resserrement extrême de la suture pour prévenir tout dommage structurel et coupe transversale de l’échantillon d’hydrogel.
  10. Serrer les boucles de suture dans les virages du chaque crochet afin d’éviter tout glissement ; utiliser ces virages comme référence pointe vers trouver nulle la séparation entre les crochets à l’étape 3.2. Couper la longueur excessive des sutures à l’aide de ciseaux médicaux (Figure 3D).
  11. Déplacer l’hydrogel attaché à l’aide de z-manipulateurs le long de la z-axe vers la chambre expérimentale de plonger l’hydrogel dans la solution expérimentale.
  12. Aligner l’échantillon hydrogel en y-z en utilisant les manipulateurs tels que le gel n’est pas sous tension.
  13. Zéro du capteur de force et de séparer les deux crochets en utilisant le x-micromètre met en scène jusqu'à ce que le gel commence à force d’expérience. Dès lors, légèrement demi-tour la vis micrométrique au x-direction.
  14. Enregistrer la position de deux manipulateurs pour le moteur à bobine et le capteur et la différence entre ces valeurs et celles mesurées à l’étape 3.2 permet de calculer la séparation exacte entre les crochets attacher au début de l’expérience.
  15. Définir l’amplitude de la courbe de mou à ~1.5 - 2 mm et mesurer le gel mou (Figure 4 a).
    Remarque : Pour chaque mesure mou, essayez de garder le début du régime lâche près de la position de bobine de voix initiale, permettant un nombre optimal de points de données pour adapter les 2 régimes (Figure 4 a). La longueur du gel peut être déterminée avec une résolution de microns à l’aide de la séparation entre les crochets et l’intersection entre les 2 régimes le mou de la courbe (voir aussi l’étape 5.1). Le capteur de force pourrait dériver avec le temps en raison des variations dans les conditions expérimentales, la partie de la courbe mou où le gel n’est pas sous force de rapports sur cette dérive possible. Le programme de contrôle de l’appareil compense automatiquement cette différence lors de l’envoi de la commande de point de consigne à la boucle de PID (encart de laFigure 4 a ).

4. base de protéines Hydrogel caractérisation à l’aide de la Force-rampe contrôlée et les mesures de Force constante

  1. Expériences de force-rampe
    1. Pour effectuer un cycle de force-rampe en augmentant la force à la vitesse de chargement désirée (par exemple, 0,01 mN/s), l’entrée les forces départ et finales et la durée du protocole comme un « V » inversé. Puis, maintenez le gel à 0 mN (ou force faible) > 200 s permettre les domaines protéiques de repli et de l’élasticité de gel pour récupérer.
    2. Enregistrer la trace.
  2. Expériences de force constante
    1. Effectuer un protocole force constante en appliquant une force faible (p. ex., 0,1 mN) pour 30 s et puis augmenter la force à une force constante (par exemple, 1 mN) pendant un temps défini (par exemple, 120 s), suivie de la trempe de la force vers le même faible valeur (p. ex., 0,1 mN) > 300 s permettre les domaines protéiques de repli et de l’élasticité de gel pour récupérer.
    2. Suite à la première impulsion, régler les paramètres de PID pour maximiser le temps de réponse de la rétroaction en boucle (voir Figure 2D).
      Remarque : Pour les gels rigides et de petits changements en vigueur, le temps de réponse de la boucle est limité par l’électronique du capteur de force et le temps de réponse de la bobine et peut être aussi faible que 5 ms7. Pour les gels plus douces et des changements importants en vigueur, le temps de réponse est dicté par l’élasticité de l’hydrogel (Figure 2D).
    3. Enregistrer la trace.

5. analyse

  1. Utilisant la séparation mesurée entre les crochets et la position de la bobine calculée, quand le gel commence à éprouver la force (Δx dans l’encart de la Figure 4 a ), calculer la longueur de gel de L à l’aide de l’équation :
    L = L0 + ∆x
    Ici, L0 est la séparation entre les crochets, mesurée à partir de la position des vis micrométrique avant l’expérience (étape 3.14).
    Remarque : Pour les gels avec des concentrations de faible teneur en protéines qui n’aboutissent pas à une réticulation complète, la longueur mesurée passe de trace-de-trace. Aussi, sur de longues périodes de temps, les protéines à l’intérieur des hydrogels peuvent rencontrer des effets de vieillissement25, qui résultent en un allongement global du gel.
  2. Normaliser l’extension mesurée à la longueur du gel afin d’obtenir de la souche.
  3. Normaliser la force mesurée à la surface transversale en utilisant le diamètre intérieur du tube utilisé pour la polymérisation.

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Résultats

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Figure 1 a montre le schéma de la réaction photoactif utilisée pour synthétiser l’hydrogel de8 L-EGP/L. Figure 1 b montre le mélange hydrogel dans le tube PTFE, avant et après la photoactivation. La figure 1 présente l’hydrogel de8 L-eGFP-l extrudé à l’intérieur d’une solution de Tris. L’exemple de l’hydrogel n’a aucun défauts structuraux tels que les encoches. Hydrogels montran...

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Discussion

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Ici, nous décrivons une technique de rhéométrie force-clamp pour étudier la réaction biomécanique des hydrogels basées sur les protéines de faible volume. De plus, un protocole est fourni pour synthétiser un échantillon d’hydrogel de protéine de faible volume cylindrique uniforme. Un protocole est également présenté qui décrit comment attacher les différents types d’hydrogels base de protéines avec des élasticités différentes sans provoquer des déformations mécaniques ou des dommages pour les échantillons d’hydrogel à ba...

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Déclarations de divulgation

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Les auteurs n’ont rien à divulguer.

Remerciements

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Nous reconnaissons l’appui financier de recherche Initiative de croissance (prix no 101 X 340), National Science Foundation, programme d’Instrumentation de recherche majeurs (Grant No. PHY-1626450), Greater Milwaukee Foundation (Prix Shaw) et le système de l’Université du Wisconsin (subvention de recherche appliquée).

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Transducteur de force SI-KG4AWorld Precision Instruments (WPI)SI-KG4A
d’équipementmoteur à bobine mobile linéaireLFA2010
Albumine sérique bovineRocky Mountain Biologicals (RMBIO)BSA-AAF-1XG / 100 G
TrizmaSigma-AldrichT1503-1KG
Chlorure de sodiumSigma-AldrichS7653-1KG
Persulfate d’ammoniumSigma-Aldrich248614-100G
Chlorure de tris(bipyridine)ruthénium(II)Sigma-Aldrich544981-1G
EXPRESS MEDICAL SUPPLIES  ; 6-0 NYLON SUTURE 12/PKFisher ScientificNC0395626
Seringue de 1 ml uniquement, Luer-Lok TipBD309628
Silane, SigmacoteSigma-AldrichSL2-25ML
Tube en PTFE microbore, 0,022 po ID x 0,042 po OD, 100 pi/rouleauCole-ParmerEW-06417-21
Aiguille hypodermique, calibre 23Healthcare Supply Pros305194
Jensen Global JG24-1.5X Red IT Embouts de distribution - Calibre 24KIMCOJG24-1.5X
USH-103D USHIO 100W Lampe à mercure à arc courtALBUSH-103D USHIO
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Solutions demédicaux

Références

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Mots-clés

Force Clamp RheometryProtein Based HydrogelsPID Control SystemVoice Coil MotorForce TransducerForce Ramp ProtocolConstant Force ProtocolHydrogel Sample PreparationElasticity MeasurementViscoelastic Analysis

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