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Les plantes dépendent des chloroplastes pour la photosynthèse et la croissance photoautotrophique1. La grande majorité des protéines de chloroplastes est codée dans le noyau, synthétisée dans le cytosol et importée dans le chloroplaste par les complexes TIC et TOC dans l’enveloppe membranes2. Le noyau du complexe TOC est constitué du chenal menant à la protéine Toc75 et deux récepteurs GTPases Toc33 Toc1593,4,5. TOC159 est essentiel pour la biogenèse des chloroplastes et intervient dans l’accumulation massive de protéines associées à la photosynthèse,6. Le complexe des TIC se compose de la canal de conduction protéine TIC20 ainsi que TIC110 et TIC407,8. Récemment, une translocation de protéines 1MD complexe au niveau de la membrane enveloppe intérieure a été isolée et contenait des éléments inconnus9, dont a été TIC56. Récemment, nous avons isolé co TIC56 du 1 MDa complexe en utilisant le protocole de purification d’affinité TAP-TOC159. Les données indiquent un chevauchement structurels entre les complexes TOC/TIC « canonical » et le complexe 1 MDa10. Auparavant inconnue des composants tels que KOC1 sont désignés comme nouveaux partenaires d’interaction des complexes TOC et TIC à l’aide de la méthode robinet décrit ici10,11.
Ainsi, la purification de TAP-tag est une méthode efficace pour l’isolation des complexes protéiques et l’identification des partenaires qui interagissent par l’analyse par spectrométrie de masse subséquentes12. La balise de robinet se compose de deux répétitions de liaison IgG séparées d’un peptide liant la calmoduline (CBP) par un tabac etch site de clivage de protéases virus (TEV). La méthode originale, consistant en une étape de purification d’affinité IgG suivie par TEV et chromatographie d’affinité-calmoduline subséquente autorisée la purification native de grand et très pur protéines complexes13,14 . Nous avons simplifié la procédure et a démontré que les complexes de protéine contenant du TOC159 peuvent également être épurées efficacement en utilisant uniquement l’étape de purification IgG-affinité suivie par TEV élution15. Dans notre expérience, l’omission de l’étape de la calmoduline-affinité a donné lieu à des rendements plus élevés et peut-être donc convenir pour des protéines de faible abondance.
En bref, nous avons conçu le stable transgéniques a. thaliana exprimant TAP-TOC159 dans le ppi2 (toc159 KO mutant) contexte et établi comme une source fiable pour la purification des complexes TOC-TIC. Le protocole pour l’isolement du complexe TOC-TIC commence par l’homogénéisation de la matière végétale dans un tampon sans détergent. Après centrifugation, le surnageant est ignoré. La pastille contenant la fraction totale de membrane est solubilisée à l’aide d’un tampon contenant du détergent. Après une étape d’ultra-centrifugation, le surnageant contenant des complexes de TOC-TIC solubilisées est appliqué à l’IgG de résine pour la purification d’affinité. Après plusieurs étapes de lavage, élution est réalisée en utilisant un tampon contenant de protéase TEV pour cliver sélectivement en aval du domaine de liaison IgG et doucement relâchez natives complexes contenant TOC159. L’éluat TEV peut être analysé directement par Western blot ou spectrométrie de masse pour identifier les partenaires d’interaction de TOC15910,11,15. La méthode a également été utilisée pour identifier les modifications post-traductionnelles des TOC15915. À l’avenir, natives complexes contenant TOC159 peuvent être utilisés pour les études structurales à l’aide de la microscopie cryoélectronique.