Article de méthode

Enquête bio-énergétique en temps réel à l’aide de Candida albicans analyse extracellulaire de Flux

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DOI :

10.3791/58913

19 mars 2019

* These authors contributed equally

Dans cet article

Résumé

Nous présentons ici un protocole par étapes pour étudier la respiration mitochondriale et la fonction glycolytique chez Candida Albicans à l’aide d’un analyseur de flux supplémentaires.

Résumé

Les mitochondries sont des organites essentiels pour le métabolisme cellulaire et la survie. Une variété d’événements importants se déroulent dans les mitochondries, telles que la respiration cellulaire, métabolisme oxydatif, transduction du signal et l’apoptose. Par conséquent, dysfonctionnement mitochondrial est signalé à jouer un rôle important dans la tolérance des médicaments antifongiques et la virulence des champignons pathogènes. Des données récentes ont également conduit à la reconnaissance de l’importance des mitochondries comme un important contributeur à la pathogénèse fongique. Malgré l’importance des mitochondries en biologie fongique, des méthodes normalisées pour comprendre sa fonction sont peu développés. Nous présentons ici une procédure afin d’étudier le taux de consommation d’oxygène basale (OCR), une mesure de la respiration mitochondriale et taux d’acidification extracellulaire (ECAR), une mesure de la fonction glycolytique chez les souches de c. albicans . La méthode décrite ci-après peut être appliquée à n’importe quel Candidaspp. souches sans la nécessité de purifier les mitochondries des cellules fongiques intacts. En outre, ce protocole peut également être personnalisé pour dépister les inhibiteurs de la fonction mitochondriale chez les souches de c. albicans .

Introduction

Infections fongiques invasives tuent plus 1,5 millions de personnes par an dans le monde entier. Ce chiffre est en hausse en raison d’une augmentation du nombre de personnes vivant avec l’immunité compromise, y compris les nourrissons prématurés âgés, receveurs et cancer patients1. C. albicans est un pathogène opportuniste qui fait partie de la microflore humaine. Il habite également les surfaces muqueuses et le système gastro-intestinal comme un organisme commensal. C. albicans produit une maladie systémique grave chez les personnes ayant des déficiences immunitaires, qui ont subi une chirurgie, ou qui ont été traités avec lo....

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Protocole

Remarque : Le protocole détaillé par étape du dosage est décrit ci-dessous, et le protocole schématique est illustré à la Figure 1.

1. les souches de c. albicans et de conditions de croissance

  1. Cultiver les souches de c. albicans dans un milieu liquide levure extrait-Peptone-Dextrose (DPJ) à 30 °C dans un agitateur incubateur du jour au lendemain.
    Remarque : Maintenir des souches de Candida comme stocks congelés et croître sur gélose YPD (1 % d’extrait de levure, peptone de 2 %, 2 % de dextrose et 2 % d’agar).

2. préparation des réa....

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Résultats

L’objectif de ce protocole consiste à déterminer les fonctions bioénergétiques c. albicans , évaluée par l’analyseur de flux supplémentaires. Un mutant de c. albicans dépourvus de protéines mitochondriales Mam33 est également inclus avec sa souche de complément, mam33Δ/Δ::MAM33 pour étudier les effets de la suppression d’une protéine mitochondriale sur OCR et ECAR. MAM33 code pour une protéine de la matrice acides mitochondriale putatif et sa fonction à.......

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Discussion

La bioénergétique test flux supplémentaire est un outil excellent pour donner lecture de la fonction mitochondriale en mesurant la phosphorylation oxydative (OXPHOS)-dépendante d’oxygéne en temps réel. En outre, une fonction glycolytique qui est mesurée sous forme d’un taux d’acidification extracellulaire (modification du pH extracellulaire) peut également être étudiée en même temps dans l’analyse en temps réel.

Électrodéposition réussie de c. albicans dans la plaque de test est une d.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont rien à divulguer

Remerciements

Recherche dans le laboratoire de NC est soutenue par une subvention du National Institutes of Health (NIH) R01AI24499 et une subvention de la Fondation New Jersey de la santé (NJHF), #PC40-18.

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
RPMI 1640CorningMT50020PB
Antimycine ASigmaA8674
KCN
Kit de stress MitoAgilent103015-100
OligomycineCalbiochem495455
pH-mètreAccumetAR20
Rouge phénoliqueSigmaP5530
Poly-D lysineSigmaP6407
RotenoneSanta cruz203242
Seahorse XF24 FluxPakAgilent100850-001
SHAM
Chlorure de sodiumAmresco  ;241
Pastilles d’hydroxye de sodiumJ.T Baker3722
Eau de qualité culture tissulaireGibco1523-0147
Solution d’étalonnage de test XFAgilent100840-000
Extrait de levure Peptone DextroseFisher scientific,BP2469
Extrait de levure Peptone Dextrose AgarSigmaA1296
Extrait de levure Peptone GlycérolSigmaG2025

Références

  1. Brown, G. D., et al. Hidden killers: human fungal infections. Science Translational Medicine. 4 (165), (2012).
  2. Wisplinghoff, H., et al. Nosocomial bloodstream infections in US hospitals: analysis ....

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Mots-clés

Respiration mitochondrialeFonction glycolytiqueTaux de consommation d oxyg neTaux d acidification extracellulaireInhibiteurs mitochondriauxPathogen se fongiqueEssai bio nerg tiqueCartouche de capteurs

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