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L’originalité de cette méthode réside dans son adaptation de la technique de gavage à la taille et la fragilité d’une souris néonatale. La section précédente décrit les étapes importantes dans l’accomplissement d’une procédure de gavage avec succès sur une souris 2 DOL. Pour établir une échelle de quantification bonne, une courbe d’étalonnage a été générée à l’aide de pure LP ADN avec trois répétitions techniques (Figure 2). La courbe d’étalonnage fournie une gamme dynamique de détection de l’ADN de LP en utilisant les amorces. La dynamique se situait entre 7 et 28 cycles où une gamme de 101 107 copies de l’ADN de LP a été détecté. La pente régulière de la courbe standard représenté l’efficacité et l’évolutivité de la réaction.
La procédure de gavage IE a été utilisée chez la souris adulte avec une relative facilité. Toutefois, le tube digestif supérieur d’une souris néonatal est fragile et requis mouvements calibrés le gavage d’aiguille au cours de la procédure. Gavages répétés pourraient augmenter les chances d’intra-oesophagiens irritations, blessures et échec ou rejet par le barrage en raison de la manipulation. Ainsi, deux annexes de gavage différentes ont été testés et la colonisation de l’intestin a été quantifiée à l’aide d’ADN des homogénats entier intestins. Les souris étaient gavés de DOL 2 à 8 de DOL avec probiotique administrée tous les jours ou tous les deux jours (Figure 3). Chaque échantillon contenait une adaptation technique et toutes les conditions avaient au moins deux réplicats biologiques. Les chiots gavés chaque jour avec 7 doses avaient environ 103 copies de LP tandis que les petits gavées tous les deux jours avec 4 doses ont environ 105 exemplaires. La cohérence des résultats entre les réplicats ajouter du crédit à la précision de la technique. Il n’y avait plus LP détectée dans les intestins des bébés gavés tous les deux jours par rapport aux rejetons qui ont reçu par gavage tous les jours. Compte tenu de cela, expériences ultérieures ont été mis en place avec un calendrier de gavage des alternats puisqu’il réduit également le stress pour les chiots.
Il est important d’éviter les probiotiques intra-litière contamination croisée lorsque vous travaillez avec des probiotiques. Le microbiome de même portée devait être similaire qu’ils partagent la même mère et l’environnement de nidification. Cela s’avère un problème pour les études des probiotiques, si les conditions de traitement et de contrôle étaient présentes au sein de la même portée que l’organisme de probiotiques a le potentiel pour devenir une partie de la microflore ("répandre la colonisation '). Pour déterminer si un probiotique va contaminer et coloniser non traitées de même portée, la moitié d’une litière a été gavés comme ci-dessus et les intestins ont été recueillies pour qPCR. Analyse de qPCR intestinale de souris DOL 10 a montré attendue d’amplification d’ADN de LP chez les souris gavées, mais aussi, dans une moindre mesure dans la même portée non gavés (Figure 4). Les intestins des souris DOL mêmes dans une cage non traitée ont montré aucune amplification ou l’amplification minimale à cycles supérieur à 32. Cela a prouvé pour le partage communautaire du microbiome dans une litière dans une cage. Ainsi, pour des expériences avec des probiotiques, les groupes de traitement doivent être séparés par cages au contrôle de la variabilité par contamination croisée. L’utilisation de barrages nourriciers sont envisageables si une expérience doit être mis en place dans un réglage de la litière, mais les effets de confusion comme soins diminuée du barrage nourricier et rejet devrait être évaluée et optimisé pour. Lorsque les souris gavées jusqu'à DOL 8 ont été laissés sans traitement pendant six jours et l’ADN intestinale a été analysée à DOL 14, environ 10 copies de LP ont été trouvées (Figure 5). Ainsi, la colonisation du LP s’est avérée pour être transitoire et la population détectable a diminué au fil du temps.

Figure 1 . Mesurer la longueur entre le processus xiphoïde (extrémité inférieure du sternum) et le museau à rendre maximale d’insertion marquant pour l’aiguille. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Figure 2 . Courbe d’étalonnage établie à l’aide des amorces de LP et ATCC LP ADN. Une dilution en série de l’ATCC LP ADN a été effectuée pour déterminer la fourchette détectable dynamique pour les amorces utilisées dans l’étude. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Figure 3 . Amplification de LP de l’ADN intestinale de DOL 10 petits traités entre DOL 2 et 8 DOL de gavages réguliers tous les jours (7 doses) et tous les autres jours (4 doses). Gavage tous les deux jours a montré supérieur LP intestinale en comparaison de gavage tous les jours. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Figure 4 . Amplification de LP de l’ADN intestinale de DOL 10 petits avec 2 traités et 2 n’est pas traité dans une portée de 4 chiots. Le gavage était entre DOL 2 et 8 de DOL en gavages réguliers tous les jours (7 doses). Le probiotique deux traités chiots spectacle le profil d’amplification attendu. Les chiots non traitées montrent l’amplification variable de LP indiquant le partage des communaux de l’organisme de probiotiques dans une litière. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Figure 5 . Amplification de LP de l’ADN intestinale de DOL 14 petits traités entre DOL 2 et 8 DOL de gavages réguliers tous les jours (7 doses) et tous les autres jours (4 doses). Les baisses de charge LP ci-dessous cycle 28 indiquant apurement des LP au cours des 6 jours post dernier probiotique gavage. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
| Étape | Température | Temps |
| 1 | 50 ° C | 2 minutes |
| 2 | 95 ° C | 3 minutes |
| 3 | 95 ° C | 30 secondes |
| 4 | 58 ° C | 30 secondes |
| 5 | 72 ° C | 30 secondes |
Table 1. conditions d’amplification de qPCR. La température et un certain nombre de conditions de cycle pour la réaction PCR.
| Objectif | Espaceur intergénique 16 s-23 s |
| Taille des fragments attendus | 144 bp |
| Apprêt Tm | 58˚C |
| Avant apprêt (FP) | LPN-1 : TGG ATC ACC TCC TTT CTA AGG AAT |
| Apprêt inverse (RP) | LPN-2 : CAT CGG TTT TCT TGT TAT GAA AAA ATA |
Le tableau 2. Détails des composants de la réaction de qPCR. Les détails sur les amorces, leur température de recuit et de taille des fragments attendus lors de la réaction PCR.
| Concentration de | Réaction de 10µl | Réaction de 20 µL |
| Modèle de l’ADN | 200 pg/µL | 1 ΜL | 1 ΜL |
| SYBR Master Mix | - | 5 ΜL | 10 ΜL |
| FP | 10 ΜM | 0,3 ΜL | 0,6 ΜL |
| RP | 10 ΜM | 0,3 ΜL | 0,6 ΜL |
| dH2O | - | 3.4 ΜL | 8.8 ΜL |
Tableau 3. Par les concentrations et volumes de la réaction. La concentration des réactifs et des volumes pour les réactions.