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Article de méthode

Une description colorimétrique de l'activité de Synthase Citrate dans Drosophila Melanogaster

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DOI :

10.3791/59454

16 janvier 2020

* These authors contributed equally

Dans cet article

Résumé

Nous présentons un protocole pour un test colorimétrique de l'activité de synthase de citrate pour la quantification de la masse mitochondriale intacte dans les homogénéités de tissu de Drosophila.

Résumé

Les mitochondries jouent les rôles les plus importants dans le métabolisme cellulaire en produisant de l'ATP par phosphorylation oxydative et en régulant une variété de processus physiologiques. Le dysfonctionnement mitochondrial est une cause primaire d'un certain nombre de maladies métaboliques et neurodégénératives. Les mitochondries intactes sont essentielles à leur bon fonctionnement. La synthase de citrate d'enzyme est localisée dans la matrice mitochondriale et peut ainsi être employée comme marqueur quantitatif d'enzyme de la masse mitochondriale intacte. Étant donné que de nombreuses molécules et voies qui ont des fonctions importantes dans les mitochondries sont fortement conservés entre les humains et Drosophila, et qu'un éventail d'outils génétiques puissants sont disponibles dans Drosophila, Drosophila sert de bon système modèle pour l'étude de la fonction mitochondriale. Ici, nous présentons un protocole pour la mesure rapide et simple de l'activité de synthase de citrate dans l'homogénéisation de tissu des mouches adultes sans isoler des mitochondries. Ce protocole convient également à la mesure de l'activité de synthase de citrate dans les larves, les cellules cultivées et les tissus mammifères.

Introduction

Les mitochondries sont surtout connues comme les organites producteurs d'énergie dans la plupart des organismes eucaryotes, qui produisent la monnaie de l'énergie, l'ATP, à travers le cycle de l'acide tricarboxylique (c.-à-d. le cycle Debs) et la phosphorylation oxydative. Les mitochondries jouent également un rôle important dans un grand nombre d'autres processus physiologiques, tels que la régulation de l'apoptose1, Ca2 ' homéostasie2,3, espèces d'oxydation réactive (ROS) génération4, et réticulum endoplasmique (ER)-réponse au stress5. Le dysfonctionnement mitochondrial peut affecter n'importe quel organe dans le corps à n'importe quel âge et est une cause primaire des maladies métaboliques, liées au vieillissement6,et neurodegenerative7. Les mitochondries intactes sont mécanistes liées à la fonction mitochondriale. Ainsi, la quantification appropriée de la masse mitochondriale intacte est très importante pour évaluer la fonction mitochondriale8. La synthase de citrate, une enzyme de limitation de taux dans la première étape du cycle d'acide tricarboxylique9,est localisée dans la matrice mitochondriale dans les cellules eucaryotes, et peut ainsi être employée comme marqueur quantitatif pour la présence de la masse mitochondriale intacte9,10. L'activité de synthase de citrate peut également être employée comme facteur de normalisation pour les protéines mitochondriales intactes11,12.

La mouche des fruits, Drosophila melanogaster, est un excellent système modèle pour l'étude de la fonction mitochondriale, comme de nombreuses molécules et les voies qui jouent des rôles pivots dans les mitochondries sont évolutivement conservés de Drosophila à l'homme13,14,15. Ici, nous présentons un protocole pour une méthode rapide et simple pour la mesure de l'activité de synthase de citrate par un test colorimétrique dans le tissu de Drosophila homogénéise16 dans un format de plaque de puits 96. Dans l'analyse de l'activité de synthase de citrate, la synthase de citrate dans le tissu de Drosophila homogénéise catalyse la réaction de l'oxaloacetate avec la coenzyme acétyle A (acétyl CoA) pour former le citrate CoA-SH etH. CoA-SH réagit par la suite avec 5,5'-dithiobis-(2-nitrobenzoic acid) (DTNB) pour générer un produit coloré, 2-nitro-5-thiobenzoate (TNB), qui peut être facilement mesuré spectrophotometrically à 412 nm. L'activité de synthase de citrate peut être reflétée par le taux de production de couleur.

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Protocole

1. Colorimétrique Citrate Synthase Activity Assay pour D. melanogaster16

  1. Recueillir dix mouches adultes pour chaque échantillon. Recueillir au moins des échantillons tripler pour chaque génotype.
  2. Préparer 500 l de tampon d'extraction à froid contenant 20 mM HEPES (pH à 7,2), 1 mM EDTA et 0,1 % de triton X-100 dans un tube à essai de 1,5 mL pour chaque échantillon.
  3. Anesthésier les mouches adultes avec du CO2 sur un coussin et isoler les tissus désirés. Pour isoler les thoraxes mouche adultes, par exemple, fixer les thoraxes mouche par une paire de forceps, puis isoler les abdomens de mouche en coupant le long de la frontière du thorax et de l'abdomen à l'aide d'une paire de ciseaux. Recueillir les thoraxes mouche pour le citrate musculaire synthase activité d'assay.
    REMARQUE : Déterminez le poids frais du tissu à cette étape si vous l'utilisez pour normaliser l'activité de synthase du citrate.
  4. Transférer immédiatement 10 thorax mouches adultes à 100 l de tampon d'extraction à froid et homogénéiser avec un pilon sur la glace. Pour garder les échantillons glacés, homogénéiser les échantillons pour 5-10 s sur la glace, puis faire les échantillons assis sur la glace pendant 5 s, et répéter jusqu'à ce que tous les tissus dans le tube sont homogénéisés complètement.
    REMARQUE: Tapez le tube, vérifiez les homogénéates pour s'assurer qu'il n'y a pas de caillots dans les homogénéates et que les tissus dans le tube sont homogénéisés complètement. Tous les échantillons de traitements doivent être effectués sur glace.
  5. Prenez 10 L de chaque échantillon homogénéisé dans un nouveau tube pour la mesure de la teneur en protéines. Conservez les échantillons pour la mesure des protéines sur la glace.
    REMARQUE : Les échantillons de protéines peuvent être congelés et stockés à -80 oC pour une analyse ultérieure. Les concentrations protéiques servent de paramètre interne pour la normalisation des activités de synthase de citrate.
  6. Ajouter 400 ll de tampon d'extraction à glace à chaque échantillon restant pour obtenir un volume total de 500 l. Bien mélanger en tirant doucement de haut en bas au moins 5 fois, en évitant la formation de bulles. Pour chaque réaction, ajouter 1 l de lysate dilué à 150 oL de la solution de réaction fraîchement préparée (20 mM Tris-HCl (pH 8,0), 0,1 mM DTNB, 0,3 mM d'acétyl CoA, 1 mM d'acide oxaloacétique). Mélanger soigneusement et immédiatement en pipetilage doucement, en évitant la formation de bulles. Mesurer l'absorption à 412 nm tous les 10-30 s pendant 4 min à 25 oC à l'aide d'un lecteur de plaque capable de mesurer l'absorption à 412 nm à intervalles minimums de 10 s.
    REMARQUE : Changez la pointe avant de pipetting un réactif différent et éviter de former des bulles dans les puits. Le mélange incomplet des réactifs peut entraîner des variations dans les mesures. L'analyse d'activité de synthase de citrate devrait être faite à la température ambiante immédiatement après que les échantillons soient rassemblés, car cet analyse est employé pour quantifier la masse mitochondrique intacte. Le tampon de réaction doit être préparé immédiatement avant utilisation et ne doit pas être stocké.
  7. Tracer les données sous forme d'absorption de densité optique (OD) (abs) (axe Y) par rapport au temps (en minutes) (axe X). Calculez ensuite la pente pour la partie linéaire de la courbe, où le taux de réaction est

    figure-protocol-1

    Divisez la valeur par la concentration de protéines de l'échantillon pour normaliser l'activité de synthase du citrate. L'activité de synthase du citrate est calculée comme

    figure-protocol-2

    REMARQUE : La concentration en protéines de l'échantillon peut être mesurée par un kit d'analyse de concentration de protéines.

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Résultats

La figure 1 présente un exemple des courbes cinétiques de l'absorption de l'OD à 412 nm au fil du temps obtenue s'appuyant sur l'analyse colorimétrique de l'activité de synthase de citrate pour mesurer les homogénéités du tissu thorax Drosophila de différents génotypes. Il est bien connu que PGC-1 est un régulateur principal de la biogenèse mitochondriale. PgC-1 est fonctionnellement conservé entre la drosophile et l'homme. Drosophile

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Discussion

Les études métaboliques utilisant Drosophila comme modèle doivent prendre en considération le fond génétique, l'alimentation, et l'entretien de stock des mouches18. Afin d'éviter les effets de différents milieux génétiques sur la mesure de l'activité de la synthase du citrate, différentes souches de Drosophila doivent être rétrocroisées à la souche témoin pendant 10 générations. Le fond génétique de toutes les souches de Drosophila utilisées dans nos expériences est ...

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Déclarations de divulgation

Les auteurs ne déclarent aucun conflit d'intérêts.

Remerciements

Ce travail a été soutenu par les subventions de la National Natural Science Foundation of China (31401013 et 31471010), de la Science and Technology Commission of Shanghai Municipality, du Shanghai Pujiang Program (14PJ1405900) et de la Natural Science Foundation of Shanghai (19ZR1446400).

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Acide 2-[4-(2-hydroxyéthyl)-1-pipérazinyl]éthanesulfonique (HEPES)Sigma-AldrichV900477
2-Amino-2-(hydroxyméthyl)-1,3-propanediol (TRIZMA Base)Sigma-AldrichV900483
Acétyl-CoASigma-AldrichA2181
Acide dithio-bis-nitrobenzoïque (DTNB)Sigma-AldrichD8130
Acide éthylènediaminetétraacétique (EDTA)Sigma-AldrichV900106
OxaloacétateSigma-AldrichO4126
Pilon à granulésSangonF619072
Moteur pilon à granulésTiangenOSE-Y10
Lecteur de plaquesBioTekEon
Protein BCA Kit de dosageBeyotimeP0010S
CiseauxWPI14124
Triton X-100SangonA110694-0100

Références

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