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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Ce protocole vise à générer des interneurones directement reprogrammés in vivo, à l'aide d'un système viral à base d'AAV dans le cerveau et d'un journaliste GFP piloté par la synapsine FLEX, qui permet l'identification cellulaire et une analyse plus approfondie in vivo.
La conversion des glies résidentes dans le cerveau en neurones fonctionnels et spécifiques au sous-type in vivo permet de faire un pas en avant vers le développement de thérapies alternatives de remplacement cellulaire tout en créant des outils pour étudier le destin cellulaire in situ. Jusqu'à présent, il a été possible d'obtenir des neurones par reprogrammation in vivo, mais le phénotype précis de ces neurones ou comment ils mûrissent n'a pas été analysé en détail. Dans ce protocole, nous décrivons une conversion plus efficace et une identification cellulaire spécifique des neurones reprogrammés in vivo, à l'aide d'un système vectorielle virale basé sur l'AAV. Nous fournissons également un protocole pour l'évaluation fonctionnelle de la maturation neuronale des cellules reprogrammées. En injectant des vecteurs flip-excision (FLEX), contenant les gènes de la reprogrammation et de la synapsine à des types de cellules spécifiques dans le cerveau qui servent de cible pour la reprogrammation cellulaire. Cette technique permet d'identifier facilement les neurones nouvellement reprogrammés. Les résultats montrent que les neurones reprogrammés obtenus mûrissent fonctionnellement au fil du temps, reçoivent des contacts synaptiques et montrent des propriétés électrophysiologiques de différents types d'interneurones. En utilisant les facteurs de transcription Ascl1, Lmx1a et Nurr1, la majorité des cellules reprogrammées ont des propriétés d'interneurons à pointe rapide et contenant de la parvalbumine.
L'objectif global de cette méthode est de convertir efficacement les gliales résidentes du cerveau in vivo en neurones fonctionnels et spécifiques au sous-type tels que les interneurons exprimant la parvalbumine. Ceci fournit un pas en avant vers le développement d'une thérapie alternative de remplacement de cellules pour des maladies de cerveau sans avoir besoin d'une source exogène de cellules. Il crée également un outil pour étudier les commutateurs de destin cellulaire in situ.
Le cerveau n'a qu'une capacité limitée pour générer de nouveaux neurones. Par conséquent, dans les maladies neurologiques, il ya un besoin de sources cellulaires exogènes pour la réparation du cerveau. Pour cela, différentes sources de cellules ont fait l'objet d'intenses recherches au fil des ans, y compris des cellules provenant de tissus primaires, de cellules souches dérivées et de cellules reprogrammées1,2,3. La reprogrammation directe des cellules cérébrales résidentes en neurones est une approche récente qui pourrait fournir une méthode attrayante pour la réparation du cerveau car elle utilise les propres cellules du patient pour générer de nouveaux neurones à l'intérieur du cerveau. À ce jour, plusieurs rapports ont montré la reprogrammation in vivo par la livraison de vecteurs viraux dans le cerveau4,6,6,78,9 dans différentes régions du cerveau telles que le cortex, la moelle épinière, le striatum et le midbrain5,10,11, ainsi que dans le cerveau intact et lesioned5,8,11,12. Les neurones inhibiteurs et excitateurs ont été obtenus4,8, mais le phénotype précis ou la fonctionnalité de ces cellules n'a pas encore été analysé en détail.
Dans ce protocole, nous décrivons une reprogrammation plus efficace et l'identification cellulaire-spécifique des neurones reprogrammés in vivo. Nous fournissons un protocole pour l'évaluation fonctionnelle de la maturation neuronale et de la caractérisation de phénotype basée sur la fonctionnalité et les traits immunohistochemical.
Nous avons utilisé un vecteur AAV inductible et un journaliste GFP pour identifier les neurones reprogrammés in vivo. Ce choix de vecteurs viraux a l'avantage d'infecter à la fois les cellules de division et de non-division du cerveau, en augmentant le nombre de cellules ciblées, comme une alternative à l'utilisation du rétrovirus7,8. Un journaliste FLEX (GFP) piloté par la synapsine spécifique aux neurones nous a permis de détecter spécifiquement les neurones nouvellement générés. Des études antérieures ont utilisé des promoteurs spécifiques au sous-type pour la reprogrammation in vivo7,9, qui permettent également l'expression de gènes de reprogrammation et de journalistes dans des types de cellules spécifiques. Cependant, cette méthode exige une identification plus poussée des neurones reprogrammés par l'analyse post mortem de la co-expression des marqueurs de journaliste et neuronal. L'utilisation d'un journaliste spécifique aux neurones, comme celui décrit ci-contre, permet une identification directe. Ceci fournit une preuve directe d'une conversion réussie et permet une identification de cellules vivantes qui est exigée pour l'électrophysiologie de correction-clamp.
Toutes les procédures expérimentales ont été réalisées dans le cadre de la directive de l'Union européenne (2010/63/UE) et approuvées par le comité d'éthique pour l'utilisation d'animaux de laboratoire à l'Université de Lund et le Département suédois de l'agriculture (Jordbruksverket). Les souris sont logées dans un cycle clair/sombre de 12 h avec un accès ad libitum à la nourriture et à l'eau.
1. Vecteurs viraux
2. Injection de facteurs de reprogrammation dans le cerveau
3. Enregistrements électrophysiologiques
4. Immunohistochimie, stérilisation et quantification
REMARQUE: Consacrer un groupe spécifique de souris pour l'immunohistochimie, car les sections de tissu utilisées pour l'électrophysiologie ne sont pas optimales pour l'immunohistochimie.
L'injection de vecteurs AAV est utilisée pour reprogrammer avec succès les cellules gliales NG2 résidentes dans les neurones du striatum de souris NG2-Cre (Figure 1A). Pour cibler spécifiquement NG2 glia, les vecteurs FLEX avec des gènes de reprogrammation/reporter, sont insérés dans une direction antisens et flanqués de deux paires de sites loxP antiparallèles et hétérorotypic (Figure 1B). Chacun des trois gènes de reprogrammation (Ascl1, Lmx1a et Nurr1) est placé sous le contrôle du promoteur de l'abc omniprésent sur les vecteurs individuels. Afin de s'assurer que l'expression GFP est limitée aux neurones reprogrammés provenant d'une cellule exprimant cre, GFP est placé sous le contrôle du promoteur de synapsin spécifique aux neurones, (également dans un vecteur FLEX).
L'utilisation de la combinaison de la reprogrammation et des constructions de reporter permet la génération de neurones GFP-positifs dans le striatum de souris (Figure 1C, C'). L'utilisation de la construction du journaliste sans la présence de gènes de reprogrammation ne donne pas de neurones GFP-positifs (Figure 1D).
Les neurones reprogrammés qui sont remplis de biocytine sont visibles après l'immunocoloration post-mortem (Figure 2A). Si la conversion est réussie, il devrait y avoir une morphologie neuronale étendue. Les enregistrements électrophysiologiques des neurones reprogrammés montrent la présence de connexions fonctionnelles postsynaptiques avec des mesures d'activité spontanées (Figure 2B, C). Ceci peut être bloqué avec le bloqueur gabAergique ionotropique ou glutamatergic (Picrotoxin ou CNQX), suggérant l'entrée synaptique excitatoire et inhibitrice aux neurones reprogrammés. L'occurrence de l'activité spontanée augmente avec le temps après l'injection virale (figure 2D),indiquant une maturation progressive.
Les potentiels d'action induits par le courant sont présents dans les neurones fonctionnels. Les potentiels d'action augmentent en nombre au fil du temps après la conversion (Figure 2E). Ceci indique davantage la maturation dans la fonction neuronale. Dans un neurone immature, le courant induira aucun ou très peu de potentiels d'action (Figure 2F).
Les modèles de tir d'un neurone est de type cellulaire spécifique car il dépend de facteurs tels que la morphologie des cellules et l'expression du canal15. Les modèles enregistrés dans les neurones reprogrammés in vivo peuvent être distingués en groupes et comparés à ceux des sous-types neuronaux endogènes, par exemple les interneurons à pointe rapide (cell type B, figure 3B) ou d'autres types de cellules (Figure 3A,C,D ). Les différences électrophysiologiques observées peuvent être confirmées par la présence de marqueurs de sous-type spécifiques et la coexpression avec GFP (Figure 3E-H). Au total, ces données indiquent que les neurones reprogrammés présents dans le striatum ont des propriétés de différents types d'interneurons, tels que Les interneurons exprimant par-albumine, ChAt- et NPY, ainsi que l'identité striatal de neurones épineux moyens (DARPP32) ( Figure 3E -H).

Figure 1 : Reprogrammation in vivo des gliales NG2 résidentes en neurones. (A) Représentation schématique de la reprogrammation in vivo de NG2 médié par le virus AAV. (B) Représentation schématique des constructions AAV5 FLEX utilisées pour la reprogrammation in vivo, dans laquelle l'expression des gènes est réglementée par l'expression Cre dans les cellules ciblées. (C et C') Neurones reprogrammés in vivo, résultant de l'injection de Syn-GFP et d'ALN dans le Striatum. (D) Absence de neurones reprogrammés lorsqu'aucun facteur de reprogrammation n'est ajouté dans le cocktail viral, et que seule la construction du journaliste est injectée in vivo. Barres d'échelle de 100 mm (C), 25 mm (C'), 25 mm (D). Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 2 : Les neurones reprogrammés in vivo sont fonctionnels et montrent une maturation au fil du temps. (A) Neurone reprogrammé rempli de biocytine, montre la morphologie neuronale mûre, y compris les épines dendritiques. Traces montre (B) l'activité inhibitrice (GABAergic) qui est bloquée avec la picrotoxine, un antagoniste des récepteurs GABAA et (C) activité excitatrice qui est bloqué avec CNQX, un antagoniste des récepteurs AMPA. (D) Le nombre de neurones avec l'activité postsynaptique augmente avec le temps. (E) Les neurones patchés montrent le tir répétitif déjà à 5 semaines après l'injection (w.p.i.) et continuent à montrer qu'à 8 et 12 w.p.i. (F) Potentiel d'action induit par le courant et activité postsynaptique d'un neurone immature, montrant peu de synaptique événements et peu de potentiels d'action par rapport à B et D. Barre d'échelle de 25 mm S'il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 3 : Les neurones reprogrammés in vivo montrent des propriétés immunohistochimiques et électrophysiologiques des interneurons striatal. (A-D) Les modèles de tir des neurones reprogrammés in vivo peuvent être de types distincts : (A) Type A est similaire au neurone épineux moyen endogène (DARPP32); (B) semblable aux interneurons à pointe rapide (PVMD); (C) semblable aux neurones à faible seuil avec un affaissement proéminent (NPYMD); (D) neurones tirant avec une grande hyperpolarisation après (Chat). (E-H) Images confocales montrant la co-localisation du GFP et des marqueurs interneuron PV (E), ChAT (F), NPY (G), et marqueur neuronal de projection DARPP32 (H). Toutes les barres d'échelle de 50 mm. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
Les auteurs n'ont rien à révéler.
Ce protocole vise à générer des interneurones directement reprogrammés in vivo, à l'aide d'un système viral à base d'AAV dans le cerveau et d'un journaliste GFP piloté par la synapsine FLEX, qui permet l'identification cellulaire et une analyse plus approfondie in vivo.
Marcella Birtele a été financée par le programme Horizon 2020 de l'Union européenne (H2020-MSCA-ITN-2015) dans le cadre des réseaux de formation innovants Marie Skoodowska-Curie et de l'Accord de subvention no 676408. Daniella Rylander Ottosson a été financée par le Conseil suédois de la recherche (2017-01234).
| PAVA-CA-FLEX | AddGene | 38042 | |
| Ascl1 | AddGene | 67291 | NM_008553.4 |
| Lmx1a | AddGene | 33013 | NM_0033652.5 |
| Nurr1 | AddGene | 35000 | NM_013613.2 |
| GFP-syn | AddGene | 30456 | |
| Séquence LoxP (FLEX) 1 | GATCTccataacttcgtataaagtatcctatac gaagttatatcaaaataggaagaccaatgcttc accatcgacccgaattgccaagcatcaccatcg acccataacttcgtataatgtatgctatacgaa gttatactagtcccgggaaggcgagaggga agaggctctaga | ||
| LoxP (FLEX) séquences | 2tactagtataacttcgtataggatactttatac gaagttatcattgggattcttcctattttgatc caagcatcaccatcgaccctctagtccacatct caccatcgacccataacttcgtatagcatacat tatacgaagttatgtccctcgaagaggttcgaa ttcgtttaaacGGTACCCTCGAC | ||
| pDP5 | Plasmid Factory | PF435 | |
| pDP6 | Plasmid Factory | PF436 | |
| Saline tamponnée au phosphate (PBS) | Thermo Fisher Scientific | 10010023 | |
| FBS (sérum de veau fœtal) | Thermo Fisher Scientific | 10500064 | |
| Pénicilline streptomycine | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
| DMEM (Dulbecco’s Modified Eagle Medium)+ Glutamax | Thermo Fisher Scientific | 61965026 | |
| DPBS (Dulbecco’s Phosphate Buffer Saline) | Thermo Fisher Scientific | 14190094 | |
| cellules HEK293 | Thermo Fisher Scientific | 85120602-1VL | |
| Flacons | BD Falcon | 10078780 | 175 cm2 |
| Tris H-CL | Sigma Aldrich | 10812846001 | Pour tampon TE Utiliser 10 mM, pH 8,0 ; pour tampon de lyse utiliser 50 mM, pH 8,5 ; pour le tampon IE utiliser 20 mM, pH 8,0 ; pour le tampon d’élution utiliser 20 mM, pH 8,0 |
| EDTA EDTA | : Invitrogen | EDTA : AM9260G | Pour l’utilisation d’un tampon TE 1 mM EDTA |
| ultrapure, | voir Système d’eau ultrapure | ||
| CaCl2 | SigmaAldrich | C5080 | 2,5 M |
| Dulbecco´ ; s solution saline tamponnée au phosphate (DPBS) | Thermo Fisher Scientific | 14190136 | |
| NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 | POUR HBS utilisation 140 mM ; pour tampon de lyse utilisation 150 mM ; pour tampon IE utilisation 15 mM ; pour tampon d’élution utilisation 250 |
| mM MgCl2 | Sigma-Aldrich | M8266-100G | Pour lyse Tampon : 1 mM |
| Ultracentrifugeuse tubes d’étanchéité | Beckman Coulter | Quick-Seal® ;   ; Tube | en polypropylène |
| OptiPrep&trade ;   ; Gradient de densité Medium | Sigma Aldrich | D1556-250ML | |
| Seringue 10 ml-18G aiguille | BD | 305064 | |
| Bouteilles en verre | de laboratoire VWR | ? | |
| Filtre échangeur d’anions | Unité d’acrodisque PALL de laboratoire MSTG25Q6 | avec membrane Mustang Q | |
| Unité de filtration centrifuge | Merck | Z740210-24EA | Dispositif Amicon Ultra-4 |
| Kits d’isolement d’ADN plasmidique sans endotoxines | Thermo Fisher Scientific | A33073 | |
| Na2PO4 | Sigma-Aldrich | S7907 | |
| HEPES | Sigma-Aldrich | H7523 | Tube Falcon 15 mL |
| Thermo Fisher Scientific | Corning 352196 | ||
| Tube Falcon | Thermo Fisher Scientific | Corning 352070 | |
| Flacons en verre | Novatech | 30209-1232 | CGGCCTCAGFGAGCGA |
| Amorce avant pour séquence | de répétition terminale inversée (ITR) | GGAACCCCTAGTGATGGAGTT | |
| Amorce inversée pour la séquence | de répétition terminale inversée (ITR) | CACTCCCTCTCTGCGCGCTCG | |
| 5´ ; FAM / 3&aigu ; Sonde BHQ1 | Jena Bioscience | ||
| Filtre 0,22 mm | Filtre Merck | SLGV004SL | Millex-GV |
| Congélateur -20 ° ; C | |||
| Congélateur -80 ° ; C | |||
| Réfrigérateur +4 ° ; C | |||
| AAV salle | virale | ||
| Système d’eau ultrapure | Merck | Milli-Q® ; IQ 7000 | |
| Mélangeur vortex | VWR | 444-0004 | |
| Ultracentrifugeuse | Beckman Coulter | Beckman Optima LE-80K Ultracentrifugeuse | |
| Autoclave | Tuttnauer | 2540 EL | |
| Réaction en chaîne par polymérase (PCR) | BioRad | C1000 Touch Thermal Cycler | |
| PCR quantitative (qPCR) | Roche | LightCycler® ; 480 Système | |
| de centrifugation | Thermo Fisher Scientific | Sorvall ST16 | |
| Bain-marie | Thermo Fisher Scientific | TSGP02 | |
| ANIMAL MODEL | |||
| NG2-Cre | mice Jackson | NG2-CrexB6129, Stock #008533 | |
| RÉACTIFS POUR L’INJECTION DE FACTEURS DE REPROGRAMMATION DANS LE CERVEAUSaline | |||
| Apoteket AB | 70 % | ||
| Éthanol | Solveco | ||
| Isolfurane | Apoteket AB | Diluer à 1 % solution avec de l’eau tiède. | |
| Virkon | Viroderm | 7511° ; | |
| Pentobarbital | Apoteket AB | P0500000 | i.p. pour procédure terminale à la dose de 60 mg/ml. |
| Sucrose | Merck | S0389-500G | |
| Trypan Blu | Thermo Fisher Scientific | 15250061 | |
| Retrobeads | Lumafluor | R170 | |
| Buprénorphine | Apoteket AB | ||
| >EQUIPMENT POUR L’INJECTION DE FACTEURS DE REPROGRAMMATION DANS LE CERVEAU | De RSG Solingen. | ||
| Ciseaux | VWR | 233-1552 | de Biochem. |
| Pince à épiler | VWR | 232-0007 | |
| Pince | VWR | 232-0120 | |
| Porte-scalpel | VWR | RSGA106.621 | Numéro 20. |
| Scalpel | VWR | RSGA106.200 | |
| Cadre stéréotaxique | Stoelting Europe | 51500D | |
| Barres d’oreille de souris | Stoelting Europe | 51648 | 5 ul |
| Seringue avec aiguille amovible | Hamilton Company | 65 | 0,75 diamètre intérieur et 1,5 diamètre extérieur. |
| Capillaires en verre | Stoelting | 50811 | |
| Extracteur capillaire en verre | Sutter company | P-1000 | |
| Foret dentaire | Agnthos AB | 1464 | |
| Rasoir | Agnthos AB | GT420 | |
| Chambre et pompe isoflurane | Agnthos AB | 8323101 | 2 mL |
| Seringues | Merck | Z118400-30EA | 25G |
| Aiguilles | Merck | Z192414  ; Aldrich | |
| Souris et rat néonatal adaptateur pour fram stéréotaxique | Stoelting | 51625 | |
| Coussin chauffant | Braintree scientific, inc | 53800M | De Covidien 2187. |
| Gaze de coton | Fisher Scientific | 22-037-902 | |
| Tube en caoutchouc | Elfa Distrelec | HFT-A-9.5/4.8 PO-X BK 150 | |
| Cotons-tiges | Fisher Scientific | 18-366-473 | |
| RÉACTIFS POUR ENREGISTREMENTS DE PATCHS À CELLULES ENTIÈRES | |||
| NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 | |
| KCl | Sigma-Aldrich | P9333 | |
| NaH2PO4-H2O | Sigma-Aldrich | S9638 | |
| MgCl2-6 H2O | Sigma-Aldrich | M2670 | |
| CaCl2-6 H2O | Sigma-Aldrich | C8106 | |
| MgSO4-7 H2O | Sigma-Aldrich | 230391 | |
| NaHCO3 | Sigma-Aldrich | S5761 | |
| Glucose | Sigma-Aldrich | G7021 | voir Système d’eau ultrapure |
| Eau | ultrapure | Prepare 1 ou 2M. | |
| KOH | Sigma-Aldrich | P5958-500G | |
| K-D-gluconate | Sigma-Aldrich | G4500  ; Sigma | |
| KCl | Sigma-Aldrich | P9541 | |
| KOH-EGTA (Etilene glycol-bis-N-tetracetic acid) | Sigma-Aldrich | E3889  ; Sigma | |
| KOH- Acide Hepes (N-2-hydroxyéthylpipérazine-N'-2-acide éthanesulfonique) | Sigma-Aldrich | H7523 | |
| NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 | |
| Mg2ATP | Sigma-Aldrich | A9187 | |
| Na3GTP | Sigma-Aldrich | G8877 | |
| Biocytine | Sigma-Aldrich | B4261 | |
| Picrotoxine | Merck | P1675²5 ; Sigma | |
| CNQX | Merck | C239° ; Sigma | |
| Ice | |||
| EQUIPMENT POUR L’ENREGISTREMENT DE PATCHS À CELLULES ENTIÈRES | |||
| Pipette en verre borosilicaté | Sutter Company | B150-86-10 | |
| Extracteur capillaire en verre | Sutter company | P-1000 | |
| Vibratome | Leica | Leica VT1000 S | |
| WaterBath | Thermo Fisher Scientific | TSGP02 | |
| Logiciel Clampfit | Dispositifs moléculaires Logiciel | ||
| Multiclamp | Dispositifs | ||
| moléculaires | Utilisation à une concentration de 4 %.  ; MISE EN GARDE&NBSP ; Le PFA est un puissant fixateur. Évitez l’ingestion et le contact avec la peau. | ||
| Paraformaldéhyde (PFA) | Merck Millipore | 1040051000 | Utilisation à une concentration de 0,1 %. |
| Triton X-100 | Fisher Scientific | 10254640 | Donkey.Utilisation à une concentration de 1 : 400. |
| Sérum | Merck Millipore | S30-100ML | Reconstituer la poudre dans de l’eau Milli-Q à 1 mg/mL. Aliquote et stocker à -20° ; C,  ; sensible à la lumière. Utiliser à une concentration de 1 : 500. |
| 4&prime ;,6-Diamidino-2&prime ;-dichlorhydrate de phénylindole (DAPI) | Sigma Aldrich | D9542 | 1:600 dans KPBS-T. |
| streptavidin- Cy3 | Thermo Fisher Scientific | 434315 | 1:5000, lapin. |
| Anti-GAD65/67 | Abcam | 1:2000, souris. | |
| Anti-PV | Sigma | P3088 | 1:200, chèvre. |
| Anti-Chat | Merk | AB143 | 1:5000, lapin. |
| Anti-NPY | Immunostar | 22940 | |
| K2HPO4 | Sigma-Aldrich | P3786 | |
| NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 | |
| KH2PO4 | Sigma-Aldrich | NIST200B | 1:1000, poulet. |
| Anti-GFP | Abcam | ab13970 | |
| Solution de montage | Merck | 10981 | Alcool polyvinylique avec DABCO® ;, anti-décoloration |
| OCT | Agar | ||
| Scientific Glycérol | Sigma-Aldrich | G9012-100ML | |
| Eau | distillée | ||
| Solution antigel | Tissue Pro Technology | AFS05-1000N, 1000 mL/ch. | |
| ÉQUIPEMENT | Leica DMI6000 |||
| B | |||
| Microscope confocal | Leica | TCS SP8 Microscope confocal à balayage laser. | |
| Prisme | GraphPad | ||
| Microtome | Leica | SM2010R |