Notre laboratoire et beaucoup d’autres ont exploité la haute puissance de résolution de la microscopie électronique à transmission pour étudier la morphologie et l’organisation spatiale des vésicules synaptiques. Afin d’obtenir des micrographies électroniques de haute qualité qui peuvent produire le degré de détail morphologique nécessaire à l’analyse quantitative de la distribution de vésicules présynaptiques, la préparation optimale des spécimens est essentielle. La fixation chimique est la première étape dans le processus de préparation des spécimens, et de la plus haute importance pour préserver l’ultrastructure fine. La fixation vasculaire avec une solution de glutaraldéhyde-formaldéhyde, suivie d’un traitement de spécimens coupés en vibratome avec du tétroxyde d’osmium, stabilise le nombre maximal de molécules, en particulier les protéines et les lipides, et entraîne une conservation supérieure de l’ultrastructure. Le tissu est ensuite traité avec une contre-coloration, une déshydratation séquentielle et une incorporation de résine. La coloration en bloc avec l’acétate d’uranyle (c.-à-d., coloration des tissus sectionnés par vibratome avant l’incorporation de résine) renforce le contraste endogène et stabilise les composants cellulaires contre l’extraction pendant le traitement des spécimens. Le contraste peut être augmenté davantage en appliquant l’acétate d’uranyle comme post-tache sur des sections ultrafines. La double coloration des coupes ultrafines avec le citrate de plomb après le traitement par l’acétate d’uranyle améliore également la résolution de l’image, en intensifiant l’opacité électronique des structures contenant de l’acide nucléique par liaison sélective du plomb à l’acétate d’uranyle. La microscopie électronique à transmission est un outil puissant pour caractériser les détails morphologiques des vésicules synaptiques et la quantification de leur taille et de leur organisation spatiale dans le bouton terminal. Cependant, parce qu’il utilise des tissus fixes, la microscopie électronique par transmission ne peut fournir que des informations indirectes sur les processus vivants ou en évolution. Par conséquent, d’autres techniques devraient être envisagées lorsque l’objectif principal est d’étudier les aspects dynamiques ou fonctionnels du trafic de vésicules synaptiques et de l’exocytose.