Les connexions synaptiques sont essentielles à la fonction du circuit neuronal, mais la topologie et la physiologie précises des synapses dans les circuits neuronaux sont souvent difficiles à sonder expérimentalement. C’est parce que la stimulation électrique, l’outil traditionnel de l’électrophysiologie cellulaire, active sans discernement les axones près du site de stimulation, et dans la plupart des régions du cerveau, les axones de différentes sources (locales, ascendantes et/ou descendantes) s’entremêlent. Cependant, en utilisant channelrhodopsine cartographie de circuit assisté (CRACM)1,2, cette limitation peut maintenant être surmontée3. Channelrhodopsin (ChR2) est une lumière activée, canal d’ions cation-sélectif à l’origine trouvé dans l’algue verte Chlamydomonas reinhardtii. ChR2 peut être activé par la lumière bleue d’une longueur d’onde autour de 450-490 nm, dépolarisant la cellule par l’afflux de cation. ChR2 a été décrit pour la première fois et exprimé dans les ovocytes Xenopus par Nagel et ses collègues4. Peu de temps après, Boyden et ses collègues5 ont exprimé le ChR2 dans les neurones mammifères et ont montré qu’ils pouvaient utiliser des impulsions lumineuses pour contrôler de façon fiable les pointes sur une échelle de temps milliseconde, induisant des potentiels d’action de 10 ms après l’activation de ChR2 avec la lumière bleue. Des canaux optogénétiques avec des cinétiques encore plus rapides ont été trouvés récemment (par exemple, Chronos6).
L’approche de base d’une expérience CRACM est de transfect une population de neurones présynaptiques putatifs avec un virus adéno-associé recombinant (rAAV) qui porte l’information génétique pour une canalrhodopsine. La transfection des neurones avec le rAAV conduit à l’expression de la channelrhodopsine codée. Typiquement, la canalrhodopsine est marquée avec une protéine fluorescente comme GFP (protéine fluorescente verte) ou tdTomato (une protéine fluorescente rouge), de sorte que la transfection des neurones dans la région cible peut facilement être confirmée avec l’imagerie de fluorescence. Parce que les rAAV sont non pathogènes, ont un faible potentiel inflammatoire et l’expression génique de longue durée7,8, ils sont devenus une technique standard pour livrer des canalrhodopsines aux neurones. Si, après transfection d’une population présynaptique putative de neurones, l’activation d’une canalrhodopsine par des éclairs de lumière suscite des potentiels ou des courants postsynaptiques dans les neurones cibles, c’est l’évidence d’une connexion axonale du noyau transfecté à la cellule enregistrée. Puisque les axones coupés dans des expériences de tranche de cerveau peuvent être conduits pour libérer le neurotransmetteur par l’activation de canalrhodopsine, les noyaux qui se trouvent en dehors de la tranche aigue mais envoient des axones dans la région de cerveau postsynaptic peuvent être identifiés avec CRACM. La puissance de cette technique est que la connectivité et la physiologie des entrées synaptiques à longue portée identifiées peuvent être étudiées directement.
En plus de channelrhodopsines qui sont excitables par la lumière bleue, les enquêteurs ont récemment identifié plusieurs canalrhodopsines rouges décalées9,10, y compris Chrimson et son plus rapide analogique ChrimsonR, qui sont tous deux excités par la lumière rouge de 660 nm6. Les opsines à décalé rouge sont d’intérêt parce que la lumière rouge pénètre le tissu mieux que la lumière bleue, et la lumière rouge peut avoir une cytotoxicité inférieure à la lumière bleue10,11,12. Les canalrhodopsines décalées rouges ouvrent également la possibilité d’expériences CRACM à double couleur, où la convergence des axones de différents noyaux sur le même neurone peut être testée dans une expérience6,13,14. Cependant, les opsines rouges actuelles présentent souvent une activation croisée non désirée avec une lumière bleue15,16,17, ce qui rend deux expériences de couleur difficiles. En outre, certains rapports ont indiqué que ChrimsonR subit un trafic axonal limité, ce qui peut rendre difficile l’utilisation de ChrimsonR pour les expériences du CRACM16,17.
Presque toutes les projections ascendantes des noyaux auditifs inférieurs de tronc cérébral convergent dans le colliculus inférieur (IC), le centre de cerveau moyen de la voie auditive centrale. Cela comprend les projections du noyau cochléaire (CN)18,19, la plupart du complexe olivaire supérieur (SOC)20, et le dorsal (DNLL) et ventral (VNLL) noyaux du lemniscus latéral21. En outre, une grande projection descendante du cortex auditif se termine dans l’IC18,19,20,21,22, et les neurones IC eux-mêmes synapse largement dans les lobes locaux et contralatéraux de l’IC23. L’entremêlement d’axones provenant de nombreuses sources a rendu difficile la sonde des circuits IC à l’aide de la stimulation électrique24. En conséquence, même si les neurones de l’IC effectuent des calculs importants pour la localisation sonore et l’identification de la parole et d’autres sons de communication25,26, l’organisation des circuits neuronaux dans l’IC est largement inconnue. Nous avons récemment identifié les neurones VIP comme la première classe de neurones moléculairement identifiables dans l’IC27. Les neurones VIP sont des neurones stellates glutamatergiques qui projettent à plusieurs cibles à longue portée, y compris le thalamus auditif et colliculus supérieur. Nous sommes maintenant en mesure de déterminer les sources et la fonction des entrées locales et à longue portée aux neurones VIP et de déterminer comment ces connexions de circuit contribuent au traitement du son.
Le protocole présenté ici est conçu pour étudier les apports synaptiques aux neurones VIP dans l’IC des souris, en particulier de l’IC contralatéral et le DCN (Figure 1). Le protocole peut être facilement adapté à différentes sources d’entrée, un type de neurone différent ou une région différente du cerveau tout à fait. Nous montrons également que ChrimsonR est une canalrhodopsine rouge-décalée efficace pour la cartographie à longue distance de circuit dans le tronc cérébral auditif. Cependant, nous démontrons que ChrimsonR est fortement activé par la lumière bleue, même à faible intensité, et donc, pour combiner ChrimsonR avec Chronos dans des expériences CRACM bicolores, des contrôles prudents doivent être utilisés pour empêcher l’activation croisée de ChrimsonR.