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Tous les embryons de poissons zèbres utilisés dans cette procédure ont été élevés et élevés selon les protocoles établis de l’IACUC27. Ces protocoles ont été approuvés par l’Université du Texas à Austin et l’Université de Louisville.
REMARQUE: La ligne de poisson zèbre Tg(fli1:EGFP)y1 a été utilisée dans cette étude28. Toute l’eau utilisée dans cette procédure est stérile eau d’osmose inverse. Toutes les analyses statistiques ont été effectuées à l’aide de Graphpad Prism v8.2.1.
1. Faire des médias d’embryon
- Pour faire un stock 20x de médias embryonnaires, dissoudre 17,5 g de NaCl, 0,75 g de KCl, 2,9 g de CaCl2, 0,41 g de K2HPO4, 0,142 g de NA2HPO4, et 4,9 g de MgSO47H2O en 1 L d’eau. Ignorer le précipité blanc qui se forme; cela n’aura pas d’impact sur les médias. Filtrer la stérilisation de la solution de stock et le stocker à 4 oC.
- Pour créer la solution de support embryonnaire de travail, dissoudre 1,2 g de NaHCO3 en 1 L de 20x stock de médias embryonnaires et ajouter 19 L d’eau. Maintenir la solution de support embryonnaire de travail à 28 oC.
2. Mesurer le volume embryonnaire à l’aide du déplacement de l’eau
REMARQUE : Dans ce protocole, 24 h d’embryons postfertilisation (hpf)(figure 1) sont utilisés. Les embryons utilisés dans les mesures de volume ne sont pas utilisés dans l’analyse de l’éthanol.
- Placez 10 embryons et du liquide extraembryonnaire dans un tube microcentrifuge de 1,5 ml marqué à un volume de 250 l(figure 2A). Ajouter de l’eau à la ligne de remplissage de 250 l (voir l’échantillon avec de l’eau teintée à la figure 2B).
- Répétez l’étape 2.1 pour mettre en place des réceptacles pour les embryons qui ont eu leurs chorions enlevés.
- Pour enlever le chorion, placer les embryons dans leurs chorions dans un plat Petri de 100 mm avec 2 mg/ml de cocktail de protéase dans le support embryonnaire à température ambiante (RT) pendant 10 min. Toutes les quelques minutes, faites tourbillonner doucement les embryons pour briser le chorion.
- Une fois que tous les embryons sont exempts de leur chorion, retirer les embryons déchorions du cocktail de protéase/gène et le placer dans un nouveau plat Petri de 100 mm avec des supports d’embryons frais pour laver les embryons. Répétez cette étape de lavage 1 fois de plus (pour un total de 2 lavages). Transférer les embryons dans un plat Petri frais de 100 mm.
- En utilisant la plus petite pointe possible et sans endommager les embryons, retirez soigneusement tout le liquide autour des embryons à l’aide d’un micropipettor p200(figure 2C) et pesez l’eau avec une balance avec une précision de 0,1 mg. Pour déterminer le volume de l’échantillon de 10 embryons, soustrayez le poids/volume de l’eau (1 ml d’eau et 1 g d’eau. Pour déterminer le volume d’un seul embryon, divisez la différence entre 250 L et le poids de l’eau enlevée par 10.


3. Traiter les embryons avec de l’éthanol
- Rassemblez les embryons des réservoirs d’accouplement et placez-les dans un plat Petri standard de 100 mm. Comptez pas plus de 100 embryons par plat Petri unique et incuber à 28,5 oC.
REMARQUE : Si le chorion doit être enlevé (étape 2.2), il doit être enlevé avant d’ajouter de l’éthanol.
- À 6 hpf, ajouter jusqu’à 100 embryons à une nouvelle norme de 100 mm Petri plat soit avec le média embryonnaire ou le média embryonnaire - 1% d’éthanol (v/v). Couvrir, mais NE PAS sceller le plat Petri. Placer les embryons dans un incubateur à basse température réglé à 28,5 oC pendant 18 h, ou jusqu’à ce que les embryons atteignent le point de temps de développement de 24 hpf.
4. Préparation du flux de travail avant le traitement des embryons pour la chromatographie de gaz de l’espace de la tête
- Faire une solution de 5 M NaCl dans l’eau (450 L sera nécessaire par tube d’échantillon) pour dénaturer toutes les protéines et prévenir le métabolisme de l’éthanol. Faire le cocktail de protéase (Table of Materials) à une concentration de 2 mg/mL dans les médias embryonnaires.
- Étiqueter un tube microcentrifuge de 1,5 ml et une flacon de chromatographe gazeux de 2 ml pour chaque échantillon. Étiquetez des flacons de chromatographe stéatographe sérogaz supplémentaires de 2 ml pour les normes d’éthanol décrites ci-dessous ainsi que l’air, l’eau et les blancs de cocktail NaCl/protéase de 5 M.
- Mettre en place trois micropipettors p200 deux ensemble à 50 L, et le troisième ensemble à 200 l; un micropipettor p1000 réglé à 450 L et un micropipettor p2 réglé à 2 ll. Pour les pipettes en verre utilisées pour transférer les embryons de la vaisselle Petri aux tubes microcentrifuges de 1,5 ml, passez rapidement la pointe de la pipette à travers une flamme pour lisser les bords pour ne pas endommager les embryons lors de leur dessin dans la pipette.
5. Traitement des embryons pour la chromatographie de gaz de l’espace de la tête
REMARQUE : Les deux embryons dans leurs chorions et ceux précédemment retirés de leurs chorions sont traités de la même manière pour la cohérence dans le calcul des facteurs de dilution.
- À l’aide des deux micropipettors p200 réglés sur 50 l, puisez 50 l de la solution de cocktail de protéase en une et puisez 50 l’eau dans la seconde.
- À l’aide de la pipette en verre et du micropipettor, placez rapidement 10 embryons (à partir de l’étape 3.2) dans un tube microcentrifuge de 1,5 ml et fermez le bouchon (tel que décrit à la figure 2A). Répétez l’essai pour tous les échantillons à tester, les contrôles et les embryons traités à l’éthanol.
- À l’aide du micropipettor p200 réglé sur 200 l, ouvrez rapidement le bouchon et retirez tous les supports embryonnaires résiduels (tels que décrits dans la figure 2C). Placez rapidement la pipette contenant 50 ll d’eau dans le tube et rapidement mais doucement (pour ne pas endommager les embryons) ajouter, puis retirer l’eau. Ajouter rapidement 50 l de la solution de cocktail de protéase du pipettor d’attente et fermer le bouchon du tube (Figure 2D).
REMARQUE : Effectuez ce processus un échantillon à la fois.
- Laisser l’échantillon s’asseoir à RT pendant 10 min pour permettre au cocktail de protéase de dégrader le chorion. Ensuite, ajoutez rapidement 450 l de 5 M NaCl et fermez le bouchon du tube (Figure 2E). Vortex les échantillons pendant 10 min. Pour accélérer le processus, configurez le mélangeur pour vortexr plusieurs échantillons en même temps.
REMARQUE : Ajouter une petite quantité (100 l) d’un mélange de perles de silice (2 tailles, 0,5 mm et 1 mm de perle) à n’importe quel tube dont les embryons de plus de 24 hpf. Chez les embryons plus âgés, le notochord restera intact indépendamment de combien de temps ils sont homogénéisés.
- Après homogénéisation pendant 10 min, retirer rapidement 2 l de supernatant d’embryon homogénéisé et ajouter à un flacon de chromatographe gazeux. Scellez rapidement le flacon avec le bouchon de polytétrafluoroéthylène.
6. Préparation des normes sur les médias et l’éthanol
- Pour préparer les normes des médias, diluer les médias par un facteur de 10 avec une solution de cocktail NaCl/protéase de 5 M. Ajouter 2 ll de chaque échantillon à un flacon de chromatographe à gaz et sceller avec un bouchon de polytétrafluoroéthylène.
- Pour préparer les normes d’éthanol, créez une dilution sérielle de 100 % d’éthanol dans une solution de cocktail NaCl/protéase de 5 M à des concentrations suivantes : 0,3125, 0,625, 1,25, 2,5, 5, 10, 20 et 40 mm. Ajouter 2 ll de chaque norme à un flacon de chromatographe à gaz et sceller avec un bouchon de polytétrafluoroéthylène.
7. Préparation du chromatographe de gaz de l’espace de tête
REMARQUE : Cette configuration et ce protocole peuvent devoir être modifiés en fonction du chromatographe à gaz utilisé. La chromatographie de gaz de l’espace de tête est utilisée pour quantifier les niveaux d’éthanol, et non pour la séparation.
- Fixer le chauffe-eau de l’autosampler à 58 oC et allumer. Laisser le chauffe-eau atteindre 58 oC et allumer les conduites d’air et d’hydrogène alimentant le chromatographe à gaz (pour l’ionisation des flammes utilisée pour quantifier l’éthanol).
REMARQUE : Le psi doit être réglé pour fonctionner correctement le chromatographe selon les spécifications du fabricant. Assurez-vous que la ligne d’hélium est allumée et réglé sur le psi approprié.
- Pour le septum, assurez-vous que le nombre d’échantillons injectés n’est pas le numéro de 100. Pour la fibre d’injection, assurez-vous que le nombre d’échantillons injectés n’est pas 'gt;500.
REMARQUE : Si l’une ou l’autre est au-dessus de la quantité d’injections, elles devront être changées avant d’exécuter les échantillons d’essai.
- Activez le logiciel d’analyse et assurez-vous que le poste de travail est correctement installé. Stockez toutes les données selon les normes du laboratoire et du département. Créez une nouvelle liste d’échantillons pour les échantillons à exécuter.
- Lancez la méthode de démarrage et attendez que le détecteur d’ionisation des flammes se stabilise avant d’exécuter les échantillons. Une fois stable, exécutez la méthode de démarrage du logiciel pour nettoyer la fibre.
8. Mesures d’échantillon utilisant la chromatographie de gaz d’espace de tête
- Une fois la méthode de démarrage terminée, créez 1 nouvelle ligne par échantillon dans la liste d’échantillons. À partir du menu des méthodes du logiciel d’analyse, chargez 436 Current spme éthanol 2013 3min absorber 2_5min rg run. METH pour chaque échantillon de la liste d’échantillons.
- Remplissez la liste d’échantillons, en commençant par l’air, l’eau, 5 M NaCl /protéase cocktail blanc. Ensuite, entrez dans les normes dans l’ordre, de 0.3125 à 40 mM. Suivez les normes avec un deuxième tour de l’air, de l’eau, et 5 M NaCl / blanc cocktail de protéase.
- Entrez tous les échantillons de supernatants d’embryons homogénéisés à tester, de la plus faible à la plus élevée concentration prévue d’éthanol. Terminez par entrer dans un troisième et dernier tour de l’air, de l’eau, et 5 M NaCl / blanc cocktail de protéase.
- Ajouter les flacons de chromatographe à gaz à l’autosampler dans l’ordre dans lequel les échantillons ont été entrés. Laisser les échantillons se réchauffer pendant 10 à 15 min. Démarrer l’échantillon s’exécute dans le logiciel.
- Après que tous les échantillons et les blancs finaux ont exécuté, activez la méthode d’arrêt dans le logiciel en ajoutant un échantillon final dans la liste d’échantillons et en cours d’exécution en attente. METH. Sauvegarder toutes les données acquises lors des exécutions de l’échantillon. Éteignez l’équipement dans l’ordre suivant : chauffe-autosampler, réservoir d’hydrogène et, seulement après que la température du chromatographe atteigne 30 oC, le réservoir d’air. Laissez le réservoir d’hélium pour préserver la colonne de cire.
9. Échantillon d’analyse maximale de l’éthanol et de concentration de l’échantillon
REMARQUE : Toutes les valeurs à partir de 9,3 sur ont été calculées dans un fichier Excel que toutes les équations préremplies.
- Une fois la méthode d’arrêt terminée, cliquez sur Le chromatogramme ouvert. Ouvrez le dossier contenant les résultats. Les échantillons sont automatiquement intégrés dans ce programme.
- Dans les résultats, assurez-vous que les pics corrects ont été intégrés (les pics d’éthanol entre 2 et 2,5). Une fois que tous les échantillons ont été confirmés, imprimez ou exportez les résultats.
- Tracer la hauteur maximale des normes d’éthanol sur un graphique. Calculez la pente, l’interception Y et les valeurs R2 pour les normes d’éthanol (R2 devrait être 'gt;0.99).
REMARQUE : Ces valeurs seront utilisées pour déterminer la concentration d’éthanol à partir de la hauteur de pointe de l’échantillon.
- Pour chaque échantillon, soustrayez la hauteur maximale de l’échantillon de l’interception Y des normes d’éthanol. Divisez cette valeur par la pente des normes d’éthanol pour obtenir la valeur de l’éthanol pour chaque échantillon dans les flacons GC.

- Pour calculer la concentration d’éthanol dans les embryons, calculez d’abord le facteur de dilution pour chaque échantillon. Prenez la mesure de volume calculée à l’étape 2.3 de ce protocole et divisez-la par la mesure de volume plus 500 L. Il s’agit de la solution de cocktail NaCl/protease de 5 M ajoutée à chaque échantillon pendant le traitement de l’embryon (étapes 5.3 et 5.4).

- À l’aide de ce facteur de dilution de l’échantillon, multipliez la valeur de l’éthanol de l’échantillon pour chaque échantillon. Les résultats seront dans la concentration mM. Calculez les échantillons de référence des médias en multipliant la valeur de l’éthanol média par le facteur de dilution de 10.

