Les modèles animaux sont essentiels pour le développement de médicaments précliniques à chaque étape du processus, de l’identification de nouveaux PCP, des études de biodistribution, du mécanisme de transduction, à l’essai final de l’efficacité de la cargaison livrée en utilisant ces nouveaux CPP comme vecteurs. Il existe de nombreuses méthodes couramment utilisées pour évaluer la biodistribution comme l’histologie, l’imagerie en médecine nucléaire (SPECT et PET) et l’imagerie optique in vivo12. Les méthodes d’imagerie nucléaire peuvent être lourdes en raison de la disponibilité limitée des systèmes SPECT et PET pour petits animaux, ainsi que de la capacité de produire des conjugués radiolabel-médicaments, qui nécessitent l’expertise d’un radiochimiste. En revanche, les étiquettes fluorescentes sont beaucoup plus simples et peuvent être rentables pour travailler avec. Le protocole décrit dans cet article permet une analyse rapide de la biodistribution à l’aide de multiples méthodes. L’imagerie optique fluorescente ex vivo permet la comparaison immédiate de la fluorescence entre différents tissus et groupes de traitement et peut identifier l’absorption d’organes et le temps de pic d’absorption dans l’organe d’intérêt d’une manière semi-quantitative. L’histologie quantitative des tissus nécessite un traitement plus étendu pour traiter, sectionr, imager et analyser les tissus, mais elle fournit plus de données au niveau microscopique et est une technique standard actuelle. Il est utile de noter que la comparaison directe et quantitative entre les deux techniques n’est pas possible, parce que l’autofluorescence observée avec chaque technique pour différents organes et longueurs d’onde d’excitation varie considérablement.
Une partie importante de ce protocole consiste à choisir le fluorophore droit pour étiqueter les CPP candidats pour les expériences. Un problème potentiel est le chevauchement des spectres, qui peut être problématique lorsque plusieurs fluorophores sont nécessaires. Les supports de montage fluorescent DAPI et le Cy5.5 n’ont pas de spectres qui se chevauchent. Toutefois, pour certaines applications où de multiples fluorophores sont nécessaires, le risque de chevauchement spectral doit être soigneusement pris en considération. Selon le système utilisé, la sélection des fluorophores peut être limitée. Par conséquent, la connaissance des capacités du système est essentielle. Les systèmes optiques fluorescents sont mieux utilisés avec des fluorophores infrarouges lointains ou proches en raison de l’absorption élevée des tissus des longueurs d’onde plus courtes13. Les fluorophores de la gamme des protéines fluorescentes vertes améliorées ont une limitation majeure, parce qu’il y a l’autofluorescence significative d’organe vu à sa longueur d’onde d’excitation, spécifiquement dans le cerveau et le tissu de foie. Selon les conditions d’une expérience, il est préférable d’éviter certains fluorophores. Certains fluorophores organiques solubles dans l’eau ont une forte interaction avec les bicouches lipidiques, ce qui peut causer de faux positifs. Par conséquent, il est conseillé de prendre des mesures pour déterminer si un fluorophore a une forte affinité avec le tissu d’intérêt14. Un autre facteur à considérer est la sélection de la méthode appropriée de conjugaison de fluorophore, qui peut être un paramètre important affectant les résultats. Les CPP peuvent être étiquetés fluorescents au terminus N ou C par un lien covalent entre le terminus N du peptide et le groupe carboxyle du colorant tel que Cy5.5-NHS. Il faut faire attention, parce que le mécanisme de transduction de la plupart des CPP n’est pas compris en détail et la conjugaison à une extrémité peut affecter le mécanisme d’absorption plus qu’à l’autre extrémité. Une autre possibilité pour l’étiquetage des CPP est de biotinyler le N-terminus pour la conjugaison à la streptavidine fluorescente étiquetée. L’utilisation de cette stratégie a la commodité de permettre différents conjugués fluorescents streptavidin d’être utilisés. Cependant, une limitation possible de cette stratégie est qu’un complexe de biotine-streptavidine est une grande construction, qui pourrait potentiellement interférer avec la transduction.
Les systèmes d’imagerie optique fluorescente sont une stratégie efficace pour générer une comparaison efficace de la fluorescence entre différents organes et traitements, mais ils sont incapables de produire une mesure quantitative des concentrations absolues dans les tissus. Ceci est dû aux effets de diffusion de la lumière dans le tissu, qui est encore aggravée par la variété naturelle dans les tailles et les densités de tissus, et les différences dans la vascularité, avec la dispersion variable de fluorescence. L’autofluorescence des tissus peut également être un facteur, en raison de sources biochimiques naturelles telles que le collagène, ou des sources alimentaires comme la chlorophylle dans les aliments13.
L’histologie est la méthode la plus couramment utilisée pour mesurer la biodistribution et peut potentiellement être utilisée pour mesurer et comparer avec précision l’absorption entre différents tissus au fil du temps. Les problèmes de diffusion de la lumière sont évités en utilisant cette méthode parce que tous les tissus sont sectionnés à la même épaisseur15. Un avantage majeur de cette méthode est la capacité d’inclure des étiquettes fluorescentes supplémentaires postsection pour l’immunohistorichimie. Bien que l’ajout d’un autre fluorophore puisse rendre l’imagerie plus difficile, l’utilisation d’étiquettes fluorescentes peut être utile pour la localisation d’un RPC dans des compartiments intracellulaires particuliers, comme les lysosomes ou les mitochondries. Un anticorps pourrait être utilisé dans une expérience de microscopie confocale pour déterminer si un candidat transduqué CPP colocalise avec une structure d’intérêt, ce qui peut montrer le potentiel d’un RPC en tant qu’agent de livraison. Une limitation de cette méthode est que la préparation des diapositives à partir d’échantillons d’organes peut prendre beaucoup de temps, la main-d’œuvre, et sujette à l’erreur humaine12,15. Lors de l’imagerie des diapositives, il faut prendre soin de ne pas imager le même endroit trop longtemps pour éviter le photobleaching. Certains photobleaching sera inévitable, en fonction de la sensibilité de la fluorophore. Il faut faire attention à chaque étape de ce protocole pour protéger les échantillons de la lumière ambiante et les stocker correctement16. Nous recommandons que les diapositives soient stockées à 4 °C, protégées par la lumière, pour l’imagerie future.
Il existe une variété de méthodes disponibles pour mesurer la biodistribution d’un RPC candidat qui nécessitent de l’équipement spécialisé et peuvent produire des résultats comparables, bien qu’elles puissent nécessiter une étiquetage plus complexe du RPC. Le protocole décrit dans cet article utilise deux méthodes compatibles pour produire efficacement des données de biodistribution dans le contexte d’un système vivant tout en permettant l’acquisition d’informations plus approfondies sur l’internalisation des peptides dans les cellules à partir du même échantillon, réduisant ainsi de moitié le nombre d’animaux nécessaires à une étude. Ces méthodes ont été utilisées pour générer les données ci-dessus, qui démontrent que les deux méthodes peuvent être utilisées séquentiellement chez le même animal, et la qualité des données générées par chacun. Nos résultats mettent également en évidence l’incapacité de corréler directement les résultats entre les deux techniques d’une manière quantitative.