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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Ce protocole décrit les étapes nécessaires à l’administration du gène par l’ouverture de la barrière hémato-encéphalique (BHE) par ultrasons focalisés, l’évaluation de l’expression génique résultante et la mesure de l’activité de neuromodulation des récepteurs chimiogénétiques par des tests histologiques.
La chimiogénétique ciblée acoustiquement (ATAC) permet le contrôle non invasif de circuits neuronaux spécifiques. L’ATAC permet d’obtenir un tel contrôle grâce à une combinaison d’ouverture de la barrière hémato-encéphalique induite par les ultrasons focalisés (FUS-BBBO), d’administration de gènes avec des vecteurs viraux adéno-associés (AAV) et d’activation de la signalisation cellulaire avec des récepteurs protéiques modifiés et chimiogénétiques et leurs ligands apparentés. Avec l’ATAC, il est possible de transduire à la fois de grandes et de petites régions du cerveau avec une précision millimétrique à l’aide d’une seule application d’ultrasons non invasive. Cette transduction peut permettre plus tard une neuromodulation à long terme, non invasive et sans dispositif chez les animaux se déplaçant librement à l’aide d’un médicament. Étant donné que le FUS-BBBO, les AAV et la chimiogénétique ont été utilisés chez de nombreux animaux, l’ATAC devrait également être évolutif pour une utilisation chez d’autres espèces animales. Cet article développe un protocole publié précédemment et décrit comment optimiser l’administration de gènes avec FUS-BBBO dans de petites régions du cerveau avec un guidage IRM, mais sans avoir besoin d’un dispositif FUS compliqué compatible avec l’IRM. Le protocole décrit également la conception de composants de ciblage et de contention de souris qui peuvent être imprimés en 3D par n’importe quel laboratoire et peuvent être facilement modifiés pour différentes espèces ou équipements personnalisés. Pour faciliter la reproductibilité, le protocole décrit en détail comment les microbulles, les AAV et la ponction veineuse ont été utilisés dans le développement de l’ATAC. Enfin, un exemple de données est présenté pour guider les investigations préliminaires des études utilisant l’ATAC.
L’utilisation de technologies de neuromodulation spécifiques aux circuits, telles que l’optogénétique1,2 et la chimiogénétique 3,4,5, a fait progresser notre compréhension des troubles psychiatriques en tant que troubles des circuits neuronaux. Les circuits neuronaux sont difficiles à étudier et encore plus difficiles à contrôler dans le traitement des troubles cérébraux, car ils sont généralement définis par des types de cellules, des régions cérébrales, des voies de signalisation moléculaire et le moment de l’activation. Idéalement, tant pour la recherche que pour les applications cliniques, un tel contrôle devrait être exercé de manière non invasive, mais il est difficile d’obtenir une neuromodulation à la fois précise et non invasive. Par exemple, bien que les médicaments neuroactifs puissent atteindre le cerveau de manière non invasive, ils manquent de spécificité spatiale en agissant dans tout le cerveau. D’autre part, la stimulation électrique cérébrale profonde peut contrôler des régions cérébrales spécifiques, mais a du mal à contrôler des types de cellules spécifiques et nécessite une intervention chirurgicale et la mise en place d’un dispositif6.
La chimiogénétique ciblée acoustiquement7 (ATAC) fournit une neuromodulation avec une spécificité spatiale, de type cellulaire et temporelle. Il combine trois techniques : l’ouverture de la barrière hémato-encéphalique induite par ultrasons focalisés (FUS-BBBO) pour le ciblage spatial, l’utilisation de vecteurs viraux adéno-associés (AAV) pour délivrer de manière non invasive des gènes sous le contrôle de promoteurs spécifiques à un type de cellule, et l’ingénierie de récepteurs chimiogénétiques pour moduler sélectivement les circuits neuronaux transfectés via l’administration de médicaments. FUS est une technologie approuvée par la FDA qui tire parti de la capacité des ultrasons à se concentrer profondément dans les tissus, y compris le cerveau humain, avec une précision spatiale millimétrique. À haute puissance, le FUS est utilisé pour l’ablation ciblée non invasive, y compris un traitement approuvé par la FDA pour le tremblement essentiel8. FUS-BBBO combine des ultrasons de faible intensité avec des microbulles administrées par voie systémique, qui oscillent dans les vaisseaux sanguins au foyer de l’échographie, ce qui entraîne une ouverture localisée, temporaire (6-24 h) et réversible de la BHE9. Cette ouverture permet l’acheminement des protéines9,10, des petites molécules11 et des vecteurs viraux 7,12,13,14 au cerveau sans dommage tissulaire significatif chez les rongeurs 10 et les primates non humains 15. Des essais cliniques sont en cours pour FUS-BBBO16,17, indiquant des applications thérapeutiques possibles de cette technique.
L’administration de gènes viraux à l’aide de l’AAV progresse également rapidement vers une utilisation clinique pour les troubles du SNC, avec les récentes approbations réglementaires de la FDA et de l’UE comme étapes majeures. Enfin, les récepteurs chimiogénétiques18, tels que les récepteurs de conception activés exclusivement par des drogues de synthèse (DREADDs), sont largement utilisés par les neuroscientifiques pour fournir un contrôle pharmacologique de l’excitation neuronale chez les animaux transgéniques ou transfectés 19,20. Les DREADD sont des récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) qui ont été génétiquement modifiés pour répondre à des molécules chimiogénétiques synthétiques plutôt qu’à des ligands endogènes, de sorte que l’administration systémique de ces ligands augmente ou réduit l’excitabilité des neurones exprimant DREADD. Lorsque ces trois technologies sont combinées dans l’ATAC, elles peuvent être utilisées pour la modulation non invasive de circuits neuronaux sélectionnés avec une précision spatiale, de type cellulaire et temporelle.
Ici, nous développons et mettons à jour un protocole précédemment publié pour FUS-BBBO11 en incluant une méthodologie de ciblage précis des régions du cerveau avec FUS-BBBO chez la souris à l’aide d’un simple équipement de ciblage imprimé en 3D. Nous montrons également une application de FUS-BBBO à l’ATAC. Nous montrons les étapes nécessaires à l’administration d’AAV porteurs de récepteurs chimiogénétiques, et l’évaluation de l’expression génique et de la neuromodulation par histologie. Cette technique est particulièrement applicable pour cibler de grandes ou plusieurs régions du cerveau pour l’expression génique ou la neuromodulation. Par exemple, une large zone d’un cortex peut être facilement transduite avec FUS-BBBO et modulée à l’aide de la chimiogénétique. Cependant, l’administration de gènes avec une technique alternative, les injections intracrâniennes, nécessiterait un grand nombre d’injections invasives et de craniotomies. FUS-BBBO et son application, ATAC, peuvent être mis à l’échelle d’animaux de différentes tailles, où les régions du cerveau sont plus grandes et plus difficiles à cibler de manière invasive.
Toutes les expériences ont été menées selon un protocole approuvé par le Comité institutionnel de protection et d’utilisation des animaux de l’Institut de technologie de Californie, où les données ont été obtenues à l’origine par J.O.S.
1. Conception et impression 3D de harnais pour animaux et de matériel de guidage d’image
2. Description de l’échographe
3. Préparation des animaux
4. Ciblage guidé par IRM
REMARQUE : Avec l’utilisation de guides de ciblage conçus sur mesure, il n’est pas nécessaire de placer un transducteur d’ultrasons dans une IRM, ni d’inciser la peau pour effectuer un ciblage par remise à zéro stéréotaxe sur les lignes bregma et lambda. Suivez les étapes ci-dessous pour effectuer le processus de ciblage.
5. Préparation de la solution injectable
REMARQUE : Les solutions de microbulles sont très sensibles à la pression. Par conséquent, un mélange vigoureux ou une injection rapide à travers des aiguilles fines peut faire s’effondrer les microbulles et réduire l’efficacité de l’ouverture de la BHE. De plus, les microbulles sont plus légères que l’eau et peuvent flotter jusqu’au sommet d’un tube, d’un cathéter ou d’une seringue (figure 4), par exemple dans un injecteur automatique. Il est fortement recommandé de remettre en suspension la solution de microbulles immédiatement avant chaque injection.
6. Procédure d’insonation
7. Évaluation par IRM de l’ouverture de la BHE
NOTE : L’évaluation par IRM de l’ouverture de la BHE a été décrite en détail ailleurs11. L’emplacement de l’ouverture de la BHE peut être visualisé sous forme de zones plus lumineuses chez les souris qui ont reçu une injection d’un agent de contraste Gd pondéré en T1.
8. Stimulation DREADD avec un ligand chimiogénétique
9. Évaluation histologique de l’expression des gènes et de l’activation chimiogénétique
REMARQUE : Une fois que le critère d’évaluation expérimental (p. ex., fin de l’étude comportementale, temps requis pour l’expression des gènes) est atteint, il est essentiel de confirmer l’emplacement et la présence de l’expression du gène.
10. Évaluer l’activation neuronale avec l’immunomarquage pour les c-Fos
La première étape de l’exécution du protocole ATAC est le ciblage du FUS-BBBO sur les régions cérébrales souhaitées. Par exemple, en suivant le protocole décrit, l’hippocampe a été ciblé avec du FUS-BBBO, et un agent de contraste et de l’AAV9 porteurs de DREADD ont été injectés aux souris, suivis d’une séquence d’IRM FLASH 3D qui acquiert des images du cerveau de la souris. Une augmentation du signal T1 a été obtenue dans la région de l’hippocampe (Figure 6) et dans d’autres parties du cerveau (Figure 7). Après plusieurs semaines, les DREADDs ont été exprimés à l’intérieur de la région cérébrale cible. Alors que de nombreux DREADD sont fusionnés à un rapporteur fluorescent (par exemple mCherry), le processus de perfusion et de fixation avec le formaldéhyde s’est avéré réduire considérablement la fluorescence de ces protéines. L’immunomarquage contre mCherry ou le DREADD a conduit à une détection plus fiable de l’expression (Figure 8) sur la base de l’expérience antérieure. Dans des expériences précédentes, ~85% des souris ont montré une expression après FUS-BBBO7. Un test simple pour des niveaux d’expression suffisants des DREADDs consiste à tester leur fonctionnalité au niveau cellulaire. Cela peut se faire, par exemple, en fournissant un ligand chimiogénétique ou un contrôle salin, tel que le CNO19, la deschloroclozapine 28, ou d’autres29, et en attendant 2 heures avant une perfusion et une fixation cardiaques. Les coupes cérébrales ont ensuite été co-immunocolorées pour la protéine c-Fos30, qui indique une activité accrue des neurones, et pour DREADD. L’expérience a été considérée comme réussie si le site du cerveau ciblé par les DREADDs présentait un nombre significativement plus élevé de noyaux neuronaux c-Fos positifs dans le groupe qui a reçu un ligand chimiogénétique par rapport au groupe qui a reçu une solution saline7 ou par rapport à un site controlatéral qui n’a pas été soumis à FUS-BBBO. Il convient de noter qu’il existe un potentiel pour certains de ces ligands d’activer les neurones de manière non spécifique sans expression de DREADDs. Par exemple, il a été démontré que le CNO est métabolisé en faibles niveaux de clozapine chez la souris, qui traverse la BHE et active les DREADDs avec une puissance élevée27. Cependant, il a également été démontré qu’il se lie à des emplacements non spécifiques. Comme dans toute expérience, il est essentiel d’inclure tous les contrôles appropriés dans les études chimiogénétiques31. Un contrôle possible est l’administration du ligand chimiogénétique à des souris de type sauvage, sans procédures, afin d’exclure les effets du médicament seul sur le test comportemental ou histologique souhaité. Un autre contrôle pourrait être l’inclusion de quatre groupes : DREADD + ligand, DREADD + véhicule, EGFP + ligand, EGFP + véhicule, ce qui expliquera les effets potentiels de l’administration du gène avec FUS-BBBO et du ligand chimiogénétique.

Figure 1 : Processus de ciblage de FUS guidé par IRM dans l’ATAC. a) Placement de la souris avec des barres auriculaires, un cône nasal et une plate-forme pouvant être insérée à l’intérieur d’un scanner IRM. b) Un guide imprimé en 3D (bleu) visible à l’IRM a été fixé aux extrémités du cadre de la barre auriculaire, puis fixé en place à l’aide d’un support d’une bobine d’IRM de surface contenant quatre boulons encliquetables (bleu semi-transparent). (c) Apparition du guide imprimé en 3D en IRM sagittale (panneau de gauche), avec un bas de la représentation virtuelle d’un transducteur aligné (demi-cercle jaune) avec le bas du guide. Le panneau de droite montre l’apparence du guide imprimé en 3D sur l’IRM à partir d’une vue coronale. Le cercle lumineux a été constitué d’un matériau de support polyjet qui présente un fort contraste IRM. La croix a été formée avec du plastique. Un cercle jaune représente l’emplacement du transducteur qui a été aligné concentriquement avec le guide à l’intérieur d’un cadre stéréotaxique. (d) Pour cibler les structures cérébrales, un transducteur virtuel a été déplacé dans la direction z au-dessus des souris pour correspondre à l’épaisseur d’un cône / boîtier d’ultrasons. Dans ce cas, en raison de l’épaisseur du bain-marie, le transducteur a été déplacé de 8,2 mm au-dessus du guide pour un ciblage précis. Les structures cérébrales ont été sélectionnées à l’aide de données d’imagerie IRM, puis leurs coordonnées IRM ont été écrites et entrées dans l’appareil stéréotaxique. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : Interface du logiciel utilisé. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : Processus d’appariement de l’espace de coordonnées de l’IRM à l’instrument stéréotaxique. a) Trois trous à l’intérieur d’un support de transducteur ont été alignés avec trois trous à l’intérieur du guide d’IRM, et trois boulons de ciblage coniques ont été insérés sans provoquer de flexion de l’ensemble de l’ensemble. (b) Idéalement, les trois boulons devraient se trouver au centre des trous. c) S’il y a une imprécision dans l’alignement, les trois boulons ne s’insèrent pas, par exemple, dans le cas d’un petit lacet probablement imperceptible de 1°, un seul boulon s’insère alors que les boulons opposés sont coincés au niveau du guide IRM. Alternativement, il pourrait y avoir une flexion visible de l’ensemble de l’assemblage lorsque les boulons ont été forcés. d) Vue agrandie de l’assemblage des boulons. Les boulons doivent être placés de manière concentrique pour une meilleure précision. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 4 : Redistribution rapide des microbulles à l’intérieur de la seringue. a) La seringue a été photographiée 5 s après le mélange. b) Une minute plus tard, une couche clairement visible montrait une partie du concentré de bulles près du sommet d’une seringue à tuberculine de 1 mL. Cet exemple, en particulier, utilisait une solution de microbulles. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 5 : Processus de placement du centre d’un transducteur sur le centre d’un guide IRM. (a) Dans les modèles présentés dans le présent document, le support rouge a été conçu pour se déplacer de 10,56 mm vers l’avant de la position indiquée à la figure 3b à celle illustrée ici. b) Le guide bleu d’IRM a été retiré avant la sonication et un gel à ultrasons a été appliqué entre la souris et le transducteur (orange) pour assurer le passage des ultrasons. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 6 : Visualisation par IRM de l’ouverture de la BHE. a) Vue axiale de l’ouverture de la BHE. La zone plus claire désignée par une pointe de flèche montre l’extravasation d’un agent de contraste IRM T1 . (b) Vue coronale de l’hippocampe dorsal et du cortex au-dessus de l’hippocampe ciblés par FUS-BBBO (pointes de flèche). (c) Vue coronale de l’hippocampe central ciblé par FUS-BBBO (pointes de flèches). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 7 : Exemple de ciblage de 4 sites cérébraux à l’aide du système de ciblage à trois boulons décrit dans cet article. Les zones avec des pointes de flèches ont montré des sites ouverts de la BHE avec diffusion d’un agent de contraste IRM. Les quatre sites ont été ciblés successivement, avec ~150 s entre chaque ouverture de la BBB, de bas en haut. L’image a été prise dans les 2 minutes qui ont suivi la dernière ouverture de la BBB. La barre d’échelle est de 2 mm. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 8 : Détection de l’expression DREADD. (a) L’immunomarquage du fluorophore attaché aux DREADDs, dans ce cas, mCherry était une méthode de détection fiable dans certaines études. (b) Dans une autre section représentative avec des DREADDs ciblant l’hippocampe en utilisant les mêmes conditions que dans (a), la fluorescence de mCherry en elle-même a produit un fort bruit de fond et un signal relativement faible. (c) Comme témoin négatif, une souris qui a reçu une injection systémique d’AAV, mais qui n’a pas subi de FUS-BBBO, a été utilisée. Aucune expression significative n’a pu être trouvée par l’immunomarquage mCherry. Les barres d’échelle sont de 500 mm. (Données en a, c adaptées de7 avec autorisations, Copyright 2020 Nature-Springer). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Pas de conflit d’intérêts.
Ce protocole décrit les étapes nécessaires à l’administration du gène par l’ouverture de la barrière hémato-encéphalique (BHE) par ultrasons focalisés, l’évaluation de l’expression génique résultante et la mesure de l’activité de neuromodulation des récepteurs chimiogénétiques par des tests histologiques.
Cette recherche a été financée par la Brain and Behavior Foundation, NARSAD Young Investigator Award. Plusieurs composants imprimés en 3D ont été conçus à l’origine par Fabien Rabusseau (Image Guided Therapy, France). L’auteur remercie John Heath (Caltech) et Margaret Swift (Caltech) pour leur aide technique dans la préparation du manuscrit.
| Aiguilles de calibre 21 (BD) | Fisher Scientific | 14826C | |
| Cathéter papillon de calibre 25 | Harvard Bioscience | 725966 | |
| Aiguilles de calibre 30 (BD) | Fisher Scientific | 14826F | |
| Tampon absorbant bleu | Office Depot | 902406 | |
| Anticorps anti-c-Fos | Santa Cruz Biotechnology | SC-253-G | |
| Anticorps anti-mCherry | Thermofisher | PA534974 | |
| Bruker Biospec 70/30 | Bruker | custom | comprend les bobines RF |
| Clozapine-n-oxide | Tocris | 4936 | |
| Harnais de souris imprimés en 3D conçus sur mesure et composants de ciblage MRIgFUS | ImageGuidedTherapy, Szablowski lab | téléchargement personnalisé | depuis szablowskilab.org/downloads |
| Appareil MRIgFUS personnalisé | ImageGuidedTherapy | N/A | |
| Definity microbulles | Lantheus | DE4 | |
| Gel aquasonique/à ultrasons dégazé | Fisher Scientific | 5067714 | |
| Dépilation crè ; Mee | Nair | n/a | |
| Sonde annulaire à huit éléments | Imasonic Inc. | tampons à l’éthanol/tampons d’alcool personnalisés | |
| (70 %) (BD) | Office Depot | 599893 | |
| Héparine | Sigma-Aldrich | H3149-25KU | |
| Isoflurane | Patterson Vétérinaire | 07-893-1389 | |
| Kétamine | Patterson Veterinary | 07-890-8598 | |
| Formol tamponné neutre (10 %) | Sigma-Aldrich | HT501128-4L | |
| Hydrophone à fibre optique | Precision Acoustics | ||
| PE10 tubing | Fisher Scientific | NC1513314 | |
| Pompe | péristaltique | ||
| Saline tamponnée au phosphate (PBS) | Sigma-Aldrich | 524650-1EA | |
| Agent de contraste Prohance | Bracco | 0270-1111-04 | |
| Saline | Fisher Scientific | NC9054335 | |
| Anticorps secondaire, âne-anti-chèvre | ThermoFisher | A-11055 | |
| Anticorps secondaire, âne-anti-lapin | ThermoFisher | 84546 | |
| Ciseaux chirurgicaux (droits) | Fisher Scientific | 17467480 | |
| ThermoGuide Logiciel | ImageGuidedTherapy | ||
| Colle tissulaire (Gluture) | Fisher Scientific | NC9855218 | |
| Seringue à tuberculine (1 mL) (BD) | Fisher Scientific | 14823434 | |
| VeroClear Matériau imprimable en 3D | Stratasys | RGD810 | |
| Dispositif d’activation des microbulles Vialmix | Lantheus | VMIX | |
| Microtome vibrant | Compresstome | VF-300 | |
| Xylazine | Sigma-Aldrich | X1251-1G |