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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Nous présentons ici le protocole de fabrication d’un dispositif à transistor à effet de champ à modulation de charge organique (OCMFET) pour l’interfaçage cellulaire in vitro . Le dispositif, appelé micro réseau OCMFET, est un dispositif flexible, peu coûteux et sans référence, qui permettra de surveiller les activités électriques et métaboliques des cultures cellulaires électroactives.
L’électrophysiologie moderne a été constamment alimentée par le développement parallèle d’outils et de matériaux de plus en plus sophistiqués. À leur tour, les découvertes dans ce domaine ont entraîné des progrès technologiques dans un processus de va-et-vient qui a finalement déterminé les réalisations impressionnantes des 50 dernières années. Cependant, les dispositifs les plus utilisés pour l’interfaçage cellulaire (à savoir, les réseaux de microélectrodes et les dispositifs microélectroniques basés sur des transistors) présentent encore plusieurs limitations telles que le coût élevé, la rigidité des matériaux et la présence d’une électrode de référence externe. Pour surmonter partiellement ces problèmes, il y a eu des développements dans un nouveau domaine scientifique appelé bioélectronique organique, ce qui a entraîné des avantages tels que des coûts inférieurs, des matériaux plus pratiques et des techniques de fabrication innovantes.
Plusieurs nouveaux dispositifs organiques intéressants ont été proposés au cours de la dernière décennie pour s’interfacer facilement avec les cultures cellulaires. Cet article présente le protocole de fabrication de dispositifs d’interfaçage cellulaire basés sur le transistor à effet de champ à modulation de charge organique (OCMFET). Ces dispositifs, appelés micro réseaux OCMFET (MOA), combinent les avantages de l’électronique organique et les caractéristiques particulières de l’OCMFET pour préparer des outils transparents, flexibles et sans référence avec lesquels il est possible de surveiller à la fois les activités électriques et métaboliques des cardiomyocytes et des neurones in vitro, permettant ainsi une évaluation multiparamétrique des modèles cellulaires électrogéniques.
La surveillance in vivo des cellules électroactives, telles que les neurones et les cardiomyocytes, représente une approche valide et puissante dans les applications de recherche fondamentale pour le cerveau humain, les études de connectivité fonctionnelle, la pharmacologie et la toxicologie. Les outils habituellement utilisés pour de telles études sont principalement basés sur des réseaux de microélectrodes (MEA)1,2,3,4,5 et des dispositifs à effet de champ (FED) de plus en plus efficaces et puissants 6,7,8,9,10,11,12 . Ces deux familles d’appareils permettent la surveillance et la stimulation en temps réel de l’activité électrique des neurones et des cardiomyocytes et se caractérisent généralement par leur robustesse, leur facilité d’utilisation et leur fiabilité. Ces caractéristiques font des MEA et des FED la référence en matière d’applications électrophysiologiques, étant actuellement utilisées pour s’interfacer avec des cultures cellulaires standard, des tranches de cerveau organotypiques et des organoïdes tridimensionnels13,14,15,16. Malgré leur utilisation répandue et leurs caractéristiques impressionnantes, les MEA et les FED présentent certaines limitations telles que le coût élevé, la rigidité des matériaux et la présence d’une électrode de référence généralement volumineuse, qui doit être placée dans l’environnement liquide de mesure et est nécessaire au bon fonctionnement des dispositifs.
Pour explorer des solutions alternatives pour l’interfaçage cellulaire, beaucoup d’efforts ont été investis au cours de la dernière décennie dans l’étude des dispositifs électroniques basés sur des matériaux organiques et des techniques de fabrication innovantes17. Parmi les nombreux dispositifs organiques étudiés pour répondre aux limitations susmentionnées, un transistor organique particulier appelé OCMFET a récemment été proposé comme alternative valable aux MEA et FEDs18. En plus des caractéristiques standard offertes par la technologie de l’électronique organique, telles que les matériaux et les techniques de fabrication à faible coût, les propriétés mécaniques et chimiques optimales, la transparence optique et la biocompatibilité, l’OCMFET offre également une sensibilité de charge ultra-élevée (en raison de sa structure à double porte) sans avoir besoin d’une électrode de référence externe. De plus, ce capteur organique a la capacité remarquable de détecter différents paramètres analytiques/physiques, en fonction de la fonctionnalisation spécifique de sa zone de détection, qui est séparée de la zone du transistor19,20. Toutes ces caractéristiques peuvent être facilement exploitées pour l’acquisition de différents paramètres au sein d’une culture cellulaire. En particulier, en plus de pouvoir détecter l’activité électrique neuronale/cardiaque, il est également possible d’exploiter la sensibilité au pH ultra-élevée offerte par la structure à double porte particulière de l’OCMFET en utilisant une simple fonctionnalisation physique21 pour surveiller de manière fiable les légères variations locales de pH causées par l’activité métabolique cellulaire.
Dans la biodétection cellulaire in vitro, la surveillance de l’activité métabolique cellulaire est un indicateur puissant de l’état de la culture et peut être utilisée pour évaluer la réponse cellulaire à divers stimuli, tels que l’administration de médicaments et la stimulation électrique22,23. De plus, dans le cas spécifique des applications neuronales, la surveillance des activités électriques et métaboliques est d’un grand intérêt, en particulier en pharmacologie et en toxicologie24. Dans le but de répondre facilement aux exigences de l’électrophysiologie in vitro moderne tout en offrant tous les avantages de l’OCMFET, un dispositif appelé Micro OCMFET Array (MOA) a été récemment introduit. Le MOA est un réseau basé sur OCMFET avec des zones de détection spécialisées spécialement conçues pour l’interfaçage cellulaire in vitro, permettant l’analyse multiparamétrique de cultures de cellules électrogéniques. En particulier, deux canaux MOA ont des zones de détection plus grandes pour maximiser leur sensibilité et peuvent être fonctionnalisés de manière sélective pour surveiller des paramètres spécifiques d’intérêt, tels que les variations de pH du milieu de culture. Les autres OCMFET de la structure agissent comme des capteurs d’activité électrique extracellulaires. La figure 1 montre la structure d’un protocole d’accord à 16 canaux. Cette capacité, combinée à l’absence d’électrode de référence externe, fait du MOA un outil très intéressant pour les applications in vitro. Ce travail présente le protocole de fabrication étape par étape d’un protocole d’accord multidétection pour la détection in vitro des activités électriques et métaboliques des neurones et des cardiomyocytes. La figure 2 montre les principales étapes de fabrication, les matériaux utilisés et la structure de l’appareil.
Toutes les lignes directrices internationales, nationales et/ou institutionnelles applicables pour le soin et l’utilisation des animaux ont été suivies. Tous les efforts ont été faits pour réduire le nombre d’animaux pour le projet et minimiser leurs souffrances.
1. Préparation de la solution en développement, des solutions de gravure, de la solution semi-conductrice organique et des masques photolithographiques
2. Sélection et préparation du substrat
3. FG: dépôt de titane
4. Motifs FG
5. Dépôt diélectrique de la porte
6. Ouverture des zones de détection de l’OCMFET pour l’enregistrement de l’activité électrique et formation des vias pour accéder à l’arrière des FG
7. Auto-alignement de la source et du drain avec le FG
8. Dépôt d’or, formation de canaux et modelage des sources, des drains et des portes de contrôle
9. Dépôt et activation du parylène C pour la détection du pH
10. Dépôt de semi-conducteurs, placement de la chambre de culture et découpe finale du dispositif à partir du PET
11. Caractérisation électrique des transistors
Le potentiel du protocole d’accord a été validé ici pour les enregistrements d’activité électrique et la surveillance de l’activité métabolique. L’estimation précise des capacités du dispositif à détecter les potentiels d’action extracellulaire a été basée sur une caractérisation approfondie avec des cultures de cardiomyocytes de rat (en particulier dans les cardiomyocytes primaires de rat mesurés à 8 jours in vitro [DIV])18. La figure 3A montre un protocole d’accord complet avec 16 OCMFET. L’encart supérieur montre un exemple de culture cardiomyocytaire de rat confluent adhérant à la surface du MOA. Pour mettre en évidence leur santé, les cellules ont été immunocolorées pour la protéine sarcomérique, la tropomyosine, après la séance d’enregistrement. L’encart inférieur montre un seul signal cardiomyocytaire mesuré avec un OCMFET.
Fait intéressant, l’appareil pourrait détecter l’activité électrique spontanée et l’activité induite lors de l’administration de différents produits chimiques, comme le montre la figure 3B. Cette validation a été cruciale pour démontrer la faisabilité de l’utilisation de cette approche pour l’interfaçage de cellules électrogéniques. En raison de la configuration du réseau, le protocole d’accord a également permis la reconstruction de la vitesse de propagation du signal cardiaque, démontrant ainsi l’adéquation du système à l’étude des réseaux cellulaires (Figure 3C). Pour une validation plus poussée afin de déterminer la limite de détection réelle de l’appareil, le MOA a également été testé avec des neurones striataux (21 DIV)18, avec des résultats intéressants en termes d’amplitude du signal et de fiabilité des enregistrements. Comme le montre la figure 3D, l’OCMFET pourrait amplifier les potentiels de champ neuronal avec une stabilité remarquable, montrant des rapports signal/bruit (SNRS) allant jusqu’à 3,2 (dans la même gamme que celle des SNR obtenus avec les MEAs25 standard). La configuration d’enregistrement consistait en une électronique multicanal personnalisée pour la polarisation du transistor et la lecture et le conditionnement du signal. Chaque canal pour l’enregistrement électrique a un premier étage composé d’un convertisseur I/V avec une résistance de rétroaction de 1 MΩ et d’un filtre passe-bande de 150 Hz-1,3 kHz avec un gain de tension de 110. Pour toutes les mesures présentées, les transistors étaient biaisés avec VDS = VGS = -1 V. La conversion A/N ainsi que la visualisation et le stockage des données ont été effectués à l’aide d’une carte d’acquisition de données (voir la Table des matériaux). Toutes les séances de mesure ont été effectuées à l’intérieur d’une cage de Faraday afin de minimiser le bruit électrique et environnemental sur le système.
Comme mentionné précédemment, en exploitant la fonctionnalisation physique simple présentée dans le protocole, il a été possible de préparer des capteurs de pH très sensibles avec une réponse supernernstienne. En raison de l’approche de fabrication présentée, ces dispositifs de pH pourraient être intégrés dans un protocole d’accord et utilisés pour surveiller les légères variations de pH induites par l’activité métabolique des neurones primaires du rat hippocampique26. En particulier, comme le montre la figure 4, un seul des deux OCMFET dédiés à la détection basse fréquence a été fonctionnalisé de manière sélective pour démontrer la faisabilité de l’approche. Cette fonctionnalisation sélective a permis d’évaluer la réponse des deux OCMFET aux variations métaboliques induites chimiquement : en particulier, un état métabolique élevé peut être obtenu en utilisant la bicuculline (BIC), un inhibiteur des récepteurs GABA A27, tandis qu’un état métabolique faible peut être induit par l’ajout de tétrodotoxine (TTX), qui provoque éventuellement la mort cellulaire28 . La configuration d’enregistrement consistait en la même électronique multicanal personnalisée utilisée pour les mesures d’activité électronique.
Contrairement au cas précédent, deux canaux dédiés ont été utilisés pour enregistrer les variations lentes induites par l’activité métabolique cellulaire. Chaque canal se composait d’un circuit simple composé de deux blocs principaux : un convertisseur I/V avec une résistance de rétroaction de 1 MΩ et un filtre passe-bas avec une fréquence de coupure de 10 Hz. Les transistors ont été biaisés avec VDS = VGS = -1 V, et toutes les mesures ont été effectuées à l’intérieur d’une cage de Faraday pour minimiser l’impact du bruit externe sur les enregistrements (c’est un aspect particulièrement important compte tenu des faibles fluctuations de courant induites par l’activité métabolique cellulaire). Au cours des expériences, les cultures ont été maintenues dans un milieu de culture à faible tampon et l’ensemble du système a été placé dans un environnement contrôlé (37 °C et un flux continu de CO2 / air). Comme prévu, seul le courant de l’OCMFET sensible au pH a pu être modulé par l’ajout de 25 μM BIC. Cela a été confirmé par l’induction de la variation actuelle par la variation correspondante de l’activité métabolique cellulaire.
La même expérience a été répétée après l’ajout de 10 μM TTX, ce qui a entraîné un ralentissement progressif du métabolisme cellulaire. Après l’ajout du TTX, ni l’OCMFET sensible au pH ni l’OCMFET insensible au pH n’ont montré de réponse, démontrant ainsi l’efficacité de l’approche. Ces résultats démontrent l’efficacité de la fonctionnalisation proposée et sa stabilité relative jusqu’à 2 semaines. Une conclusion importante que l’on peut tirer des expériences proposées (à la fois l’activité électrique et l’activité métabolique) est qu’il est possible de préparer différents types de capteurs en fonctionnalisant sélectivement différents OCMFET dans la même zone de culture. Cet aspect représente une réalisation non triviale dans la biodétection pour les applications cellulaires, car la capacité de surveiller différents paramètres au sein d’une même culture cellulaire est cruciale pour une meilleure caractérisation de la complexité de ces systèmes biologiques.

Figure 1 : Vue de dessus d’un protocole d’accord à 16 canaux pour la surveillance métabolique et électrique des cellules électroactives. Barre d’échelle = 1 cm. Abréviations : OCMFET = transistors organiques à effet de champ modulés en charge ; FG = porte flottante; S/D = source/drain; MOA = micro réseau OCMFET. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : Principales étapes de fabrication d’un protocole d’accord pour la surveillance métabolique et électrique des cellules électroactives. (A et B) Le film Ti évaporé est modelé à l’aide d’un procédé photolithographique standard pour préparer la porte flottante des OCMFET. (C) Dépôt de 15 nm de parylène C. Cette couche, avec l’oxyde de Ti natif, agit comme diélectrique de porte des transistors. (D et E) La couche de parylène C est modelée à l’aide d’un traitement à l’oxygène plasmatique. Une couche de résine photosensible à motifs est utilisée pour exposer sélectivement les zones de détection pour les enregistrements électriques et les contacts arrière de la porte flottante. (F) Modelage des contacts supérieurs Au, à savoir la source, le drain, la porte de contrôle et le contact arrière de la porte flottante. Une technique d’auto-alignement est utilisée pour améliorer les performances électriques de l’appareil. (G-I) Dépôt de la deuxième couche de parylène C sur la zone de détection des OCMFET pour la surveillance de l’activité métabolique. Après l’exposition au plasma d’oxygène, cette couche agira comme la membrane sensible au pH (J). (K) Coupe transversale d’un protocole d’accord complet (avec matériaux) après le dépôt du semi-conducteur organique (TIPS Pentacene) et le positionnement de la chambre de culture. Abréviations : OCMFET = transistors organiques à effet de champ modulés en charge ; FG = porte flottante; S/D = source/drain; MOA = micro réseau OCMFET; CG = porte de contrôle; PET = polyéthylène téréphtalate; Par C = Parylène C; TIPS = 6,13-bis(triisopropylsilylethynyl) pentacène; ABS = acrylonitrile butadiène styrène. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : Enregistrements de l’activité électrique cellulaire avec un MOA. (A) Une culture confluente de cardiomyocytes de rat (8 DIV) adhérant à la surface d’un MOA, fixé après une séance d’enregistrement et immunocoloré pour la protéine sarcomérique, la tropomyosine (encart supérieur). Encadré du bas : exemple d’un signal cardiomyocytaire unique mesuré avec un OCMFET. Barre d’échelle = 150 μm. (B) Réglage chimique de l’activité électrique d’une culture de cardiomyocytes. L’accélération de l’activité résulte de l’ajout de 100 mM de noradrénaline, tandis que la suppression résulte de l’ajout de 100 mM de vérapamil. À gauche : modulation de fréquence battante ; à droite : statistiques sur 5 OCMFET-moyenne et écart-type : pic sur 4 min d’activité basale (129 ± 4,6), médiée par la noradrénaline (280 ± 28,6) et médiée par le vérapamil (15 ± 1,9). (C) Reconstruction de la propagation d’un signal cardiaque. A droite : tracé raster de l’activité spontanée de la culture indiquant la propagation du signal du site 14 au site 41 (à droite). (D) Potentiels d’action des cellules striatales provenant d’embryons de rat (21 DIV). Ce chiffre a été modifié par rapport à 18. Abréviations : OCMFET = transistor à effet de champ à modulation de charge organique ; MOA = micro réseau OCMFET; NE = noradrénaline; VER = vérapamil; DIV = jours in vitro. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 4 : Enregistrements de l’activité métabolique avec un protocole d’accord. Réponse des canaux (A) sensibles au pH et (B) insensibles au pH d’un MOA à l’ajout de 25 μM BIC avant et après l’ajout de 10 μM de TTX. Après l’ajout de TTX, le comportement du canal sensible au pH devient similaire à celui du canal insensible au pH. En particulier, aucune variation de courant ne peut être observée après l’ajout de BIC en raison de la mort cellulaire induite par TTX. (C) Protocole d’accord pour les enregistrements de l’activité métabolique. Les OCMFET sensibles au pH et insensibles au pH sont décrits en vert et en rouge, respectivement. Encart : neurones sains de l’hippocampe cultivés sur l’appareil après 15 DIV. Barre d’échelle = 50 μm. Ce chiffre a été modifié par rapport à 26. Abréviations : OCMFET = transistor à effet de champ à modulation de charge organique ; MOA = micro réseau OCMFET; BIC = biccuculline; TTX = tétrodotoxine; DIV = jours in vitro. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts à déclarer.
Nous présentons ici le protocole de fabrication d’un dispositif à transistor à effet de champ à modulation de charge organique (OCMFET) pour l’interfaçage cellulaire in vitro . Le dispositif, appelé micro réseau OCMFET, est un dispositif flexible, peu coûteux et sans référence, qui permettra de surveiller les activités électriques et métaboliques des cultures cellulaires électroactives.
Les auteurs reconnaissent le financement du programme de recherche et d’innovation Horizon 2020 de l’Union européenne dans le cadre de la convention de subvention n° 882897-Search&Rescue et du projet PON « TEX-STYLE » ARS01_00996, PNR 2015-2020.
| Imprimante 3-(triméthoxysilyl)méthacrylate de propyle | Sigma Aldrich | 440159 | |
| imprimante 3D Makerbot Replicator 2x | Makerbot | https://www.makerbot.gr/. Prix estimé : 2k-3k euros. | |
| Filament | ABS | ||
| Anisole | Sigma Aldrich | 296295 | |
| Modèle Bromograph Hellas | Bungard | https://www.bungard.de/. Prix estimé : 1k-2k euros. | |
| Or | Vendeur | local | |
| Acide fluorhydrique | Sigma Aldrich | 695068 | |
| Iode | Sigma Aldrich | 207772 | |
| Kapton tape | ruban | isolant polyimide | |
| Découpeuse laser VLS2.30 | Universal Laser Systems | https://www.ulsinc.com/it. Prix estimé : 20k euros. | |
| Systèmes multicanaux carte | d’acquisition www.multichannelsystems.com | ||
| pastilles de NaOH | Sigma Aldrich | 567530 | |
| Dimère de parylène C SCS | systèmes de revêtement spéciaux revêtement | ||
| PDMS Silgard 184 | Sigma Aldrich | 761036 | |
| PDS 2010 LABCOATER 2 Système de dépôt de parylène | SCS systèmes | de revêtement spéciauxhttps://scscoatings.com/. Prix estimé : 50k euros | |
| Film PET orienté biaxialement (épaisseur 0,25 mm) | Goodfellow | ES301450 | |
| Boîtes | de Pétri | ||
| Nettoyeur plasma Gambetti « Tucano" | Gambetti | https://www.gambetti.it/. Prix estimé : 20k euros. | |
| Photorésine positive AZ1518 | MicroChemicals | ||
| Iodure de potassium KI | Sigma Aldrich | 221945 | |
| Source Meter 2636 | Keithley | https://it.farnell.com/. Prix estimé : 18k euros | |
| Unité d’enduction Spin | Ossila | https://www.ossila.com/. Prix estimé : 2,5k euros. | |
| Microscope stéréoscopique SMZ745T | Nikon | https://www.microscope.healthcare.nikon. com/. Prix estimé : 2k-3k euros. | |
| d’évaporation thermique | |||
| TIPS pentacene (6,13-Bis(triisopropylsilylethynyl)-pentacene) | Sigma Aldrich | 716006 | |
| Fil de titane | Goodfellow | TI005129 | |
| Bain à ultrasons | Falc Instruments | https://www.falcinstruments.it/. Prix estimé : 1k euro. |