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Article de méthode

Deux méthodes de peeling pour l’isolement des compartiments des cellules photoréceptrices dans la rétine de la souris pour l’analyse des protéines

3.6K vues

DOI :

10.3791/62977

7 décembre 2021

Dans cet article

Résumé

Ce protocole présente deux techniques pour isoler les compartiments subcellulaires des photorécepteurs de bâtonnets murins pour l’analyse des protéines. La première méthode utilise de la rétine vivante et du papier filtre de cellulose pour séparer les segments extérieurs des tiges, tandis que la seconde utilise de la rétine lyophilisée et du ruban adhésif pour décoller les couches internes et externes des segments.

Résumé

Les photorécepteurs de bâtonnets sont des neurones sensoriels hautement polarisés avec des compartiments distincts. Les bâtonnets de souris sont longs (~80 μm) et minces (~2 μm) et sont emballés latéralement dans la couche la plus externe de la rétine, la couche photoréceptrice, ce qui entraîne l’alignement de compartiments subcellulaires analogues. Traditionnellement, la section tangentielle de la rétine plate gelée a été utilisée pour étudier le mouvement et la localisation des protéines dans différents compartiments de tiges. Cependant, la courbure élevée de la rétine de souris à dominante bâtonnet rend la section tangentielle difficile. Motivés par l’étude du transport des protéines entre les compartiments, nous avons développé deux méthodes de peeling qui isolent de manière fiable le segment externe de la tige (ROS) et d’autres compartiments subcellulaires pour les transferts occidentaux. Nos techniques relativement rapides et simples fournissent des fractions enrichies et spécifiques aux subcellulaires pour mesurer quantitativement la distribution et la redistribution de protéines photoréceptrices importantes dans des bâtonnets normaux. De plus, ces techniques d’isolement peuvent également être facilement adaptées pour isoler et étudier quantitativement la composition protéique d’autres couches cellulaires dans la rétine saine et dégénérée.

Introduction

Les cellules photoréceptrices en bâtonnets, étroitement emballées dans la couche la plus externe de la rétine neurale, font partie intégrante de la vision en basse lumière. Pour fonctionner comme des compteurs de photons fidèles, les bâtonnets utilisent une voie de signalisation à base de protéine G, appelée phototransduction, pour générer des réponses rapides, amplifiées et reproductibles à la capture de photons uniques. Cette réponse à la lumière déclenche finalement un changement du courant au niveau de la membrane plasmique et est ensuite signalée au reste du système visuel1. Comme leur nom l’indique, chaque cellule de bâtonnet a une forme ....

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Protocole

Toutes les expériences ont été réalisées conformément aux directives institutionnelles locales du comité de recherche sur les soins aux animaux de l’Université de Californie du Sud (USC).

1. Méthode de peeling de la rétine à cellules vivantes

  1. Préparation des tampons d’Ames, des papiers à peler et du plat de dissection
    1. À l’aide de ciseaux à iris à pointe émoussée (ou d’un type de ciseau équivalent), découpez le papier filtre en cellulose (grade 413) en rectangles mesurant environ 5 mm x 2,5 mm. Conservez les boutures pour une utilisation ultérieure.
    2. Préparer 1 L de tampon HEPES d’Ames en combinan....

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Résultats

Les stratégies actuelles ont été développées pour fournir des méthodes relativement rapides et simples pour isoler et analyser des protéines parmi des compartiments subcellulaires de bâtonnets spécifiques pour l’analyse par transfert de Western. Nous avons appliqué deux techniques de peeling séquentiel (Figure 1 et Figure 2) suivies d’immunoblotting pour démontrer que ces méthodes pouvaient être utilisées de manière fiable pour détecter la distribution connue de.......

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Discussion

De nombreuses maladies de la rétine affectent les cellules photoréceptrices des bâtonnets, entraînant la mort des bâtonnets et, en fin de compte, une perte de vision complète37. Une partie importante des origines génétiques et mécanistes de la dégénérescence rétinienne humaine ont été récapitulées avec succès dans de nombreux modèles murins au fil des ans. Dans ce contexte, la capacité de séparer facilement et sélectivement les compartiments subcellulaires individuels des bâtonnets de la petite ré.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs déclarent qu’ils n’ont pas d’intérêts concurrents.

Remerciements

Ce travail a été soutenu par NIH Grant EY12155, EY027193 et EY027387 à JC. Nous remercions le Dr Spyridon Michalakis (Caltech, Pasadena, États-Unis) et Natalie Chen (USC, Los Angeles, États-Unis) d’avoir relu le manuscrit. Nous tenons également à remercier le Dr Seth Ruffins (USC, Los Angeles, États-Unis) et le Dr Janos Peti-Peterdi (USC, Los Angeles, États-Unis) d’avoir fourni l’équipement nécessaire pour recueillir les images fournies par l’auteur. Matériel de: Kasey Rose et al, Separation of photoreceptor cell compartiments in mouse retina for protein analysis, Molecular Neurodegeneration, publié [2017], [Springer Nature].

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Flacon de laboratoire ou de milieu de 100 mL équipé d’un adaptateur de capuchon de tubeN/A/
100 % O2N/AN/A Filtre
1000 mL sur le dessus de la bouteille, matériau filtrant PES, 0,22 &mu ; mGenesee Scientific25-235
4X SDS Sample BufferMillipore Sigma70607-3
50 mL Falcon tubeFisher Scientific14-432-22
95 % O2 et 5 % CO2 réservoirN/A/A
Ames' Moyen avec L-glutamine, sans bicarbonateSigma-AldrichA1420
CaCl2 (99 %, dihydraté)SigmaC-3881
Drierite (sulfate de calcium anhydre, >98 % CaSO4, >2 % CoCl2)WA Hammond Drierite Co LTD21005
Falcon Easy-Grip Boîte de Petri (polystyrène, 35 x 10 mm)Falcon-Corning08-757-100A
Falcon Easy-Grip Boîte de culture tissulaire (60 x 15 mm)Falcon-Corning08-772F
Scalpel à plumes (n° 10, 40 mm)VWR100499-578
Scalpel à plumes (n° 11, 40 mm)VWT100499-580
KCl (99 %)SigmaP-4504
Kimble Kontes pilon à granulésSigmaz359971
Flacons à congélation rapideLabconcoN/A
LN2 (azote liquide) + Fiole Dewar ou bouteille à vide similaireN/A/A
MgCl2SigmaM-9272
Milli-Q/eau désioniséeEMD MilliporeN/A
Na2HPO<>4 (poudre)J.T. Baker4062-01
NaCl (cristal)EMD MilliporeSx0420-3
NaHCO3Amresco0865
OmniPur EDTAEMD4005
OmniPur HEPES, Free AcidEMD5320
Parafilm MSigma-AldrichP7793
Reynolds Wrap Feuilled’aluminium Reynolds BrandsN/A
Scotch Magic Tape (12,7 mm x 32,9 m)Scotch-3MN/A
Désoxycholatede sodium Sigma-AldrichD67501
Spectrafuge mini centrifugeuseLabnet International, IncC1301
Chambre d’incubation de tissus (achetée ou fabriquée sur mesure)N/AN/A
Tris-HClJ.T.Baker4103-02
Triton X-100Signma-AldrichT8787
VirTis Benchtop 2K Lyophilizer ou machine équivalenteSP ScientificN/A
VWR Grade 413 Filer Paper (diamètre 5,5 cm, taille des pores 5 &mu ; m)VWR28310-015
Whatman Grade 1 Papier filtre qualitatif (diamètre 9 cm, taille des pores 11 &mu ; m)Whatman/GE Healthcare1001-090
Pipette de transfert à grand diamètre, Global ScientificVWR76285-362
NA réservoir de N N

Références

  1. Arshavsky, V. Y., Lamb, T. D., Pugh, E. N. G proteins and phototransduction. Annual Review of Physiology. 64, 153-187 (2002).
  2. Molday, R. S., Moritz, O. L. Photoreceptors at a glance. Journal of Cell Science. 128 (22), 4039-4045 (2015).
  3. Koch, K. W., Dell'Orco, D.

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Réimpressions et autorisations

Mots-clés

Isolation des photor cepteurssegment externe des b tonnetspelage de la r tinecompartiment subcellulairem thode de pelage au ruban adh siftechnique de lyophilisationWestern blotprot ines des photor cepteurs