Le micro-écosystème intestinal humain est extrêmement complexe, avec plus de 1000 espèces de bactéries dans l’intestin d’une personne en bonne santé1. La flore intestinale est impliquée dans le maintien des fonctions physiologiques normales de l’intestin et de la réponse immunitaire et a une relation inséparable avec le corps humain. L’accumulation de preuves suggère que le microbiome intestinal constitue le dernier organe humain, qui fait partie du corps humain, pas seulement un groupe de parasites2. Une relation symbiotique « saine » entre le microbiote intestinal, ses métabolites et le système immunitaire de l’hôte établi au début de la vie est essentielle au maintien de l’homéostasie intestinale. Dans certaines conditions anormales telles que l’inflammation chronique, les changements dans l’environnement interne et externe du corps perturbent gravement l’homéostasie intestinale, entraînant un déséquilibre persistant de la communauté microbienne de l’intestin, appelé dysbiose3. En fait, l’exposition à de multiples facteurs environnementaux, y compris l’alimentation, les médicaments et les agents pathogènes, peut entraîner des changements dans le microbiote.
La dysbiose est associée à la pathogenèse de diverses maladies intestinales, telles que les maladies inflammatoires de l’intestin (MII), le syndrome du côlon irritable (SCI) et l’entérite pseudomembraneuse, ainsi qu’à une liste croissante de troubles extra-intestinaux, notamment les maladies cardiovasculaires, l’obésité et les allergies4. Le profilage du microbiote a révélé que les patients atteints de MII présentent une diminution spectaculaire de la diversité bactérienne, ainsi que des altérations marquées dans les populations de certaines souches bactériennes spécifiques 5,6. Ces études ont démontré moins de Lachnospiraceae et de Bacteroidetes, mais plus de Protéobactéries et d’Actinobactéries chez les patients atteints de MII. On croit que la pathogenèse des MII est liée à divers facteurs pathogènes, y compris une flore intestinale anormale, une réponse immunitaire dérégulée, des défis environnementaux et des variantes génétiques7. De nombreuses preuves suggèrent que les bactéries intestinales jouent un rôle dans les phases d’initiation et d’application de la MII8,9, ce qui indique que la correction de la dysbiose intestinale peut représenter une nouvelle approche pour le traitement et/ou le traitement d’entretien des MII.
Le prototype de la transplantation de microbiote fécal (TMF) a commencé dans la Chine ancienne10. En 1958, le Dr Eiseman et ses collègues ont traité avec succès quatre cas d’entérite pseudomembraneuse sévère avec des matières fécales provenant de donneurs sains par lavement, ouvrant un nouveau chapitre dans la médecine occidentale moderne utilisant des excréments humains pour traiter des maladies humaines11. L’infection à Clostridium difficile (ICD) s’est avérée être la principale cause d’entérite pseudomembraneuse12 et la FMT est très efficace dans le traitement de l’ICD. Au cours des huit dernières années, la TMF est devenue une thérapie standard pour le traitement de l’ICD13 récurrente, ce qui a incité d’autres études sur le rôle de la TMF dans d’autres troubles, tels que les MII. Au cours des vingt dernières années, de nombreux rapports de cas et études de cohorte ont documenté l’utilisation de la FMT chez les patients atteints de MII14. Une méta-analyse, incluant 12 essais, a montré que 62 % des patients atteints de la maladie de Crohn (MC) ont obtenu une rémission clinique après la TMF et que 69 % des patients atteints de la MC ont présenté une réponse clinique15. Malgré ces résultats encourageants, le rôle de la FMT dans la prise en charge des MII demeure incertain, et les mécanismes par lesquels la FMT améliore l’inflammation intestinale sont mal compris. Une enquête plus approfondie est nécessaire avant que FMT puisse rejoindre l’arsenal actuel des options de traitement pour les MII dans les cliniques.
Dans ce protocole, nous avons appliqué la FMT sur des souris IL-10-/-, qui développent spontanément une colite après le sevrage et ont servi d’étalon-or pour refléter la nature multifactorielle de la MII16,17,18. Les souris IL-10−/− ont été largement utilisées pour disséquer l’étiologie des MII parce qu’elles présentent des caractéristiques moléculaires et histologiques similaires à celles des patients atteints de MII et, comme les patients, la maladie peut être améliorée par un traitement anti-TNFα16. Les souris IL10−/− vieillissantes (âgées de >9 mois) ont une taille cardiaque accrue et une fonction cardiaque altérée par rapport aux souris de type sauvage appariées selon l’âge19, ce qui en fait un excellent modèle pour étudier les maladies cardiaques induites par la colite. Cependant, d’autres modèles murins de colite, tels que le modèle de sulfate de sodium de dextrane et le modèle de colite induite par les cellules T, peuvent également être utilisés. Nous avons administré une suspension fécale par gavage oral, qui s’est avérée être une voie efficace et meilleure que le lavement chez l’homme20.