Le cerveau n’est plus considéré comme un organe fonctionnant isolément; L’accumulation de preuves suggère que les changements dans le système immunitaire périphérique peuvent indirectement façonner le fonctionnement du cerveau. À l’interface entre le cerveau et la circulation systémique, les plexus choroïdes (PC), qui constituent la barrière hémato-céphalo-rachidienne, ont été mis en évidence comme un site clé de la communication périphérique-cerveau. La PC produit le liquide céphalo-rachidien, les facteurs neurotrophiques et les molécules de signalisation qui peuvent façonner l’homéostasie cérébrale. La PC est également un créneau immunologique actif. Contrairement au parenchyme cérébral, qui est peuplé principalement de microglies dans des conditions physiologiques, l’hétérogénéité des cellules immunitaires CP récapitule la diversité trouvée dans d’autres organes périphériques. La diversité et l’activité des cellules immunitaires CP changent avec le vieillissement, le stress et la maladie et modulent l’activité de l’épithélium CP, façonnant ainsi indirectement la fonction cérébrale. L’objectif de ce protocole est d’isoler la PC murine et d’identifier environ 90% des principaux sous-ensembles immunitaires qui les peuplent. Cette méthode est un outil pour caractériser les cellules immunitaires CP et comprendre leur fonction dans l’orchestration de la communication périphérique-cerveau. Le protocole proposé peut aider à déchiffrer comment les cellules immunitaires CP modulent indirectement le fonctionnement du cerveau dans la santé et dans diverses maladies.