Étapes critiques
L’optimisation de trois étapes augmentera considérablement le succès de ce protocole. Tout d’abord, à l’étape 1.5, soyez économe avec la colle adhésive appliquée sur le couvercle. Si trop de colle adhésive est ajoutée, les pupes peuvent s’enfouir dans une épaisse couche de colle adhésive solidifiée, ce qui rendra la dissection impossible, et si elle recouvre le notum lui-même, la colle adhésive obstruera la lumière de l’échantillon. Deuxièmement, au cours des étapes 2.3 à 2.6, assurez-vous de ne retirer que le dôme supérieur du notum, en excluant autant de tissu latéral que possible. S’il est inclus, le tissu latéral sera comprimé pendant le montage et provoquera une boucle vers l’intérieur du milieu du notum, le plaçant souvent en dehors de la distance de travail des objectifs à ouverture numérique élevée. Troisièmement, lors de l’étape de nettoyage 2.9, il faut prendre un soin extrême pour ne pas endommager l’épithélium monocouche. Si le tissu a de grandes portions manquantes ou si aucun signal ne peut être détecté, cette étape est susceptible d’être blâmée.
Dépannage
Problème 1 : Après le montage, la nymphe s’éloigne du ruban adhésif double face pendant la dissection. C’est un problème courant, en particulier pour les débutants. Le meilleur remède est de s’assurer que l’extérieur de l’étui des nymphes est complètement sec / exempt de débris alimentaires. Retirer les aliments avec une pince émoussée et laisser le boîtier sécher à l’air libre pendant 10 à 15 minutes aidera à adhérer au ruban adhésif. Alternativement, utilisez la main non dominante et une paire de pinces émoussées pour maintenir les nymphes contre le ruban pendant la dissection. Si le problème persiste, l’application d’une petite goutte de vernis à ongles de 5 à 10 μL à la base de l’extrémité postérieure du boîtier et le laisser durcir fournit généralement une adhérence suffisante pour même les pupes les plus indisciplinées.
Problème 2 : Notum s’effondre à l’étape 2.3, ou la brèche initiale à travers le tégument n’est pas lisse. Si le tégument est difficile à percer, il peut y avoir trop de colle adhésive des étapes d’immobilisation. Placer les pupes disséquées dans de la colle moins adhésive améliorera ce problème. De plus, assurez-vous que les ciseaux de microdissection sont tranchants. Les ciseaux contondants ne pourront pas couper dans le tégument et auront tendance à le faire s’effondrer vers l’intérieur. Une fois que l’hémolymphe se répand hors des nymphes, assurez-vous que l’une des lames de coupe peut pénétrer dans la nymphe sans provoquer de déformation du notum. Si le notum s’effondre et que la lame ne pénètre pas dans la nymphe, continuez à couper jusqu’à ce qu’une lame pénètre dans la nymphe.
Problème 3 : Au cours de l’étape 2.4, les ciseaux attrapent ou font glisser le tégument. Si les ciseaux commencent à attraper ou à traîner le tégument, il est souvent utile de passer du côté opposé des pupes et de « desserrer » le tégument. D’autres ciseaux de microdissection émoussés rendront difficile l’obtention de coupes nettes à travers le tégument, et des ciseaux aiguisés doivent être utilisés.
Problème 4 : L’échantillon est accidentellement aspiré lors de la coloration (étapes 3.1 à 3.6). Le notum disséqué est difficile à voir car il est transparent. Il peut être utile de placer une feuille bleu foncé ou noire sous le couvercle pour fournir un contraste (un vieux porte-embout de pipette fonctionne bien. De plus, tous les changements de solution peuvent être effectués sous un microscope à dissection.
Problème 5 : Aucun signal n’est détecté/un signal inégal est détecté. Après avoir exclu les problèmes spécifiques aux taches, si aucun signal n’est détecté ou s’il est inégal, l’étape 2.9 (nettoyage) est probablement le coupable. Un signal absent ou inégal peut provenir de dommages et de l’ablation du tissu épithélial pendant le nettoyage. Inversement, un mauvais signal peut être causé par l’occlusion des bandes musculaires / cellules du corps adipeux si elles ne sont pas enlevées, car elles peuvent limiter la diffusion des taches et des anticorps dans le notum par rapport au tissu environnant. Si le tissu est endommagé, être plus doux pendant le nettoyage est la meilleure solution. Si, au lieu de cela, la tache est visible mais inégale, il est recommandé d’augmenter la vigueur / le temps consacré à l’étape de nettoyage pour enlever autant que possible le corps musculaire et gras. De plus, l’augmentation de la durée de la tache peut aider à résoudre ce problème avec un meilleur nettoyage.
Problème 6 : Le tissu notum a un aspect déformé/ridé pendant l’imagerie. Le gauchissement et les rides du tissu proviennent de deux sources. Tout d’abord, la compression du notum pendant le montage entraînera sa boucle et sa déformation. La meilleure solution est d’enlever autant de tissus latéraux que possible afin que le dôme soit aussi court que possible et puisse s’adapter entre les entretoises de glissement de couverture. Deuxièmement, si le notum est plié pendant la dissection, cette courbure ne se redressera pas pendant le montage, il faut donc prendre des précautions supplémentaires pour ne pas déformer le notum pendant la dissection. La flexion accidentelle du notum est plus fréquente lors de la coupe du tégument loin du reste des pupes. Il est tentant d’avoir les ciseaux de dissection à un angle par rapport aux nymphes au lieu de les garder dans le plan de l’échantillon comme les nymphes. Cependant, les ciseaux inclinés provoquent la boucle du tégument vers le haut lorsqu’il est coupé au lieu de rester plat.
Méthodes existantes, limites et applications futures
Wang et al.20 ont rapporté un protocole de dissection comparable pour l’isolement de l’épithélium nymphal. Cette technique nécessite que la nymphe reste dans son étui et soit rapidement coupée en deux avec un scalpel. Ce protocole est incompatible avec les échantillons précédemment imagés en direct, car l’imagerie en direct nécessite le retrait d’une grande partie du cas nymphal. Parce que les nymphes manquent de rigidité, la bisection nymphale à l’extérieur du boîtier a mutilé le tissu, inspirant la création de ce protocole. La technique détaillée ici permet l’isolement et la fixation du notum, et elle pourrait être utilisée comme première étape pour un large éventail d’autres méthodes telles que la cryosection, l’hybridation in situ ou la microscopie électronique.
Cette technique a certaines limites. Tout d’abord, la dissection, la fixation et la coloration du notum prennent plus de temps que l’imagerie vivante des protéines marquées par fluorescence dans le notum, qui ne nécessite qu’une simple dissection pour éliminer le cas nymphal 9,23. Deuxièmement, par rapport aux dissections d’autres tissus de la drosophile, cette dissection est plus difficile en raison du tissu mince et fragile et de la cuticule hydrophobe. Pour visualiser simplement les protéines dans l’épithélium de la drosophile, l’immunohistochimie sur des embryons fixes, des disques d’ailes larvaires ou des ovaires est plus facile. Cependant, cette technique permet d’associer la puissance de l’imagerie en direct à la fixation et à la coloration, ce qui en fait un outil puissant une fois maîtrisé.
Une technique de dissection/fixation présente certains avantages par rapport à l’imagerie en direct. Les structures basales (intérieures) peuvent être mieux résolues avec une vue basale (Figure 5L,J). Plus important encore, l’imagerie en direct est limitée aux fluorophores qui doivent être génétiquement fournis, nécessitant souvent de longs schémas de croisement génétique. En revanche, le protocole actuel permet l’application de taches, d’immunohistochimie et d’autres techniques nécessitant une dissection et une fixation. Cela augmente considérablement le nombre de signaux sondés dans le tissu tout en diminuant potentiellement le temps d’obtention de résultats expérimentaux.